基于amoA基因扩增子高通量测序的氨氧化古菌多样性分析方法

【背景】对于环境样品中氨氧化古菌(Ammonia-oxidizing archaea,AOA)多样性的研究,利用amoA功能基因作为分子标记会比16SrRNA基因有更强的特异性和更高的分辨率,能更准确地反映环境样品中氨氧化古菌的种群结构和分布特征。然而,目前对amoA基因扩增子高通量测序的分析存在两大限制因素:一是缺乏相应的amoA基因参考数据库;二是AOA amoA基因在种水平上的相似性阈值未知,分析过程中没有明确的划分种水平操作分类单元(Operational taxonomic unit,OTU)的阈值。【目的】构建基于amoA功能基因序列分析氨氧化古菌多样性的方法,为基于高通量测序的功能微生物多样性分析提供参考。【方法】基于目前已通过分离纯化或富集培养获得的34株氨氧化古菌及功能基因数据库中收录的环境样品amoA基因序列,构建氨氧化古菌amoA基因参考数据库。通过菌株间两两比对获得的amoA基因相似度与16SrRNA基因相似度的相关性分析,确定amoA基因在种水平上的相似性阈值。基于MOTHUR软件平台,利用建立的参考数据库和确定的阈值对南海一个垂直水体剖面样品的amoA基因序列进行多样性分析。【结果】构建了含有26 091条序列信息的古菌amoA基因参考数据库,确定了89%作为分析过程中古菌amoA基因划分种水平OTU的阈值,对南海水体样品氨氧化古菌的多样性分析结果很好地显示了南海不同深度水层水体中氨氧化古菌的种群结构和系统发育关系,有效揭示了南海氨氧化古菌的垂直分布差异。【结论】建立了基于amoA基因高通量测序的氨氧化古菌多样性分析方法,此方法可以有效分析环境样品中氨氧化古菌的多样性。     

在上树时间序列过程中,油松毛虫越冬幼虫扩散型变化的趋势分析

本文在测定油松毛虫越冬幼虫静态空间格局及其抽样技术研究的基础上,为了进一步揭示越冬幼虫在上树时序过程中扩散或聚集的变化趋势,本研究从越冬幼虫上树开始到结束,随着幼虫由树下逐渐向树上转移,分别以株为单元,轮为单元和枝为单元进行了3种抽样的调查,通过测定其种群聚集度指标,根据Mont Lloyd(1967)给出的判断法,并在此基础上应用谐波分析法来研究越冬幼虫种群与其环境之间所表现的种的特性反应和行为。     

土壤因子对次生森林群落演替的影响

采用聚类分析、主分量分析和回归分析对紫金山次生森林群落的系列群落,演替途径和学业速率进行了研究,紫金山次生森林群落目前的演替趋势为马尾松群落－马尾松、落叶阔叶树嫩落－落叶阔叶树、马尾权群落－落叶阔叶树群落,但在不同的土壤条件下,阔叶树的侵入、生长状况不同,群落具体的发展途径和速度有差异。制约森林演蝗主要土壤因子为土壤 不分和土壤厚度,它们通过对马尾松、枫香、黄檀、栓皮栎等主要树种显著度,对树种竞争     

苍黄霉素的研究——1.苍黄霉素的分离和鉴定

苍黄霉素是苍黄诺卡氏菌苍黄霉素变种(Nocardia lurida var. Luridomycina)71-N40产生的抗生素。它是两性(偏碱)水溶性物质,对革兰氏阳性细菌、分枝杆菌有抑制作用。本文报道苍黄霉素的发酵、产物的分离及其复合物的理化性质。     

卧龙国家级自然保护区绿尾虹雉种群分布和生境质量评价

绿尾虹雉Lophophorus lhuysii是中国特有的高山雉类,国家一级重点保护野生动物,具有极高的保护价值.卧龙国家级自然保护区是绿尾虹雉的重要分布区,但长期以来都缺乏针对性分布调查和生境研究.2019—2021年使用红外相机技术对保护区的绿尾虹雉种群进行了广泛调查,采用物种分布模型评价了其生境质量.结果显示:1...     

海南热带雨林国家公园试点经验

海南热带雨林国家公园是目前最晚启动的国家公园体制试点,其诞生和推动一直受到高度重视.2018年4月13日,习近平总书记在庆祝海南建省办经济特区30周年大会上发表重要讲话强调,“要积极开展国家公园体制试点,建设热带雨林等国家公园,构建归属清晰、权责明确、监管有效的自然保护地体系”.海南省委省政府把建设热带雨林国家公园确定...     

植物原生质体的细胞壁再生

细胞壁作为植物细胞重要的组成部分,在决定细胞形状、维持机械支撑、吸收养分等方面发挥重要功能.因此,揭示植物细胞壁合成的调控机制具有重大的生物学意义.基于植物组织水平研究细胞壁的生物合成具有难以控制时间尺度、观察空间狭小等局限性.原生质体作为去除细胞壁的单个细胞是研究细胞壁再生的理想系统.在过去的几十年里报道了大量关于植...     

弯角与单侧PVP治疗骨质疏松性椎体压缩骨折疗效比较的回顾性研究

目的：回顾性比较弯角与单侧经皮椎体成形术（PVP）治疗骨质疏松性椎体压缩骨折（OVCF）疗效。方法：回顾性分析2020年1月-2023年1月期间中国人民解放军陆军第七十一集团军医院骨科收治的98例OVCF患者的临床资料。根据手术方式的不同将患者分为弯角组（n=51）、单侧组（n=47）,对比两组围术期指标、骨水泥双侧分布情况、骨水泥渗漏情况、疼痛视觉模拟评分（visual analogue scale,VAS）、Oswestry功能障碍指数（Oswestry disability index,ODI）和并发症发生率。结果：两组术中出血量、总治疗费用、住院时间对比未见差异（P>0.05）。与单侧组相比,弯角组的骨水泥双侧分布情况更优,骨水泥渗漏发生率更低（P<0.05）。与单侧组相比,弯角组手术时间更长,骨水泥注入量、术中透视次数更少（P<0.05）。与单侧组相比,术后1周、术后12周弯角组ODI、VAS评分更低（P<0.05）。两组并发症发生率组间对比未见差异（P>0.05）。结论：与单侧PVP相比,弯角PVP治疗OVCF,可获得相当的效果,同时还可降低骨...