基于动态规划的快速序列比对算法

序列比对算法是生物信息学中重要的研究方向之一,而动态规划法是序列比对算法中最有效最基本的方法．由于原有的基本动态规划方法时间和空间复杂度大,不适合实际的生物序列比对,因此本文在分析介绍几种相关动态规划算法的基础上,提出了一种基于动态规划的快速序列比对算法UKK_FA．实验结果表明,该算法有效地降低了时间复杂度,具有一定的实用性。     

英国《科学》教材中的非仪器支持生物学实验例析

英国《科学》教材中的非仪器支持生物学实验取材于生活,不依赖固定仪器,实验成本低,实验过程简便易行,具有广泛的适用性,而且源于生活的设计思路能充分培养学生学习生物学的兴趣,同时也为我国《科学》教材的实验编排提供了启示与借鉴。归纳了英国《科学》教材中几类典型的非仪器支持生物学实验．即趣味游戏型、模型制作型、手工操作型、开放性实验型、自主设计型,并辅以具体的实验案例对不同类型实验的特点及优势进行深入剖析。     

冬季不同刈割水芹浮床连续净化过程及效果

在冬季利用不同刈割处理的水芹浮床做连续两个周期的水质净化试验研究.结果表明:浮床系统能够维持水体为偏弱酸性环境;总磷的去除率在58％以上,前4天去除量占总磷去除量的80％以上,到第8天时,总磷浓度基本达到稳定,到2个周期试验结束,总磷浓度分别为0.366和0.215 mg· L-1;铵态氮的去除率在90％以上,前4天的去除量占总去除量的70％以上,2个周期试验结束时,铵态氮浓度分别为0.455和0.522 mg·L-1;硝态氮由于初始浓度不同,去除率差异比较大,2个周期试验结束时,硝态氮浓度分别为0.262和0.289 mg·L-1;与空白对照相比,浮床系统能够在较短的时间内快速去除富营养化物质,但到试验结束时浮床与空白对照在营养元素去除方面几乎没有差异;不同刈割处理的水芹浮床在水体净化效果方面没有显著差异, 在实际应用中可以不考虑刈割处理的影响.     

影响北京南海子半散放麋鹿新生幼仔存活原因探讨

1999～2006年北京南海子麋鹿苑出生麋鹿幼仔224只,新生麋鹿幼仔存活率81.70%,死亡率18.30%.41只麋鹿幼仔死亡的主要原因为死胎、弱胎和弃子等.分析仔鹿初生体重与仔鹿死亡关系发现,存活仔鹿与死亡仔鹿的初生体重具有极显著性差异,体重大的幼仔更容易存活,事实上初生体重小于6.00 kg时仔鹿基本不能存活.北...     

罗格列酮对2型糖尿病合并急性冠脉综合征患者血清TGF-β1及IL-1β 的影响

目的:观察罗格列酮对2型糖尿病合并急性冠脉综合征患者血清转化生长因子-β1(TGF-β1)及白细胞介素-1β(IL-1β)的影响。方法:116例2型糖尿病合并急性冠脉综合征患者,随机分为罗格列酮治疗组(n=58)和常规治疗组(n=58)。检测两组患者治疗前后空腹血糖、血脂及血清TGF-β1、IL-1β的变化。结果:治疗前两组患者空腹血糖、血脂及血清TGF-β1、IL-1β的水平无显著差异(P>0.05);治疗4月后,两组患者空腹血糖、血脂无显著差异,血清IL-1β较治疗前下降(P<0.01),罗格列酮组较常规治疗组下降明显,两组间差异显著(P<0.05);治疗后血清TGF-β1较治疗前上升(P<0.05),罗格列酮组与常规治疗组比较,差异显著(P<0.05)。结论:罗格列酮能调控糖尿病合并急性冠脉综合征患者炎症介质和抗炎因子的分泌,可能具有改善动脉粥样硬化的作用。     

乳腺癌组织CCNA1 启动子区甲基化与肿瘤转移的相关性

目的:探讨CCNA1基因甲基化在乳腺癌发生发展中的作用。方法:采用Qiagen-FFPE的步骤提取95例石蜡包埋乳腺癌组织的基因组DNA,应用限制性酶切-PCR对所提DNA进行CCNA1甲基化检测。结果:乳腺癌组织中CCNA1基因启动子甲基化的阳性率为90.9%(86/95)。结论:CCNA1基因甲基化参与乳腺癌的发生,发展,有淋巴结转移多见的特征,CCNA1基因甲基化与乳腺癌转移由关。     

