比较基因组学分析不同来源罗伊氏乳杆菌基因多样性及生境适应性

【目的】研究34株不同来源罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri)基因多样性及生境适应性机制,了解该菌株在肠外生境及肠内生境中适应性的异同,为L. reuteri优良菌株的开发提供理论基础。【方法】基于二代测序平台对11株源于发酵食品(酸马奶、酸粥)的L. reuteri进行测序,并应用比较基因组学将其与发酵食品、酸面团、食草动物L. reuteri分离株基因组进行比较分析。【结果】分离自酸马奶、酸粥L. reuteri基因组大小平均为2.14 Mb,GC含量平均为38.77%,且同种来源分离株系统发育关系距离较近。泛-核心基因集分别包含7242个、969个基因家族,其中酸马奶分离株特异性基因最多为459个。功能注释结果显示不同来源菌株碳水化合物、氨基酸相关基因数量及种类差异较大,仅在发酵食品和食草动物株中发现抗生素耐药性基因。注释到的碳水化合物活性酶中仅出现在发酵食品与食草动物分离株的为GH3 (β-葡萄糖苷酶等)和GH43 (β-木糖苷酶等),特有的分别为AA3 (纤维二糖脱氢酶等)和GH66 (葡萄糖转移酶等)。【结论】不同来源L. reuteri具有广泛的基因...     

益生乳酸菌Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus plantarum P8对全价饲料pH及微生物类群变化的研究

研究了益生乳酸菌干酪乳杆菌Zhang(Lactobacillus casei Zhang)和植物乳杆菌P8(Lactobacillus planta-rum P8)对全价饲料pH及微生物类群变化的影响。分别将L.casei Zhang、L.plantarum P8单一菌种及复合菌种(11)以6.30 lg cfu/g的接种总量发酵全价饲料,测定25℃10 d发酵期间全价饲料pH和微生物类群的变化,应用选择培养基测定发酵饲料中的乳酸菌及杂菌(酵母菌、霉菌、大肠菌群、芽胞杆菌和梭状芽胞杆菌)的动态变化,应用RT-PCR技术测定试验组中的L.casei Zhang和L.plantarum P8的动态变化。结果显示,试验组pH下降显著,发酵10 d时,L.casei Zhang、L.plantarum P8单一菌种和复合菌种发酵饲料的pH分别为4.23、4.24和4.22,显著低于对照组(P0.05);L.casei Zhang、L.plantarum P8单一菌种和复合菌种发酵饲料中的L.casei Zhang、L.plantarum P8活菌数分别为8.91、8.89、6.58和8.69 lg cfu/g。发酵期间,试验组中酵母菌、霉菌、大肠菌群、芽胞杆菌及梭状芽胞杆菌活菌数显著低于对照组(P0.05),其中L.plantarum P8单一菌种发酵和复合菌种发酵对杂菌抑制效果显著优于L.casei Zhang单一菌种发酵(P0.05)。结果表明,全价饲料经L.casei Zhang、L.plantarum P8发酵可以显著降低其pH,抑制其中杂菌的生长,同时L.casei Zhang、L.plantarum P8在饲料中具有良好的稳定性。     

16S rRNA和recA、groEL基因分类鉴定乳酸乳球菌乳酸亚种和乳脂亚种的比较

【目的】比较16S rRNA和recA、groEL基因部分序列用于乳酸乳球菌乳酸亚种和乳脂亚种分类鉴定的效果。【方法】对已鉴定的8株分离自传统发酵乳的乳酸乳球菌, 选取recA和groEL基因片段, 通过PCR扩增、测序, 将测序得到的序列比对后构建系统发育树, 并与16S rRNA基因序列分析技术进行比较。【结果】比较分析不同菌株16S rRNA和recA、groEL基因的亲缘关系, recA、groEL基因可以准确地完成乳酸乳球菌乳酸亚种和乳脂亚种的区分和鉴定。【结论】recA和groEL基因序列分析可以实现乳酸乳球菌乳酸亚种和乳脂亚种的区分, 因其具有快速、准确、稳定的特点, 可适合于乳酸乳球菌乳酸亚种和乳脂亚种间的快速分类鉴定。     

