来源于Micrococcus luteus的复苏促进因子异源表达及其对活性污泥中休眠细菌的促生长作用

【背景】复苏促进因子(Resuscitation promoting factor,RPF)是由某些放线菌分泌的一类活性蛋白质,最初在Micrococcusluteus中被发现。它不但能够复苏休眠细菌恢复生长,而且对正常的细菌也有促生长效果。然而关于RPF对于环境样品中除原始宿主以外细菌的复苏促进作用研究还鲜有报道。【目的】以寻找新的菌种资源、开发环境功能菌角度研究了RPF对环境样品中潜在休眠菌群的复苏促进作用。【方法】首先对来源于Micrococcus luteus IAM 14879的RPF(Ml RPF)蛋白序列进行生物信息学分析和同源模建;随后克隆了Ml RPF编码基因并在大肠杆菌中异源表达;最后利用重组Ml RPF对活性污泥样品中潜在的休眠细菌开展了复苏促生长研究。【结果】Ml RPF在进化树上处于单独分支,远离其它RPF家族成员;模建结构分析表明Ml RPF具有与C型溶菌酶相似的催化结构域,这有助于解释RPF家族蛋白具有溶解酶活性;重组Ml RPF在大肠杆菌中获得了可溶性表达,它能够促进休眠态M. luteus IAM 14879生长,保留了其生理活性;利用重组Ml RPF从某污水厂活性污泥样品中分离获得了Dietzia、Paracoccus、Rhodococcus和Brevundimonas菌株。【结论】为环境样品中微生物多样性研究及特殊微生物资源的发掘提供新的方法,也为基于Ml RPF的废水生物强化处理技术研发提供理论依据。     

黑龙江省老爷岭南部黄喉貂栖息地适宜性评价与廊道构建

黄喉貂(Martes flavigula aterrima)为典型的林栖兽类,对栖息地干扰和破碎化极为敏感,被视为森林生态系统的指示物种。为了科学有效保护该物种,于2020-2021年在黑龙江省老爷岭南部区域布设红外相机642台收集黄喉貂活动位点信息,利用最大熵(MaxEnt)建模方法开展黄喉貂栖息地适宜性研究,探究影响种群生存的关键环境因素,并利用最小成本路径方法构建潜在的种群扩散生态廊道,探讨研究区域黄喉貂种群的栖息地连通性。研究结果表明:(1)MaxEnt模型的受试者工作特征曲线(ROC曲线)评价结果的平均曲线下面积(AUC)值为0.861,能够较好的反映研究区域黄喉貂栖息地适宜性的实际分布情况;(2)本研究利用的13个变量中,距东北虎(Panthera tigris altaica)、东北豹(Panthera pardus orientalis)距离12 km黄喉貂出现概率最高,且贡献率达20.6%,是影响黄喉貂栖息地选择的关键变量,其次坡向(9.9%)、农田(9.5%)、草地(9.0%)、常绿针叶林(8.9%)、道路(7.0%)、河流(6.6%)、居民点(6.1%)和海拔(5.9%)是影响黄喉貂栖息地质量的次要变量;(3)研究区域黄喉貂适宜栖息地面积为793.54 km²,占研究区域总面积的21.4%,主要分布在黑龙江省绥阳林业有限公司的柳桥沟、青山和万宝湾林场。黄喉貂栖息地破碎化严重,因此通过栖息地适宜性分布图获得15块总面积为401.61 km²的核心栖息地,并构建14条生态廊道利于黄喉貂栖息地生态恢复管理。研究综合分析了黑龙江省老爷岭南部黄喉貂栖息地现状及连通性,促进黄喉貂扩散、栖息地的连通性和适宜性。     

