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1.
RG108对肺腺癌A549细胞增殖、凋亡及RASSF1A基因表达的影响   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的探讨DNA甲基转移酶抑制剂RG108对人肺腺癌细胞株A549增殖、凋亡以及对RASSF1A(Ras as-sociation domain proteinfamily1)基因启动子区域甲基化状态、表达的影响。方法用20μmol/L的RG108对A549细胞进行化学干预72h,用MTT法检测细胞生长抑制率;流式细胞术检测细胞周期以及凋亡情况;RT-PCR观察RASSF1A基因mRNA水平变化;Western blot检测RASSF1A蛋白的表达;甲基化特异性PCR(MS-PCR)检测RASSF1A基因启动子区域甲基化状态的改变。结果经RG108干预72h后,A549细胞的抑制率为17.2±0.43%,细胞周期阻滞于G0/G1期,并引起细胞凋亡。RT-PCR和Western blot结果显示在干预组细胞中分别出现RASSF1A基因的DNA条带(329bp)和蛋白质条带(39kD),而对照组中无相应条带出现。RASSF1A基因启动子区域由甲基化状态转变为非甲基化状态。结论RG108可使RASSF1A基因启动子区域去甲基化,并通过该机制诱导RASSF1A基因在人肺腺癌细胞株A549中表达。  相似文献   

2.
目的:分析骨肉瘤组织中RASSF1A基因甲基化状况。方法:运用甲基化特异性PCR(MSP)分别检测44例骨肉瘤组织及相应的癌旁组织中RASSF1A基因启动子甲基化状态并分析其临床病理意义。结果:骨肉瘤组织中RASSF1A基因异常甲基化率(61.4%)显著高于癌旁正常骨组织中RASSF1A基因的异常甲基化率(20.5%),二者之间差异具有统计学意义(P〈0.05)。RASSF1A基因异常甲基化导致组织中RASSF1A基因mRNA和蛋白表达水平均显著降低。另外,RASSF1A基因异常甲基化和肿瘤组织分化程度及全身有无转移情况有相关性(P值分别为0.022和0.016),而与患者年龄、性别、肿瘤位置及大小等临床特征无关(P值分别为0.6944,0.977,0.786和0.831)。结论:RASSF1A基因启动子高甲基化可能是导致其在骨肉瘤中表达水平降低的分子机制之一,有望成为骨肉瘤早期辅助诊断的一个重要分子标志物。  相似文献   

3.
为了检测肝细胞癌患者血清中RASSF1A和CDH13基因启动子的甲基化状态,收集肝细胞癌患者及健康对照者的血清标本,采用巢式甲基化特异性PCR(nMSP)法检测RASSF1A和CDH13基因启动子区甲基化状态.结果肝细胞癌患者血清样品中RASSF1A和CDH13基因启动子区甲基化率为53.12%和31.25%,68.75%的患者血清可以检测到异常甲基化,正常对照血清中未检测到RASSF1A和CDH13基因启动子区甲基化,RASSF1A和CDH13基因甲基化与患者的临床病理资料无明显相关性(P>0.05);表明nMSP法检测血清中RASSF1A和CDH13基因启动子区甲基化具有较高的敏感性,可为肝细胞癌的筛查、早期诊断和预后判断提供有价值的信息.  相似文献   

4.
目的:研究非小细胞肺癌RASSF1A基因启动子甲基化及下游基因表达情况。方法:留取58例非小细胞肺癌患者手术标本及正常肺组织,甲基化特异性PCR分析RASSF1A基因启动子甲基化情况,同时Northern blot分析SM22、SPARC、SDHB和CC-ND3等4种RASSFIA下游基因的表达情况。结果:58例非小细胞肺癌中RASSFIA基因启动子甲基化阳性率为34.5%,甲基化与各临床参数之间无显著相关性,SM22和SPARC在RASSF1A甲基化组表迭明显下调。结论:原发性非小细胞肺癌中存在着较高比例的RASSF1A启动子过度甲基化,并与下游基因SM22和SPARC的表达下调密切相关。提示RASSF1A在非小细胞肺癌的发生中起着多种作用。  相似文献   

