胡萝卜素产生菌粘红酵母ZR－5的培养优化条件研究

本文报道胡萝卜素产生菌粘红酵母（Ｒｈｏｄｏｔｏｒｕｌａｇｌｕｔｉｎｉｓ）ＺＲ－５的培养优化条件。结果表明培养基组分、糖浓度、通气量、培养时间、培养基起始ｐＨ值等对该菌细胞生物量和胡萝卜素含量均有影响。在确定的优化条件下,细胞生物量为２７．７ｍｇ干重／ｍｌ培养基;胡萝卜素含量为３７５μｇ／ｇ干重细胞。     

生物医学数据分析中的深度学习方法应用

生物医学数据的积累速度史无前例,为生物医学研究带来机遇的同时,也让传统数据分析技术面临巨大挑战.本文综述了深度学习方法应用在生物医学数据分析中的最新研究进展.首先阐述了深度学习方法,列举深度学习方法的主要实现模型,随后总结了目前生物医学数据分析中的深度学习方法应用情况,分析了在数据处理、模型构建和训练方法等方面共有问题的解决方法,最后给出了深度学习方法应用于生物医学数据分析时可能存在的问题及建议.     

LINCS——面向转化医学的细胞反应大数据计划

正近十几年来,基因芯片、转录组测序、蛋白质组等技术的发展是极大地推动了生物医学研究的重要手段.通过基因和蛋白质表达谱分析可以发现疾病发生与发展的关键分子、辅助辨识诊断标志物和药物治疗靶标.然而,传统的组学分析主要关注显著差异表达基因,由于噪声的影响,差异表达分析往往带来较多的假阳性.近年来,基因表达谱关联图谱分析逐渐成为基因表达谱分析的另一重要途径.基因表达谱关联图     

利用长距离PCR扩增国内肠道病毒流行株基因组方法的建立和评价

目的:通过调查近年来我国肠道病毒EV-71型和柯萨奇病毒A16型流行株的全基因组序列,建立一种能够获得我国肠道病毒序列的通用扩增方法,为今后的手足口病流行病学分析、致病机理研究等打下基础。方法:收集我国近5年各地报道的肠道病毒流行株全基因组序列作为参考序列进行比对分析,在保守区设计通用引物,利用3'RACE、长距离PCR扩增及简并引物扩增肠道病毒全基因组序列,采用IonTorrentPGM二代测序仪对扩增产物进行深度测序,以对扩增方法进行验证和评价。结果:通过比对肠道病毒流行株序列设计了通用扩增引物,经二代测序实验获得了肠道病毒全基因组序列;以系列比例模拟混合病毒感染,该扩增方法能够同时获得2株肠道病毒的全基因组序列;能够完整地揭示肠道病毒重组情况。结论:建立了针对我国近年来肠道病毒流行株的通用全基因组扩增方法,在病毒培养液中肠道病毒的提取与扩增中显示了较高的灵敏度,能够反映混合病毒感染、重组病毒的情况。     

诺瓦克病毒ORF2的原核表达及其产物分析

诺瓦克病毒(Norovirus,NV)是1972年在美国首次发现的新生病毒,直到1995年国内才有报道.该病毒是严重危害人类健康的重要食源性病毒,可导致不同年龄阶段人群的急性病毒性腹泻.实验以提取临床NV阳性腹泻样本的基因组RNA为模板,采用RT-PCR方法扩增得到全长为1623 bp编码NV主要衣壳蛋白VP1的ORF2全基因序列.将测序结果进行进化分析,结果表明该病毒属于NV GⅡ.将ORF2亚克隆到原核表达载体pET-28a构建原核表达载体,鉴定后转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞.经IPTG诱导表达,获得大小约62 kD的融合蛋白并命名为rVP1.以纯化的rVP1免疫新西兰大白兔后制备高免血清,Western Blot结果表明,实验所获得的多克隆抗体可以特异性识别临床样本中NV VP1.因此,rVP1具有良好的免疫原性和反应原性.对小于rVP1的蛋白条带进行Western Blot分析,结果表明所有条带均为rVP1的部分蛋白.双向琼脂扩散试验结果显示实验所获得的高效价多克隆抗体与纯化的原核表达产物仅形成单一沉淀带.     