ClpP2蛋白失活对集胞藻PCC6803生长、光合作用和蛋白质组的影响

【背景】蛋白酶能够降解细胞中错误折叠或是无功能的蛋白,Clp家族蛋白就是一类重要的蛋白酶复合物。Clp蛋白酶复合物的水解核心是ClpP,集胞藻PCC6803中存在4种不同的ClpP蛋白,分别为ClpP1-ClpP4。作为重要的蛋白水解复合物的功能组分,目前对集胞藻ClpP的研究十分有限,对其生理功能与调控底物的研究甚少。【目的】选择集胞藻为研究对象探究ClpP2蛋白的功能,鉴定其潜在底物,为集胞藻ClpP2作用机制提供实验支撑。【方法】构建集胞藻ClpP2突变株(ΔClpP2),进行其生长实验和光合生理功能研究。通过标记定量蛋白质组学技术(isobaric tag for relative absolute quantitation, iTRAQ)鉴定ClpP2调控的靶标蛋白,生物信息学分析底物蛋白参与的代谢通路,最后利用平行反应监测(parallel reaction monitoring, PRM)技术对部分定量数据进行验证。【结果】ΔClpP2可以在自然条件下光合自养生长至对数生长期,但高光或高温胁迫下则无法正常生长。相较于野生型,ΔClpP2有着显著降低的PSⅡ电子传递效率及P...     

热带地区不同水稻品种对土壤镉胁迫的生理生化响应

以热带地区主栽品种博优225和矮糯为材料,采用盆栽试验研究了不同水稻品种对土壤外源重金属Cd胁迫的耐性机理。结果表明:在各浓度镉胁迫下,2个品种水稻都是根累积的镉含量要高于茎叶和稻壳、糙米,即根>茎叶>稻壳>糙米;随着镉胁迫浓度的增加,细胞膜受损的伤害程度越大,矮糯质膜透性略高于博优225;随着Cd浓度的升高,水稻叶片丙二醛(MDA)、脯氨酸含量逐渐增加,且博优225的增加幅度明显大于矮糯,超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化物酶(POD)活性均呈上升趋势,且博优225明显高于矮糯;过氧化氢酶(CAT)活性呈下降趋势;表明同样条件下博优225受Cd毒害更严重。     

内蒙古昆虫物种多样性分布格局及其机制

物种多样性的地理分布格局及其机制是宏生态学和生物地理学的核心问题之一。区域尺度与局域尺度的影响因素, 如温度、降水、海拔变化、生境过滤、捕食、竞争与互惠等, 共同影响昆虫物种多样性的分布格局。然而, 迄今为止少有研究同时讨论不同尺度驱动因子对昆虫多样性地理分布格局的影响。本文基于内蒙古自治区86个旗县的昆虫多样性数据, 结合各地年平均气温、年降水量、古气候变化、海拔变化及植物多样性, 探讨昆虫物种多样性分布格局及其主要驱动因子。结果发现内蒙古昆虫多样性主要受到植物多样性与海拔变化的影响, 而气候因子对昆虫物种多样性的影响并不大。这一结果表明种间关系(食物多样性)与生境异质性可能对内蒙古昆虫多样性的分布格局起着主导作用。     

脾全切除术与脾部分切除术治疗外伤性脾破裂的临床疗效对比

目的:比较脾全切除术和脾部分切除术治疗外伤性脾破裂的临床疗效和安全性。方法:选择我院2013年3月~2016年3月收治的84例外伤性脾破裂患者并平均分为两组,脾全切除组42例采用脾全切除术治疗,脾部分切除组42例采用脾部分切除术治疗,比较两组的手术效果、治疗前后血小板计数、血清Ig A、Ig G、Ig M、CD3~+、CD4~+、CD8~+及CD4~+/CD8~+水平的变化以及术后并发症的发生情况。结果:部分切除组术中失血量、排气时间、住院时间均短于全切除组,但部分切除组手术时间显著长于全切除组,差异有统计学意义(P0.05)。部分切除组血小板计数、Ig M、CD8~+水平明显低于对照组,Ig A、Ig G、CD3~+、CD4~+、CD8~+、CD4~+/CD8~+显著高于全切除组(P0.05)。部分切除组并发症发生率显著低于全切除组(P0.05)。结论:脾部分切除术治疗外伤性脾裂的手术效果优于脾全切除术,且对患者血小板及免疫功能的影响较小。     

