对未知关系个体进行系谱推断的自动分析系统

基于短串联重复序列(short tandem repeat, STR)和单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)的亲缘关系推断在群体遗传学、法医学等领域应用广泛,但目前没有成熟的系统可以实现针对STR数据和SNP数据的自动批量化处理。为弥补这一空白,项目组开发了一款基于STR数据和SNP数据的DNA系谱推断系统(DNA Genealogy Analyzer Version 1.0, DGA v1.0),该系统可运用STR和SNP亲缘关系预测算法计算未知亲缘关系群体中的所有亲缘关系。系统核心算法部分基于Python语言实现,前端部分采用HTML和CSS语言编写,整体采用Python的Flask框架开发。该系统与已有分析方法相比,结果一致性为100%,运算效率提高了800%以上,在群体遗传学等领域有重要应用价值。     

地黄自毒物质提取及其生物指标测定

连作障碍在药用植物地黄(Rehmannia glutinosa L.)栽培中尤其明显,同一地块上种植一茬地黄后,须经8-10a后方可再种。从怀地黄主产区河南省焦作地区采集种植1a地黄的茬后土壤,采用不同溶剂提取地黄土壤自毒物质并利用生物测试确定抑制率最强的土壤提取液作温室栽培实验以确定对植物生理指标的影响。利用高效液相色谱法(HPLC)对土壤提取液和根系分泌物进行比较,并利用高效液相色谱、傅立叶转换红外光谱(FTIR)和电喷雾离子阱质谱(ESI-MS)技术鉴定地黄连作自毒物质的化学成分。生物测试结果表明水和甲醇提取的地黄茬后土壤自毒物质对地黄生长具有最强的抑制作用;在培养器中加入浓度0.5g/mL的水和甲醇提取液对地黄胚根的抑制率分别达17%和26%,当浓度增至5.0g/mL时,抑制率增加到70%以上。盆栽结果显示甲醇提取的自毒物质导致地黄地上部叶绿素含量减少,根系活力下降,明显抑制了地黄体内超氧化物歧化酶、过氧化物歧化酶、过氧化物酶的活性,加剧了地黄膜质过氧化,以及引起地黄植体内生长素类激素含量下降。高效液相色谱法显示土壤提取液和根系分泌物具有相似图谱。电喷雾离子阱质谱分析共检测到6个特征物质:香草酸、D-甘露醇、二十六烷酸苯羟基乙酯、毛蕊花糖苷、β-谷甾醇和胡萝卜苷。     

膜翅目旗腹蜂总科昆虫化石研究进展

旗腹蜂总科是膜翅目在侏罗纪大辐射时出现的一个重要类群,延续至今既包含灭绝的化石类群,又具有丰富的现生类群.综述了旗腹蜂总科昆虫化石的研究进展,统计了世界已记载的旗腹蜂总科化石名录、地理分布及地质年代,梳理了旗腹蜂总科化石目前的主要研究成果,并对未来研究进行展望.     

杆菌属中蛋白酶基因的筛选及表达

杆菌属中蛋白酶基因的筛选及表达刘白玲,何先祺,张义正（四川成都科技大学皮革工程系成都６１００６５）（四川大学生物工程系成都６１００６４）蛋白酶是大多数杆菌产生的具有重要工业价值的水解酶,广泛应用于轻工、纺织、食品、化妆、洗涤剂及皮革工业中￣［１］。早...     

室内非直射日光对细菌生长的影响

透过玻璃窗的室内非直射日光(简称室内日光)对细菌生长的影响,国外早有报道,国内报道尚少,而且有些微生物学实验室对此重视不够。我们在对“消毒”的研究中,发现实验菌生长不规律,既不是培养基的质量问题,也不是技术操作的差异。而是由于实验时将琼脂平板接种菌液的一面朝上,放置的位置离窗距离     

紫外线对单纯疱疹病毒Ⅱ型灭活作用的研究

单纯疱疹病毒Ⅱ型(以下简称HSV-Ⅱ)与宫颈癌的密切关系以及对正常细胞的转化作用已经肯定。用于HSV-Ⅱ转化试验以紫外线灭活方法为最好。合适灭活剂量的标志是HSV-Ⅱ基本上完全灭活的最小剂量。一般为17—46 erg/mm~2/sec。本试验目的在于找到     

沙眼衣原体的简便计数法

目前衣原体的计数,一般采用Reeve的方法,即用姬姆萨液将经过一定处理的衣原体染色,然后在显微镜暗视野下进行计数。该方法步骤较多,耗时长,且易受细胞碎片干扰。Salari利用荧光素染料Hoechst 33258(Bisbe-     

间作药材与接种内生真菌对连作花生土壤微生物区系及产量的影响

利用盆栽试验研究了药用植物间作及接种内生菌拟茎点霉B3的菌丝对连作花生(Archis hypogaea)红壤微生物区系及花生产量的影响,以探索花生连作障碍的生物防治措施。结果表明,药材间作和接种B3能够显著减少土壤霉菌数量、增加土壤细菌数量和土壤蔗糖酶活性,增加花生超氧化物歧化酶(SOD酶)活性和花生产量。与花生单作相比,茅苍术(Atractylodes lancea)/京大戟(Euphorbia pekinensis)间作花生产量增加9%-22%,接种B3处理花生产量增加24%。茅苍术/京大戟和花生间作处理配合接种B3后,花生产量分别较未接种B3处理增加30%和4%。其中茅苍术花生间作配合接种B3处理的花生产量最高,比对照(P)花生产量高59%,比单独接种B3处理(PB3)的花生产量高28%;京大戟花生间作配合接种B3处理(PEB3)的花生产量比对照增加13%,但不及单独接种B3处理(PB3)。这表明茅苍术间作和接种B3具有协同提高花生产量的作用,而京大戟或许对B3的功能发挥有一定抑制作用。     

Ames试验菌株TA100的电子显微镜观察

Ames等人提出用鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typjhimurium)突变株测试化学致癌物质,经过10多年的研究,发表了一系列研究报告。目前国外已有很多实验室建立了Ames试验方法,并测试了上千种物质,获得比较满意     

两种厌氧培养法对人粪中某些厌氧菌分离结果的比较

肠道正常菌群是一个复杂的生态系统,人和动物在出生不久,肠道就有微生物定居。有的微生物是常住菌,另一些微生物是过路菌。这些在肠道内定居的微生物,它们之间以及它们