多基因模型在肝细胞癌预后中的应用

利用较少分子信息预测肝细胞癌类型对患者的个性化治疗十分关键。探索已知的与肝细胞癌预后相关的信号通路,共发现41个关键基因。随后,运用机器学习的方法对其构建风险预测模型,并在4个肝细胞癌数据集上进行验证。结果显示,该模型能将肝细胞癌患者分成两个预后差异显著的类型:癌症基因图谱(The cancer genome atlas,TCGA)数据集交叉验证的平均log rank P值为0.03;其他测试数据集的log rank P 值分别为0.000 38、0.002 1和0.01。生物信息学分析显示肝细胞癌的预后与细胞周期等信号通路显著相关,并筛选出12个潜在的肝细胞癌分子标志物。研究结果表明,基于41个基因构建的肝细胞癌预后模型具有较好的稳健性和准确的风险预测能力。     

蛋白质序列中的关联规则发现及其应用

随着蛋白质序列-结构分析中使用的机器学习算法越来越复杂,其结果的解释和发现过程也随之复杂化,因此有必要寻找简单且理论上可靠的方法。通过引入原理简单、理论可靠、结果具有很强实际意义的关联规则发现算法,找到了蛋白质序列中数以万计的模式。结合实例演示了如何将这些模式应用于蛋白质序列分析中,如保守区域发现、二级结构预测等。同时根据这些结果构建了一个二级结构规则库和一种简单的二级结构预测算法,实验结果表明,约81%的二级结构可以由至少一条关联规则预测得到。     

低渗介质对影泡载体的影响

本文提供了利用低渗透析技术将生物大分子物质牛血清白蛋白、L-天门冬酰胺酶包封入人红细胞影泡制备载体的技术方法,并且比较了PBS、HEPES-EDTA两种缓冲系统制备的影泡载体的性能。发现以后一种缓冲系统制备的载体H-Gs无论在形态、包封率还是在稳定性等方面均比P-Gs有明显优点。为载体应用于实验研究提供了必要的参数。     

条件启动子pCTR4在隐球菌基因表达调控中的应用

目的通过条件启动子pCTR4的质粒构建以及其在新生隐球菌中的同源置换,研究其在隐球菌基因表达调控中的应用。方法应用套叠PCR,构建含报告基因NEO的铜离子抑制性启动子质粒pNEO/CTR4和启动子同源重组框,并利用基因枪将其转化入新生隐球菌感受态细胞,常规及实时定量PCR检测条件启动子对目的基因的转录调控效应。结果成功构建了质粒pNEO/CTR和隐球菌条件启动子重建菌株,条件启动子pCTR4对目的基因具有预期的转录诱导和抑制效果。结论新建铜离子抑制性启动子质粒pNEO/CTR4可以应用于对隐球菌目的基因表达水平的调控;隐球菌泛素编码基因UBI 1并非致死性关键基因。我们的研究为今后新生隐球菌泛素系统的分子致病机制研究奠定了基础。     

三亿年前的树木

不久前,苏联地质学家Г.А.契尔诺夫等在巴伦支海岸,发现了生活在三亿五千万年前晚泥盆世的树木化石。科学家们根据化石推断,这棵树直径约10厘米,高4—5米;没有叶和花,茎杆上有一些豆粒般的孢囊。孢囊内有可以随风飘撒的孢子。那时候的植物就是用孢子繁殖的。在巴伦支海岸卢多瓦特海角,契尔诺夫等人在一个重达150公斤的大岩石上,发现了非同寻常的树木的断面,它那纹理清晰的树干,和看去仿佛富有弹性的树枝,就象是一件精致的雕塑品一样。但这是大自然留给我们的三亿多年前的树木的遗体。科学家认为,这是在欧洲北部古老的沉积层中,第一次发现这样重要的植物遗迹。在此以前,科学界还     

用新月弯孢霉11β-羟基化16a-甲基化合物RS-21醋酸酯

对新月弯孢霉AS3．4381的菌丝体转化16a-甲基Reicbstein's 化合物S21-醋酸酯(I)生成16a-甲基氢化可的松(II)进行了研究。培养24h的菌丝体的11β-羟基化活性最高;乙醇对此羟基化活性的抑制作用明显。当(1)浓度为0.15％,转化72h,产物(II)的重量收率为55.4％。     

石油分散剂BP-1100X对海洋围隔生态系的影响研究

在分散剂作用下,围隔水体中浮游动物种群数量明显减少,浮游植物因捕食压力不大而诱发“赤潮”.分散的原油在围隔水体中的生态效应变得不明显,细菌生物量和生产力在实验前期比对照组高,后期则随原油降解而波动,这表明微生物积极参与了原油的降解活动。实验揭示,由于添加物的毒性作用促成的生态系的不平衡,也可最终导致“赤潮”发生。     

A环饱和甾体的微生物转化作用II.降解5a一△16一3β一羟基-孕甾烯-20-酮-3β-醋酸酯为△1,4-雄甾二烯-3，17一二酮

节杆菌9—2能彻底降解5a一△16一3β一羟基一孕甾烯一20一酮一3β一醋酸酯(I)形成二氧化碳和水。在它的培养基质中添加钴离子可抑制甾核的进一步降解,从而积累中间产物△1,4-雄甾二烯-3,17一二酮(VI),