利用内源CRISPR-Cas系统开展乳酸菌基因编辑的研究进展北大核心CSCD

CRISPR-Cas9技术是一种高效、精准的基因编辑工具,该技术的建立推动基因组编辑进入快速发展阶段。目前应用最广泛的Cas9蛋白是来源于酿脓链球菌(Streptococcuspyogenes)的SpyCas9,该蛋白作为“基因剪刀”在哺乳动物、植物等真核生物中应用较为广泛且成熟,但是该蛋白在一些乳酸菌中的应用仍然受到多种因素的限制。乳酸菌基因组上已发现多种类型的CRISPR系统,也蕴含着多种未表征的Cas蛋白,利用乳酸菌内源CRISPR-Cas系统,结合外源导入的向导RNA和同源修复模板,也可实现对乳酸菌基因组的编辑。这种基于内源CRISPR-Cas系统实现基因编辑的方式,具有打靶载体相对较小易转化、无外源Cas9蛋白对宿主细胞产生毒性等优势,相比于CRISPR-SpyCas9更适合于乳酸菌基因组进行编辑,可能是一些乳酸菌未来开展基因组编辑的主要手段,本文重点对此部分内容进行了综述。     

对新型冠状病毒肺炎的认识

新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)是近期在世界范围发生的一种以呼吸系统症状为主要表现的传染性疾病,该病对我国乃至世界人民的生命安全造成了重大威胁。严重急性呼吸综合征冠状病毒2(Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2,SARS-CoV-2)的传染性较SARS-CoV、MERS-CoV强,是该病原体最大特点之一,且其感染后进展快、危害大。现已经过我国及全世界科学家努力对该病有了进一步的认识。该文旨在对该病的认识进行梳理,提高临床医生对该病的初步认识。     

miR156靶基因SPL在植物中的系统分布和进化模式分析

Squamosa promoterbinding proteinlike genes （SPLs）在植物发育过程中具有重要作用。很多SPLs被miR156调节,然而,对于它们在植物中的系统分布和进化模式还知之甚少。本文对9个测序物种（藻类,苔藓,石松,单子叶和双子叶植物）的183个SPLs进行了生物信息学分析。结果表明miR156应答元件（MREs）仅在陆生植物SPLs中发现,藻类中不存在。系统进化分析显示陆生植物SPLs分为两大分支：group I和group II。 MiR156靶基因仅分布于group II,表明它们有着共同的祖先。Group II进一步分为7个亚支（IIaIIg）,miR156靶基因分布在除IId外的其余6个亚支的特定SPLs。系统分类与基因结构的相关性反映了SPL靶基因结构上的变化。在进化过程中,它们可能发生外显子的丢失且伴随MRE的丢失。另外,基因重复对SPL靶基因的丰度变化影响很大,尤其是被子植物与低等植物分歧后它们数量明显增加。以拟南芥为模式植物分析发现串联重复和片段重复是SPL靶基因扩张的主要机制。     

假蜜环菌液体种子培养条件的优化及其应用研究

目前国内多采用固体菌种进行假蜜环菌的发酵生产。在假蜜环菌液体种子的培养及培养条件优化等方面进行了探讨,优化条件为:玉米淀粉为较适宜碳源;酵母浸出粉为较适宜氮源;添加KH2PO4、吐温-80对菌丝生长有一定的促进作用。正交试验结果显示,适合假蜜环菌菌丝体生长的培养基配方为玉米淀粉30 g/L,酵母浸出粉3g/L,KH2PO41.5 g/L。此外,还探讨了液体种子与传统的固体种子对固体发酵产物的影响,结果表明,接种液体种子能提高固体发酵的主要代谢产物的产量。该实验为改善假蜜环菌现行的生产工艺提供参考。     

赛罕乌拉国家级自然保护区红角鸮(Otus scops)的繁殖生态观察

为了解红角鸮(Otus scops)的繁殖状态,2009年5～8月,在内蒙古赛罕乌拉国家级自然保护区,以直接观察法对红角鸮的繁殖生态进行了研究。结果表明,所观察的4个巢址全部是以柳树为主干的树洞巢,巢内铺垫物较少或无铺垫,巢距地面的平均高度为91.3cm,巢内径平均为13.5cm,巢外径平均为15.0cm,巢深平均32.0cm(n=4)。平均窝卵数为3.75,对其中一窝进行测量,4枚卵平均量度是28.9mm×24.6mm,重量9.5g。雏鸟孵出后,雌性亲鸟承担主要育雏任务,雄性亲鸟日间停歇于离巢不远的树上负责警戒工作,夜间与雌鸟共同哺育雏鸟。小型鼬科动物的捕食可能是干扰红角鸮繁殖成功率的主要因素。     

