蛋白质质谱分析的无标记定量算法研究进展

作为发现疾病相关生物标志物的重要途径,定量研究已成为蛋白质组学的热点问题.随着实验方法的发展和改进,定量数据处理算法也在不断更新和完善.将现有的无标记定量方法归纳为需要/不需要鉴定结果两类方法,分析比较了两类方法的异同及优缺点,详细讨论了所涉及的主要算法,总结了一些常用的无标记定量软件及对应的网络资源.展望了无标记定量数据分析的未来研究方向.     

环青海湖地区土壤、牧草及牦牛血液中矿物质元素动态变化研究

2005年3月(冬春季草场)和2005年7月(夏季草场),分别对环青海湖地区放牧牦牛的全血、牧草和土壤中的Zn、Ca、Cu、Fe、K、Na、S、P、Cl、F、I、Se 12种矿物元素和Ca、Cu、K、Fe、Na、P、Se 7种矿物元素的营养状况进行了测定.结果 显示,除夏季牦牛全血Se和S有显著增加外,其它矿物质含量均显著降低,提示夏季草场由于牦牛生长发育迅速其矿物质元素的缺乏更为严重,在生产中更应进行有关矿物质元素的补饲,进一步提高其生产性能.     

黄瓜 CsCCD7 基因的克隆及表达研究

使用RACE技术克隆黄瓜(Cucumis sativus L.)腋芽生长抑制基因并进行生物信息学和半定量RT-PCR分析。结果表明:从黄瓜腋芽中成功克隆了拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtCCD7/MAX3同源基因,命名为CsCCD7(GenBank登录号:HQ005419);CsCCD7基因序列含有1665 bp的开放阅读框(ORF),编码554个氨基酸;编码的蛋白质命名为CsCCD7,隶属于CCD蛋白家族成员,蛋白质的二级结构和三级结构预测显示其富含β折叠和β转角以及无规卷曲,是不稳定蛋白。CsCCD7在根中的表达量最高,在多分枝、矮化黄瓜D0462中的表达量最低,这说明CsCCD7蛋白可能参与调控植物分枝信号的转导及分枝相关基因的表达调控。     

asr基因酵母双杂交系统的构建及筛选鉴定

为研究asr作用的分子机制,分析该基因表达产物在体内相互作用的靶蛋白,分别构建诱饵质粒载体和转基因拟南芥cDNA文库,通过转入酵母细胞中,初步的鉴定分析证实成功构建了诱饵质拉载体和拟南芥cDNA文库.构建的酵母双杂交系统为发现asr基因表达产物在体内相互作用的靶蛋白奠定了基础.     

山小橘属 (芸香科) 花粉形态及其系统学意义

利用扫描电镜（SEM）对芸香科山小橘属（Glycosmis）12个分类群16个样品的花粉形态特征（包括花粉大小、萌发孔及外壁纹饰等）进行了观察研究,其中光叶山小橘（G.craibii var. glabra）、长果山小橘（G.erythrocarpa）、锈毛山小橘（G.esquirolii）、长叶山小橘（G.longifolia）、亮叶山小橘（G.lucida）、海南山小橘（G.montana）、少花山小橘（G.oligantha）、小花山小橘（G.parviflora）和华山小橘（G.pseudoracemos）等9个分类群的花粉形态为首次报道。结果表明,国产山小橘属植物的花粉均为单粒花粉,近球形或长球形,花粉大小范围为(15.90~23.92)×(14.56~22.00)μm,极面观为圆形、三裂圆形或近三角形,极轴与赤道轴比值（P/E）范围为1.03~1.31,均为3孔沟;根据花粉外壁纹饰可以将国产种类划分为条网状、复条网状、条纹-穿孔纹饰以及孔穴状纹饰等四种类型,其中小花山小橘不同来源花粉的外壁纹饰差异较大,至少存在5种类型：(1) 极面穴状,赤面条网状或穿孔,(2) 极面穴状,赤面均匀分布圆形穿孔,(3) 具复条网状,(4) 条网状兼具不规则小穿孔,(5) 条网状兼近圆形穿孔纹饰。研究发现山小橘属植物的花粉形态特征具有较高的多样性,为该属植物的分类及系统学研究提供了可用的孢粉学资料。     

