基于扩展起始节点和加权融合策略预测肺癌风险致病基因

肺癌风险致病基因预测有助于了解疾病发病机制、提高临床治疗效果.目前,以重启游走为框架的风险致病基因预测算法,普遍存在起始节点少、节点转移概率相同、信息源单一的问题.为此,本文提出一种基于扩展起始节点和加权融合策略的风险致病基因预测算法(命名为AFMFSC),并在肺癌中验证算法有效性.首先,基于增广模糊测量思想,计算疾病表型近似基因间的增广功能相似得分,从中选出重要基因与致病基因作为扩展起始节点;其次,采用节点拓扑相似度转移矩阵及基因表达差异相关性转移矩阵,分别在蛋白质网络中重启随机游走,并将两种结果加权融合排序;最后,通过富集分析排名靠前基因,得到有显著意义的风险致病基因.AFMFSC算法预测的73个肺癌风险致病基因,均与肺癌发生、发展有密切联系,生物学意义显著.与其他排序算法相比,AFMFSC算法的Top 1%、Top 5%和AUC值比较大,平均排名和受拓扑特性偏差影响程度小;融合策略排名性能优于单一转移矩阵或普通邻接矩阵游走排名.AFMFSC算法不仅能准确有效地预测肺癌风险致病基因,而且可推广预测其他疾病风险致病基因,为探索癌症致病机理提供新视角及依据.     

两地产抗生素纸片的抗菌性能与片间差比较

两地产抗生素纸片的抗菌性能与片间差比较大连市第四人民医院大连１１６０３１周国华大连大学医学院大连１１６０１２张青春我们用大肠埃希氏菌、金黄色葡萄球菌对北京、大连两地产的卡那霉素、链霉素、庆大霉素三种抗生素纸片的抗菌性能及片间差进行了实验观察,兹做以下...     

‘章姬’草莓茎段愈伤组织诱导及高频植株再生体系的建立

该研究以‘章姬’脱毒苗带节匍匐茎段为外植体,以MS为基本培养基,进行单因素预实验,选取适合‘章姬’草莓生长的植物激素种类和质量浓度范围,进而通过L_9(3~4)正交实验研究不同植物激素种类及其质量浓度对愈伤组织诱导、丛芽发生及植株再生的影响。结果表明:采用的3种基本培养基中,B_5和1/2MS对抑制培养过程中的褐化现象明显优于MS,而附加20 g·L~(-1)Na_2S_2O_3在保证材料存活的前提下,大大降低了褐化率;去除褐化的材料在MS+0.1 mg·L~(-1)6-BA+0.05 mg·L~(-1)2,4-D+0.1 mg·L~(-1)NAA中可同步进行愈伤组织诱导和丛芽发生;丛芽增殖培养基为MS+0.1 mg·L~(-1)6-BA+0.1 mg·L~(-1)NAA,30 d后繁殖系数可达12.86;试管苗生根则在1/2MS+1.0 g·L~(-1)AC中进行,35 d后可获得生长健壮的再生植株,生根率92.50%。再生苗移栽成活率在95%以上。该研究建立了‘章姬’草莓体外高效快速繁殖体系,对短期内为‘章姬’草莓栽培提供大量种性稳定、质量优良的种苗具有重要意义,同时为其他草莓品种的体外快繁提供了技术参考。     

人胰岛素原C肽的表达、纯化及其细胞活性研究

近年来研究发现人胰岛素原C肽 (简称C肽 )有多种生物活性 ,在治疗糖尿病的并发症中有潜在的应用价值。在前期研究中 ,完成了多拷贝串联C肽基因的构建和融合表达 ,在原核中获得了高表达。用发酵的方法大规模表达融合蛋白C肽 (FCP) ,由Ni-NTA柱亲和纯化获得的蛋白经胰蛋白酶和羧肽酶B的酶解及RP HPLC分离获得了纯度超过 95 %的C肽单体。细胞活性研究显示它对U2 5 1、2 93细胞的生长具有一定的促进作用     

