DGGE技术在动物胃肠道微生物研究中的应用

变性梯度凝胶电泳(DGGE)是通过聚丙烯酰胺凝胶中变性剂浓度梯度的不同,将序列不同的DNA分开。目前,该技术已广泛应用于瘤胃微生物、肠道微生物等多样性研究。综述了变性梯度凝胶电泳技术的基本原理、优缺点及其在动物营养中的应用。     

壮族Y染色体分型及其内部遗传结构

壮族是中国最大的少数民族,与东南亚的泰老族群关系密切,在东亚人群的遗传结构研究中地位非常特殊。本研究调查了壮族各个支系的Y染色体多样性,通过主成分分析、聚类分析和分子方差分析,揭示壮族的内部父系遗传结构。结果发现,壮族的主要Y染色体单倍群为O%＊,O2a,O1。传统的对壮族按方言分为南北二组的分类方法在遗传上并没有依据,壮族支系体现出从东往西的梯度变化过程。这说明壮族的结构中有几个层次,最早的成分普遍出现在各个支系中,第二层是由东部来的百越核心成分,第三层是北方来的汉族成分。壮族内部遗传结构的分析将有助于对东亚人群的南来起源的研究。     

刚毛柽柳天然居群遗传多样性初探

柽柳是荒漠地区主要的灌木资源树种。以刚毛柽柳为代表,运用RAPD技术分析了广布于新疆境内9个刚毛柽柳(Tamarix hispida L．)天然居群的遗传多样性及居群间的遗传分化。10条随机引物检测到157个可重复的位点,其中多态位点155个,占总位点数的98．7％。由Shannon表型多样性指数和Nei基因多样性指数估计居群间遗传分化百分比分别为62．5％和55．30％,表明刚毛柽柳种内的遗传变异主要存在于居群间。根据以上结果,我们认为新疆境内刚毛柽柳天然居群的遗传多样性很丰富,居群间分化程度较高;繁育系统属于一种自交和不完全异交混合的交配类型;形成并维持其分布格局的主要因素是基因流的隔离。     

杂交早稻稻米品质的改良

本文是关于改良杂交早稻米质方面的研究报道．通过以美国品种和中国品种杂交,选育出米质优良的温敏型雄性不育系香１２５Ｓ,所配制的香１２５Ｓ／Ｄ６８是一个早熟、高产、优质杂交水稻．作者认为“优势组群”和“强光生态型”在杂交早稻稻米品质改良中是非常重要的两个方面．     

云南不同产地阳春砂内生真菌多样性分析及其活性研究

分析云南西双版纳和马关产阳春砂(Amomum villosum Lour.)内生真菌的分布、种群差异及其抗氧化、抗菌潜力,并为获取新型天然活性代谢产物提供资源。通过植物组织表面灭菌法分离纯化阳春砂内生真菌,利用ITS序列分析进行种属鉴定。同时用滤纸片法评价真菌发酵物对5株细菌的抑制作用,采用总还原力、DPPH自由基和羟基自由基清除法评价真菌发酵物的抗氧化活性。从两个产区阳春砂中共分离鉴定出77株内生真菌,其中西双版纳阳春砂中鉴定了39株,优势菌属为Penicillium、Colletotrichum、Xylaria、Daldinia和Diaporthe;马关阳春砂中鉴定了38株,优势菌属为Penicillium、Phanerochaete、Pyrenochaetopsis、Neopestalotiopsis和Cladosporium。马关阳春砂内生真菌的Shannon多样性指数、辛普森多样性指数和均匀度均高于西双版纳阳春砂,二者间的Jaccard相似性系数为0.222 2。抗菌结果显示菌株BSR 18、BSR 32、BSR 34和MSR 15具有较强活性;而抗氧化结果表明菌株BSR 1...     

