海洋微生物宏基因组工程进展与展望

据初步统计,生活于海洋环境包括大洋深处的微生物有100万种以上,构成了一个动态的遗传基因库,其中绝大多数微生物或者从来没有经过实验室培养,或者至今无法培养,因而其分类地位及其生态学功能尚未为人类所认识。随着16S rRNA序列分析与系统分类学的广泛应用,海洋微生物多样性研究领域已经发生了很可观的改变,这些变化极大的丰富了人们对的微生物多样性及其生态功能的认识和理解。这里结合笔者近十年来的工作实践,讨论近年来在海洋微生物资源开发利用方面的研究进展,提出一个带有自动化特征的宏基因组功能表达平台,探讨海洋微生物资源利用的新途径。可以预见在不久的将来,海洋环境宏基因组工程研究将在一定程度上使得传统未培养海洋微生物基因资源及其功能产物能够为人类所开发和利用。     

根结线虫放线菌及其生物防治活性研究

从感染植物根部的根结线虫卵和雌虫中,分离得到放线菌20株。形态、细胞壁氨基酸组分和16S rRNA基因序列分析表明:分离菌株分属于链霉菌属(Streptomyces)、诺卡氏菌属(Nocardia)和假诺卡氏菌属(Pseudonocardia),其中链霉菌占80.0%。分离菌株对根结线虫Meloidogynespp.卵的平均寄生率、卵的孵化率、幼虫死亡率分别为54.1%、40.4%和26.2%。根据体外测试的结果,选择具有高致病力的3株链霉菌(1-17,2-6,9-47)和1株诺卡氏菌(5-1)进行温室番茄防效测试,其生防效率分别为31.4%、37.7%、56.4%和42.4%。     

应用分散和差速离心法分离嗜酸和耐酸链霉菌的试验及评价*

新的微生物资源的开发离不开菌种分离技术的改进和分离效率的提高。我们采用一种新的分离方法——分散和差速离心法(Dispersion and Differential Centrifugation,DDC),以传统的振荡法做对照,对12份酸性土壤样品进行了链霉菌的分离。结果表明DDC方法的分离效率是传统方法的2—20倍,且选择性好。用DDC方法共分离出链霉菌249株,归属于12个颜色类群,其中的45株代表菌株的形态和细胞壁类型均符合链霉菌的特征,最适生长pH均为4．5—5．5。结果表明应用DDC方法分离非常见的嗜酸和耐酸链霉菌是可行的。