焦磷酸测序测定SNP的常见问题与解决方法

目的：探讨焦磷酸测序技术对单核苷酸多态性分型因测序图谱中存在的一些典型问题而导致分型结果不准确的解决方法。方法：以VKORC1基因1639 G〉A位点、CYP2C19基因636 G〉A位点及UGT1A1基因TA重复序列（TA）6〉（TA）7的多态性检测为例,分别采用优化PCR条件、改变测序时dNTP的加入顺序以及设立外标校正的方法来解决上述问题,从而提高焦测序对SNP分型的准确性。结果：通过升高PCR退火温度,可以显著提高VKORC1基因的扩增特异性,降低了测序图谱中非特异性信号峰强度;通过优化测序时dNTP的加入顺序,CYP2C19基因636 G〉A位点的准确分型结果可通过观察测序图谱中相关信号峰的有无而简单获得,避免了比较信号峰的相对强度;通过比较待测样本与已知基因型的外标样本的测序图谱来确定待测样本的基因型,提高了对UGT1A1基因TA重复序列（TA）6〉（TA）7多态性的分型准确性。结论：本文针对焦测序在测定SNP时的常见问题所提出的相应解决方法不仅简单、经济有效,而且在临床应用方面具有可靠性。     

三峡水库消落区植被在差异性水淹环境中的分布格局

人工水库修建引发的差异性水文节律是决定消落区植被群落格局的主要因素,高强度水淹环境中水淹胁迫是影响植被的重要因子而低强度水淹环境中物种竞争是影响植被的重要因子。为了探究差异性水淹环境中三峡水库消落区植物的水淹耐受能力及光资源竞争能力(植物株高)对植被群落分布格局的影响,对三峡水库典型消落区不同水淹强度下生长的植被进行了研究,结果表明:(1)典型消落区调查共发现有植物41种,其中高耐淹低竞争能力型植物4种,其生物量在所有物种生物量中的占比达70.99%,低耐淹高竞争能力型植物23种,其生物量占比为28.02%,低耐淹低竞争能力型植物14种,生物量占比不足1%,消落区内无高耐淹高竞争能力型植物物种分布;(2)高耐淹低竞争能力型植物在水淹强度大的消落区区域占优,低耐淹高竞争能力型植物在植物物种竞争压力大的消落区区域占据主导,低耐淹低竞争能力型植物在消落区中仅有零星分布;(3)消落区植被生物量格局随着高程增加呈现出先增加后减少的趋势。研究差异性水淹环境对三峡水库消落区植被分布的影响,可以为深入理解消落区植被分布格局的形成机制和大型水库消落区植被恢复与重建提供理论依据。     

古大湖湿地盐碱土壤微生物群落结构及多样性分析

以黑龙江省古大湖湿地原生、林地、耕地及湖岸盐碱土壤微生物为研究对象,基于高通量测序方法,分析4种生境类型条件下土壤细菌和真菌群落结构及多样性。结合土壤理化指标,进一步分析影响微生物群落多样性的环境因子。结果表明:细菌群落中变形菌门的相对丰度值最高,真菌群落中为子囊菌门。同一生境细菌群落多样性具有相似性,而真菌具有一定的差异;不同生境间两者均具有差异。耕地土壤和林地土壤的细菌群落多样性接近,但与湖岸土壤真菌的更相近。前两者中细菌群落多样性较高,其次为原生土壤,而湖岸土壤中的最低。耕地土壤与湖岸土壤真菌群落多样性较高,原生土壤较低,而林地土壤中最低。与真菌相比,细菌的群落多样性受土壤环境因子影响更大,其中pH值、含水量对土壤细菌和真菌群落多样性均具有显著影响。     

环介导等温扩增技术改进的研究进展

环介导等温扩增法(LAMP)是近年发展起来的新型核酸检测技术,因其检测特异性好、灵敏度高、时间短、无需热循环设备而在病原体检测中得到广泛应用。基于该技术进行的改造和改良也层出不穷,本文从该技术的方法改造、缩短反应时间和简化模板预处理、多重扩增产物分析、防止假阳性污染四个方面对近几年LAMP技术的发展进行综述,为今后以该技术平台为基础的创新和应用提供理论依据。     