5.
目的:探讨p16基因和RASSF1A基因甲基化与肺癌发生发展的关系和应用于诊断的意义。方法:采用甲基化特异性PCR(Methylation Specific PCR,MSP)检测120例周边型非小细胞肺癌患者癌组织、痰液脱落细胞和120例非肺癌人群的痰液脱落细胞中p16基因和RASSF1A基因甲基化,分析它们与临床特征的关系以及非肺癌人群与肿瘤患者之间的差异。结果:(1)120例周边型非小细胞肺癌组织中,p16基因甲基化率46.7%(56例),RASSF1A基因甲基化率53.3%(64例)。P16和RASSF1A基因甲基化与吸烟程度、肿瘤大小和临床分期正相关(P<0.05)。(2)肺癌痰液脱落细胞中有28例p16基因出现甲基化(23.3%),20例RASSF1A基因出现甲基化(16.7%),其中32例至少存在一个基因的甲基化(26.7%);66例重度吸烟者中只有4例痰液脱落细胞出现p16基因甲基化(6%),4例出现RASSF1A基因甲基化(6%);54例非重度吸烟正常人中仅有2例出现p16基因甲基化(3.7%),RASSF1A基因无甲基化。(3)液基痰细胞病理学检查与痰脱落细胞p16和RASSF1a基因甲基化检测结合起来可有效提高诊断的灵敏度(P<0.05)。结论:烟草可能具有潜在的诱导抑癌基因p16和RASSF1A发生甲基化的作用;p16和RASSF1A基因甲基化可能参与肺癌的生长过程。痰脱落细胞p16和RASSF1a基因甲基化检测结合液基痰细胞病理学诊断,可提高非小细胞肺癌诊断的灵敏度。  相似文献   

6.
目的:分析骨肉瘤组织中RASSF1A基因甲基化状况。方法:运用甲基化特异性PCR(MSP)分别检测44例骨肉瘤组织及相应的癌旁组织中RASSF1A基因启动子甲基化状态并分析其临床病理意义。结果:骨肉瘤组织中RASSF1A基因异常甲基化率(61.4%)显著高于癌旁正常骨组织中RASSF1A基因的异常甲基化率(20.5%),二者之间差异具有统计学意义(P<0.05)。RASSF1A基因异常甲基化导致组织中RASSF1A基因mRNA和蛋白表达水平均显著降低。另外,RASSF1A基因异常甲基化和肿瘤组织分化程度及全身有无转移情况有相关性(P值分别为0.022和0.016),而与患者年龄、性别、肿瘤位置及大小等临床特征无关(P值分别为0.6944,0.977,0.786和0.831)。结论:RASSF1A基因启动子高甲基化可能是导致其在骨肉瘤中表达水平降低的分子机制之一,有望成为骨肉瘤早期辅助诊断的一个重要分子标志物。  相似文献   

7.
目的:通过检测各类型白血病骨髓中RASSF1A基因启动子区甲基化水平,探讨其对白血病分型的临床检测意义。方法:抽选93例不同类型白血病患者(观察组)予以甲基化特异性PCP(MSP)方法进行骨髓RASSF1A基因甲基化状态检测,研究不同类型白血病甲基化状态差异,同期抽选93例非白血病者为对照研究(对照组)。结果:观察组中有13例(13.98%)检测到RASSF1A基因甲基化,而对照组中RASSF1A基因甲基化率为0%,比较差异显著(P0.05)。不同类型白血病RASSF1A甲基化率比较:淋巴系显著高于髓系(P0.05),急性与慢性白血病比较差异无显著性(P0.05)。结论:白血病骨髓中MSP法检测存在RASSF1A甲基化;而RASSF1A基因在淋巴系白血病中的甲基化概率明显增高,因此,对RASSF1A进行甲基化检测有可能作为白血病临床诊断分型的生物学指标之一。  相似文献   