Mini-CEX 在住院医师培养中的应用现状

住院医师培养制度现已逐步在中国各城市开始实施,住院医师培养最主要的目标是培养临床能力合格的医师。对住院医师临床能力的评估,最好的方式应该是在临床的实践工作中的给予评估。Mini-CEX(Mini-Clinical Evaluation Exercise)是在传统的CEX基础上,发展出的一套用来评估住院医师临床技能并具有教学功能的测评工具,包括观察和评价住院医师的知识、技能、态度和主治医师的适时反馈。Mini-CEX为一种迷你型的多次重点式评估,在门诊、急诊或住院等临床例行工作中均可以开展,具备相当可靠的信效度和极好的便利性。Mini-CEX具有一个参与双方的信息及时反馈。应用Mini-CEX能增强评估的科学性,并能促进学习和培训。Mini-CEX作为目前医学教育体系中应用最广泛的一种评估手段之一,受到了国内外医学教育工作者的关注,并开始逐渐引入我国。Mini-CEX将在中国住院医师培养制度中发挥非常重要的作用。     

56例创伤性休克患者的救治体会

目的 探讨创伤性休克的救治措施,最大限度提高创伤性休克患者的存活率.方法 回顾性分析2005年1月~2011年12月我院收治的56例创伤性休克患者的抢救过程.结果 抢救成功53例,成功率为94.6%;死亡3例,死亡率为5.4%.结论 创伤性休克病情迅猛,院前进行适当救护措施结合院内早期快速合理的抗休克治疗是创伤性休克的救治关键.     

铁皮石斛M型硫氧还蛋白基因的分子特征

利用RT-PCR和RACE技术,从珍稀濒危兰科药用植物铁皮石斛中分离到1个编码M型硫氧还蛋白(TRX)基因cDNA全长,命名为Do TRXm1(GenBank注册号KC178573).序列分析结果表明,DoTRXm1基因长850 bp,ORF(570 bp)编码1条由189个氨基酸组成的肽链,分子量20.32 kD,等电点9.44;DoTRXm1蛋白具有保守的硫氧还蛋白结构域(第87～187位氨基酸)和催化位点(106～124).多序列比对和系统进化分析结果显示,DoTRXm1与植物M型TRXs基因有较高相似性(53％～70％),与水稻、玉米以及高梁等单子叶植物TRXs聚在1个分支,隶属于M型TRXs基因进化系统的Ⅱ类群.实时定量PCR分析显示,DoTRXm1基因为组成型表达,其转录本在石斛根中的相对表达量较高,为叶中的5.63倍,茎中次之(2.35倍),叶中最低.该研究为进一步解析DoTRXml在铁皮石斛生长发育、逆境胁迫等过程中的生物学功能奠定基础.     

外源水杨酸对酸雨胁迫后龙眼幼苗生理特性恢复的影响

以龙眼幼苗为材料,研究酸雨胁迫(pH 3.0)后不同浓度外源水杨酸(0、0.1、0.5、1.0和2.0 mmol·L-1)对龙眼幼苗生理特性的影响.结果表明:酸雨胁迫后龙眼幼苗叶片中的超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)活性降低,叶绿素、蛋白质和可溶性糖含量下降,丙二醛含量升高,龙眼幼苗显示出毒害效应.0.1 ～1.0mmol·L-1外源水杨酸显著提高龙眼幼苗叶绿素、可溶性糖和蛋白质的含量,增强SOD、POD和CAT活性,降低丙二醛含量,减少幼苗所受氧化伤害的程度;其中0.5 mmol· L-1水杨酸处理效果最好,叶绿素、可溶性糖和蛋白质的含量分别比单独酸雨胁迫处理植株增加了62％、105％和177％,SOD、POD和CAT活性分别提高144％、440％和132％,丙二醛含量降低了35％;而2.0 mmol·L-1水杨酸却起到相反的作用.可见,低浓度水杨酸(0.1～1.0 mmol·L-1)能通过刺激龙眼抗氧化酶活性,减轻氧化胁迫,缓解酸雨胁迫后的毒害作用,而高浓度水杨酸(2.0 mmol·L-1)对龙眼幼苗的缓解作用下降.