肾透明细胞癌Caki-1细胞系差异表达基因的生物信息学分析

目的比较肾透明细胞癌Caki-1细胞系与正常肾上皮细胞系ASE-5063中的差异表达基因（DEGs）,寻找潜在的肾透明细胞癌特异性分子标志物。 方法利用GEO数据库自带的GEO2R在线分析工具分析基因芯片GSE78179,将筛选出的DEGs分别导入Metascape、STRING以及Cytoscape进行综合分析并筛选出核心基因。最后使用FunRich等软件对筛选出的核心基因进行GO和KEGG富集分析。 结果共筛选出562个DEGs,其中上调基因345个,下调基因217个。进一步使用MCODE筛选出36个关键基因,GO功能分析发现这些基因与细胞粘附分子活性、趋化因子活性、细胞通讯和信号转导等密切相关;KEGG通路富集结果则表明差异基因主要集中在趋化因子信号通路、TNF信号通路以及NF-κB信号通路等多种与肿瘤相关的通路上。 结论运用生物信息学方法筛选出肾透明细胞癌Caki-1细胞系中DEGs,其中数个核心基因广泛参与多种肿瘤的病理进程,但尚未在肾透明细胞癌有相关研究报道,提示其可能是治疗肾透明细胞癌的潜在靶点。     

幽门螺杆菌检测技术研究进展及展望

幽门螺杆菌是(Helicobacter pylori,H. pylori)是导致人类多种胃肠疾病的主要病因,通过多种毒力因子导致各种疾病的发生和发展。鉴于目前幽门螺杆菌缺少商业化疫苗且多重耐药性问题日益严重,临床上对其根除效果不佳,因此,精准的检测技术是预防幽门螺杆菌感染的关键,也是评估感染后治疗效果的重要手段。幽门螺杆菌的检测方法主要包括尿素呼气试验、快速尿素酶试验、粪便抗原检测、血清学检查、内镜检查、组织学病理检查、聚合酶链式反应及细菌培养,每种方法在临床上皆存在优点与局限性。目前,对于幽门螺杆菌检测的“金标准”尚无统一定论,因此本文重点综述当前应用的幽门螺杆菌检测技术,分析其优点和局限性,并指明精准、快速且便捷的检测技术在流行病学调查等方面具备的优势,旨在为临床和研究提供科学的参考依据。     

MicroRNA 在肿瘤诊断、治疗中的应用

MicroRNA(miRNA)是真核生物中一类内源性、长约22个核苷酸的非编码小分子RNA,参与基因转录后水平调控。miRNA的突变或者异常表达,与大多数癌症的发生发展有关,且与某些抗肿瘤药物疗效密切相关。因此,miRNA在癌症的诊断、预后、治疗和指导肿瘤个体化用药方面具有一定的临床应用潜力,是肿瘤生物治疗领域的一个新亮点。本文即对miRNA在诊断和治疗肿瘤方面的应用现状作一综述。     

马协型水稻细胞质雄性不育系线粒体基因组的变异与功能的研究

马协型水稻细胞质雄性不育系是近年培育并广泛应用的一种新型不育系。利用Southern blot、Northern blot和Blue-native PAGE电泳等技术对其线粒体基因组的变异和功能进行研究,分析其雄性不育的分子机理。发现其不育系线粒体基因组中除有一个正常的cox2基因外还存在一个多余的拷贝,且分别转录成不同的转录本。Blue-native PAGE电泳显示,不育系线粒体呼吸链复合物IV的活性明显低于保持系。     

食管癌转移淋巴结外科治疗的研究进展

食管癌早期即具有跳跃式淋巴结转移的特点,中下段食管癌喉返神经累及可作为颈部淋巴结转移的预测因子.淋巴结转移是影响食管癌预后的重要因素.食管癌术前应详细评估有无淋巴结转移,术中应尽可能广泛切除病变组织.常见的手术路径包括经胸及经食道裂孔两种方式,但由于不能有效清扫纵隔淋巴结,因此经食道裂孔食道切除术应该严格把握手术适应症.三野淋巴结清扫适用于中上段食管癌,二野淋巴结清扫结合术后新辅助治疗可取得较满意的生存率.本文主要就食管癌转移淋巴结外科治疗的研究进展做一综述,旨在为改善食管癌的预后提供更多的参考依据.     