8.
为分析局部晚期乳腺癌行新辅助化疗TAC方案的临床效果以及RASSF1A和WIF-1基因甲基化程度对预测临床结局的价值,本研究连续选择126例患者接受TAC方案(多西他赛,吡柔比星和环磷酰胺),至少进行4个周期,记录总有效率,检测外周血RASSF1A和WIF-1甲基化阳性率。结果显示,126例患者总有效率79.37%(100/126);血清RASSF1A和WIF-1甲基化阳性率在有效组中均较低,与无效组有统计学差异(p0.05)。血清RASSF1A与WIF-1甲基化阳性率预测临床结局的敏感性分别为85.0%和94%,特异性分别为50.0%和75%,阳性预测值分别为76.2%和81%,阴性预测值分别为23.8%和19%。本研究的结果说明,检测局部晚期乳腺癌患者血清RASSF1A和WIF-1基因甲基化程度对预测新辅助化疗TAC方案的临床效果有重要应用价值。  相似文献   

9.
目的:研究Ras相关区域家族1A基因(ras association domain family 1A,RASSF1A)启动子区甲基化对结肠癌组织中该基因转录和表达的影响.方法:应用甲基化特异性PCR(Methylation-special PCR,MSP)、RT-PCR和Western blot方法检测30例结肠癌组织和癌旁组织中的RASSF1A基因启动子区甲基化状态、mRNA和蛋白表达水平.结果:①RASSF1A基因启动子区在结肠癌纽织和正常组织中的甲基化频率分别为57%(17/30)和20%(6/30),甲基化频率在两组具有统计学差异(p<0.01),,结肠癌组织中RASSF1A基因启动子区甲基化频率显著高于癌旁正常组织(x2=8.531,p<0.01);②结肠癌组织中RASSF1A基因mRNA和蛋白袁达均显著低于癌旁组织(癌组织和癌旁正常组织中mRNA相对表达量分别为0.2836±0.0493和0.5092±0.0433,P<0.001;以上组织中蛋白相对表达量分别为0.3124±0.0472和0.5320±0.0440,P<0.01);③在结肠癌组织中,甲基化组RASSF1A基因mRNA和蛋白表达明显低于非甲基化组(甲基化组和非甲基化组mRNA相对表达量分别为0.0686±0.0174和0.5511±0.0486,P<0.0001;以上组中蛋白相对表达量分别为0.1219±0.0326和0.5614±0.0380,P<0.0001).结论:结肠癌组织中RASSF1A基因启动子区甲基化明显增高,与该基因蛋白表达减少显著相关,这可能是导致结肠癌中RASSF1A抑癌基因失活的主要因为.  相似文献   

10.
为探讨分析局部晚期乳腺癌行新辅助化疗TAC方案的临床效果以及血清Ras相关区域家族1A基因(RASSF1A)和Wnt抑制因子(WIF)-1基因甲基化程度对预测临床结局的价值,本研究通过连续选择126例患者接受TAC方案(多西他赛,吡柔比星和环磷酰胺),进行至少4个周期,记录总有效率;采用甲基化特异性PCR(MSP)法检测外周血RASSF1A和WIF-1甲基化阳性率。126例患者总有效率79.37%(100/126)。有效组血清RASSF1A和WIF-1甲基化阳性率明显低于无效组,差异有统计学意义(p0.05)。血清RASSF1A甲基化阳性率预测临床结局的敏感性为85.0%,特异性50.0%,阳性预测值76.2%和阴性预测值23.8%;血清WIF-1分别为94.0%、75.0%、81.0%和19.0%。由此证明,检测局部晚期乳腺癌患者血清RASSF1A和WIF-1基因甲基化程度对预测新辅助化疗TAC方案的临床效果有重要应用价值,值得临床推广使用。  相似文献   

11.
RASSF1A 基因在乳腺癌发生、发展中的作用   总被引:1,自引:1,他引:0       下载免费PDF全文
RASSF1A基因是新近发现的新型候选抑癌基因,其正常表迭能够抑制肿瘤的发生。启动于区域CpG岛异常甲基化可以导致其失活,并在乳腺癌的发生、发展起着重要作用。RASSF1A的甲基化状态检测具有重要的临床意义,有望为乳腺癌的早期诊断、疗效监测、预后判断提供新的参考指标,而逆转RASSF1A的甲基化则可能为乳腺癌治疗提供新的方向。  相似文献   

