生物信息学在长非编码RNA研究中的应用

长非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度大于200个核苷酸的非编码RNA分子,它们在细胞生命活动中的许多关键过程中起到重要调控作用。近年来关于lncRNA的研究发展迅速,涌现出一批用于lncRNA的鉴定、定量、结构分析以及功能预测的生物信息学工具和数据库,本文将对这些lncRNA研究的资源进行综述。     

黄连中原小檗碱型生物碱分子构型和结构研究

本文以中药黄连中原小檗碱型生物碱为研究对象,采用重结晶的方法,获得盐酸小檗碱和盐酸药根碱的针状晶体.应用量子力学计算研究盐酸小檗碱和盐酸药根碱的分子构型,同时使用粉末X射线衍射研究结晶体的初步晶体构型.实验表明两种晶体同属三斜晶系,盐酸药根碱的晶胞参数为:a＝15.417 ,b＝14.850 ,c＝8.013 ,α＝114.746°,β＝94.436°,γ＝95.071°;盐酸小檗碱的晶胞参数为:a＝13.608 ,b＝11.080 ,c＝12.775 ,α＝80.360°,β＝105.110°,γ＝111.640°.     

野油菜黄单胞菌NK-01编码生物合成多糖基因的克隆

采用甲基磺酸乙酯诱变野油菜黄单胞菌ＮＫ－０１得到多糖合成缺陷的不产粘突变株。经ＳａｌⅠ部分酶切得到的野生型ＮＫ－０１染色体ＤＮＡ片段,连接到广泛寄主载体ｐＲＫ２９３上,在Ｅ．ｃｏｌｉ中建立完整的ＮＫ－０１基因库。通过使一株不产多糖突变株在协助质粒ｐＲＫ２０１３存在下,分别与含基因库的Ｅ．ｃｏｌｉ菌落群体进行三亲结合转移筛选具有卡那霉素抗性的产粘接合后体,对接合后体进行的重组质粒的酶切分析表明,     

野油菜黄单胞菌NK-01的形态及黄原胶分泌的电镜研究

利用透射电镜,研究了野油菜黄单胞菌(Xanthomonas campestris)NK-01菌株培养过程中菌体形态及黄原胶分泌的动态变化过程.喷涂造影显示出菌体形态及黄原胶分泌的变化规律.超薄切片揭示了此菌株的超微结构.用铬离子交联技术观察到黄原胶可交织成网状结构.     

肉苁蓉苯乙醇苷对APP/PS1双转基因模型小鼠海马脑区β淀粉样蛋白表达的影响

为研究肉苁蓉苯乙醇苷对阿尔茨海默病模型小鼠海马β淀粉样蛋白表达的影响。实验选用6月龄APP/PS1双转基因AD模型小鼠60只,随机分为模型组、多奈哌齐组(0.65mg/kg)、肉苁蓉苯乙醇总苷剂量组(250,125,62.5mg/kg)、肉苁蓉毛蕊花糖苷组(125mg/kg),正常组为同窝非转基因小鼠10只,分别给予药物和蒸馏水灌胃3个月,于9月龄时通过Morris水迷宫法检测行为学改变,采用HE染色法观察小鼠脑部海马病变,采用免疫组化法和Western-blot法考察海马Aβ1-42和Aβ1-40蛋白表达。实验结果发现肉苁蓉苯乙醇苷明显改善小鼠学习与记忆能力和脑部海马神经元的损伤,减少Aβ1-42、Aβ1-40阳性细胞数,并下调蛋白表达。肉苁蓉苯乙醇苷通过下调小鼠海马脑区Aβ1-42、Aβ1-40蛋白表达,从而影响Aβ级联反应以保护神经元,发挥拮抗AD作用。本研究明确了苯乙醇苷是肉苁蓉发挥抗AD活性的主要药效物质基础,为后续将其开发为抗AD新药提供了理论支撑。     

