瘤胃微生物RNA提取中样品前处理方法的优化

通过优化瘤胃液前处理方法,提高瘤胃微生物RNA提取数量与质量。试验优化4个前处理条件,共组合形成5个处理组。前处理完成后,利用Trizol进行RNA提取,检测RNA浓度和完整度(RIN)。结果显示,提取瘤胃内容物和瘤胃菌体RNA浓度和完整度的影响没有显著差异(P0.05)。液氮保存的样品提取的RNA浓度和完整度均显著(P0.05)高于RNA保护液保存的样品。解冻处理对RNA浓度的影响无显著差异(P0.05),但是不解冻处理提取的RNA完整度显著高于解冻处理(P0.05)。液氮冷冻研磨提取的RNA浓度(P0.05)显著高于常温研磨,但是对RNA完整度的影响没有显著差异(P0.05)。瘤胃内容物、液氮速冻、不解冻处理结合冷冻研磨方法所提取RNA的RIN值为9.43,完整度最高。瘤胃内容物、液氮速冻、解冻离心收集菌体结合冷冻研磨方法所提取的RNA浓度为1 048 ng/μL,为最高浓度。因此,瘤胃内容物直接液氮速冻并在不解冻条件下冷冻研磨,所提取的RNA效果最好,可用于后续宏转录组学试验。     

微生物代谢组学的前处理及分析技术

微生物代谢组学主要研究细胞生长或生长周期某一时刻细胞内外所有低分子量代谢物。分析技术的不断发展促进了微生物代谢组学研究的进展。本文结合微生物样品前处理方法, 综述了目前研究中所采用的各种分析技术的特点与应用, 并展望微生物代谢组学研究中分析技术的发展趋势。     

LC-MS/MS测定单抗药动学参数的样品前处理方法研究进展

随着生物技术药物研发的大力开展,单抗类药物的药动学评价越来越受到重视。对近年来应用LC-MS/MS检测单抗类药物药动 学特征的文献进行归纳,总结其样品前处理的不同方法及各自优缺点和适用范围,为单抗类药物LC-MS/MS检测方法的进一步研究提供 参考。     

菌落总数检测胶膜的制备与应用

本文应用胶膜法和平板倾注法,检验省内外14个单位的食品、水、化妆品等10种2445份样品的菌落总数,经符号秩和统计,P>0.05,结果无显著差异,胶膜法操作简便,成本低廉、结果准确、运输和保存方便,对基层检验单位有广泛的应用价值。     

不同方法检测鸡蛋表面菌落总数的相关性研究

研究了ATP生物荧光检测法与国标法《GB4789.2-2010食品卫生微生物学检验菌落总数测定》检测鸡蛋壳表面细菌总数的相关性。采用ATP生物荧光检测法和国标法对40个混合样品表面细菌总数进行检测,以log CFU/个蛋壳为横坐标(x),以logRLU/个蛋壳为纵坐标(y),分别进行线性、对数、乘幂、指数拟合。结果表明,ATP荧光检测法与国标法检测结果 Pearson相关系数为0.912,线性模型y=0.7306x-1.0041(R2=0.8322)拟合度较高。该试验结果为ATP荧光检测法在鸡蛋壳表面细菌总数快速检测中应用的可行性提供了依据。     

3M Petrifilm快速菌落总数测试片法与食品中菌落总数检测国标方法（GB 4789.2‒2010）的比较

目的 比较3MTM PetrifilmTM快速菌落总数测试片（RAC）法与食品中菌落总数检测国标方法（GB 4789.2‒2010）检测熟肉样品、人工污染熟肉样品中的菌落总数结果的一致性。方法 分别用两种方法对129份熟肉样品和166份人工污染熟肉样品进行菌落总数项目的检测,并对3MTM PetrifilmTM快速菌落测试片法与国标方法的实验结果进行配对资料t检验、线性回归分析以及对数值差值绝对值（|dlog|）汇总分析。结果 第一部分：两种方法检测熟肉样品、人工污染熟肉样品的菌落总数检测结果t=1.5704、P=0.1188,差异无统计学意义;相关系数R2值分别为0.897、0.964;|dlog|≤0.500所占百分比分别为97.7％、100.0％。第二部分：两种方法检测295份样品,t=1.1336,P=0.2586;相关系数R2=0.992;|dlog|≤0.500的结果百分率为99.0％。结论 在检测熟肉样品、人工污染熟肉样品时,3MTM PetrifilmTM快速菌落总数测试片法与国标方法检测结果的一致性较好。     