12.
结直肠癌发展的分子机制之一是抑癌基因CpG岛甲基化。RASSF1A位于3p21.3,参与了包括细胞周期调控、凋亡、微管稳定在内的多种生物进程,被认为是抑癌基因,在包括结直肠癌在内的多种肿瘤中因甲基化失活。近来研究发现,RASSF1A的甲基化可能作为结直肠癌分子诊断的标志。本文就RASSF1A功能及其与结直肠癌的关系进行综述。  相似文献   

13.
用生物信息学方法筛选肺腺癌(Lung adenocarcinoma,LUAD)的诊断生物标志物,并分析肺腺癌中免疫细胞浸润情况。从GEO和TCGA数据库下载肺腺癌的表达数据集,利用R软件筛选肺腺癌与正常肺组织间的差异表达基因(DEGs),使用DAVID网站对DEGs进行GO及KEGG富集分析,使用STRING及Cytoscape等工具对DEGs构建蛋白相互作用网络并筛选hub基因;利用Kaplan-Meier法对DEGs进行生存分析,并对hub基因进行ROC分析筛选诊断生物标志物,利用GSEA预测有预后价值的基因参与的信号通路;并用Cibersort软件反卷积算法分析肺腺癌中免疫细胞浸润情况。共得到肺腺癌的234个DEGs,这些基因主要参与信号转导、物质代谢、免疫反应等相关信号通路;构建PPI网络筛选出的20个hub基因中8个存在预后价值(CCNA2、DLGAP5、HMMR、MMP1、MMP9、MMP13、SPP1、TOP2A),ROC分析中DLGAP5、SPP1值分别是0.703、0.706;DLGAP5、SPP1基因表达水平与肺腺癌组织浆细胞、未活化的CD4+记忆细胞、调节T细胞、巨噬细胞M0、M1、M2及中性粒细胞浸润密切相关(P<0.05)。肺腺癌中DLGAP5、SPP1具有较高诊断价值且参与肺腺癌组织免疫细胞浸润;DLGAP5、SPP1基因可作为肺腺癌诊断的生物标志物,可为肺腺癌的靶向治疗研究提供新思路。  相似文献   

14.
李丽希  黄钢 《生物信息学》2022,20(3):218-226
对肺腺癌自噬相关基因进行生物信息学分析,结合多基因预后标志和临床参数构建能够预测肺腺癌患者预后的模型。首先,对TCGA肺腺癌数据中的938个自噬相关基因进行差异分析,获得了82个差异自噬相关基因,使用单因素Cox比例风险回归模型从差异自噬相关基因中筛选出候选基因,通过 lasso回归进一步筛选出预后相关基因,分别是ARNTL2、NAPSA、ATG9B、CAPN12、MAP1LC3C和KRT81。通过多因素Cox回归分析以构建风险评分模型,根据最优cutoff值将患者分为高低风险组,生存曲线显示高低风险组之间生存差异显著,ROC曲线显示风险评分的预测能力良好,并在内、外验证集中得到验证。同时对传统的临床因素进行单因素和多因素Cox回归分析,结果显示Stage、复发和风险评分能够独立预测预后,结合这三个独立的预后参数以构建列线图模型,使用一致性指数、校准曲线评估列线图的预测能力,结果显示预测结果与实际结果之间具有良好的一致性。通过与Stage和风险评分的比较发现,列线图的预测能力表现最佳。基于肺腺癌相关的自噬基因和临床参数构建了一个列线图模型来预测肺腺癌患者的预后生存,这可能为临床医生提供了一种可靠的预后评估工具。  相似文献   

