黑水虻幼虫氨基酸及其微量元素分析

黑水虻具有较高的营养价值,是一种重要的环境友好型资源昆虫.本研究采用凯氏定氮法、茚三酮柱后衍生离子交换色谱法和微波消解-电感耦合等离子质谱法(ICP-MS)等多种分析技术,测定了厨余垃圾饲喂的黑水虻幼虫蛋白质、氨基酸和微量元素的组成及含量.研究结果表明,黑水虻幼虫中蛋白质的含量为40.60 g/100 g.在测定的16...     

结构基因组学研究与核磁共振

各种生物的基因组DNA测序计划的完成,将结构生物学带入了结构基因组学时代.结构基因组学是对所有基因组产物结构的系统性测定,它运用高通量的选择、表达、纯化以及结构测定和计算分析手段,为基因组的每个蛋白质产物提供实验测定的结构或较好的理论模型,这将加速生命科学各个领域的研究.生物信息学、基因工程、结构测定技术等的发展为结构基因组学研究提供了保证.近年来核磁共振在技术方法上的进展,使其成为结构基因组学高通量结构分析中的一个关键方法.     

基于质谱的蛋白质生物标志物发现中的特征选择与机器学习方法研究进展

随着质谱技术的进步以及生物信息学与统计学算法的发展,以疾病研究为主要目的之一的人类蛋白质组计划正快速推进。蛋白质生物标志物在疾病早期诊断和临床治疗等方面有着非常重要的意义,其发现策略和方法的研究已成为一个重要的热点领域。特征选择与机器学习对于解决蛋白质组数据"高维度"及"稀疏性"问题有较好的效果,因而逐渐被广泛地应用于发现蛋白质生物标志物的研究中。文中主要阐述蛋白质生物标志物的发现策略以及其中特征选择与机器学习方法的原理、应用实例和适用范围,并讨论深度学习方法在本领域的应用前景及局限性,以期为相关研究提供参考。     

北京蛋A质组研究中心被确立为国际总部

北京蛋白质组研究中心成立暨人类蛋白质组研究国际学术研讨会日前在北京举行,国际人类蛋白质组计划各分计划主席等多位国际知名科学家云集北京,共同交流人类蛋白质组计划的最新研究成果,共谋未来发展大计。此次会议的召开标志着人类蛋白质组计划研究进入了一个新的发展阶段,新建成的北京蛋白质组研究中心已经被正式确立为人类肝脏蛋白质组计划的国际总部。     

北京蛋白质组研究中心被确立为国际总部

北京蛋白质组研究中心成立暨人类蛋白质组研究国际学术研讨会日前在北京举行,国际人类蛋白质组计划各分计划主席等多位国际知名科学家云集北京,共同交流人类蛋白质组计划的最新研究成果,共谋未来发展大计。此次会议的召开标志着人类蛋白质组计划研究进入了一个新的发展阶段,新建成的北京蛋白质组研究中心已经被正式确立为人类肝脏蛋白质组计划的国际总部。旨在全面解读人类基因组“天书”的人类蛋白质组计划诞生于2001年2月,此后相继启动了人类血浆、肝脏等多个蛋白质组研究分计划。由中国科学院院士、北京蛋白质组研究中心主任贺福初领衔的…     

"鱇(鱼良)白鱼人工增殖技术和种群恢复研究"取得进展

由中国科学院昆明动物研究所、玉溪市水电局、抚仙湖管理局共同承担的"鱇(鱼良)白鱼人工增殖技术和种群恢复研究"项目是中国科学院昆明分院和玉溪市政府拟定的院、市合作项目之一.该项目于1999年4月正式启动.为顺利开展本项目的研究,以参加单位的有关科技人员的技术骨干,成立了"鱇(鱼良)白鱼人工增殖技术和种群恢复研究"实验站.     

蛋白质组研究的技术体系及其进展

随着后基因组时代的到来,蛋白质组研究越来越受到国内外科学工作者的密切关注, 我国国家自然科学基金委员会已把蛋白质组研究列为重大科研项目.概述了蛋白质组研究中的基本技术,包括双向凝胶电泳的样品制备和分离、蛋白质的检测、凝胶图像分析、蛋白质的鉴定以及蛋白质数据库构建等,并就蛋白质鉴定的常用方法如氨基酸组成分析方法、蛋白质末端序列分析、肽质量指纹谱作了详细阐述.直观地列出了蛋白质组研究的技术体系流程图,着重介绍了蛋白质组研究的最新技术及其进展.     