祁连山区早奥陶世头足类化石

本文所报导的材料来自两个地区:一是祁连山南坡,即青海省柴达木盆地北缘大柴旦区的大头羊沟和石灰沟附近;一是邡连山的北麓,即河西走廊南缘甘肃省玉门西南的东大窑一带。祁连山南坡的标本,是穆恩之、俞昌民等同志于1958年采集的。根据他们的意见,祁连山南坡的奥陶纪地层可分为三个地层单位,即大头羊沟羣,属中奥陶统,石灰沟页岩组和多泉山石灰岩组,属下奥陶统。大头羊沟剖面的上覆地层为中奥陶统的大头羊沟羣,它与下面的下奥陶统石灰沟页岩组呈假整合接触。石灰沟页岩组以灰黑色炭质页岩、灰色钙质页岩及泥质灰岩为主,并夹少量黄灰色钙质砂岩和灰黑色薄层石灰岩,本层     

Rspo1对雌性脊椎动物性别分化的功能

长期以来雌性脊椎动物的性别分化被认为是一个“默认”的程序.但是近些年研究发现,Rspo1基因的突变或缺失可导致哺乳动物XX型个体性反转为雄性.Rspo1在鱼类、两栖爬行类、鸟类和哺乳类动物性腺发育的不同阶段表达,其表达在雌雄个体性别分化时期有差异,是潜在的性别调控基因.Rspo1在性别发育早期可通过Wnt/β-catenin信号通路调控性腺分化相关因子的表达,影响原始生殖细胞分裂增殖、细胞周期和生长发育,参与调控性腺中体细胞的分化.本文总结了近年来Rspo1在脊椎动物中的表达调控及其在雌性性别决定方面功能的研究进展.     

长江三角洲石荠苧属群体水平变异式样的研究

本文应用数量分类学方法对长江三角洲地区5种石荠苧属植物的群体进行了表征变异式样的分析,并参照繁育方式、生态适应和染色体数目等证据,来揭示种内群体间变异式样的差异及其与环境条件的关系,并探讨了这些种可能的种系发生关系。笔者认为石荠苧属Mosla在进化的早期就已经分化为两个大支,在分类上即表现为两个组——唇萼组和石荠苧组的分化。     

房颤射频消融术后复发风险预测评分系统的建立及评价

目的:探讨心房颤动(房颤)患者射频消融术后复发的风险因素,并依此构建个性化的风险评分系统。方法:选取2017年1~8月行射频消融术的房颤患者154例作为研究对象,依据术后3个月的随访结果将患者分为复发组及未复发组,采用单因素分析和Logistic回归分析对各风险因素进行分析,构建其评分系统,采用Hosmer-Lemeshow拟合优度检验和ROC曲线下面积评价评分系统的准确度及区分度。结果:术后随访3个月的结果显示共37例(24.03%)房颤患者出现复发,房颤类型、病程、体质量指数(BMI)、左房前后径(LAD)、左房容积(LAV)及超敏C反应蛋白(hs-CRP)水平均是房颤复发的独立风险因素(P<0.05)。构建的风险评分系统得分为0~26分,Hosmer-Lemeshow拟合优度检验:x^2=7.520,P=0.482;ROC曲线下面积为0.864(95%CI:0.837~0.891),预测评分值为15分时,约登指数最大(0.605),此时的敏感度和特异度分别为77.3%和83.2%。结论:房颤患者射频消融术后的复发率较高,依据风险因素构建的风险评分系统具有较高的预测效率和区分能力,可作为房颤患者射频消融术后复发风险评估的参考工具。     

羊草(Leymus chinensis)草地雨天放牧与非雨天放牧的绵羊采食特征

通过受控实验,比较了雨天和非雨天放牧在采食方式、采食损失量、践踏折损率以及土壤含水量和容重的差异.得出雨天放牧条件下,羊草各种采食方式的比例降低,去顶量依旧随放牧压升高而增加,但与非雨天放牧不同的是不再占主要比例.羊草采食损失量与非雨天差异不大,对于适口性更高的植物,如芦苇和全叶马兰,雨天放牧时损失更高.绵羊在冷湿环境中活动明显减少,羊草的践踏折损率各放牧压下差异不大,但芦苇的折损率依旧表现为随放牧压增强而增加.放牧后土壤15cm的含水量都低于对照小区,表明绵羊践踏加速了土壤水分的蒸发.放牧后土壤容重与放牧前和非牧区差异显著,并且容重随放牧压增强而增加.     

应用三系配套途径产生遗传上全雄莫桑比克罗非鱼

通过性别三系配套可获得100％莫桑比克罗非雄鱼XY鱼,并指出生产上的应用技术关键就是实现原系XX♀、雄性纯合系YY和雄性纯合转化系YY♀之间的三系配套。对遗传上全雄鱼与生理上雄鱼人工控制的途径进行了分析比较。