15.
通过检测PTN蛋白在肺腺癌患者术前血清标本及相对应的恶性胸水肺腺癌细胞2种不同标本中的表达及对比其表达的差异,探讨其诊断意义.利用Western-blot免疫印迹方法检测50例恶性胸水及相对应的术前血清,并对肺腺癌细胞进行石蜡包埋、免疫细胞化学检查.同时分别以10例正常献血者血清、20例胸水良性增生细胞作为对照.肺腺癌患者血清和恶性胸水细胞中PTN蛋白的表达分别高于对照组PTN蛋白的表达,恶性胸水中PTN蛋白的表达59.0% (49/83)高于肺腺癌患者血清中PTN蛋白的表达32.5% (27/83).差异均具有统计学意义(P<0.05),恶性胸水肺腺癌细胞中的PTN蛋白表达和波形蛋白Vimentin呈正相关关系(P <0.01,r =0.728),而与钙粘连蛋白E-ca呈负相关.PTN蛋白在肺腺癌患者血清和恶性胸水细胞标本中高表达,恶性胸水肺腺癌细胞中PTN蛋白的表达高于血清中PTN蛋白的表达,肺腺癌细胞中PTN蛋白的表达与波形蛋白Vimentin表达相一致,肺腺癌细胞在转移过程中已发生了向间质细胞转化EMT的过程,同时增强了肺腺癌细胞的高侵袭性,而恶性胸水肺腺癌细胞PTN蛋白的高表达更促进了肺腺癌细胞的转移.提示对未发生胸水转移的肺腺癌患者进行血清中PTN蛋白的检测,对已发生胸水转移的肺腺癌患者同样要检测PTN蛋白,以期提高肺腺癌患者的诊断率.  相似文献   

16.
目的通过检测肺腺癌患者术前血清标本及相对应的术后切除肺癌组织标本,和肺腺癌转移胸水标本中的PTN蛋白的表达,探讨PTN蛋白在肺腺癌患者三种不同标本中的表达及意义。方法利用Western-blot、免疫组织化学、免疫细胞化学方法分别检测189例上述三种不同标本中PTN蛋白的表达,其中有29例对应的术前血清,肺腺癌术后组织和术后3-4个月的转移胸水标本,同时分别以50例正常献血者血清、50例来自于189例肺腺癌癌旁组织和50例胸水良性增生细胞作为对照。结果肺腺癌患者血清、组织、胸水中PTN蛋白的表达分别高于对照组PTN蛋白的表达。PTN蛋白在肺腺癌患者胸水细胞中的表达率57.7%(109/189)高于组织中的表达率42.9%(81/189)、组织中的表达率42.9%(81/189)高于肺腺癌患者血清中的表达率18%(53/189),差异均具有统计学意义(P<0.05)。在189例肺腺癌患者的胸水标本中PTN和Vim-entin的表达呈正相关关系(P<0.01,r=0.728)。并且,在29例分别来源于同一例患者的这三种标本中,27例PTN在血清和肺腺癌组织中阴性表达,但在相对应的恶性胸水腺癌细胞中PTN呈阳性表达。同时,在这27例对应的标本中,PTN阳性表达的标本Vimentin亦阳性表达,而E-ca阴性表达。结论 PTN蛋白在肺腺癌患者血清、组织和胸水中高表达,且PTN和Vimentin的表达一致说明PTN在肺腺癌的EMT转化过程中可能起到重要的作用。  相似文献   

17.
目的:探讨肺腺癌细胞中NDRG2基因启动子甲基化状态及其与基因表达的关系。方法:甲基化焦磷酸测序技术检测启动子区域甲基化状态,荧光定量PCR技术检测不同药物浓度下培养细胞中NDRG2基因mRNA的表达水平,分析启动子区域甲基化与基因表达之间的关系。结果:在体外培养细胞中检测到NDRG2基因启动子区域呈现不同程度的甲基化,甲基化频率分别为肺癌A549细胞71.8%、GLC-82细胞86.1%、人脐静脉内皮ECV-304细胞36.8%、胃上皮GES-1细胞42.9%。NDRG2基因mRNA表达与其启动子甲基化程度成反比,甲基转移酶抑制剂5-杂氮-2-脱氧胞苷(5-Aza-CdR)作用于细胞后,A549和GLC-82细胞中NDRG2基因的mRNA转录明显上调,至72 h差异显著(P0.05)。结论:肺腺癌细胞中NDRG2基因启动子CpG岛存在高甲基化,甲基化程度与该基因的表达具有负相关性,5-Aza-CdR能在一定程度上提高NDRG2的转录水平。  相似文献   

