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环状RNA是新发现的一类具有重要生物学功能的RNA。现有的环状RNA识别工具依赖高通量测序数据,因数据本身和识别方式的弊端而普遍存在准确性不足、不同方法间重复性低以及假阳性率/假阴性率高等缺点。为了解决该问题,我们搭建模型来实现不依赖于测序数据而根据序列的内在特征的环状RNA从头预测。本文选取了包括剪接位点上下游内含子的长度、A-to-I密度和Alu重复序列等100个与RNA成环相关的序列特征,建立了机器学习模型,并识别了人类基因组中的环状RNA,比较了两种机器学习方法随机森林法(RF)和支持向量机(SVM)的分类效果。结果表明,所选序列特征能有效地鉴别RNA能否成环,同时,不同序列特征对模型的分类预测能力的贡献也不同。相比于SVM方法,RF分类的效果更好。 相似文献
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多巴胺(DA)和去甲肾上腺素(NE)在文昌鱼神经系统和性腺中的免疫细胞化学定位 总被引:7,自引:0,他引:7
用免疫细胞化学ABC法对多巴胺(DA)和去甲肾上腺素(NE)的文昌鱼神经系统和性腺中进行定位研究。免疫反应结果显示:DA和NE免疫阳性神经细胞广泛分布在文昌鱼端脑后部、中脑前部和中部以及脊髓,我们还观察到,在文昌鱼漏斗部也有DA免疫阳性神经细胞及其纤维;在中脑中部,NE免疫阳性神经细胞及其纤维与另一个神经细胞相接触。此餐,文昌鱼精巢和卵巢中也存在DA和NE免疫阳性物,研究结果表明,DA和NE可有像在鱼类中那样,参与调节文昌鱼哈氏窝上皮细胞的分泌活动以及性腺发育。 相似文献
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目的:了解陕西省咸阳市某县2周岁内婴幼儿贫血及含铁辅食添加情况。方法:在某县儿保体检门诊共收集586名婴幼儿体检报告,并对婴幼儿家长进行含铁辅食添加情况的问卷调查。结果:被调查的婴幼儿贫血患病率为18.4%;患病率性别差异无统计学意义(χ2=2.21,P>0.05);患病率年龄段差异有统计学意义(χ2=13.6,P<0.05),患病人数最多在第二组(0.5~1岁);早产儿与足月儿患病率差异有统计学意义(χ2=11.4,P<0.05);被调查的家长对含铁辅食添加相关知识的知晓率相对较低,平均为41.6%;结论:该县婴幼儿贫血问题突出,乳母缺乏婴幼儿贫血及补充含铁辅食相关知识,建议相关部门开展对贫血及含铁辅食知识的宣讲活动,让广大育龄妇女意识到给宝宝添加含铁辅食的重要性。 相似文献
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探讨健脾益肾通络方(JYTR)对1-甲基-4-苯基-1,2,3,6-四氢吡啶(MPTP)诱导的帕金森病小鼠肠道菌群组成和短链脂肪酸的影响。
将成年雄性C57BL/6小鼠随机分成3组:空白组、MPTP组、MPTP+JYTR组,每组15只。采用爬杆、悬挂、横梁实验评估运动情况。采用免疫荧光法检测纹状体酪氨酸羟化酶(TH)的表达。采用蛋白印迹法检测纹状体和结肠中α-突触核蛋白(α-syn)的表达。采用16S核糖体RNA(16S rRNA)基因测序评估肠道菌群的变化。采用气相色谱质谱法(GC-MS)分析小鼠粪便短链脂肪酸的水平。最后对差异菌群和短链脂肪酸进行相关性分析。
与MPTP组相比,MPTP+JYTR组小鼠悬挂评分增加(
JYTR可以通过调节肠道菌群失调和改善短链脂肪酸水平起到治疗帕金森病的作用。
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大肠杆菌难以表达大的蛋白,毒性蛋白以及膜蛋白,“Npu DnaE内含肽表达系统“使这些蛋白的表达成为可能。该系统的基本原理是:在特定位点处将目标基因(编码T7 RNA聚合酶的基因)断裂成两部分,然后分别与Npu DnaE内含肽的N端,C端片段融合,两种融合基因分别表达纯化,在体外将两种融合蛋白等摩尔比混合即可产生有功能的T7 RNA聚合酶。理论上,该体系也可用于合成其他大的蛋白,毒性蛋白或膜蛋白。 相似文献
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大青山外生菌根真菌资源与生态研究 总被引:5,自引:0,他引:5
历经5a,采用踏查与样线调查相结合的方法,对内蒙古大青山主要林区的外生菌根真菌资源与生态进行了系统研究。通过对子实体鉴定及对菌根组织的分离与回接研究,并借鉴前人对大青山大型真菌调查资料,初步认为在大青山分布的外生菌根真菌共163种,占现有国内报道种的26.6%,它们分别隶属于18科、41属。在大青山此次调查发现内蒙新记录种54种,占大青山记录种的33%,还有5个存疑种;通过对分布区内各生态因子研究表明,在大青山外生菌根真菌喜欢生长在有机质丰富、林分郁闭度0.7~0.9、海拔1300~1900 m、阴坡的中部、坡度为20~40°的环境中,而在陡坡、山顶或山麓分布较少;通过对生境土壤理化因子分析结果表明,菌根真菌的存在能够明显降低土壤pH值、并对环境中全N含量有显著的提高,对全P、全K无显著影响,但对速效态N、P、K释放均有显著的促进作用,尤其速效K的释放与对照存在着极显著的差异;从对共生关系研究表明,白蘑科(Tricholomataceae)、红菇科(Russulaceae)、丝膜菌科(Cortinariaceae)、鹅膏科(Amanitaceae)的大部分真菌,以白桦(Betula platyphyllaSuks.)、山杨(Populus davidianaDode.)、云杉(Picea asperataMast.)、蒙古栎[Quercus mongolica(Fisch.)Turcz.]、虎榛子(OstryopsisdavidianaDecne.)为主要宿主,而牛肝菌科(Boletaceae)的大部分真菌主要以油松(Pinus tabulaeformisCarr.)、华北落叶松(Larixprincipisr-upprechtiiMayr.)、云杉、白桦、虎榛子等为主要宿主植物。 相似文献
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利用光学显微镜和扫描电镜对中国25种4变种绣线菊属(Spiraea L.)植物的种子形态特征进行了研究。结果显示,绣线菊属植物种子外观上呈窄线形至椭圆形,表面有光泽和条纹,种子颜色为红棕色至深褐色;种皮纹饰可分为网纹、复网纹、负网纹和链状网纹4种类型。种子按长宽比的划分方法在一定程度上支持该属传统的组下系的划分;种皮纹饰在种间具有明显的差异,可作为中国绣线菊属植物种的分类依据。本研究为绣线菊属的分类及系统学研究提供了种子形态及种皮微观形态方面的新资料,对进一步完善该属属下分类具有借鉴意义。 相似文献
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高中生物课直观教具的综合设计与应用尝试□周晶(齐齐哈尔铁路教育学院,161000)由于生物学科本身的特点是研究活生物的生物界,这就决定了直观教学是生物教学中最重要的教学原则之一。我们紧密结合高中生物教材内容深、难点多、课时少的特点,在教学手段方面进行... 相似文献