基于生物信息学和分子对接筛选结直肠腺癌的潜在生物标志物及其靶向药物

[目的]获取结直肠癌(Colon adenocarcinoma, COAD)的潜在生物标志物及其靶向药物。[方法]用R和Cytoscape 3.8.2软件分析临床数据库中56例COAD患者和45例正常样本的转录组数据,获取生物标志物及其共表达基因并分析其生物功能。通过miRWalk和miRTarBase数据库得到与COAD生存预后相关的miRNAs并分析它们的功能。利用分子对接筛选与所获生物标志物具有较好结合能力的靶向中药小分子化合物。[结果]共筛选得到179个差异表达基因,包括49个高表达基因和130个低表达基因。STRING和Cytoscape 3.8.2所得30个Hubba基因中仅CLCA1符合Cox模型(C-index:0.708(0.632-1),P<0.001)。CLCA1及其共表达基因主要参与氯离子跨膜转运过程,与肿瘤的发生发展密切相关(P<0.01)。mRNA-miRNA网络中与CLCA1密切相关的10个miRNA主要参与肿瘤细胞的增殖,凋亡和血管的形成。且甘草次酸、小檗碱和雷公藤红素被证实与CLCA1结合较牢。[结论]CLCA1是COAD的潜在生物标志物,...     

中国科学院古脊椎动物与古人类研究所动态

从今年初以来,古脊椎动物与古人类研究所的各项科研工作呈现出崭新的形势。与大规模的野外调查、发掘的同时,对近十年来积累的大量脊椎动物化石的描述及研究成果的出版,正在加快进行。今年3月,古脊椎动物与古人类学报第11卷第1期和读者见面了(该刊第10卷第2期出版于1966年5月)。面向广大工农兵的科普刊物《化石》(由本所负责编辑)也于今年创刊,它将以通俗的文字和插图向读者普及古生物学、古人类学知识,通过介绍生物史与人类史,宣传辩证唯物主义与历史唯物主义。上述两刊今年均出版两期,学报明年起定为四期。本所专刊已自去年重新陆续出版。已出版的三册(甲种专刊第8—10号)是:《合川马门溪龙》(杨钟健、赵喜进);《中国三迭纪水生爬行动物》(杨钟健、董枝明);新疆古生物考察(1963—1966)报告之一,《吐鲁番二、三迭纪脊椎动物化石》(杨钟健、刘宪亭、孙艾玲等)。该考察报告之有关其     

居维叶的道路说明了什么?

当人们在探索化石世界的秘密、特别是研究古脊椎动物时,常常提到居维叶(Georges L.C.F.D.Cuvier)的名字,有人曾把他称为古脊椎动物学的“奠基人”,说明他对这门学科曾有过贡献。但居维叶却又是生物进化论的顽固反对者,最后成了反动的神创论的辩护士。究竟我们应该怎样看待居维叶在科学史上的千秋功罪?在今天,我们通过居维叶与古脊椎动物学以及进化论的关系应该吸取那些经验教训?本文就想着重从上述两个问题上作一些初步的探讨。在这篇短文里不准备也不可能对居维叶其人作出全     

致ICU和非ICU患者下呼吸道感染肺炎克雷伯菌的耐药性分析

摘要：目的 分析致ICU与非ICU患者下呼吸道感染肺炎克雷伯菌的耐药性差异,为临床科学选用抗菌药物,有效控制感染提供科学依据。方法 对2012年1月至2014年12月从临床下呼吸道标本中分离的肺炎克雷伯菌582株进行比较分析,常规方法分离培养肺炎克雷伯菌,采用K-B纸片法进行药敏试验,利用WHONET 5.6软件分析处理实验数据。结果 检测菌株582株,其中ICU分离208株,占35.7%,非ICU分离374株,占64.3%;从ICU中分离出的肺炎克雷伯菌的耐药率除头孢替坦外明显高于非ICU,两者差异有统计学意义（P＜0.05）;两者对氨苄西林、头孢唑林、头孢呋辛的耐药率都较高,均＞40.0%,对头孢替坦、阿米卡星、亚胺培南、美罗培南都较敏感,耐药率＜25.0%;产ESBLs率ICU和非ICU分别为70.7%和40.4%,两者差异有统计学意义（P＜0.05）。结论 从ICU中分离的肺炎克雷伯菌产ESBLs率高,且对18种抗菌药物耐药率明显高于非ICU,应用抗菌药物治疗该菌感染时,必须依据药敏试验结果,临床应加强对肺炎克雷伯菌的耐药性监测,了解其耐药趋势,减少耐药菌株的产生。     