方中明副教授参加国家重点研发计划项目会议并作会议报告

正2016年10月22-23日,由南京农业大学承办的国家重点研发计划"主要农作物养分高效利用性状形成的分子基础"项目会议在南京国际会议中心召开。我校生命科学与技术学院教师方中明副教授作为课题任务"氮营养调控水稻产量性状发育的分子机制的研究"负责人与会,并作会议报告。     

规模化蛋白质鉴定中母离子的准确检测技术研究

蛋白质组学的基础研究之一是蛋白质鉴定.规模化的蛋白质鉴定通常采用"鸟枪法",即选择一些酶切肽段(母离子)碎裂生成二级谱图,通过二级谱图及其母离子质量鉴定肽段,再推断对应的蛋白质.在鉴定过程中,母离子质量是一个关键参数.母离子是否是肽段的单同位素峰决定了正确肽段是否能进入候选,母离子的质量精度决定了候选肽段的数目.本文从判断单同位素峰和系统误差校准这两个角度研究了母离子的准确检测技术.判断单同位素峰的技术在蛋白质上已有研究,包括电荷判断、单同位素峰判断和重叠同位素峰判断.可以借鉴蛋白质水平的技术研究母离子的单同位素峰判断方法.同时母离子的系统误差校准也有较为成熟的方法.这两个角度的研究有助于提高规模化蛋白质的鉴定率.     

祁连山区几种草地蝗虫蛋白质营养评价

为评价草地蝗虫作为家禽蛋白源饲料的营养价值.本研究以几种草地蝗虫为供试对象,在分析测定其蛋白和氨基酸含量基础上,采用国际通用蛋白质营养评价标准,分析评价其蛋白质营养价值.结果表明,草地蝗虫蛋白含量高(62.4%～67.3%,DM),氨基酸组分齐全、家禽所需必需氨基酸约占蝗虫总干重的30.3%～34.2%,其氨基酸模式优...     

要闻聚焦: 铁基纳米材料类酶效应与急性髓系白血病诊疗技术国家重点研发项目简介

正纳米酶是一类具有类似天然酶催化活性的纳米材料,自2007年氧化铁基纳米酶被中国科学家发现并首次报道以来,迄今已有超过50种不同纳米酶被发现,并用于生物、医学、农业、环境治理、国防安全等多个领域的研究.近年来,纳米酶的应用研究已从体外检测发展到体内治疗,展示出其对现代生物医学技术的重要影响及广阔的应用潜力.2017年在国家重点研发专项"纳米计划"中,"铁基纳米材料类酶效应与急性髓系白血病诊疗技术"项目获得了立项,本项目旨在通过对铁基纳米     

基于“人造精子细胞”的基因组标签计划

蛋白质是一切生命活动的基础,蛋白质研究特别是生命活动中蛋白质功能网络调控的揭示成为继人类基因组计划后广受关注的重要科学问题.然而,大规模开展蛋白质研究缺乏一个高效、标准的平台,构建基因组范围的蛋白质标签模式生物资源平台是解决这一问题的关键.虽然在酵母、线虫、果蝇等模式生物上已经实现了基因组范围的蛋白质标签文库的构建,但是在小鼠个体水平上,基因组范围的蛋白质标签的构建仍然困难重重.基因组标签计划(Genome tagging project, GTP)的提出是基于孤雄单倍体胚胎干细胞(又称为"人造精子细胞")介导的半克隆技术和CRISPR-Cas9基因编辑技术的发展:首先在"人造精子细胞"上利用CRISPR-Cas9技术对特定编码蛋白质基因进行标签序列的原位插入获得相应的细胞系,进一步通过卵子注射即能获得携带标签的小鼠模型.因此,该策略简单、高效、成本低,可以用于基因组范围制备蛋白质标签小鼠. GTP的目标是给小鼠中的每个蛋白质带上标签, GTP的实施有望实现以一套标准化的方法来对每个蛋白质进行在体研究,将促进生命科学的发展.     