Trametessp.AH28-2漆酶A的诱导合成及其基因5′-端调控区的克隆与分析

Trametessp.AH28_2漆酶同工酶的合成需要铜离子的存在,较高浓度的Cu2+有利于漆酶合成。在以葡萄糖为碳源补加0·5mmol/LCu2+的培养基中生长时,发酵液漆酶活性为44·3u/L,同时补加4·0mmol/L邻甲苯胺时,漆酶酶活提高到71·0u/L;而在补加Cu2+和邻甲苯胺的纤维二糖培养基中,酶活上升至2584u/L,为葡萄糖培养基的36·4倍。邻甲苯胺和铜离子诱导产生的漆酶同工酶组分,均为漆酶A(LacA)。竞争性RT_PCR分析表明,漆酶A基因(lacA)转录本的累积伴随有发酵液漆酶活性的增加,邻甲苯胺对lacA的调控发生在转录水平。lacA结构基因长2110bp,含有10个内含子;lacA的cDNA序列为1560bp,编码520aa的漆酶蛋白,其氨基酸序列与其它真菌漆酶具有较高的相似性。采用改进的反向PCR技术,扩增得到的lacA5′_端调控区长1881bp,分析表明,该区域上分布有1个TATA框、7个CAAT框和多个潜在的顺式作用元件序列位点,包括5个MRE元件、9个CreA结合位点、4个XRE元件、2个STRE元件和7个氮因子调控位点等。这些序列位点的存在部分地对应了菌株摇瓶发酵条件下lacA的表达规律。     

先天性与后天性大鼠白内障晶体中游离氨基酸含量变化的研究

用药和的诱发大鼠先天性白内障动物模型,检测了晶体中１８种游离氨基酸含量,并与大鼠硒性和半乳糖性白内障晶体中ＦＦＡ含量进行了比较,发现：仔一代和仔二代先天性白内障晶体中各ＦＡＡ含量接近,先天性白内障晶体内,酪氨酸和羟脯氨酸含量明显高于正常对照组（Ｐ＞０．０５）;谷氨酸、甘氨酸等９种ＦＡＡ明显低于硒性白内障（Ｐ＜０．０５）;而酪氨酸高于半乳糖性白内障组,半胱氨酸等５种ＦＡＡ含量均低于半乳糖性白内障组。     

几种氯苯对模拟氧化塘系统生物群落的影响

研究一氯苯,１,２,３－三氯苯及六氯苯对模拟氧化塘系统生物群落结构的影响及其净化机制。结果表明,在５．６０９５ｍｇ／ｌ的一氯苯,１．９２９２ｍｇ／ｌ的１,２,３－三氯苯及０．１３６３ｍｇ／ｌ的六氯苯实验条件下,系统中杆菌属、微球菌属及酵母菌属的种类、密度影响不明显;对浮游藻类的种、数量及叶绿素ａ的合成有明显地抑制作用,其影响大小的顺序为：六氯苯〉１,２,３－三氯苯〉一氯苯。在模拟氧化塘系统中,氯苯     

肠道菌群与腹型过敏性紫癜性肾炎病情严重程度的相关性研究

探究肠道菌群与腹型过敏性紫癜肾炎（HSPN）患儿病情严重程度的相关性。

选取2021年4月至2023年4月在本院收治的腹型过敏性紫癜（HSP）患儿115例作为研究对象,根据患儿是否并发肾炎将患儿分为HSP组（69例）与HSPN组（46例）,根据24 h尿蛋白定量结果,将HSPN患儿分为轻型HSPN组（29例）和重型HSPN组（17例）。选取同期在我院检查健康的115名儿童为对照组,比较各组的肠道菌群数量变化。

对照组、HSP组和HSPN组患儿24 h尿蛋白定量、血清尿素氮（BUN）、血肌酐（SCR）、血清尿酸（SUA）、白细胞计数（WBC）水平依次升高（P＜0.05）。重型HSPN组患儿24 h尿蛋白定量、BUN、SCR、SUA、尿红细胞计数（RBC）、WBC水平比轻型HSPN组患儿高（P＜0.05）。对照组、HSP组和HSPN组患儿双歧杆菌、乳酸杆菌水平逐渐降低（P＜0.05）,大肠杆菌、链球菌水平逐渐升高（P＜0.05）。重型HSPN组患儿双歧杆菌、乳酸杆菌水平比轻型HSPN组低（P＜0.05）,大肠杆菌、链球菌水平比轻型HSPN组高（P＜0.05）。治疗后HSPN患儿双歧杆菌、乳酸杆菌水平比治疗前低（P＜0.05）,大肠杆菌、链球菌水平比治疗前高（P＜0.05）。

随腹型HSPN患儿病情程度加重,肠道菌群失调程度加重,有益菌减少,致病菌增多。