快速评价肠道微生物的qPCR方法的建立

【背景】近些年,16S rRNA基因测序与宏基因组分析常用于肠道微生物病原体检测。【目的】为了使检测不受限于高成本与耗时长的问题,基于荧光探针的实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR, qPCR),建立一种评估人类肠道微生物群组成的平台用于检测肠道微生物丰度。【方法】从公共数据库筛选10种肠道中普遍存在的微生物分类群,使用20个粪便样本验证为10种靶标所设计的特异性引物与探针,最后通过比较qPCR方法和16SrRNA基因测序技术的检测结果来评估该平台的有效性。【结果】10对引物及其探针对靶标分类群具有特异性并且在HITdb数据库中靶向菌种的覆盖率超过70%;样本检测结果的变异系数(coefficient of variation,CV)小于10%,证明了该方法具有很高的稳定性;qPCR方法检测样本中物种的相对丰度与16S rRNA基因序列生物信息学分析结果大部分具有显著相关性(P<0.05)。【结论】本研究根据HITdb数据库设计的靶向微生物群的引物和探针检测到的粪便样本中微生物的相对丰度结果与16S rRNA基因测序结...     

B群链球菌Ia型多糖─破伤风类毒素结合菌苗对抗Ia、Ib型保护性抗体产生的刺激作用

Ｂ群链球菌Ｉａ型多糖─破伤风类毒素结合菌苗对抗Ｉａ、Ｉｂ型保护性抗体产生的刺激作用作者将Ｂ群链球菌（ＢＧＳ）Ｉａ型菌株的荚膜多糖侧链上的唾液酸氧化后,通过还原氨化反应,同破伤风类毒素（ＴＴ）结合,制备成含１２％蛋白、８８％多糖的Ｉａ－ＴＴ结合菌苗。分...     

干旱胁迫下外生菌根菌对山新杨幼苗生物量、渗透调节物质和抗氧化酶的影响

以山新杨(Populus davidiana×P. bolleana)幼苗为研究材料,分别接种褐环乳牛肝菌Suillu luteus和卷边桩菇Paxillusinvolutus2种外生菌根菌(ECMF),采用盆栽控水法,研究不同干旱胁迫对山新杨幼苗生长及抗旱性的影响。结果表明,山新杨幼苗接种2种ECMF,在正常水分和干旱下均能显著提高苗木的苗高、地径和叶片相对含水量;渗透调节物质可溶性糖、可溶性蛋白和游离脯氨酸的含量也显著高于未接菌的对照组(P<0.05)。接种2种ECMF对抗氧化酶,超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)的活性也有很大影响,在正常水分下降低了SOD和POD的活性,到轻度干旱时便提高三者活性,差异显著(P<0.05)。接种2种ECMF,在正常水分和干旱下均能显著降低H2O2和O2-·以及MDA的含量(P<0.05)。在试验过程中,接种S.luteus处理和接种P.involutus处理相比,不论是侵染率,还是后续对山新杨幼苗生长及抗旱性的提高,都展现出更加优秀的效果。研究表明,在干旱胁迫下,接种ECMF能够提高山新杨幼苗的...     

人体肠道菌群对二甲基亚砜的体外降解作用

目的 通过二甲基亚砜（DMSO）与肠道菌群相互作用机制的研究,为DMSO的降解及其在药物研究中的应用提供肠道菌群方面的理论依据。方法 采用分批发酵、气相色谱、气质联用和高通量测序技术研究DMSO的降解量与肠道菌群结构间的关系。结果 发酵液中主要检测到甲硫醚、二甲基砜、二甲基二硫醚及甲基硫代磺酸甲酯等DMSO相关代谢产物;与其他他汀相比,生理浓度氟伐他汀组菌群的DMSO降解效果最佳,可能与Proteobacteria及Solobacterium和Escherichia-Shigella等菌群的相对丰度增加有关。不同肠道菌群产二甲基硫醚（DMS）水平差异明显,DMS分解可能与硫代谢途径相关,涉及的微生物主要是Desulfovibrio。结论 人体肠道菌群可降解DMSO,其降解效率可能与Escherichia-Shigella的相对丰度有关,降解产物对人体肠道菌群结构无影响。     

中华菊头蝠不同组织基因组DNA甲基化分析

DNA甲基化在动物组织发育和分化等生物过程中发挥至关重要的作用.本研究采用荧光标记甲基化敏感扩增多态性(fluorescence-labeled methylation sensitive amplified polymorphism,F-MSAP)技术分析了中华菊头蝠(Rhinolophus sinicus)脑、心、...