工业微生物在渗透胁迫下的应激反应及保护措施

发酵工业作为生物技术产业的重要组成部分,在我国工业结构中占据了极大比重,而在工业发酵后期菌体代谢物、中和剂以及补料物的累积使微生物受到极大的渗透胁迫,严重影响了细胞生长及目标产物代谢,致使发酵产量与效率偏低。本文主要针对高渗胁迫下微生物的细胞结构、应答途径、基因、蛋白、代谢、分裂机制进行综述与分析,并以微生物菌种特性结合工业发酵技术为改良思路,从菌种改良、外源添加保护剂、改良中和剂、去除渗透抑制因子、膜过滤技术等方面找寻潜在渗透保护措施,以期为发酵行业生产力水平的提升、节能减排降耗提供参考。     

生物能源领域国际相关专利分析

随着石油资源的日益枯竭,近年来生物能源技术的开发引起了全球各界的广泛重视,加之专利保护意识的增强,生物能源领域的专利数量迅速增长,对专利信息的分析可以了解生物能源技术的发展现状和趋势,为技术创新和战略发展提供参考。本文选取目前生物能源中的三种重要技术――生物乙醇、生物柴油和生物制氢技术,利用专利计量分析的方法对其发展态势进行了研究。研究内容包括：专利申请的时间分布和空间分布,被引专利情况,主要技术领域,以及重要专利权人及其相关信息,从专利分析的角度揭示近年来这三种生物能源技术的研发状况。     

甲流患儿鼻咽部及口咽部的菌群分析

目的 比较甲流（IA）患儿鼻咽部及口咽部菌群与健康儿童的差异,分析甲型流感病毒（IAV）感染后可能对儿童鼻咽部及口咽部菌群的影响。方法 选取我院120例甲流患儿作为病例组,120例年龄性别相近的健康儿童作为健康组,采用高通量测序技术,对采集的所有鼻咽部及口咽部标本行16S rDNA基因测序分析,比较两组儿童间的菌群多样性及在门、属水平上菌群结构的差异。结果 病例组鼻咽部及口咽部的菌群多样性均高于对照组（Ps0.05）,病例组鼻咽部的变形菌门（Proteobacteria）相对丰度显著高于健康组（Ps<0.05）;在鼻咽部菌属水平上,病例组中正常优势菌莫拉氏菌属（Moraxella）、棒状菌属（Corynebacterium）、狡诈菌属（Dolosigranulum）、普氏菌属（Prevotella）等的相对丰度显著减少（Ps<0.05）,而链球菌属（Streptococcus）、嗜血杆菌属（Haemophilus）、盐单胞菌属（Halomonas）、不动杆菌属（Acinetobacter）、罗尔斯通菌属（Ralstonia）等的相对丰度显著增加（Ps<0.05）,叶杆菌属（Phyllobacterium）仅见于病例组;在口咽部菌属水平上,病例组菌群相对减少的有奈瑟菌属（Neisseria）、乳杆菌属（Lactobacillus）等,而葡萄球菌属（Staphylococcus）、奇异菌属（Atopobium）、放线菌属（Actinomyces）等的相对丰度显著增加（Ps<0.05）。结论 通过对甲流患儿进行上呼吸道菌群分析,揭示了甲流患儿鼻咽部及口咽部菌群的失调,这提示我们可从微生态角度研究甲流,从而进一步了解甲流的发病机制,为减少甲流严重并发症及病死率提供可能的理论依据。     

