庆阳市本土新冠病毒Omicron变异株的全基因组特征分析

本文将高通量测序技术应用于新型冠状病毒感染(COVID-19)的疫情防控当中,从基因组水平上了解新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的分子学特征及变异情况,从而为疫情的防控提供科学的参考及准确的研判依据。我们选取2022年8月-9月庆阳市报告的新冠疫情本土感染者标本作为研究对象,对标本进行核酸检测和病毒全基因组测序并进行序列比对,使用MEGA分析软件基于邻接法构建病毒进化树,从而了解病毒的分子学特征及相关性。本研究所选取的9例病例均为普通型病例,核酸检测Ct值均较低。Nextclade分型结果显示:9条序列均属于21L型Omicron变异株;Pangolin分型结果显示:9条序列均处于Pangolin谱系中的BA.2.76进化分支上。与武汉参考株Wuhan-Hu-1(NC_045512.2)相比,9条SARS-CoV-2序列的核苷酸同源性中位数为94.6%,核苷酸突变类型包括76~78个替换突变和3处缺失突变,氨基酸突变位点共涉及10个基因编码框,按氨基酸错义突变总数由多到少依次为:S蛋白区,ORF1ab区,N蛋白区,M蛋白区,E蛋白区和ORF3a、ORF6、ORF8、ORF9b区。进化分析结果显示:本研究获得的9条SARS-CoV-2全基因组序列处于Omicron变异株BA.2.76谱系。SARS-CoV-2在流行传播过程中,不断出现传播能力增强、抗体有效性降低及免疫逃避的新毒株,未来也将可能出现新的变异株,庆阳市首次将高通量测序技术应用到新冠病毒感染的疫情防控当中,从基因组水平上了解病毒的分子学特征,对监测庆阳市疫情防控及准确的研判具有重要意义。     

光周期对社鼠能量摄入的影响

Digested energy, metabolizable energy, digestibility and assimilation rate were quantified at different photoperi-ods in Niviventer confucianus using the food balance method. Three photoperiods were applied: a short photoperiod (8L:16D), normal photoperiod (12L: 12D) and a long photoperiod (16L: 8D). The results show that digestibility and as-similation rate were highest in the short photoperiod with values of 83.97% 1.16% and 80.46% 1.34%, and lowest in the normal photoperiod with values of 81.74% _ 1.76% and 78.45% 1.41%. Moreover, the energy intake, di-gestibility and assimilated energy of N. confucianus decreased with the amount of daylight. The statistical significance of the results obtained by a one-factor analysis of variance were all less than 0.01 or 0.05 except for digested energy. This indicates that photoperiod is an important environmental factor to affect the energy metabolism of Niviventer confucianus。     

成人t(8;21)急性髓系白血病患者初诊Ki-67的表达特征及预后意义

目的:研究成人t(8; 21)急性髓系白血病(AML)初诊Ki-67抗原的表达特征及预后意义。方法:采集2012年7月至2019年2月本院57例成人初诊t(8; 21) AML患者的新鲜骨髓标本,采用流式细胞术(FCM)检测CD34和Ki-67抗原,分析Ki-67表达与患者初诊生物学特征、疗效及复发的关系。结果:全部患者中,CD34~+Ki-67~+细胞比例的中位值为30. 5%(范围:10. 0%～65. 8%);通过受试者工作特征(ROC)曲线确定CD34~+Ki-67~+细胞比例的最适分界阈值,CD34~+Ki-67~+细胞高比例与初诊c-KIT基因突变阳性及WT1转录本低水平均明显相关(P=0. 001; P=0. 042)。随访的36例患者中,CD34~+Ki-67~+高比例比低比例患者具有明显更高的1年累积复发(CIR)率(P=0. 035);此外,初诊WT1转录本低水平和微小残留病(MRD)高水平(2个疗程巩固治疗后RUNX1-RUNX1T1转录本水平下降3-log)均与更高的1年CIR率明显相关(P 0. 0001;P=0. 041),初诊c-KIT基因突变阳性和白细胞计数 10×109/L的患者分别有较高的1年CIR率趋势(P=0. 091; P=0. 054)。联合分组显示,MRD高水平同时CD34~+Ki-67~+细胞高比例的患者比其他患者具有明显更高的1年CIR率(P 0. 0001)。结论:初诊骨髓高比例的CD34~+Ki-67~+可能是成人t(8; 21) AML患者预后不良因素,MRD联合初诊CD34~+Ki-67~+细胞比例可能比单纯MRD更好地预测复发。     

