不同种类微生物血培养阳性报警时间分析

目的分析不同病原菌在Bact/Alert 3D血培养仪中的阳性报警时间。方法收集浙江大学医学院附属第一医院2012年10月到2013年8月血培养阳性报警时间,分析病原菌种类,算出各常见病原菌阳性报警的中位时间。结果总共1 472份阳性标本:革兰阳性菌占55.2%,革兰阴性菌占37.5%,真菌占7.3%。对血培养阳性报警时间进行分析:≤12 h、≤24 h、≤48 h报警的病原菌分别为420株(28.5%)、956株(64.9%)、1290株(87.6%)。血培养阳性病原菌仪器报警中位时间分别为肠杆菌科细菌(10.8 h)、非发酵菌属(13.9 h)、链球菌属(14.6 h)、肠球菌属(14.5 h)、葡萄球菌属(22.3 h)、真菌(43.4 h)。大肠埃希菌(10.1 h)、鲍曼不动杆菌(10.8 h)、阴沟肠杆菌(10.8 h)、肺炎克雷伯杆菌(11.1 h)阳性报警中位时间相近,都≤12 h。结论根据全自动血培养仪对不同种类微生物阳性报警时间的差别,可初步判断病原菌的生长和类型,第一时间指导临床医师准确、合理选择抗菌药物。     

Slidex Staph-kit和血浆凝固酶试验在金葡菌鉴定中的应用

金黄色葡萄球菌（SA）是一种重要的机会致病菌,常引起化脓性感染,也是医院感染的重要病原菌之一,准确鉴定SA具有重要的临床意义,为了解玻片法凝固酶试验在GPI（革兰阳性球菌鉴定卡）鉴定葡萄球菌中的影响,我们收集玻片法凝固酶试验阳性经VITEK32细菌仪鉴定为SA的59株菌,用Slidex Staph-kit（葡萄球菌凝聚鉴定试剂盒）、试管法凝固酶和玻片法凝固酶3种方法进行再鉴定,现将结果报告如下。     

老年患者下呼吸道感染病原菌分布与耐药性分析

目的探讨老年患者下呼吸道感染常见病原菌分布及其耐药情况,为临床合理用药提供依据。方法对本院2010年1月至2013年12月老年患者下呼吸道痰标本分离的病原菌用VITEK32全自动细菌鉴定仪进行鉴定,用K-B纸片法进行体外药敏试验,用WHONET 5.4软件进行统计学分析。结果共分离出病原菌936株,其中革兰阴性菌655株(69.98%),前四位为肺炎克雷伯杆菌、大肠埃希菌、铜绿假单胞菌和鲍氏不动杆菌,占比分别为24.89%、18.38%、11.97%和8.01%;革兰阳性菌196株(20.94%),前三位为金黄色葡萄球菌、溶血葡萄球菌和肠球菌属,占比分别为10.15%、4.70%和3.10%;真菌85株(9.08%)。药敏结果显示,主要革兰阴性菌对阿米卡星、哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦和亚胺培南耐药率较低;主要革兰阳性菌对呋喃妥因、利福平、阿米卡星、替加环素、利奈唑胺和万古霉素耐药率较低。结论老年患者下呼吸道感染病原菌以革兰阴性杆菌为主,并出现多重耐药,临床应根据药敏结果合理选择抗菌药物。     

VITEK2 Compact全自动微生物分析系统对牛乳中葡萄球菌的鉴定效果评价

【目的】评价VITEK2 Compact全自动微生物分析系统对牛乳中葡萄球菌属细菌鉴定效果。【方法】对从西宁、白银、西安三地乳样中分离的52株葡萄球菌通过VITEK2 Compact全自动微生物分析系统进行鉴定,并与革兰氏染色、触酶试验、血浆凝固酶试验以及16S r RNA基因序列分析结果进行比对;通过对凝固酶阴性葡萄球菌和凝固酶阳性葡萄球菌在不同麦氏浓度的鉴定,评价该系统的稳定性。【结果】VITEK2 Compact全自动微生物分析系统对葡萄球菌在"属"水平的鉴定结果符合率达96.15%,与血浆凝固酶结果对比,凝固酶阴性葡萄球菌属细菌鉴定结果符合率为92.86%,对凝固酶阳性葡萄球菌属细菌鉴定结果符合率为50%,但对具体种鉴定时,结果符合率仅为44.23%。在稳定性检测的试验中,鉴定符合率为100%,鉴定结果可靠性不随菌液浓度变化而变化。【结论】该系统可用于牛乳中葡萄球菌在"属"水平的鉴定。     

