云南人群系统性红斑狼疮与TNF微卫星基因座关系的研究

位于MHC内的肿瘤坏死因子（tomor necrosis factor,TNF)基因区域有5个微卫星基因座a、b、c、d和e,本研究调查了中国云南汉族系统性红斑狼疮（systemic lupus erythematosus,SLE）与这几个微卫星基因座多态性的关系。本用荧光标记引物和半自动基因扫描方法对云南地区97例SLE患及79例健康对照的5个微卫星基因座进行了基因分型,结果发现,SLE患的TNFα1（P＝0.0206）,c2（P＝0.0000)等位基因频率较正常人显增高,而TNFα2(P=0.01630,c3(P=0.0065),c4(p=0.0012),d6(P=0.0448）等位基因频率则是正常对照较SLE患高。同时我们还发现在这5个微卫星基因座中,与白种人比较中国人出现了尚未发现的新等位基因。     

HPLC法同时测定江苏引种白芷中5个香豆素的含量

目的:建立高效液相色谱同时测定引种白芷中5种香豆素成分含量的方法,为筛选出适合江苏栽培的白芷种源提供依据.方法:采用Phenomenex Gemini C18(250 mm×4.60 mm,5μm)色谱柱;流动相为甲醇-水(70∶30),流速0.8 mL·min-1,柱温30℃;UV检测波长310 nm.结果:江苏引种的不同种质来源白芷中香豆素的含量差异明显.结论:该检测方法简单,准确,重现性好.江苏引种的川白芷生长量最大,且五种香豆素的总含量最高.     

便秘型肠易激综合征患者血清神经肽Y、P物质和5-羟色胺水平与焦虑抑郁的相关性

为探讨便秘型肠易激综合征(constipation-predominant irritable bowel syndrome, C-IBS)患者血清神经肽Y (neuropeptide Y, NPY)、P物质(substance P, SP)以及5-羟色胺(5-hydroxytryptamine, 5-HT)水平与焦虑抑郁的相关性,本研究选取确诊为C-IBS的患者35例,健康对照组35例,采用焦虑自评表(self-rating anxiety scale, SAS)和抑郁自评表(self-rating depression scale, SDS)评定C-IBS患者和健康对照组的焦虑和抑郁状况。酶联免疫吸附法(enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA)检测C-IBS患者和健康对照组血清NPY、SP以及5-羟色胺含量变化。结果表明,IBS-C中出现抑郁、焦虑或者无抑郁、焦虑的患者在各方面(性别,年龄以及病程)无统计学意义。与健康对照组相比,C-IBS组NPY和SP水平显著降低(t=7.96, p<0.01; t=5.63, p<0.01),5-HT则表现出显著性升高(t=8.06, p<0.001)。C-IBS组SAS和SDS评分结果与健康对照组相比有着显著性的升高(t=12.13, p<0.001; t=11.34, p<0.001)。C-IBS患者血清NPY与SAS和SDS评分均呈负相关(r=-0.62, p<0.001; r=-0.69, p<0.001)。C-IBS患者血清SP水平与SAS和SDS评分均呈负相关(r=-0.63, p<0.001; r=-0.57, p<0.001)。C-IBS患者血清5-HT与SAS和SDS评分均呈正相关(r=0.74, p<0.001; r=0.68, p<0.001)。本研究初步表明,C-IBS患者血清中NPY和SP水平降低,并与焦虑、抑郁评分呈负相关性,5-HT在C-IBS患者血清中升高,与焦虑、抑郁评分呈正相关性,NPY、SP以及5-HT可能在便秘型肠易激综合征出现焦虑、抑郁的过程中发挥重要作用。     

干旱区绿洲防护林网格局对农田蒸散量的影响——以新疆三工河流域绿洲为例

蒸散发作为干旱区农田最敏感的水分支出项,是绿洲生态系统中水量和能量平衡的关键组成部分,而防护林作为干旱区绿洲农田重要的生态屏障,对绿洲农田蒸散发过程有着不可忽视的影响。本研究以新疆天山北坡典型流域——三工河流域绿洲为例,研究农田防护林网分布格局对绿洲蒸散发的影响,结果表明:防护林不仅能够有效降低绿洲农田蒸散量,而且能够在一定程度上维持蒸散量在较低水平上的相对稳定;在防护林网的格局功能上,防护林网带斑比指数与农田蒸散量呈极显著负相关(P0.01),环度指数与农田蒸散量呈显著负相关(P0.05),而防护林网连接度指数与蒸散量的相关性不明显(P0.05),说明防护林网的分布密度和林网结构的成型程度对农田蒸散量具有明显的影响,而在网格基本成型的防护林网络中其连通性对蒸散量的影响不明显。在景观水平上,研究防护林网格局对蒸散量的影响,对于农田防护林网的规划管理具有一定的参考价值。     

机器学习在微生物组宿主表型预测中的应用

随着大数据时代的到来,如何将生物组学海量数据转化为易理解及可视化的知识是当前生物信息学面临的重要挑战之一.为了处理复杂、高维的微生物组数据,目前机器学习算法已被应用于人体微生物组研究,以揭示疾病背后的复杂机制.本文首先简述了微生物组数据处理方法及常用的机器学习算法,如支持向量机(SVM)、随机森林(RF)和人工神经网络...     