五苓胶囊对前列腺癌循环miRNA-141表达的影响

目的:采用荧光定量PCR法检测前列腺癌循环miRNA-141表达,并研究五苓胶囊对其影响。方法:选取我院泌尿外科收治的前列腺癌患者20例,随机分为A、B两组,各10例;A组给予常规治疗,B组在常规治疗基础上给予加用五苓胶囊治疗。选取同期住院前列腺增生患者20例,正常对照组为同时期体检健康者20例。采用荧光定量PCR法检测正常对照组、前列腺增生组以及前列腺癌组血清miRNA-141的表达情况,以及前列腺癌组治疗前TPSA(前列腺特异性抗原)含量。结果:前列腺癌组的血清miRNA-141的表达水平为正常对照组的(11.22±8.19)倍,明显高于前列腺增生组(1.65±1.73)和正常对照组,差异有统计学意义(P0.05);前列腺增生组和正常对照组比较无明显差异(P0.05);前列腺癌组血清miRNA-141的表达水平与TPSA水平呈正相关关系,相关系数r=0.753,有统计学意义(P0.05)。治疗后,前列腺癌A组与B组的血清miRNA-141的表达水平均有所改善,与A组(5.82±4.51)相比较,B组的miRNA-141的表达水平(1.93±0.67)明显降低,差异有统计学意义(P0.05)。结论:前列腺癌患者血清中miRNA-141表达水平明显升高,且与TPSA水平呈正相关关系,五苓胶囊能够降低miRNA-141表达。     

中国肥腹蛛属一新种记述(蜘蛛目:球蛛科)

2008～2010年在宁夏六盘山国家级自然保护区进行无脊椎动物科学考察,采集到蜘蛛目球蛛科Theridi-idae蜘蛛标本3370余头,经鉴定共有13属。发现肥腹蛛属Steatoda一新种,命名为彭阳肥腹蛛Steatoda pengyangensissp.nov.。模式标本保存于河北大学博物馆。     

白首乌光合日变化的研究

白首乌叶片光合日变化曲线呈明显双峰型,峰值分别出现在上午9：00～10：00时和下午3：00时左右。在高光强下中午有明显“午休”现象。叶绿素荧光参数Fv／Fm和φPSⅡ在晴天中午明显降低,说明田问白首乌叶片在晴天中午经常发生光抑制,高光强和高温是发生光抑制的主要原因。     

中国2种平腹蛛的再记述(蛛形纲:蜘蛛目)

对采自内蒙古自治区的2种平腹蛛进行重新记述:袜昏蛛 Phaeocedus braccalus (L. Koch, 1866)和软毛掠蛛 Drassodes pubescens (Thorell, 1856)     

中国平腹蛛科5新种(蛛形纲:蜘蛛目)记述

记述了笔者发现的中国平腹蛛科五新种 :宋氏平腹蛛GnaphosasongiZhangsp nov 、椭圆单蛛Haplo drassusparamecusZhang ,SongetZhusp nov 、罗氏小蚁蛛MicarialogunoviZhang ,SongetZhusp nov 、马氏小蚁蛛MicariamarusikiZhang ,SongetZhusp nov 和普氏狂蛛ZelotesplatnickiZhang ,SongetZhusp nov 。     

中国Waagenophyllum (Waagenophyllum)种的分支分析

在对材料产自我国的Waagenophyllum (Waagenophyllum)的种进行系统分类厘定的基础上,以Waagenophyllum (Liangshanophyllum)wengchengense作为外类群,对22个种的10个性状进行分支分析,探讨各种之间的系统发育关系。分支分析结果表明,Waagenophyllum (Liangshanophyllum)与Waagenophyllum(Waagenophyllum)关系很近,一些研究者提出的Liangshanophyllum作为一个独立属的分类意见值得商榷。