18.
目的胶原蛋白是细胞外基质的主要成分之一,我们在临床数千例恶性胸水转移的非小细胞肺癌细胞胞浆中常见到围绕细胞核或局灶状葱皮排列的纤维样结构,由此我们假设肺腺癌细胞在侵袭转移形成胸腔积液过程中发生与细胞外基质相同的结构变化,即肿瘤细胞胶原化形成“盔甲”式保护膜起到对肿瘤细胞结构及功能的支撑,达到抵御化疗药物、毒素的穿透和放射线的轰击,提高了自我保护能力,适应新的肿瘤细胞增生微环境。方法TCT方法选取224例肺腺癌细胞学标本,其中胸腔积液标本144例,肺泡灌洗液40例,痰液标本40例,24例为良性胸腔积液作为对照。常规制成细胞包埋块,切片、HE染色及CK7、TTF-l、vimintin的免疫细胞化学染色。透射电镜观察肿瘤细胞内部结构。Masson特殊染色,胶原蛋白工、Ⅱ、Ⅲ亚型染色,Western-blot蛋白检测。观察肺腺癌细胞是否存在胶原蛋白亚型及肺腺癌不同标本的表达情况。结果Masson细胞化学染色显示胶原纤维在恶性胸腔积液、支气管肺泡灌洗液及痰肺腺癌标本中的表达率分别为59.7%(sG/144)、0%(0/40)、o%(0/40),在良性标本中不表达均为阴性(0/24)。免疫细胞化学结果显示:COLlAl、COL2Al和COL3Al在肺腺癌细胞中的阳性表达率分别为22.6%(38/1G8),5.4%(9/1G8),22.6%(38/168),阳性表达主要定位于胞浆,而在增生的上皮细胞中不表达,统计学分析结果显示COLlAl、COL3Al的表达率要显著高于COL2Al的表达率(P=0.024),并且我们发现COLlAl与COL3A1的表达成正相关性(r=0.886,P=0.000)。透射电镜可观察到在肿瘤细胞胞浆中可见多量纤维状物质。结论本研究从形态学上观察到在转移的肺腺癌细胞胞浆内有一些围绕胞核呈葱皮样改变的纤维样结构,结果表明肺腺癌细胞可以产生胶原蛋白,  相似文献   

19.
徐毅  胡娟  李霞  胡永胜  许建中 《生物磁学》2013,(30):5949-5952,5987
目的:应用Logistic回归筛选高龄患者下肢深静脉血栓灰阶及彩色多普勒超声诊断特征。方法:对我院150例主动要求下肢深静脉血栓灰阶及彩色多普勒超声检查的高龄患者,应用超声检查观察血管管径、管腔内回声及血流动力学等特征,进行Logistic回归分析,筛选超声诊断特征,对Logistic回归模型预测诊断绘制受试者工作曲线图(ROC),评估模型效果。结果:150例超声检查高龄患者,发生下肢深静脉栓塞129例,占86.00%。Logistic回归筛选,血管管径、管腔内回声、管壁内壁、血流信号改变4个变量进入回归模型,Logistic回归模型预测超声检出的ROC曲线下面积为0.903,灵敏度为90.3%,特异度为93.8%。结论:以高龄患者下肢深静脉血栓超声特征建立的Logistic回归模型对该病具有较好的预测诊断价值。  相似文献   

20.
目的探讨表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)在肺腺癌细胞中的表达及与细胞发生胶原化的相关性。方法从胸水中提取肺腺癌细胞为研究对象,以32例良性胸水中的增生上皮细胞、炎性细胞为对照,采用免疫细胞化学方法检测细胞中EGFR、E钙粘素蛋白、Vimentin、TTF-1和胶原蛋白亚型I的表达。Masson染色方法检测胶原纤维表达。结果78例胸水标本中,EGFR在肺腺癌细胞中的阳性率为79.5%,胶原蛋白亚型I为32.1%,Masson染色的阳性率为70.5%,明显高于对照组且EGFR和Masson染色的阳性表达结果的相关性具有统计学意义(P〈0.01)。结论EG—FR在肺腺癌细胞中阳性表达,可能与细胞内基质胶原蛋白形成有关。  相似文献   

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