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用图论方法研究核酸序列的密码子使用与基因表达水平的关系 总被引:3,自引:2,他引:3
研究了Escherichiacoli(115个基因)和SacharomycesYeast(97个基因)核酸序列的密码子使用频率与基因表达水平的关系.将同义密码子按使用频率统计值分成三种特性的密码子:最适密码子(H)、非最适密码子(L)和稀有密码子(R),对每一基因序列的编码区,算出它们各自出现的概率P(H),P(L)和P(R).以P(H)和P(R)为指标,用图论法聚类,发现每种生物的高低表达基因明显分开,基因表达水平被分为四级:甚高表达基因(VH)、高表达基因(H)、较低表达基因(LM)和低表达基因(LL).每类基因的表达水平与实验结果保持了很好的相关性,与E.coli和Yeast的现有资料相比,符合很好. 相似文献
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