高频超声与喉镜检查对甲状腺癌侵犯喉返神经的术前评价价值分析

目的:比较高频超声与喉镜检查对甲状腺癌侵犯喉返神经(recurrent laryngeal nerve,RLN)的术前评价价值。方法:选择2012年2月到2019年8月在本院进行诊治的甲状腺癌患者207例,采用高频超声与喉镜进行术前评估侵犯喉返神经情况,记录超声特征并判断诊断价值(以病理检查作为金标准)。结果:在207例甲状腺癌患者中,术后病理学证实喉返神经侵犯52例(侵犯组),转移率为25.1%。侵犯组的性别、年龄、发病位置、体重指数、病程等与非侵犯组患者对比差异无统计学意义(P0.05)。侵犯组超声显示病灶形态、内部回声、边界、钙化、晕环等特征与非侵犯组对比差异有统计学意义(P0.05),主要表现为侵犯组的病灶形态不规则、无晕环、无钙化、边界不清晰、内部高超声均显著高于非侵犯组(P0.05)。侵犯组的峰值强度(Peak intensity,PI)值高于非侵犯组患者(P0.05),两组达峰时间(Peak time,TP)与AUC值对比差异无统计学意义(P0.05)。在207例患者中,高频超声判断为喉返神经侵犯43例,喉镜判断为喉返神经侵犯39例,高频超声与喉镜检查对甲状腺癌侵犯喉返神经的术前诊断敏感性为97.7%和97.4%,特异性为93.9%和91.7%,高频超声诊断的敏感性和特异性比喉镜检查稍优。ROC曲线显示高频超声诊断的AUC为0.903,喉镜检查的AUC为0.860。结论:高频超声与喉镜检查对甲状腺癌侵犯喉返神经的术前评价的应用价值相当,均有很高的敏感性与特异性,能准确反映患者侵犯喉返神经的情况。     

氧化胁迫对酿酒酵母NAD(H)激酶突变体呼吸链活性的影响

【目的】了解酿酒酵母线粒体NAD(H)激酶Pos5p对呼吸链活性的维持是否与其抗氧化功能有关。【方法】比较在不同类型的氧化胁迫试剂作用下,野生菌BY4742、POS5基因缺失体pos5Δ及其回补体pos5Δ/POS5-YEp的呼吸链各个酶复合体的活性变化及细胞内活性氧水平变化。【结果】在非胁迫条件下,pos5Δ的各个复合体活性明显低于BY4742,而pos5Δ/POS5-YEp的活性有所恢复,这与它们的胞内活性氧水平相一致。在甲萘醌胁迫下,BY4742和pos5Δ的各个复合体活性都发生不同程度的下降,但pos5Δ/POS5-YEp的活性都升高。在H2O2、马来酸二乙酯胁迫下,除个别复合体外,BY4742、pos5Δ和pos5Δ/POS5-YEp的呼吸链复合体活性都降低,尤以pos5Δ的活性降低最为严重,BY4742的活性降低则较少,而pos5Δ/POS5-YEp在H2O2胁迫下的活性降低得到了缓解。说明甲萘醌、H2O2和马来酸二乙酯胁迫会造成酿酒酵母呼吸链各个复合体发生损伤,而过表达Pos5p则有助于缓解甲萘醌和H2O2引起的损伤。【结论】Pos5p对呼吸链的作用与其抗氧化功能有相关性。     

在蒙族中首次发现血红蛋白D-Los Augeles——试论这种血红蛋白的来源问题

1.1975年于内蒙自治区蒙族牧民中发现一种D型β链异常血红蛋白,暂命名为血红蛋白D-乌兰花。2.本文对此变异物做进一步分析,弄清其一级结构特点为β121谷→谷胺,证明Hb D乌兰花=Hb D Los Angeles(Hb D Punjab)。3.Hb D Los Angeles在伊朗及印度次大陆的发生率相当高。H.Lehmann曾提出这种血红蛋白可能来源于蒙古族。4,现在我们证明在蒙族中确有Hb D Los Angeles,从而给Lehmann设想的可能性提供了依据。     

蝮蛇咬伤损伤程度与尿微球蛋白变化的临床观察

目的观察蝮蛇咬伤患者尿傲球蛋白（β2-MG）变化与损伤程度的关系．方法选择蝮蛇咬伤患者40例．按损伤程度分轻型、中重型两组。采用r-免疫计数器进行尿微球蛋白检测并进行比较．蛄果40例患者中尿微球蛋白异常18例。占45％．其中轻型4例，中重型14例。结论尿徽球蛋白的变化与蝮蛇咬伤的损伤程度呈正相关，尿徽球蛋白升高是肾小管功能损害非常敏感的指标．可用于判断肾小管的损伤程度．为临床治疗提供依据．