与昆虫学相关的“973”计划项目简介

1997年6月4日,原国家科技领导小组第三次会议决定要制定和实施《国家重点基础研究发展规划》,随后科技部组织实施了国家重点基础研究发展计划,亦称"973"计划。制定和实施"973"计划是党中央、国务院为实施"科教兴国"和"可持续发展战略",加强基础研究和科技工作做出的重要决策,是提高科技持续创新能力的重要举措。文章简要介绍与昆虫学相关的8个"973"计划项目的研究概况,这8个项目分别是:农作物重大病虫害成灾机理及调控基础的研究、农业重要转基因生物安全研究、农林危险生物入侵机理与控制基础研究、农业微生物杀虫防病功能基因的发掘和分子机理研究、绿色化学农药先导结构及作用靶标的发现与研究、家蚕主要经济性状功能基因组与分子改良研究、农业生物多样性控制病虫害和保护种质资源的原理与方法、重大农业害虫猖獗危害的机制及可持续控制的研究。     

植物生理学的展望

当今很多国家都在考虑发展战略、长远规划。这是为迎接二十一世纪的到来作准备,但更重要的是和科学技术发展的突飞猛进有关。美国在1983年3月提出了星球大战计划,看来是为军事目的服务的,实际上它将带动高技术、新技术的发展。1985年7月欧洲宣告“尤里卡”计划的诞生,更明确地声称它是“具有军事价值的民用技术的飞跃”。1985年     

蛋白质溶液NMR结构测定的一些新进展

新的标记技术的进展和采用稀释的液晶作为溶剂以提供额外的结构信息,提高了核磁共振技术测定蛋白质溶液三维结构的精度,扩大了分子质量测定范围.目前已经利用多维 ¹⁵N,¹³C,²H标记NMR测定了许多分子质量为30 ku左右的蛋白质溶液结构,这一上限可能还会被进一步提高.     

十一五国家高技术研究发展计划“重大疾病的分子分型和个体化诊疗”重大项目布局及实施情况分析

简要分析了"十一五"期间国家高技术研究发展计划("863"计划)"重大疾病的分子分型和个体化诊疗"重大项目的课题设置及实施情况。分别从本项目研究方向及课题设置、课题承担单位及研究人员结构、课题完成情况及所取得的代表性研究成果等方面进行了具体分析和归纳总结,供广大科技工作者参考。     

研发动态·产业动向·会议报道

我国将加强发育与生殖等4项重大科学研究2007年,科技部将加大基础研究和前沿技术研究的支持力度,将在综合交叉和重要科学前沿领域进行重点部署,组织实施纳米、干细胞、蛋白质、生殖与发育等科学研究计划。2006年,“973”计划批准了70个项目立项,启动蛋白质研究、量子调控研究、     

蛋白质组学技术及其在肺脏疾病研究中的应用

蛋白质组学是旨在研究蛋白质表达谱和蛋白质与蛋白质之间相互作用的新领域,其研究必须依赖高通量、高自动化的技术.简要介绍了蛋白质组分离技术(双向电泳、色谱),蛋白质组分析技术(质谱分析、氨基酸组成分析、蛋白质芯片,Edman降解法测N端序列),蛋白质相互作用技术(酵母双杂交系统、表面等离子共振)以及生物信息学.并从寻找差异表达的蛋白质,寻找用于诊断的疾病相关的标记分子,研究疾病的发病机制三方面介绍了蛋白质组技术在肺脏疾病研究中的应用.     

“自顶向下(top-down)”的蛋白质组学——蛋白质变体的规模化鉴定

高分辨率质谱技术的快速发展使得"自顶向下"的蛋白质组学(top-down proteomics)研究逐渐成熟起来.在完整蛋白质水平上研究蛋白质组可以提供更精准、更丰富的生物学信息,特别是对于蛋白质上发生了多种关联性的翻译后修饰的情况.另外,由于基因突变、RNA可变剪接和大量蛋白质翻译后修饰的存在,同一个基因往往最终会产生多个"蛋白质变体"(proteoform),而要准确地鉴定这些蛋白质变体,也离不开"自顶向下"的蛋白质组学.在蛋白质水平上的分离技术、质谱技术与生物信息学技术是完整蛋白质鉴定最关键的三项技术.高效的分离技术是实现规模化蛋白质变体鉴定的前提,有效的质谱碎裂是提供可靠鉴定的核心,而快速准确的质谱鉴定算法则是数据分析效率的保障.本文对这三项技术进行了详细总结,重点集中在生物信息学相关技术上,包括对完整蛋白质的质谱数据预处理、数据库搜索鉴定以及翻译后修饰定位等几个计算问题的讨论.     

酵母三杂交系统的应用研究进展

1996年,酵母三杂交技术被研究应用于筛选RNA结合蛋白.本介绍了酵母三杂交系统的原理、应用、前景和存在的不足及局限,并分析其原因,总结了在过去8年中利用此方法所取得的成就.在酵母双杂交基础上发展起来的酵母三杂交系统,其应用范围已扩大到蛋白质-蛋白质、蛋白质-RNA、蛋白质-小分子药物间的相互作用等更加广泛的研究领域.