中国不同地区疾控机构青年职工饮食行为分析

目的：分析我国不同地区疾控机构青年职工饮食行为差异。方法：采用整群抽样的方法，对全国31个省（自治区、直辖市）和新疆建设兵团省级疾控机构40岁及以下职工共计6 099人，以网络问卷的形式开展膳食调查。按照经济发展状况分成东、中、西部和东北地区，比较不同地区疾控机构青年职工饮食行为差异。结果：东部地区达到谷薯类推荐摄入量的比例为43.5%，中部地区达到肉类推荐摄入量的比例为45.2%，西部地区受访者不吃水产的比例为18.2%，均显著高于其他地区（P<0.05）。西部地区受访者外就餐/外卖次数≥6次/周的比例为29.0%，东北地区受访者不吃早餐≥5次/周的比例为15.7%，西部地区受访者每日都吃早餐的比例为72.6%，西部地区受访者摄入含糖饮料≥4瓶/周的比例为20.7%，结果均显著高于其他地区（P<0.05）。结论：不同地区疾控青年职工饮食行为存在差异，部分地区存在饮食行为不合理情况，应针对性的加强健康宣教。     

基于16S rDNA测序分析枳术丸水煎液对慢传输型便秘脾虚证模型小鼠肠道菌群的影响

目的 基于16S rDNA测序分析慢传输型便秘（STC）脾虚证小鼠肠道菌群结构特征，初步探讨枳术丸对STC肠道菌群的可能干预机制。方法 40只小鼠随机分成正常组、模型组、枳术丸组与莫沙必利组。造模组（模型组、枳术丸组与莫沙必利组）采用番泻叶灌胃，随后控制饮食饮水采用饥饱失常的方法造成脾虚便秘小鼠模型。造模成功后，枳术丸组给予中药水煎剂灌胃，莫沙必利组给予莫沙必利悬浊液灌胃，正常组与模型组给予蒸馏水灌胃。连续给药7 d后测定小鼠肠道推进率和血清D-木糖水平，采集小鼠结肠内粪便进行16S rDNA检测，分析样本菌群的多样性与丰度，分析门、属、种水平的物种组成。结果模型组肠道菌群丰富度指数（Chao1指数）与多样性指数（Shannon指数）较正常组均显著降低（P<0.05），说明STC发病过程中伴随肠道菌群物种丰富度水平和菌群物种数目的降低以及菌群多样性水平的降低。在门水平上，正常组与模型组均以厚壁菌门（Firmicutes）和拟杆菌门（Bacteroidetes）为主；在属水平上，模型组肠鼠杆菌属（Muribaculum）、拟杆菌属（Bacteroides）、乳杆菌属（Lactoba...     

超级植物糖棕

正人类的追求永无止境,总希望找到一些"超级植物",既能满足日常需要,又易于栽培收获,最好还能有一点文化寄托。这听上去有点不可思议,然而这样的"超级植物"还真的存在。古往今来,中国人找到了大豆和茶、北美原住民找到了玉米、安第斯山的居民找到了玛咖、埃塞俄比亚人找到了咖啡。最终这些超级植物     

我国近海龟足3个地理群体比较转录组及环境适应性研究

龟足(Capitulum mitella)隶属于节肢动物门(Arthropoda)指茗荷科(Pollicipedidae)龟足属，广泛分布于亚热带及热带近海沿岸中高潮地带。由于龟足生存环境复杂多变，可能导致其不同地理群体形成与其生境相适应的特征。本研究基于高通量测序技术对浙江舟山、福建宁德和广东珠海3个典型海域的龟足进行比较转录组分析，并利用生物信息学方法探究3个地理群体对环境的适应机制。结果表明，3个地理群体间存在651个(广东珠海和福建宁德群体间)至3 738个(浙江舟山和福建宁德群体间)数量不等的差异表达基因(DEGs)，主要涉及核糖体合成、抗原加工与递呈、分子伴侣代谢通路。基因序列的非同义替换率(K_a)和同义替换率(K_s)之间的比例K_a/K_s，如果其超过1，则认为有正选择压力作用于该基因，基因正在快速进化。3个地理群体间龟足直系同源基因正选择压力分析结果显示，254个直系同源基因中有7个基因受到正选择压力，包括D-天冬氨酸酶基因(K_a/K_s=2.0...