基于同化数据的标准化土壤湿度指数监测农业干旱的适宜性研究

农业干旱是导致作物减产的主要灾害之一,及时、准确地监测农业干旱状况有助于制定区域减灾策略,降低灾害损失。标准化土壤湿度指数(SSMI)是基于历史土壤湿度时间序列构建的一种农业干旱指数,目前分析该指数监测农业干旱的适宜性研究十分缺乏。本文以黄淮海平原为研究区,利用数据同化的根区土壤湿度数据构建SSMI,并通过与标准化降水蒸散指数(SPEI)、农业干旱灾害记录数据的对比以及与冬小麦产量的关系分析,综合评价SSMI监测农业干旱的适宜性。结果表明,SSMI与SPEI具有良好的一致性,二者之间具有极显著相关关系(P0.001);利用SSMI识别的农业干旱与农气站点干旱灾害记录是基本一致的,SSMI能够有效反映干旱发生、发展直至减轻的演变过程;冬小麦生长季SSMI与减产率显著相关,利用SSMI识别的农业干旱发生区域与基于统计数据计算的减产区域基本相符,SSMI能够对农业干旱引起的冬小麦减产起到一定的指示作用。综上所述,基于同化数据构建的SSMI能够反映黄淮海平原的农业干旱状况,利用SSMI监测区域农业干旱状况是适宜的。研究可为基于土壤湿度的农业干旱监测业务化运行提供依据,为黄淮海平原的抗旱减灾提供科学参考。     

龟纹瓢虫的初步观察

<正> 龟纹瓢虫Propylaea japonica(Thunberg)是鄂东地区棉蚜天敌的优势种群,具有耐高温、抗低温、耐饥、适应性强的特点,同时对农药有一定的抗性。主要在棉田活动,对伏蚜、秋蚜有较强的抑制作用。1980—1981年,作者对其生物学特性进行了初步观察,现报道如下。     

《中国植物志》80卷全部出齐

被世界植物学界誉为巨著的《中国植物志》共80卷．计126分册,编研和出版经历了45年,近日全部出齐,实现了中国几代植物分类学家的夙愿。全书记载中国产的维管束植物(蕨类和种子植物)300科3407属,31141种,图版9000余幅,是世界各国已出版的植物志中种类数量最多的一部、该书内容包括科、属、种的中外文献,     

顺铂对卵巢癌SKOV3细胞水通道蛋白5表达的影响及调控

应用噻唑蓝法、蛋白质印迹和RT-PCR法研究顺铂对卵巢癌SKOV3细胞水通道蛋白5(AQP5)表达的影响及其调控.结果显示顺铂浓度增加,SKOV3细胞AQP5、胞浆和胞核NF-kB p65以及胞核IkBα表达均逐渐减少(P=0.001,0.000,0.000,0.000);10 μg/ml顺铂与SKOV3细胞温育6-12 h,AQP5、胞浆和胞核NF-kB p65以及胞浆IkBα表达均明显增加达峰值,24 h后急剧下降到低值,并维持至72 h后(P=0.000,0.000,0.000,0.000,0.000).随着核转录因子阻断剂PDTC浓度增加、作用时间延长,AQP5表达及mRNA量均逐渐减少(P=0.000,0.000);顺铂对细胞抑制率与AQP5呈负相关(r=-0.598;P=0.009),PDTC对细胞抑制率与AQP5和mRNA呈负相关(r=-0.983,-0.905;P=0.000,0.000).AQP5表达与NF-kB p65和IkBα呈正相关(r=0.894,0.857;P=0.000,0.000).提示AQP5与SKOV3细胞生长有关,顺铂下调AQP5表达,其过程可能受NF-kB调控,为AQP5成为卵巢癌治疗的靶目标提供了一定的理论基础.     

WWOX和E2F-1在大肠癌中的表达及临床意义

目的:探讨WWOX和E2F-1在大肠腺癌组织中的表达及意义.方法:采用免疫组化SP法检测78例大肠腺癌、20例正常大肠粘膜、30例大肠腺瘤中WWOX和E2F-1的表达情况.结果:WWOX在大肠腺癌中的阳性率显著低于正常大肠粘膜和大肠腺瘤(P＜0.05).E2F-1在大肠腺癌中的阳性率显著高于正常大肠粘膜以及大肠腺瘤(P＜0.05).WWOX、E2F-1表达与大肠腺癌的病理分化程度、淋巴结转移和临床分期具有相关性(P＜0.05).WWOX与E2F-1基因的表达呈负相关(r=-0.323,P=0.004).结论:WWOX和E2F-1的表达与大肠腺癌发生关系密切,是大肠腺癌发生、发展的重要生物学标记物.