移植和钾肥对降香黄檀光合特性与叶绿素含量的影响

以降香黄檀(Dalbergia odorifera T. Chen)为材料,分析不同移植方式和外施钾肥等培育措施对其光合参数和叶绿素(Chl)含量的影响。结果显示,断根处理后植物的最大净光合速率(Pnmax)比去冠、全冠移、对照(CK)和去冠移4种处理方式分别提高了19.25%、34.79%、40.88%和219.86%。光合参数分析结果显示,光饱和点(LSP)最高的为去冠处理,光补偿点(LCP)最高的为断根处理。断根处理后植物的净光合速率(Pn)和蒸腾速率(Tr)最大。断根、去冠、全冠移3种处理的Chla、Chlb、Chl(a+b)含量及胡萝卜素均高于CK,且断根处理后上述各指标达到最高值。外施钾肥处理中,降香黄檀最大净光合速率随钾肥用量的增加而增加,K2处理下的LSP值最大。随着钾肥施用量的增加,植物叶片的Pn、气孔导度呈上升的趋势,且植株的Chla、Chlb和Chl(a+b)含量均随钾肥用量的增加而增加,CK处理下Chla/Chlb比值显著高于K1、K2处理。研究结果表明断根、去冠、施用钾肥等处理均可显著提升降香黄檀叶片的叶绿素含量,有利于植株进行光合作用,促进生长发育。     

用比较聚类法寻找转录因子的结合位点

将动态序列比较和自动聚类算法相结合,对９２个ｍＲＮＡ的转录调控区域的所有８元碱基片段进行了分析,得到了５２个聚类中心,并与已知的转录因子结合位点相比较,结果表明,用本方法寻找蛋白质基因调控区的转录因子结合位点是简单可行的。     

基于从头算的缬氨酸两性离子和水分子的相互作用势

本工作分两个阶段,第一阶段用从头算方法计算纳氨酸两性离子同处于160种不同位置的水分子的相互作用能,计算时采用最小基组并进行了基组重叠修正,最后还对计算得的相互作用能用Slater-Kirwood公式作色散能修正.第二阶段是势函数拟合的工作,做法是舍弃12个相互作用能大于5Kcal/mole或原子间距离小于1.68(?)的布点,对其余148个布点进行拟合.拟合结果的标准偏差为SD=0.48Kcal/mole.     

真核生物DNA非编码区的组分分析

在全基因组水平上,用直方图、混沌表示灰度图、距离差异度和信息熵差异度四种方法,研究了拟南芥、线虫、果蝇的DNA内含子、基因间隔区DNA、外显子三种区域的核苷酸短序列组分及组分复杂度.结果表明：a.不同基因组之间,不管基因数目多少,用4种方法得到的外显子部分其组分复杂度都比较接近,而非编码区部分的组分复杂度却很大.这一点定量地说明了物种之间的复杂程度,主要不体现在编码区部分,而体现在非编码区部分.b.同一基因组中,内含子的核苷酸短序列组分复杂度都是相似的,外显子和intergenic DNA部分的组分复杂度也是相似的.c.内含子和intergenic DNA在转录、剪切、二级结构等方面有很大的不同,但它们在核苷酸短序列组分上的差异却很小,说明内含子和intergenic DNA在转录、剪切、二级结构上的不同并不通过核苷酸短序列组分来进行限制.     

胰凝乳蛋白酶原激活过程的分子动力学研究

本文报道了我们使用分子动力学方法模拟胰凝乳蛋白酶原激活过程的研究.使用我们所提出的虚拟势法,通过对不加虚拟势和加大小不等的虚拟势的几种情形的模拟和比较,对于激活过程可能具有的时间尺度以及过程中势垒的位置及性质都给出了一定的信息,这是只用普通(?)分子动力学方法不易达到的.     