短尾猴样品常见污染的检测方法

为检测在野外通过非损伤取样法采集到的短尾猴样品是否受到其它常见哺乳动物及人源的污染,收集包括短尾猴(Macaca thibetana)、人以及7种常见哺乳动物的毛发、血液、粪便、精液或肌肉组织样品,提取并纯化基因组DNA,利用14对微卫星引物扩增不同物种的STR位点,以确定其在短尾猴样品检测中的应用价值。扩增结果表明,TH01等13对引物在人和短尾猴中均能扩增且扩增产物长度未见明显差异,F13A01产物长度在人和短尾猴之间相差240bp碱基,只有FGA位点在常见动物猪、羊、牛、狗、兔、小白鼠及豚鼠都未见扩增产物;因此,FGA、F13A01座位较高的分辨能力,可以排除短尾猴样品是否受到人及常见哺乳动物的污染,通过特异性STR引物结合PCR方法,检测短尾猴野外非损伤取样获得的样品是否受到哺乳动物及人源DNA污染,此方法简单、稳定性高、可重复性好,在短尾猴的遗传多样性分析及亲缘关系鉴定中有较大的应价值。     

不稳定生物样品的前处理

本文综述了几种不稳定生物样品的前处理方法,如易被酶解的蛋白变性或加入抑制剂使酶失活,易被氧化的加入抗氧剂或衍生化掩蔽不稳定基团,光不稳定的避光操作,易受pH值和温度影响的选择合适条件等,最大程度保证测定结果的准确性。     

丹参分析样品中丹参酮的超声波辅助提取

为了提取丹参分析样品中隐丹参酮、丹参酮Ⅰ及丹参酮ⅡA等有效成分,建立了以CH3OH-CH2Cl2为提取溶剂的超声波辅助提取法。优化的提取条件是,液／固比：133．3mL／g,提取溶剂组成：φ（CH2Cl2）=0．2,提取时间：8min。与几种常规提取法（如甲醇回流法、CH3OH—CH2Cl2室温浸取法）相比较,超声波辅助提取法具有提取时间短、丹参酮提取量高等优点,适用于丹参中隐丹参酮、丹参酮Ⅰ及丹参酮ⅡA同时测定的样品前处理。     

Selection and optimization of a suitable pretreatment method for miscanthus and poplar raw material

Miscanthus and poplar are very promising second‐generation feedstocks due to the high growth rates and low nutrient demand. The aim of the study was to develop a systematic approach for choosing suitable pretreatment methods evaluated with the modified severity factor (log ). Optimal pretreatment results in a high delignification grade, low cellulose solubilization and increased accessibility for enzymatic hydrolysis while revealing minimal log values. In order to do so, several reaction approaches were compared. Acid‐catalyzed organosolv processing carried out for miscanthus and poplar revealed the highest delignification grade leading to a relatively high glucose yield after enzymatic saccharification. In both cases, a design of experiments approach was used to study the influence of relevant parameters. Modeling the data resulted in the identification of optimum pretreatment conditions for miscanthus with concentrations of 0.16% H₂SO₄ and 50% EtOH at 185°C for a retention time of 60 min. Experimental validation of these conditions revealed an even higher delignification degree (88%) and glucose yield (85%) than predicted. 0.19% H₂SO₄ and 50% EtOH were determined as optimum concentrations, 182°C and 48 min identified as optimum pretreatment conditions for poplar; the delignification degree was 84% and the resulting glucose yield 70%.     

蜜蜂蜂王质量及其性状表现影响因素研究进展

作为重要的传粉昆虫,蜜蜂蜂群损失现象受到广泛关注。研究表明,蜂王问题是导致蜂群损失的主要因素之一。蜂王是蜂群中唯一雌性生殖器官发育完全的个体,是维持蜂群存续的关键。蜂王质量决定了蜂群的群势以及生产性能,对蜂群的发展和存活至关重要。本文详细介绍了表征蜂王质量的相关指标及其在蜂王选育过程中的应用,深入论述了幼虫日龄、营养、交尾、环境温度、病虫害以及农药等相关因素对蜂王质量及其性状表现的影响,以期为蜂王的培育和使用以及蜜蜂资源的保护和利用提供参考。     

过氧化氢酶发酵生产条件优化及在染整清洁生产中的应用研究

在以嗜热子囊菌生产过氧化氢酶的摇瓶发酵研究中,获得了适合工业化生产的碳源,即以26g/L的糊化玉米淀粉和1%(v/v)乙醇为混合碳源,过氧化氢酶的酶活达到了1996 u/mL,比优化前提高了25%。在此基础上,重点研究了发酵罐上的主要影响因素溶解氧对发酵的影响,通过分段控制搅拌转速,在52h将搅拌转速从200r/min提高到350r/min,过氧化氢酶最高酶活达到4505 u/mL,与不使用控制溶氧水平策略相比,酶活力提高了2.4倍。此外,还考察了该酶去除过氧化氢的效率,并在实际纺织生产中进行了应用实验,取得了良好的效果。     

代谢组学信息获取与数据预处理瓶颈问题探讨

经过近15 年的快速发展,代谢组学已逐步成熟并渗透到生命科学和医学研究领域的各个层面。随着认识的不断深入,各种影响代谢组学研究的细节因素和技术瓶颈逐步被揭示。从生物样品采集与制备、原始数据采集、数据预处理和方法学验证等方面系统探讨了影响代谢组学研究的主要瓶颈问题,以期推动代谢组学研究的精细化和规范化发展。     

The effect of reference sample composition and size on dental age interval estimates

Objectives

Validation studies in juvenile dental age estimation primarily focus on point estimates while interval performance for reference samples of different ancestry group compositions has received minimal attention. We tested the effect of reference sample size and composition by sex and ancestry group on age interval estimates.

