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恶性横纹肌样瘤(MRT)的起源研究——高变异率HeLa细胞致裸鼠产生MRT的实验研究 总被引:7,自引:2,他引:5
HeLa细胞KB株、X株、NM20/X株、H株的染色体众数依次为60±3(超二倍体)、62±3(超二倍体)、68±3(超二倍体和亚四倍体)和78±2(亚四倍体),所占比率分别为72%~76%,69%,52%和40%。在纯化3代的肿瘤阴性对照二倍体猫肾(染色体众数38所占比率80%)和犬肾原代细胞皮下接种裸鼠的致癌/致瘤率分别为0%(0/22)和0%(0/10),X株HeLa细胞冻融裂解物皮下接种裸鼠产生进行性缩小肿瘤的比率为20%(1/5)的前提下,HeLa细胞KB株、X株、NM20/X株皮下接种裸鼠产生进行性生长恶性肿瘤的比率分别为100%(10/
10),100%(25/25)和100%(5/5),H株细胞皮下接种裸鼠产生恶性肿瘤的比率为50%(5/10)。其中,只有HeLa细胞KB株10~11代(染色体结构畸变率高达20%,出现18%双着丝点和2%断片)以超高数量接种的1组4只裸鼠(0.17ml12.75×10 相似文献
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用电子克隆新基因C17orf32和ZNF362对NCBI人类基因数据库模式参考序列5种错误类型的分析与纠正 总被引:3,自引:1,他引:2
采用生物信息学分析与实验确认相结合的技术路线,通过所识别的基因在非冗余数据库比对发现了网上公布的计算机注释人类基因组编码序列存在各种类型的多处错误。该策略既有助于发现更多的人类新基因,又有助于纠正美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因组注释项目公布的参考序列(REFSEQs)中所存在的错误。比如他们采用基因预测方法通过自动计算分析从NCBIcontig NT_010808预测到两个模式参考序列LOC124919和LOC147007,本该都是C17orf32,但却都是C17orf32的不同错误形式,分别为第1和2类型错误;再如,他们采用基因预测方法通过自动计算分析从NCBIcontig NT_004511预测到3个模式参考序列LOC14907、LOC200084和LOC91126,实际上都是.ZNF362一种基因,却提交了ZNF362的3种不同错误形式,分别为第4、5和7类型错误。本研究利用计算机识别并结合实验验证能够纠正或避免现有的人类基因组编码序列错误。以前公开发表的文献没有明确指出NCBI人类基因模式参考序列存在错误,因此直当慎重看待计算机注释的可能存在各种类型错误的人类基因组编码序列。人类新基因的正确识别和注释仍是一项长期而繁重的任务。 相似文献
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通过新基因计算机识别与实验确认对NCBI人类基因数据库一些模式参考序列错误的分析与纠正 总被引:5,自引:1,他引:4
采用生物信息学分析与实验确认相结合的技术路线,通过所识别的基因在非冗余数据库比对发现了网上公布的计算机注释人类基因组编码序列存在各种类型的多处错误,包括cDNA水平的一个或一段碱基插入、缺失或突变,或是这些错误的不同排列组合,其中以错误插入为多,往往导致编码氨基酸的移码突变。最先举证了NCBIGENOME Annotation Project预测人类新基因的下列错误类型:(1)开放读码框架(0RF)中错误插入一个碱基造成编码氨基酸移码;(2)错误拼接;(3)开放读框中错误插入一个或一段碱基造成该读框提前终止。只编码N-端氨基酸的cDNA序列而不完整;(4)只有编码c一端氨基酸序列的cDNA而不完整;(5)只是正确基因0RF中间的一段编码蛋白cDNA序列而不完整,缺N-端与C-端氨基酸序列,并且将不完整蛋白氨基酸序列的第一个非起始码氨基酸错误地预测为起始码氨基酸,如将L错误地预测为M;(6)开放读框中错误插入一个或一段碱基造成前面出现不该有的终止码,因而编码蛋白缺开头部分氨基酸;(7)可能将污染基因组序列当作完整基因cDNA序列对待而预测出所谓单一外显子基因。即便真是基因,也只是较长单一外显子mRNA中有一小0RF,而0RF起始码上游同一相位确实存在终止码,无其他特点符合基因条件;(8)所预测基因只有0RF,而0RF两端没有任何EST证据,可据此0RF拼接出受EST和人类基因组双重支持的完整基因cDNA(开放读框上游同一相位有终止码),预示所预测0RF参考序列可能不正确;(9)有EST实验证据支持存在基因的人类基因组序列范围内又被预测出一条相似但更小的蛋白编码基因,因而新预测基因有可能是错误的。 相似文献
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生命科学已进入以基因功能研究为核心的后基因组时代,大规模结构基因组学、蛋白质组学和药物基因组学已成为新的研究热点。新一轮大规模国际竞争与合作已经开始。为了加强国际生命科学领域专家的交流与合作,提高研究水平,促进生命科学技术的发展,2005年4月24~26日在桂林召开了“第三届国际后基因组生命科学技术学术论坛(3’IFPT)”,它也是HGM2005 KYOTO的卫星会议。 相似文献
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反义基因治疗──分子病毒学新领域张德礼(北京军区后勤部卫生防疫队北京军区兽医防治中心北京100071)朱关福(军事医学科学院微生物流行病学研究所北京100850)反义技术同基因工程的常规技术相反,走的是抑制基因表达的路线。它是近十年来发展起来的反义核... 相似文献
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狂犬病是急性直接接触性人兽共患病,症状凶险,一旦发病,必死无疑,当被带有病毒动物咬伤后,可用疫苗接种产生自动免疫防止发病。为此,在狂犬病研究中,对狂犬疫苗,特别是狂犬病毒基因工程疫苗的研究一直是最活跃的领域。利用重组 DNA 技术开发的狂犬病重组活载体疫苗已有制品,这是近十 相似文献
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