肝硬化并发自发性腹膜炎患者腹水病原菌分布及耐药性分析

目的探讨肝硬化并发自发性腹膜炎(SBP)患者腹水病原菌分布及耐药情况,为临床合理用药提供参考。方法回顾性分析本院2008年1月至2013年12月间SBP患者腹水病原菌162株,用VITEK32自动分析仪进行菌种鉴定,K-B纸片法进行药敏试验。结果共分离出病原菌162株,其中革兰阴性菌占70.37%,前四位为大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、阴沟肠杆菌和铜绿假单胞菌;革兰阳性菌占22.22%,前三位为表皮葡萄球菌、肠球菌属和金黄色葡萄球菌;真菌占7.41%,以白色假丝酵母菌为主。药敏结果显示,大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌和阴沟肠杆菌对阿米卡星、哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦较敏感,未检出耐亚胺培南菌株,铜绿假单胞菌的耐药率普遍较高。主要革兰阳性菌对青霉素的耐药率80%,未检出耐力奈唑胺、万古霉素和替考拉宁菌株。结论 SBP腹水病原菌以大肠埃希菌为主,临床应根据药敏结果合理使用抗生素,减少耐药株的产生。     

三种前处理在基质辅助激光解析电离飞行时间质谱鉴定假丝酵母菌属中的应用比较

目的比较3种前处理方法在基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI TOF-MS)鉴定假丝酵母菌属中的结果可靠性。方法以ITS测序鉴定结果为金标准,对临床分离的66株假丝酵母分别采用传统直涂法、改良直涂法和甲酸-乙腈蛋白提取法进行前处理,MALDI TOF-MS鉴定,比较3种方法的Biotyper Log值,分析质谱图的差异。结果传统直涂法、改良直涂法和甲酸-乙腈提取法对66株假丝酵母的属水平鉴定率分别为48.5%、50.0%和97.0%,Biotyper Log均值分别为1.628、1.674和2.010,其中甲酸-乙腈提取法对66株假丝酵母的种水平鉴定率为53.0%。甲酸-乙腈提取法得到的质谱图比另2种方法的质谱图离子峰更加密集,图像更复杂,鉴定结果可信度更高。结论甲酸-乙腈蛋白提取法对假丝酵母菌属的鉴定成功率和可靠性明显高于传统直涂法和改良直涂法,对临床假丝酵母菌病的准确诊断具有重要价值。     

辽宁省近5年痰培养主要病原菌分布及临床意义

了解住院患者痰培养的病原菌分布及其对常用抗菌药物的耐药情况,为临床合理用药提供参考.回顾性分析辽宁省2015年1月至2019年12月共3878份痰标本感染菌鉴定结果和铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)的药敏试验结果.采用法国梅里埃VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定仪进行菌种鉴定,并...     

重症监护室呼吸机相关性肺炎病原菌分布及耐药性分析

目的探讨重症监护室（ICU）呼吸机相关性肺炎（VAP）病原菌的分布及其耐药性,为临床合理用药提供参考。方法以台州市第一人民医院2009年1月至2012年12月ICU收治的458例VAP患者为研究对象,回顾性分析VAP的病原菌分布和耐药情况。菌株鉴定使用法国梅里埃VITEK32分析仪,用纸片扩散法做药敏试验。结果458例VAP患者共检出582株病原菌,其中革兰阴性杆菌占70．96％,革兰阳性球菌占15．98％,真菌占13．06％。药敏结果显示,主要革兰阴性杆菌对阿米卡星、哌拉西彬他唑巴坦、头孢哌酮／舒巴坦、亚胺培南和美洛培南耐药率较低,主要革兰阳性球菌对左氧氟沙星、呋喃妥因、利福平、替考拉宁和万古霉素耐药率较低。结论VAP患者的病原茵以革兰阴性杆菌为主,临床应合理使用抗菌药物,降低病原菌的耐药率。     