Materials and Methods

The dataset consisted of Moorrees et al. dental scores from panoramic radiographs of 3334 London children of Bangladeshi and European ancestry and 2–23 years of age. Model stability was assessed using standard error of mean age-at-transition for univariate cumulative probit and sample size, group mixing (sex or ancestry), and staging system as factors. Age estimation performance was tested using molar reference samples of four sizes, stratified by year of age, sex, and ancestry. Age estimates were performed using Bayesian multivariate cumulative probit with 5-fold cross-validation.

Results

Standard error increased with decreasing sample size but showed no effect from mixing by sex or ancestry. Estimating ages using a reference and target sample of different sex reduced success rate significantly. The same test by ancestry groups had a lesser effect. Small sample size (n < 20/year of age) negatively affected most performance metrics.

Discussion

We found that reference sample size, followed by sex, primarily drove age estimation performance. Combining reference samples by ancestry produced equivalent or better estimates of age by all metrics than using a single-demographic reference of smaller size. We further proposed that population specificity is an alternative hypothesis of intergroup difference that has been erroneously treated as a null.     

落叶阔叶林反照率的时间变化与影响因素

反照率原位测量对生态系统能量收支及其遥感应用至关重要,但目前坡面地形反照率的测量方式有局限且可见光与近红外波段反照率时间变化的差异尚不清楚。本研究以东北地区帽儿山森林生态站的落叶阔叶林为例,探究入射和反射太阳辐射(SR,300～2800 nm)、光合有效辐射(PAR,400～700 nm)、近红外辐射(NIR,700～2800 nm)的反照率时间变化特征及其影响因子,同时分析了两种辐射表安装方式反照率的差异。结果表明: 晴天SR和NIR反照率日变化呈上下午不对称的U型曲线,但PAR从早到晚递增;阴天反照率均先急剧下降后趋于稳定。平行于坡面测量增大了反照率的日均值,但缓和了SR、NIR反照率日不对称的现象。从整个生长季来看,SR、NIR与PAR反照率水平测量时最大值分别为0.16、0.27和0.11,最小值分别为0.07、0.11和0.03。SR和NIR反照率季节变化均为先增大后减小(7月为峰值),PAR则相反,SR反照率主要受NIR而不是PAR控制。各波段反照率季节变化的影响因子按照贡献率排序为宽带归一化植被指数(61.7%～78.5%,可表征叶面积指数)>太阳高度角(15.4%～36.9%)>晴空指数(0.4%～36.9%)。     

戴云山南坡不同海拔森林土壤微生物功能多样性特征及影响因素

土壤微生物作为森林生态系统的主要分解者,参与土壤养分循环,在维持土壤生态系统功能和服务中发挥着重要作用。探讨不同海拔土壤微生物群落结构和功能多样性的季节变化,对维持土壤生态系统稳定具有重要研究价值。以戴云山南坡不同海拔土壤为研究对象(900-1500 m),采用Biolog-ECO微平板法,研究不同海拔土壤微生物群落结构和功能多样性的季节变化(夏季与冬季),揭示驱动戴云山不同海拔土壤微生物季节变化的主要因素。结果表明:(1)夏季海拔1400 m区域土壤微生物的碳源利用最强,微生物活性最高。冬季表现为海拔900 m处土壤微生物对碳源利用最强,活性最高。(2)土壤微生物群落对碳源利用特征的研究表明,夏季与冬季中氨基酸类和羧酸类碳源是7个海拔土壤微生物利用的主要碳源,且夏季碳源利用程度高于冬季。(3)冗余分析表明夏季和冬季戴云山南坡7个海拔土壤微生物群落功能多样性均受土壤环境因子驱动,解释量分别为72.63%和44.12%,均高于地形因子的解释量。(4)土壤温度和全钾含量等因子是驱动夏季土壤微生物群落功能多样性变化的主要因素;土壤全钾、全磷、有效磷含量和坡向是驱动冬季土壤微生物群落功能多样性变化的主要因素。海拔和季节变化通过调节土壤理化性质和土壤酶活性,进而影响森林土壤微生物群落结构和功能多样性。