芽胞杆菌(Bacillus sp.)YX-1耐有机溶剂葡萄糖脱氢酶的基因克隆与酶学性质

[目的] 从芽胞杆菌(Bacillus sp.)YX-1基因组中克隆出一种有机溶剂耐受型的葡萄糖脱氢酶基因,实现了该基因在大肠杆菌中的高效表达,研究了重组蛋白的酶学性质.[方法] 依据芽胞杆菌属中葡萄糖脱氢酶氨基酸序列的保守性,设计合理引物,钓取来源于Bacillus sp.YX-1的葡萄糖脱氢酶基因,构建诱导型表达载体pET28a-gdh,于大肠杆菌中进行表达.镍柱亲和层析法纯化重组蛋白,考察了重组蛋白的酶学性质.[结果] 葡萄糖脱氢酶基因全长为786 bp,编码261个氨基酸.酶学研究结果表明:该酶最适反应温度为45℃,最适pH值为8.0;具有良好的有机溶剂耐受性,于50％的辛烷、环己烷、癸烷中室温放置1h后,酶活仍能保持90％以上;具有较宽的底物谱,对多种糖均具有一定的催化活性,其中催化D-葡萄糖的活力最高,产生还原型辅酶因子;对辅酶NADH和NADPH具有相似的依赖性,对NAD+和NADP+的催化比活分别为8.37 U/mg和8.62 U/mg.[结论]利用生物信息学成功地挖掘出Bacillus sp.YX-1一种耐有机溶剂的葡萄糖脱氢酶,为氧化还原酶在有机相反应中的的辅酶再生循环提供了新型的生物催化剂.     

马铃薯POTHR-1 cDNA的克隆及晚疫病菌和其他非生物因子诱导表达分析

利用RACE和重叠延伸相结合的方法,从经晚疫病菌接种诱导的马铃薯水平抗性材料叶片中克隆了一个POTHR-I基因(potato Phytophthora infestans-induced hypersensitive response related protein gene)的全长cDNA。序列分析表明,该基因编码225个氨基酸,与烟草harpin诱导蛋白基因hinI有很高的同源性(编码区核苷酸和氨基酸序列分别为83％和81％)。Southern杂交结果显示在马铃薯基因组中有2、3个拷贝。对其诱导表达模式研究表明：晚疫病病原菌接种36h后,该基因表达迅速增加;机械伤害及茉莉酸(JA)处理能够诱导表达;渗透胁迫(NaCI浸泡)能够诱导其微弱表达;但水杨酸(SA)不能诱导表达。该基因可能和病原与寄主互作时寄主产生过敏反应及细胞生理性死亡有关。     

芦丁、槲皮素快速修复嘌呤脱氧核苷酸阳离子自由基

利用脉冲辐解技术研究了芦丁和槲皮素对嘌呤脱氧核苷酸阳离子自由基的修复作用. 脉冲辐照经N²饱和的含20 mmol/L K²S²O⁸, 200 mmol/L t-BuOH及芦丁或槲皮素的脱氧核苷酸中性水溶液, 几十个微秒内出现芦丁或槲皮素酚氧自由基的瞬态吸收谱, 同时先前形成的脱氧核苷酸阳离子自由基的瞬态吸收谱迅速衰减, 表明被试黄酮能够快速修复脱氧核苷酸阳离子自由基. 对dAMP和dGMP阳离子自由基的修复反应速率常数分别为(3.8 ~ 4.4)×10⁸和(1.3 ~ 1.8)× 10⁸ L/(mol·s).     

鼻咽癌组织CTHRC1 mRNA、c-IAP2 mRNA表达水平与临床病理特征和预后的关系分析

摘要 目的：探讨鼻咽癌组织中胶原三股螺旋重复蛋白1（CTHRC1）信使核糖核酸（mRNA）、细胞凋亡抑制蛋白2 （c-IAP2）mRNA表达与临床病理特征和预后的关系。方法：选择2016年5月至2019年1月我院收治的82例鼻咽癌患者,取活检鼻咽癌组织,采用实时荧光定量聚合酶链反应（qRT-PCR）检测CTHRC1 mRNA、c-IAP2 mRNA表达,患者治疗结束后接受定期电话随访或定期回院复查,随访持续时间为3年。比较不同临床病理特征鼻咽癌组织中CTHRC1、c-IAP2 mRNA表达差异,绘制Kaplan-Meier生存曲线,分析不同CTHRC1 mRNA、c-IAP2 mRNA表达的鼻咽癌患者3年总生存率（OS）差异。单因素和多因素Cox比例风险回归模型分析影响鼻咽癌患者预后的危险因素。结果：低度分化、TNM Ⅳ期、淋巴结转移、颅底侵犯的鼻咽癌组织中CTHRC1mRNA、c-IAP2 mRNA表达均高于高、中度分化、TNM Ⅲ期、无淋巴结转移、无颅底侵犯的鼻咽癌组织（P＜0.05）。CTHRC1mRNA高表达、c-IAP2 mRNA高表达患者3年OS低于CTHRC1mRNA低表达、c-IAP2 mRNA低表达患者（log-rank χ²=7.088、5.511,P＜0.05）。多因素Cox比例风险回归分析结果显示TNM分期IV期、淋巴结转移、高表达CTHRC1mRNA、高表达c-IAP2 mRNA是鼻咽癌患者预后不良的危险因素（P＜0.05）。结论：鼻咽癌组织 CTHRC1 mRNA、c-IAP2 mRNA表达均异常升高,高表达CTHRC1 mRNA、c-IAP2 mRNA与鼻咽癌恶性病理特征以及预后不良有关。     