适于AFLP分析的酵母菌DNA提取方法

采用3种方法对不同酵母菌的总DNA进行提取, 经琼脂糖凝胶电泳、ND-1000 型微量紫外分光光度计检测以及酶切、连接、预扩增试验结果的分析, 表明采用改良氯化苄法提取酵母菌的总 DNA 质量最好, 基本无 DNA 碎带, 蛋白质污染小。通过对野生酵母菌菌株的验证试验, 进一步证明采用改良氯化苄法提取的总 DNA 产量稳定、重复性好, 可以直接用于限制性内切酶酶切试验, 完全适于 AFLP 分析及一些其它分子生物学研究的要求。     

家蚕类泛素化翻译后修饰蛋白NEDD8的cDNA克隆、表达分析和亚细胞定位

【目的】NEDD8是一种重要的蛋白质翻译后修饰蛋白,对底物蛋白的功能具有重要的调节作用。本研究旨在探索家蚕Bombyx mori中NEDD8的功能。【方法】利用RT-PCR技术,从家蚕Bm N细胞中克隆了家蚕NEDD8完整的开放阅读框。通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测家蚕NEDD8在不同发育阶段、5龄第3天幼虫不同组织中以及Bm NPV感染Bm N细胞后的相对表达量。通过构建GFP融合表达的重组Bm NPV(B.mori nucleopolyherovirus)感染家蚕Bm N细胞,在共聚焦显微镜下观察NEDD8在细胞中分布情况,用GFP抗体进行Western blot验证。【结果】克隆获得了NEDD8基因。序列分析表明,家蚕NEDD8高度保守,与家蚕泛素蛋白氨基酸序列一致性最高。qRT-PCR分析结果表明,NEDD8在家蚕的不同组织中均有表达,其中头部中表达量最高,其次是丝腺中,而在精巢和卵巢中表达量最低;在家蚕5龄第3天幼虫始到化蛹后第3天NEDD8的表达量开始逐渐增加,化蛾后降至低水平;在家蚕杆状病毒感染Bm N细胞的早期和极晚期NEDD8的表达量都有明显增加。GFP-NEDD8融合表达定位显示NEDD8在Bm N细胞内普遍存在,分布于整个细胞中,并且在感染48 h后存在细胞质内的聚集现象。【结论】NEDD8编码序列在物种间高度保守;NEDD8在家蚕幼虫头部中表达量最高,在化蛹阶段表达量逐渐增加;NEDD8在Bm N细胞内普遍存在并且可能与参与Bm NPV复制。本研究所得结果为进一步研究NEDD8在家蚕中的生物学功能及修饰底物蛋白的作用机制奠定了基础。     

现代生物技术——万能灵药,还是新潘多拉魔盒?

<正>ISBN:9787122174994定价:49.0元开本:16装帧:平装页码:248初版时间:2013年10月读者对象:可供生物类专业的本科生及其他专业拟了解该技术的人士阅读参考。内容介绍现代生物技术在解决人类社会面临的人口、健康、资源和环境等重大问题上表现出了巨大的应用潜力。然而,与历史上任何新兴技术面世的时候一样,广大民众对现代生物技术这样一种新兴高技术的内涵并不清楚,因此容易产生怀疑、误解,甚至恐惧,阻碍了现代生物技术的正常发展和应用。为了更好地认识现代生物技术的科技内涵,本书以现代生物技术在     

鼻咽癌细胞中ezrin基因增强子区的定位分析

本研究采用嵌套缺失和荧光素酶检测技术对鼻咽癌CNE2细胞ezrin基因增强子区进行定位分析。实验结果显示,CNE2细胞中,ezrin基因-1541/-706具有转录激活和转录增强作用,存在转录正调控区和负调控区。对5个潜在转录调控区的进一步研究发现,ezrin基因-1297/-1186对ezrin启动子和SV40启动子具有显著的转录增强作用;其它4个区域对启动子不表现转录调控作用,或表现弱的转录增强作用。结果表明,ezrin基因-1297/-1186是具有增强子作用的关键转录调控区,它有可能与其它潜在转录调控区以共同或协同的方式调控ezrin基因转录。