ONCOMINE、cBioPortal和UCSC Xena的介绍,以EGFR为例

随着芯片和高通量测序技术的广泛应用,在肿瘤研究领域积累了越来越多的基因组学数据,这些数据库为生物学的研究提供了便利,为临床治疗奠定了基础。文中以EGFR在恶性胶质瘤中的研究为例来演示ONCOMINE数据库、c Bio Portal数据库和UCSC Xena数据库的使用过程及相关分析比较上述三个数据库的研究侧重点,为初学者介绍上述3个数据库以便更加快速的掌握并应用于科研工作中。     

神经活性甾体与GABAA受体

中枢内存在的神经活性甾体能快速改变神经元兴奋性,它们不是与甾体受体发生作用,而是与脑内主要的抑制性神经递质γ－氨基丁酸（ＧＡＢＡ）受体相互作用,调制基介导的突触抑制功能,引发中枢抑制或兴奋性效应的变化,大多数甾体能增强ＧＡＢＡ受体活化ＣＩ＾－通道的通透性,引发中枢抑制或兴奋性效应的变化。该效应与特定的ＧＡＢＡＡ受体亚基α３和γ２有关,有些甾体具与ＧＡＢＡＡ受体拮抗剂类似的惊厥效应,总之,神经活性甾     

小鼠胚泡着床过程中子宫6—酮—PGF1α（6—KF）及TXB2含量的变化

本实验利用前列环素(Prostacyclin,简称PGI_2)及血栓素(Thromboxane A_2,简称TXA_2)的代谢产物6-KF及TXB_2的RIA技术,探讨了小鼠子宫在胚泡着床点及非着床部位上述二类PG_s的含量变化。实验表明,妊娠D_5胚泡着床部位及着床间区,6-KF的水平较高;而TXB_2含量较低变化也小。表明胚泡着床时,血管通透性增强与PGI_2升高密切相关。PGI_2与TXA_2比值的增高,使血管舒张,增强抗凝,有利于胚泡着床及营养供应。     

天堂的蓝蝴蝶

闪蝶(Morpho butterfly)是世间最美的生物。光是看着它就能洞悉生命的奥秘。电影《蓝蝴蝶》中,昆虫学家布罗萨德在电视节目里的一句话让不满十岁的小皮特深信不疑。皮特是一个昆虫爱好者,他的卧室里挂满了采集的标本,他还是布罗萨德的忠实粉     

"生态系统的能量流动"教学案例

以高中生物学选择性必修2《生物与环境》"生态系统的能量流动"这一教学主题为例,通过模型与建模等科学研究方法的应用,呈现对物质与能量观、系统观等生物学学科核心素养达成的教学改进过程.以学生学案作为学习表现性评价的依据,参考学生访谈情况,鉴别学生的学业发展水平.     

传染性法氏囊病病毒VP4蛋白单克隆抗体的制备及鉴定

传染性法氏囊病病毒(IBDV)蛋白VP4在抑制宿主免疫应答中起重要作用,为制备IBDV VP4的单克隆抗体,以实验室保存的融合蛋白His-VP4免疫BALB/c小鼠,经过细胞融合、筛选、亚克隆后获得4株能稳定分泌抗VP4的单抗杂交瘤细胞株,分别命名为3B3、3H11、4C8和4G6,经间接ELISA测定4株单抗的亲和力解离常数分别为4.61×10–11、1.71×10–10、4.26×10–11和5.02×10–11,均为高亲和力抗体。4株单抗的重链类型分别为Ig G1、Ig G1、Ig G2b和Ig G1。进一步以Western blotting鉴定,该4株单抗均能特异地识别IBDV的VP4蛋白,间接免疫荧光和Western blotting试验表明4株单抗均能识别IBDV感染DF-1细胞后产生的VP4蛋白。该单抗为检测IBDV以及研究IBDV VP4的生物学作用奠定了基础。     

携带白介素-18基因的人脐带间充质干细胞的构建及其意义

目的：构建携带白介素-18（IL-18）基因人脐带间充质干细胞（hUMSCs）,为肿瘤靶向性基因治疗研究提供一种工具。方法：体外分离培养hUMSCs,流式细胞仪（FACS）检测hUMSCs 的细胞免疫表型。应用基因重组技术将表达IL-18 基因的慢病毒转染至hUMSCs,利用RT-PCR 及Western blot 法检测IL-18 的蛋白mRNA表达水平。结果：成功在体外分离和培养了hUMSCs,流式细胞仪检测结果显示hUMSCs 表达CD29、CD44 和CD105,而不表达CD34 和CD45, 符合hUMSCs 的表型。成功构建携带IL-18 基因的hUMSCs,RT-PCR 及Western blot法检测结果提示IL-18基因转染至hUMSCs并能稳定表达。结论：构建携带IL-18基因的hUMSCs并稳定表达IL-18,为肿瘤靶向性基因治疗实验性研究提供了一种新实验工具。     

GnRH在性成熟高白鲑神经系统及性腺中的分布定位

摘要：应用免疫组织化学方法,系统观察性成熟期高白鲑(Coregonus peled)神经系统及性腺中的促性腺激素释放激素( GnRH)的分布情况。结果表明,GnRH在大脑、小脑、中脑、脊髓、延髓中免疫阳性反应明显,且主要分布在神经元内。GnRH免疫阳性细胞在卵巢和精巢中均有分布,而且其阳性部位在卵巢主要分布于小生长期卵...     

肝癌细胞系中Yamanaka因子的内源和异位表达及其作用

目的检测肝癌细胞系中Yamanaka因子的表达,为肝癌细胞来源的诱导多能干细胞（iPS细胞）的建立和通过细胞重编程逆转肝癌的恶性表型提供实验依据。方法通过反转录PCR检测Huh7、SMMC-7721、HepG2等肝癌细胞系中4种Yamanaka因子Oct3／4、Sox2、Klf4和c-Myc的mRNA水平,通过Western印迹方法检测上述因子在蛋白质水平的表达,并构建上述因子的慢病毒表达载体,在肝癌细胞中过表达上述转录因子。结果4种Yamanaka因子在肝癌细胞系中均有不同程度表达,mRNA和蛋白质水平的检测结果一致。统计学分析显示,c-Myc的表达显著高于正常肝细胞。成功构建了Yamanaka因子的慢病毒表达载体,并诱导肝癌细胞呈现类似iPS细胞的形态。结论Yamanaka因子在肝癌细胞中有不同程度的内源表达,而外源高表达外源Yamanaka因子对于iPS细胞的诱导至关重要。     

一类带有扩散和时滞的非自台Lotka-Volterra系统

本文讨论有时滞的扩散系统,此系统有两个种群两个斑块,其中一种种群可以在两斑块中自由扩散,另一种群被限定在斑块中不能扩散,当系数数满足一定的条件时,得到系统有持续生存和全局稳定的解。