Wistar大鼠和RCS大鼠视网膜色素上皮细胞和视杆细胞外节表面Con－A受体

为探讨正常大鼠与吞噬功能缺陷大鼠视网膜色素上皮（ＲＰＥ）和视杆细胞外节（ＲＯＳ）膜表面的甘露糖受体的存在和分布,本实验用胶体金标记物对１２只Ｗｉｓｔａｒ大鼠和１２只ＲＣＳ大鼠的ＲＰＥ细胞及临近其顶部的ＲＯＳ表面的Ｃｏｎ－Ａ受体进行标记．结果表明。两种大鼠ＲＰＥ细胞及ＲＯＳ膜表面均有胶体金标记物．胶体金标记物在两种ＲＰＥ细胞微绒毛上分布密度较低,而在两种大鼠ＲＯＳ膜表面分布密度则高。说明两种大鼠ＲＰＥ细胞和ＲＯＳ膜表面均有Ｃｏｎ－Ａ受体分布。在两种大鼠ＲＯＳ被ＲＰＥ细胞吞入后,均无胶体金标记物。     

14个板栗品种遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD分子标记手段,研究板栗品种的遗传多样性。采用从100个随机引物筛选的20个引物对14个板栗品种的基因组DNA进行扩增,通过对140条谱带的聚类,分析了供试板栗品种的系统发育;运用特殊谱带,建立了板栗品种的分子检索表,结合扩增的特殊位点,提出了重点保存的板栗品种。     

植物环境响应启动子的诱导元件及转录因子

光、温度、水分等环境因素影响植物的生长发育,植物可以通过启动子中顺式作用元件与转录因子的相互协调作用,对这些信号产生响应,调控基因表达。本文综述了光、温度、水分诱导表达启动子中的顺式作用元件及相关转录因子研究的最新进展,从分子水平上探讨了环境因子诱导的基因表达调控,对研究植物适应环境的机制具有一定的意义。     

氟中毒及补钙干预大鼠骨骼差异蛋白的分离与鉴定

为从蛋白水平探索钙缓解氟中毒的作用机制,本试验建立氟中毒和补钙干预动物模型进行骨骼差异蛋白的分离鉴定。通过双向凝胶电泳技术(Two-dimensional electrophoresis,2-DE)和基质辅助质量飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)鉴定骨骼中的差异蛋白质,并通过gene ontology (GO)注释、pathway富集和互作网络对差异蛋白进行分析。结果表明,与对照组(C)相比,在氟中毒组(F)和氟中毒补钙组(F+Ca)中有17种差异性的蛋白,包括Ⅰ型胶原蛋白(Col1a1)、肌动蛋白(Actb)、蛋白质谷氨酰胺转移酶2 (Tgm2)等。这些差异蛋白富集到黏着斑(Focal adhesion)、PI3K-Akt信号通路、AMPK信号通路等38条骨代谢通路。并且这些蛋白的功能主要与细胞骨架、能量代谢、物质转运、离子通道、细胞凋亡有关。因此推测,钙可能通过调控黏着斑、PI3K-Akt、AMPK等信号通路进而缓解氟对骨骼带来的损伤,具体作用机制还需要进一步验证。     

谷氨酸棒杆菌生产琥珀酸的代谢工程研究进展

琥珀酸是一种具有重要应用价值的四碳平台化合物。微生物法发酵生产琥珀酸以其社会、环境和经济优势展现出良好的发展前景。谷氨酸棒杆菌被广泛应用于氨基酸、核苷酸等高附加值化学品的工业化生产,在厌氧条件下细胞处于生长停滞状态,但仍能高效利用碳源合成有机酸,通过代谢工程改造的谷氨酸棒杆菌有望成为理想的琥珀酸生产菌株。结合近年来谷氨酸棒杆菌生产琥珀酸取得的最新成果,本文综述了构建高产琥珀酸工程菌株的代谢工程策略、底物的扩展利用,并展望了将来的研究方向。