氮磷营养盐添加对二甲基巯基丙酸内盐合成与降解细菌及其功能基因的影响

【目的】二甲基巯基丙酸内盐(dimethylsulfoniopropionate,DMSP)是海洋中主要的有机硫化物之一,是海洋细菌硫的主要来源,海洋细菌将其分解成"冷室气体"二甲基硫(dimethylsulfide,DMS),对调节全球气候变化和驱动地球硫循环有重要作用。本研究通过中国东海水体的现场围隔实验模拟海水富营养化对DMSP、DMS产量以及DMSP合成基因(dsyB和mmtN)和降解基因(dddP和dmdA)及相关功能细菌的影响。【方法】通过流式细胞仪计数92个围隔海水样品中微微型浮游生物的数量,采用Illumina MiSeq测序技术对海水样品中细菌的16S rRNA基因进行高通量测序,利用荧光定量PCR技术定量测定16S rRNA基因、DMSP合成及降解基因的丰度。【结果】研究发现,同时添加硝酸盐(6.00μmol/L)和磷酸盐(0.375μmol/L)能促进叶绿素a、DMSP、DMS的浓度上升。对于DMSP合成基因,只加磷酸盐能促进dsyB及Phaeobacter等相应物种的富集,虽然同时添加硝酸盐和磷酸盐使dsyB富集,但相对只加磷酸盐却不利于dsyB积累;同时添加硝酸盐和磷酸盐也抑制Alteromonas的生长,进而抑制了mmtN的富集。对于DMSP降解基因,同时加入硝酸盐和磷酸盐促进了dddP及Thalassococcus、Thalassobius、Loktanella和Shimia等物种的富集,却抑制了SAR11、Sulfitobacter等的富集,从而导致dmdA无法被富集。【结论】氮限制能更好地促进DMSP合成基因的表达,从而迫使细菌增加DMSP的合成以应对氮营养条件不足的生存环境,并进而提高DMSP脱甲基化的比例为细菌提供更多能量;而在硝酸盐和磷酸盐充足情况下,细菌相对减少DMSP的合成且更倾向于裂解DMSP产生DMS来降低硫同化的比例。本研究结果强调了海水富营养化对细菌合成与降解DMSP过程的影响。     

繁缕属植物化学成分研究进展

繁缕属植物主要含有环肽、黄酮、甾醇、挥发油等化学成分。由于其明确的抗茵、抗病毒及抗肿瘤活性近年来日益受到研究人员的重视。     

地表反照率不同计算方法对干旱区流域蒸散反演结果的影响——以新疆三工河流域为例

地表蒸散是维持地球表面水量平衡和热量平衡的重要环节,SEBAL模型作为一种快速且有效的反演地表蒸散的遥感物理模型方法,在地表蒸散研究中得到广泛应用。地表反照率作为影响地表能量平衡的重要因素,同时也是SEBAL模型的重要输入参数,因此不同的地表反照率计算方法对SEBAL模型的反演结果有重要影响。以新疆三工河流域为研究区,利用Landsat8 OLI/TIRS数据,以应用最为广泛的Smith地表反照率计算法和Liang地表反照率计算法两种方法计算地表反照率,并输入SEBAL模型中反演日蒸散量,比较分析两种地表反照率计算方法对蒸散反演结果的影响,得出以下结论:(1)两种地表反照率计算方法下经SEBAL模型得到的日蒸散量与实测值拟合程度均较高,不同年份下线性拟合决定系数大于0.75,但是使用Smith方法计算出的地表反照率结合SEBAL模型得到的日蒸散量与实测值拟合程度更高;(2)通过RMSE等精度指标比较两种地表反照率计算方法下基于SEBAL模型反演的日蒸散量,结果显示,Smith地表反照率计算方法下反演的日蒸散量精度略高;(3)Smith地表反照率计算方法下最终得到的区域日均蒸散量高于使用Liang地表反照率计算方法最终得到的区域日均蒸散量,夏季差异最大,差异为0.64 mm/d,其他季节差异较小,差异约为0.2 mm/d。(4)进一步比较研究日内两种地表反照率计算方法得到的地表反照率,结果显示,Smith地表反照率计算法得到的地表反照率均值均小于同时期Liang地表反照率计算法得到的地表反照率均值。     

木槿属植物海滨木槿的研究进展

近几十年来,从木槿属植物中分离得到多种化合物,如木脂素、黄酮、萜类、mansonones类等化合物类型。文章重点介绍了木槿属及该属植物海滨木槿的研究进展,有助于对该属植物海滨木槿的进一步开发与研究。     

应用30个常染色体STR位点研究中国6个民族群体的遗传关系

利用30个荧光标记的人类常染色体STR位点的引物,对中国白族,纳西 族,土族,撒拉族,山东汉族,畲族6个民族进行了多重PCR扩增,产物在ABI377测序仪上进行变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和基因扫描及分型,然后用Shriver的Dsw法计算遗传距离,用Neighbor-Joining法和UPGMA法构建了系统发生树,结合有关资料分析了它们之间的遗传关系,结果揭示：撒拉族与土族的遗传距离较接近,为0．033,但与其余4个民族的距离则较远,均大于0．12,土族与纳西族和山东汉族的距离较近,与土壤的距离也较远,为0．112,纳西族和山东汉族之间存在着0．100的遗传距离,畲放与其他5个民族群体的距离均超过了0．12,关系较远,在构建的系统发生树中,纳西族,撒拉族和土族聚成一簇,汉族,白族聚成一簇,畲族单独为一枝,这一结果与它们的地理分布和民族历史基本上是一致的,并可为结合历史和考古资料综合分析这6个民族的起源,迁移,形成和发展提供遗传学依据。