干旱土壤中产漆酶真菌的分离、鉴定与生长特性分析

本研究经过选择性培养基分离及特异性底物筛选从干旱区荒漠植物松叶猪毛菜和红砂灌丛土壤中分离出两株产漆酶的真菌Z45和H53,扩增其ITS序列进行分子鉴定,并分析温度、碳源、氮源、碳氮比和pH对菌株Z45生长的影响,在此基础上利用正交试验优化其培养条件.结果 表明,产漆酶真菌Z45和H53均隶属于端梗霉属(Acrophialophora sp.),Z45温度适应范围广且耐高温,最适生长温度为40℃.最优培养基组合为:分别以麦芽糖和硝酸铵为碳、氮源,按15∶1的碳源/氮源比配制,pH值6.0.本研究从干旱区荒漠土壤中获得了1株耐高温、产漆酶、应用价值高的子囊菌端梗霉,丰富了产漆酶微生物的种质资源库.     

胀果甘草种子萌发对干旱胁迫的生理响应

为探讨胀果甘草种子萌发对干旱胁迫的生理生化适应机制,以聚乙二醇(PEG)-6000模拟干旱胁迫,分析了胀果甘草(Glycyrrhiza inflata)种子萌发过程中发芽率(GR)、丙二醛(MDA)及游离脯氨酸(Pro)、可溶性糖(SS)含量和超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)活性的动态变化规律。结果显示,水势为-0.1MPa时,GR达到100%,之后随着干旱胁迫增强而显著降低(P0.05);MDA、Pro含量及SOD、POD活性都表现出水势≥-0.2MPa时增加和-1.4MPa≤水势-0.2MPa时减少的明显趋势(P0.05),这4个指标两两之间的相关关系均达到显著水平(P0.05);而干旱胁迫增强使SS含量显著增加(P0.05)。     

太子河大型底栖动物摄食功能群对河岸带土地利用类型的响应

为研究太子河大型底栖动物摄食功能群对河岸带土地利用类型的响应关系,于2012年5月对太子河流域底栖动物和水环境因子和土地利用类型进行野外调查及数据分析。结果表明：1）太子河流域底栖动物群落在4种不同土地利用类型内具有极显著差异,平均丰度、Shannon-Wiener多样性指数和Pielou均匀度指数在森林用地中最高,分别为8.86、0.73和0.94,平均密度在森林耕作用地中最高（782.75个/m²）,除食碎屑者功能群（S）,其他摄食功能群在不同土地利用类型内无差异（P > 0.05）。2）太子河土地利用类型与水环境因子之间的Pearson分析表明,森林用地与EC、TDS、TN、NH₃-N、COD_Mn之间呈显著负相关性,与DO、IOS之间呈显著正相关性;耕地与DO和IOS之间呈显著负相关性;城镇用地与EC、TDS和TN之间呈正相关性。3）太子河土地利用类型与底栖动物功能群之间的Spearman分析表明森林用地与食碎屑者（S）、刮食者（SC）和收集者（GC）呈正相关性。耕地与食碎屑者（S）、滤食者（FC）之间呈负相关性,城镇用地与刮食者（SC）和收集者（GC）之间呈显著负相关性。4）底栖动物功能群和水环境因子之间的典范对应分析表明,食碎屑者（S）功能群主要受底质指数（IOS）驱动,其他功能群与环境因子之间无相关性。因此,水环境因子和底栖动物群落参数比摄食功能群更能反映人类活动对土地利用的改变,水环境和底栖动物群落研究可为河岸带土地利用保护提供理论依据。     

高三生物实验设计专题复习的开篇

作为实验科学,生物学科高考中,实验的地位不容置疑。分析近几年的高考试卷,我们发现生物的实验考核,往往是有关实验设计方面的。而有关实验设计方面的内容,在我们教材中没有专门章节加以论述。教师在进行这个专题复习时往往是先将相关概念加以展示,然后针对各地的生物模拟考卷中的相关题目,实验目的、实验假设、实验变量、数据分析、实验结论分别进行讲解,学生是知其然,     

植物盐胁迫蛋白

本文概述了植物盐胁迫蛋白(saltstress proteins)的种类、性质、分布和可能的生理意义以及与其他逆境蛋白的联系,并介绍对植物耐盐性分子基础的探索。