山梨糖发酵产生2-酮基-L-古龙酸氮源代谢规律

对山梨糖发酵产生2-酮基-L-古龙酸氮源代谢规律进行了初步研究。通过对这一混合发酵体系蛋白和尿素代谢的研究表明,氮源代谢与单一菌体发酵相比有其特殊性,主要表现在尿素的加入有两个作用,即作为生理碱性物质调节体系pH和为菌体代谢提供部分氮源,而体系的蛋白含量随发酵时间的延续不断增加,其增加的原因是巨大芽孢杆菌由营养体转变成芽孢所致,这是该发酵体系的特点。本文还对该发酵体系各种氨基酸变化规律进行了讨论,将一共17种氨基酸按其变化规律分成了三类,较好地解释了各种氨基酸的变化情况,为进一步深入研究该体系的动力学特性提供了数据基础。     

miR-290家簇在小鼠胚胎干细胞中的表达与调控功能

微RNA（microRNA,miRNA）是一类约22nt的非编码小分子RNA,主要在转录后水平负调控基因表达,其在生物发商、疾病、肿瘤中行使着重要调控作用。胚胎干细胞（embryonic stem cell,ESC）具有发育的全能性,能分化出成体动物的所有组织和器官。研究和利用ESC是当前生物工程领域的热点之一。近年来,越来越多的研究表明,miRNA在ESC的自我更新、分化、命运决定等方面行使着重要的调控作用。其中,miR-290家簇是在鼠科动物ESC中特异且高表达的miRNA。本文综述了miR-290家簇在ESC中的表达、功能及其分子调控网络方面的研究进展。     

马铃薯转化酶抑制子St-inh cDNA克隆及在大肠杆菌中的表达和功能测定

用RT-PCR结合5’RACE方法从马铃薯(Solarium tuberosum L．)栽培种JH块茎中克隆了转化酶抑制子St-inh全长cDNA。序列分析表明,St-inh基因编码区全长663bp,编码221个氨基酸。将含St-inh基因cDNA的DNA片段克隆到pET28a( )上,转化大肠杆菌BL21(DE3)后成功实现了表达。基因表达产物与马铃薯栽培品种(系)E1、JH试管块茎以及番茄果实的转化酶提取物共孵育结果显示,转化酶活性分别下降了34．3％、21％和33．8％,说明St-inh的翻译产物具有转化酶抑制子功能。BLAST基因序列分析表明,St-inh与Kunitz-type C类基因序列同源性达95％以上,T-COFFEE氨基酸序列对比分析显示,该基因编码的蛋白质具有典型的Kunitz-type结构域[L,I,V,M]-X-D-X-[E,D,N,T,Y]-[D,G]-[R,K,H,D,E,N,Q]-X-[L,I,V,M]-X(5)-Y-X-[L,I,V,M],因此,St-inh基因可能为Kunitz-type家族成员。     

马铃薯转化酶抑制子St-inh cDNA克隆及在大肠杆菌中的表达和功能测定

用RT-PCR结合5’RACE方法从马铃薯(Solanum tuberosum L.)栽培种JH块茎中克隆了转化酶抑制子St-inh 全长cDNA。序列分析表明,St-inh 基因编码区全长663bp,编码221个氨基酸。将含St-inh 基因cDNA 的DNA 片段克隆到pET28a(+)上,转化大肠杆菌BL21(DE3)后成功实现了表达。基因表达产物与马铃薯栽培品种(系)E1、JH 试管块茎以及番茄果实的转化酶提取物共孵育结果显示,转化酶活性分别下降了34.3%、21%和33.8%,说明St-inh 的翻译产物具有转化酶抑制子功能。BLAST 基因序列分析表明,St-inh 与Kunitz-type C 类基因序列同源性达95%以上,T-COF-FEE 氨基酸序列对比分析显示,该基因编码的蛋白质具有典型的Kunitz-type 结构域[L,I,V,M]-X-D-X-[E,D,N,T,Y]-[D,G]-[R,K,H,D,E,N,Q]-X-[L,I,V,M]-X(5)-Y-X-[L,I,V,M],因此,Sit-inh 基因可能为Kunitz-type 家族成员。     

Fast repair of purine deoxynucleotide radical cations by rutin and quercetin

Repair effects of rutin and quercetin on purine deoxynucleotide radical cations were studied using pulse radiolysis technique. On electron pulse irradiation of N2 saturated deoxynucleotide aqueous solution containing 20 mmol/L K2S2O8, 200 mmol/L f-BuOH and rutin or quercetin, the transient absorption spectra of the deoxynucleotide radical cations decayed quickly. At the same time, the spectra of flavonoid phenoxyl radicals formed within several dozen microseconds. The results indicated that deoxynucleotide radical cations can be repaired by flavonoids. The rate constants of the repair reactions were 3.8 × 108-4.4×108 mol-1 · L · s-1 and 1.3×108-1.8×108 mol-1 · L · s-1 for dAMP and dGMP radical cations, respectively.