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Sebastián Moran Miguel Vizoso Anna Martinez-Cardús Antonio Gomez Xavier Matías-Guiu Sebastián M Chiavenna Andrés G Fernandez Manel Esteller 《Epigenetics》2014,9(6):829-833
A formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) sample usually yields highly degraded DNA, which limits the use of techniques requiring high-quality DNA, such as Infinium Methylation microarrays. To overcome this restriction, we have applied an FFPE restoration procedure consisting of DNA repair and ligation processes in a set of paired fresh-frozen (FF) and FFPE samples. We validated the FFPE results in comparison with matched FF samples, enabling us to use FFPE samples on the Infinium HumanMethylation450 Methylation array. 相似文献
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Monitoring signal transduction in cancer: cDNA microarray for semiquantitative analysis. 总被引:1,自引:0,他引:1
H B Hsieh R A Lersch D E Callahan S Hayward M Wong O H Clark H U Weier 《The journal of histochemistry and cytochemistry》2001,49(8):1057-1058
This study targeted the development of a novel microarray tool to allow rapid determination of the expression levels of 58 different tyrosine kinase (tk) genes in small tumor samples. The goals were to define a reference probe for multi-sample comparison and to investigate the variability and reproducibility of the image acquisition and RT-PCR procedures. The small number of tk genes on our arrays enabled us to define a reference probe by artificially mixing all genes on the arrays. Such a probe provided contrast reference for comparative hybridization of control and sample DNA and enabled cross-comparison of more than two samples against one another. Comparison of signals generated from multiple scanning eliminated the concern of photo bleaching and scanner intrinsic noise. Tests performed with breast, thyroid, and prostate cancer samples yielded distinctive patterns and suggest the feasibility of our approach. Repeated experiments indicated reproducibility of such arrays. Up- or downregulated genes identified by this rapid screening are now being investigated with techniques such as in situ hybridization. 相似文献
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Anna Morcom 《The journal of the Royal Anthropological Institute》2014,20(4):788-789
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Kazazoglou Theodosia Panagiotou Christina Mihailidou Chrysovalantou Kokkinopoulou Ioanna Papadopoulou Anna Moutsatsou Paraskevi 《Molecular and cellular biochemistry》2021,476(12):4471-4485
Molecular and Cellular Biochemistry - Glucocorticoids (GCs) regulate astrocyte function, while glutamine synthetase (GS), an enzyme highly expressed in astrocytes, is one of the most remarkable... 相似文献