破囊壶菌利用工农业废弃物生产脂肪酸的研究进展

破囊壶菌因具有高产脂肪酸的特性而受到广泛关注,然而传统的培养方式需要的原料成本很高,很大程度上阻碍了破囊壶菌的工业化进程,因此,寻找可被破囊壶菌高效利用、来源广泛并且廉价易得的生产原料成为该领域的研究重点。本文以破囊壶菌及其生产脂肪酸为切入点,综述了近年来破囊壶菌利用工农业废弃物生产脂肪酸的研究现状,总结并提出了其发展前景,以期对今后的研究有所启发。     

湖泥施肥的研究 Ⅰ.通过湖泥矿化进行水体施肥

一、绪言1958年9月—1959年9月在湖北黄石市北郊花马湖(鄂城县境)进行湖泥施肥试验,在室内、室外先后试验了35次,历时343天,在党的正确领导和全体工作人员的积极努力下,利用湖泥施肥的方法获得了成功。湖泊底泥里面,有腐烂的水草碎片、浮游植物及水生动物的尸体残骸等淤积;加之,由于雨水将地面冲下来的表层富有机质肥土也沉积于底部,因此,一般湖泊的底泥都很肥,常厚达0.5—1.0米以上;pH 值介于5.2—7.0间;无机酸度(以甲基橙作指示剂)为零,总酸度(以酚酞作指示剂)介于0.16—0.46毫克当量(NaOH)/升间,主要是由于淤泥中有机物质分解过程中所产生的弱酸(有机酸)所致。通常1,000斤干湖泥中含氮4—5斤,磷     

长期和短期限制性束缚对小鼠造血干细胞的不同影响

慢性心理应激会导致机体多种功能紊乱,其中包括免疫力下降。慢性心理应激能够负调节免疫系统,但机制尚未完全阐明。免疫细胞,包括髓系来源细胞,由骨髓造血干细胞(hematopoietic stem cell, HSC)分化而来,在机体免疫中发挥重要作用。本实验采用短期高强度束缚和长期温和束缚慢性心理应激小鼠模型,探讨不同限制性束缚模式对小鼠骨髓HSC和髓系来源细胞的影响。长期温和束缚模型中,对小鼠连续束缚4周,每天束缚2次,每次束缚2 h (9:00到17:00间完成);短期高强度束缚模型中,小鼠连续束缚5天,每天束缚16 h (当日17:00到次日9:00)。束缚完成后,取小鼠骨髓和外周血进行白细胞计数,流式细胞术检测小鼠骨髓HSC (Lin^-CD117^+Sca1^+CD150^+CD48^-)和髓系细胞(CD11b^+Ly6C^+)的比例和绝对数,以及外周血髓系细胞的比例和绝对数,BrdU掺入实验检测小鼠HSC增殖能力。实验结果表明,长期温和应激导致小鼠骨髓HSC的比例和绝对数增加,而短期高强度应激导致小鼠骨髓HSC的绝对数下降,伴有HSC的增殖下降。两种束缚模式都使小鼠骨髓和外周血CD11b^+Ly6C^+细胞的总数增加或呈现增加的趋势。综上所述,长期温和应激和短期高强度应激对小鼠HSC的比例和绝对数影响不同;两种应激模型都可以使CD11b^+Ly6C^+细胞总数增加,HSC增多可能并不是CD11b^+Ly6C^+细胞增多的主要机制。     

屎克螂成虫的周年活动及诱捕观察

<正> 屎克螂属鞘翅目金龟子科,药用名称蜣螂虫,科学名称神农洁蜣螂Catharsius molossusL.。俗称推屎虫、钻屎虫、喷屎螂,是重要的虫药之一。具有破结、通便、定惊痫、去毒生肌、散肿止痛之功效。但随着农村环境卫生条件的改善,野生资源日趋减少。然而,医药的需求却日益增加,供需矛盾突出。为了解该虫的活动规律及为人工诱捕提供依据,我们于1988～1989年对该虫进行了观察研究,现将初步结果整理如下。