土壤含水量对旱季降香黄檀树干呼吸和非结构性碳水化合物的影响

为研究土壤含水量对旱季树体水势、树干呼吸和边材非结构性碳水化合物(NSCs)变化特征的影响,设置重度隔水(HD)、轻度隔水(LD)、旱季灌溉(DI)和对照(CK)4个土壤含水量水平,每隔半月监测各参数的动态变化。旱季土壤含水量和枝条水势呈下降趋势,各处理从11月底开始表现出显著差异。各处理树干呼吸与树干温度均具有良好的指数函数关系(R2≥0.65,P0.001),各处理温度敏感系数Q10为DICKLDHD(P0.001)。旱季树干温度和树干呼吸均呈下降趋势,且在1月达到最低。各处理树干温度只在气温较低的冬季达差异显著,树干呼吸总体表现为旱季灌溉增加树干呼吸,而干旱降低树干呼吸。旱季淀粉含量下降,可溶性糖含量上升,非结构性碳水化合物总量总体保持不变。各处理边材淀粉和可溶性糖差异显著,而NSCs总量差异不显著。相比于DI和CK,干旱(LD和HD)加速了旱季边材淀粉分解为可溶性糖的速率。树干呼吸与淀粉、可溶性糖均具有显著回归关系,树干呼吸分别解释了淀粉72%和可溶性49%的旱季变化;枝条水势解释了49%树干呼吸、75%淀粉和85%可溶性糖的旱季变化。土壤含水量很可能通过改变树体组织含水量,进而影响边材NSCs和树干呼吸。这些变量之间紧密的联系可能为干旱可以促进降香黄檀心材形成的猜想提供一定的理论基础。另外,基于树干呼吸与树体水势和NSCs的显著关系,树干呼吸可能也会对树木心材形成有一定指示作用。     

比较互洽场水模型与部分真实水模型对蛋白质能带结构的影响

本文以多聚α-甘氨酸为例,通过Monte Carlo(MC)模拟得到相应的水溶液结构.然后再使用:1.互洽场点电荷(MCF)水模型;2.部分互洽场点电荷与最近程真实水的混合模型,得到两个多聚α-甘氨酸的水壳模型结构,进而使用从头计算的晶体轨道法(ab initio CO)研究这两个水壳模型对多聚α-甘氨酸能带结构的影响,用以分析互洽场方法的可靠性.研究结果表明两个模型所导致的多聚α-甘氨酸的禁带宽度、价带宽度和导带宽度上的最大差异仅为0.04电子伏(约为0.9千卡/克分子).这说明互洽场方法在研究环境对蛋白质能带结构影响时是相当精确的.     

Fisher线性判别函数在基于COGs分类的基因组间距离研究中的应用

利用全基因组信息构建系统发育树.基于COGs类,对每一个基因组的每一个基因,都用一个17维的向量来描述其编码蛋白隶属于17个COGs类的程度;而与一个基因组的所有基因相对应的那些矢量就组成一个集合.接着,利用Fisher线性判别函数,寻找一组最优化的权重因子;在此基础上利用Fisher线性变换将上述各集合中每一个矢量进行线性变换.使得经Fisher线性变换后17个COGs类对基因组进化的重要程度得到更准确的反映.最后,用进行变换后的矢量组成的集合间的距离代替基因组之间的距离.使用这种方法,分别用38个和43个基因组做的进化树都支持了Woese的三界理论.该方法克服了其他基于全基因组信息构建系统发育树方法难以对大小相差很大的基因组进行比较的问题,并能减少基因横向迁移对基因组间距离的扭曲.     

施肥对降香黄檀营养生长和生殖生长的影响

研究施肥对降香黄檀（Dalbergia odorifera T.Chen.）营养生长和生殖生长的影响,为不同经营目标的降香黄檀人工林培育提供技术支撑。本研究以8年生降香黄檀为对象,设置N（185.6 g N/株）、P（120 g P₂O₅/株）、K（120 g K₂O/株）、PK（120 g P₂O₅+120 g K₂O/株）、NPK（185.6 g N+120 g P₂O₅+120 g K₂O/株）以及不施肥（对照）等六个处理,调查施肥后盛花期内一年生新梢、叶、花的生长情况。结果表明：6个施肥处理间降香黄檀营养生长和生殖生长均差异显著（P<0.05）。N处理的营养枝率、营养枝复叶数和小叶宽分别比对照提高40.25%、21.75%和9.52%,花序直径和花序生物量则降低12.75%和48.63%,显示N肥能促进降香黄檀营养生长,抑制生殖生长,有利于大径材培育;P、PK处理的营养枝率较对照显著降低47.96%和46.84%,表明P肥和K肥能促进生殖生长,有利于良种选育;NPK处理能同时显著促进营养生长和生殖生长,其营养枝率、营养枝长度、营养枝复叶数、营养枝小叶长、宽和枝生物量比对照提高26.04%、68.16%、32.98%、15.20%、11.40%和83.60%,花序数量和花序生物量亦提高54.20%和49.84%。因此,在降香黄檀人工林培育实践中,可通过调整肥料的NPK配比（偏向N或PK）以实现营养生长或生殖生长调控之目的。