基于mRNA水平的差异表达基因筛选技术

随着分子生物学技术的深入发展,基因组研究重点已经由基因组测序转向基因功能鉴定,即由结构基因组学向功能基因组学转变。研究获得不同处理下基因的差异表达谱是功能基因组学的重要一环,目前已经有多种检测基因差异表达的技术可供选用。在减法杂交技术和PCR基础上发展起来的DDRT—PCR、cDNA—RDA、cDNA—AFLP和SSH技术因其实用性而得到广泛的应用,并取得了令人满意的结果。     

马西尼罗热病毒E蛋白部分基因在大肠杆菌中的表达

参考GenBank发表的西尼罗病毒(west nile virus,WNV)的E蛋白基因序列,自行设计合成一对引物,利用RT-PCR扩增出了WMV E基因318bp片段,将其克隆入pMD18-T-Vector载体中,阳性克隆命名pMD-E,并进行序列分析。进一步亚克隆入表达载体pET-32a( )。重组质粒pET32a-E转化BL21(DE3)感受态细胞中表达,表达产物经SDS-PAGE可检测到分子量约为32kD的目的蛋白带,经薄层扫描分析,目的蛋白占菌体总蛋白的33．1%。表达产物纯化后,Wester-blotting分析证明表达产物能被WNV的阳性血清所识别,为下一步建立以表达产物为包被抗原建立检测马的WNV的ELISA方法打下了基础。     

中国水仙凝集素基因NTA的克隆、序列分析及蛋白结构预测

凝集素是一种糖专一性结合蛋白,它可以识别不同的糖类.植物凝集素是植物防御系统重要的组成部分.本研究采用RT-PCR的方法,从中国水仙花蕾中克隆了凝集素基因NTA,运用生物信息学方法对其核苷酸序列、编码的氨基酸序列进行分析以及对其蛋白结构进行预测.结果表明,得到的NTA基因全长698 bp,包含一个完整的开放阅读框516bp.该基因编码一个含有172个氨基酸的凝集素前体蛋白,该前体蛋白的等电点和分子量分别为5.84和18 615.19 Da.序列比对结果表明该基因编码的蛋白与其他单子叶植物如杂种水仙、雪花莲、君子兰、石蒜花和孤挺花的凝集素蛋白的同源性较高,分别为84%、80%、77%、78%以及82%.蛋白结构预测表明,中国水仙凝集素蛋白与洋水仙凝集素蛋白在结构上非常相似.对该基因编码的蛋白进行分析及蛋白结构模拟可知,该蛋白含有三个特殊的功能结构域和alpha-D卜甘露糖结合表面(QXDXNXVXY).     

Ⅱ型猪圆环病毒检测试剂盒的研制

猪圆环病毒(Porcine circovirus,PCV)属圆环病毒科圆环病毒属成员[1].PCV分两种血清型,即PCV-1和PCV-2,其中PCV-1由Tischer等[2]于1974年检测到,对猪没有致病性;PCV-2可引起部分断奶仔猪和育肥猪的断奶仔猪多系统综合征(postweaning multisystemic wasting syndrome,PMWS)[3].目前,该病呈世界分布,给养猪业造成巨大的经济损失.本研究通过分析已发表的PCV-2的基因序列,找出PCV-2的特异性片段,研制了检测PCV-2的试剂盒.检测临床疑似病料,结果表明该试剂盒使用方便、快速、敏感、特异,符合国内的养殖场及进出口的需要.     

中国兽类新纪录──戈壁阿尔泰高山鼠

中国兽类新纪录──戈壁阿尔泰高山鼠ＮＥＷＲＥＣＯＲＤＯＦＭＡＭＭＡＬＳＩＮＣＨＩＮＡ──ＡＬＴＩＣＯＬＡＢＡＲＡＫＳＨＩＮＫｅｙｗｏｒｄｓＣｈｉｎａ;Ｎｅｗｒｅｃｏｒｄ;Ｍｏｕｎｔａｉｎｖｏｌｅ;作者于１９９３年８月２６－２７日在新疆巴里坤县中蒙边境...     

新疆乌鲁木齐县达坂城—柴窝堡啮齿动物调查

1982年6月20—30日,作者在新疆乌鲁木齐县境内达板城—柴窝堡一带调查了啮齿动物的种类和数量,现简报如下。 此次调查共捕获啮齿动物7种:五趾跳鼠(Allactaga sibirica),小地兔(Alactagulus pygmaeus),小林姬鼠(Apodemus sylvaticus),红尾沙鼠(Meriones libycus),郑氏沙鼠(Merio-nes chengi),灰仓鼠(Cricetulus migratorius),鼹形田鼠(Ellobius talpinus)。     

甘蔗基因组研究进展

甘蔗基因组庞大(10 Gb)且为高倍体(5x~16x),甘蔗基因组的研究相对滞后。随着生物技术发展,如测序组装(Pacbio、Hi-C)、分子标记以及荧光原位杂交(FISH)技术,实现了对高粱、水稻以及小麦等多种禾本科植物有关的基因组研究工作。这些重要技术为研究甘蔗基因组提供了新手段。该文综述了甘蔗的起源、分类、图谱的构建,与近缘种的共线性,基因组结构以及核型演化等甘蔗的基因组学特征,以期为甘蔗基因组深入研究提供参考。     

伪狂犬病病毒上海株gE和gI基因的克隆及缺失转移载体的构建

根据已发表的伪狂犬病病毒(Pseudorabies Virus,PRV)的gI和gE基因序列,设计两对引物用PCR方法扩增出PRV-SH gI和gE基因,将其克隆入pUC18载体中,获得了缺失部分gI基因的转移载体质粒,命名为pgEI.     

15株中国TT病毒基因型鉴定和部分序列分析

TT病毒(TTV)为一种新鉴定的输血后肝炎相关的病毒.用聚合酶链式反应(PCR)扩增TTV DNA序列核苷酸1915到2185之间的片段,并将该片段克隆入pGEM-T Easy载体.重组克隆经酶切鉴定后,用全自动测序仪测序,发现本组病例中15株TTV毒株间的同源性在66.8%到99.3%之间,与TTV日本株比较同源性在66.1%到97.4%之间,分析结果显示在我国不仅有国外已报告的不同基因亚型毒株存在,而且,分离到的3株TTV毒株与日本株G1组和G2组的异源性分别达到13.3%-33.2%,可能为新的TTV基因亚型.     

南方铁杉上斑痣盘菌科一新种——铁杉小双梭孢盘菌

本文报道了在安徽黄山采自南方铁杉(Tsuga tchekiangensis Flous)针叶上的小双梭孢盘菌属一新种,即铁杉小双梭孢盘菌(Bifusella tsugae H.S.Cao et C.L.Hou)对新种作了汉文和拉丁文描述。模式标本保藏于安徽农业大学森林保护教研室。