SPINDLY在壳寡糖诱导拟南芥抗丁香假单胞菌中的功能

为了探讨拟南芥O-岩藻糖基转移酶(SPINDLY)在病原体相关分子模式诱导抗性中的作用,该研究以SPINDLY缺失拟南芥突变体spy-3为实验材料,从叶片表型、病情指数、病菌定殖量以及丁香假单胞菌(Pst DC3000)关键基因的表达水平等指标,系统考察了SPINDLY在壳寡糖诱导拟南芥抗Pst DC3000中的功能。结果显示:(1)spy-3突变体比野生型更易被Pst DC3000侵染。(2)与病菌侵染组相比,壳寡糖预处理明显缓解植株叶片黄化现象,显著降低Pst DC3000的定殖量。(3)壳寡糖预处理的spy-3植株中水杨酸和茉莉酸途径相关基因的表达量及水杨酸和茉莉酸含量均较病菌侵染组明显升高。(4)壳寡糖在spy-3中的诱抗效果与野生型相比无明显差别。研究表明,SPINDLY在植物先天免疫过程发挥重要作用,但并不影响壳寡糖的诱导抗性。     

科尔沁沙地丘间地植被演变的研究

 主要研究了科尔沁沙地丘间地植被的发生和演变规律及不同发育时间群落种类组成动态特征。结果表明：丘间地植被发育很快,在围封条件下,30年内经历了一年生草本阶段、多年生草本阶段和灌丛阶段。在组成结构上,物种多样性指数和均匀度呈上升趋势,而生态优势度下降,表明其相对稳定的特征。同时就过度放牧对植被的影响进行了论述。     

生物分子开关研究进展

分子开关是建立在分子水平上的一个可逆过程,外界条件的改变能使分子的结构或构型会有一些改变,从而表现出一些特殊的性质.其在生物体内的信号传导和信息调控等方面发挥着重要作用,成为近年来国内外的一大研究热点.本文介绍了胚胎干细胞分化的重要分子开关:Oct-3/4、神经突起相关分子开关Rho族GTP酶、控制肌卫星细胞激活的分子开关转录因子RBP-J、慢性疼痛的分子开关蛋白激酶G(PKG)、脂肪控制分子开关Wnt蛋白、调节核糖体翻译功能的分子开关L11蛋白、控制饥饿的分子开关巨噬细胞因子MIC-1、调节人体生理节奏的分子开关BMAL1基因、癌症相关的分子开关Wnt蛋白家族以及糖尿病相关的活性开关蛋白TORC2等生物学领域调控功能分子开关的作用机理以及相关研究进展情况.     

花生肽对小鼠的抗疲劳作用研究

目的：探讨花生肽对ICR小鼠的抗疲劳作用。方法：采用SPF级雄性ICR小鼠80只按体重随机分为4组,分别为空白对照组、3个花生肽干预组（250、500、1 000 mg/kg BW］。每日经口灌胃给予受试样品水溶液,干预周期为30 d,干预结束后进行负重游泳试验,并对各组小鼠负重游泳力竭时间进行记录,同时对其血糖水平、血清尿素氮含量及乳酸脱氢酶活力进行测定,并检测各组小鼠血乳酸水平,检测各组小鼠肝、肌糖原含量,并测定小鼠血清生化指标,同时测定小鼠心肌、肝脏及腓肠肌氧化应激和脂质过氧化指标水平。结果：与空白对照组相比,花生肽可显著延长小鼠负重游泳力竭时间,并提高其乳酸脱氢酶活性,降低运动后小鼠血乳酸含量,加强肌糖原储备,提高心肌SOD活力。结论：花生肽具备一定的抗疲劳作用。     

水体中诺瓦克病毒RT-PCR检测研究

诺瓦克病毒是公认的食源性或水源性非细菌性胃肠炎的主要致病因子之一。建立诺瓦克病毒的RT-PCR检测方法,验证其特异性及灵敏度,并在实验室人工污染水样,进行模拟水样的检测,验证RT-PCR检测方法的实用性。所用引物为RNA多聚酶区的JV12/JV13,多次反复实验,均可产生327bp预期大小的特异条带,并通过杂交进一步证实了其特异性和正确性;在临床粪样中,可达到的最高检测限为50pg/mL。在共42份模拟样品的检测中,经过播毒、富集和浓缩,38份均可检出诺瓦克病毒。其中4份池塘水未检出。在模拟水样中的检测灵敏度为200pg/mL。实验中所建立的试验条件和体系可用于实际水样中诺瓦克病毒的筛选,对水质控制起到了很好的监控作用。