一种联合MALDI-TOF MS直接鉴定阳性血培养瓶方法改进及与Sepsityper Kit试剂盒法、SELTERS法和血清分离胶法的比较

目的评价直接使用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)联合Sepsityper Kit试剂盒法(简称试剂盒法)、SELTERS法和血清分离胶法(简称分离胶法)鉴定阳性血培养瓶血中细菌的符合率,并对SELTERS方法进行改进,以缩短样本处理时间。方法对656例临床血培养阳性标本,应用试剂盒法、SELTERS方法或分离胶法处理后,直接使用质谱仪快速鉴定菌株,同时进行传统培养,比较分析二者之间的差异。结果656例血培养阳性标本共分离出626株单种菌感染和30株多种菌感染标本。MALDI-TOF MS联合试剂盒法、SELTERS法或分离胶法可在1 h内快速鉴定血培养阳性标本。在单种细菌感染中,MALDI-TOF MS联合试剂盒法直接鉴定革兰阳性菌的种、属符合率分别是66.8%(141/211)、21.3%(45/211),革兰阴性菌的种、属符合率分别是97.1%(367/378)、0.8%(3/378),真菌的种、属符合率分别是32.4%(12/37)、0.0%(0/37);MALDI-TOF MS联合SELTERS法直接鉴定革兰阳性菌的种、属符合率分别是66.8%(141/211)、21.3%(45/211),革兰阴性菌的种、属符合率分别是96.3%(364/378)、2.4%(9/378),真菌的种、属符合率分别是32.4%(12/37)、2.7%(1/37);MALDI-TOF MS联合分离胶法直接鉴定革兰阳性菌的种、属符合率分别是51.2%(108/211)、20.9%(44/211),革兰阴性菌的种、属符合率分别是93.4%(353/378)、1.6%(6/378),真菌的种、属符合率分别是13.5%(5/37)、2.7%(1/37);MALDI-TOF MS联合改良SELTERS法直接鉴定革兰阳性菌的种、属符合率分别是59.1%(13/22)、18.2%(4/22),革兰阴性菌的种、属符合率分别是88.5%(23/26)、3.8%(1/26),真菌的种、属符合率分别是0.0%(0/2)、50.0%(1/2)。而对于多种菌感染的血培养瓶,3种方法鉴定率均较低。结论MALDI-TOF MS联合试剂盒法、SELTERS法或分离胶直接鉴定阳性血标本中的病原菌,其结果可在1 h内获得,并与传统培养结果相比具有较高的符合率。但是这些方法检测更快速、操作更简便,同时改良SELTERS法样本处理时间缩短,成本降低,且符合率与前3种方法没有区别。这4种方法均能满足临床快速诊断和及时有效抗菌治疗的需求,临床可根据自身情况选择。     

冷冻食品中低温微生物的研究

目的：研究冷冻食品中的低温微生物。方法：采用传统法对30份样品进行菌属鉴定,同时探讨了低温微生物的最适温度和时间。结果：得出5类菌属,并确定15℃ 48h为低温微生物快速、适用的检超温度和时间。     

长奈瑟菌致胸腔感染1例报道

本文报道了国内罕见的由长奈瑟菌引起的胸腔感染病例。分离菌株的鉴定分析采用MALDI TOF Vitek MS系统、VITEK 2 Compact全自动微生物分析系统和分子测序技术;常规药敏试验采用K-B法和E-Test法,并参照美国临床实验室标准化协会(Clinical and Laboratory Standards Institute, CLSI)对脑膜炎奈瑟菌的要求进行折点判读。同时分析长奈瑟菌的生物学特征及感染病例的诊疗过程,从而提高临床微生物人员对罕见病原菌的重视,并为临床诊疗提供实验室依据。     

MALDI-TOF-MS在病原微生物鉴定中的研究进展

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)是鉴定多种致病性细菌的快速、可靠的方法,具有较好的稳定性和可重复性,在快速和准确性方面的总体表现明显好于传统的细菌生化鉴定方法。适合于一些致病菌的快速、高通量的检测和鉴定。综述MALDI-TOF-MS技术在普通病原菌、多血清型病原菌、非发酵性细菌,以及植物病原菌等病原微生物鉴定方面的最新研究进展。     

微生物非培养鉴定技术在临床标本检查中的应用研究

感染性疾病的病原学诊断仍以微生物的分离培养作为“金标准”,但能培养成功的仅为少数。绕过分离培养环节,以微生物rRNA／rDNA基因作为种属鉴别序列,设计通用引物（universal primer,up）,用PCR扩增标本中微生物的16SrRNA或16S～23SrRNA序列,通过毛细管电泳（CE）进行单链构象多态性（SSCP）和限制性片段长度多态性（RFLP）分析,筛选基因的点突变以达到快速鉴定微生物（到属和种）。用PCR—CE—SSCP和PCR—CE—RFLP分析系统检测了呼吸道、消化道、女性生殖道标本中感染的病原菌;用PCR-CE-SSCP系统检测了男性泌尿道溶脲脲原体两个生物群。建立PCR—CE—RFLP分析系统,用非培养法鉴定技术检测脓汁、肠道和泌尿生殖道标本,检测并鉴定了临床标本中的多种病原菌;对人体肠道菌群进行定性和定量分析,用该法可协助腹泻的病原学诊断;检测生殖道常见的致病菌;用PCR—CE—SSCP系统建立了检测溶脲脲原体两个生物群的方法。微生物的非培养鉴定技术比传统方法缩短20h,为临床感染症的诊断提供快速、准确的依据。结果可见,利用16S～23SrRNA间区基因PCR—CE—RFLP和PCR—CE—SSCP系统可以达到对临床常见病原菌的快速种属鉴定,比传统的细菌培养法具有快速、准确、灵敏的优点,可用于临床感染症的病原学诊断。微生物的非培养鉴定技术将替代培养法而成为病原学诊断新的金标准。     

VITEK 2 Compact 联合MALDI-TOF MS、16S rDNA基因测序对1株类志贺邻单胞菌的对比鉴定报告

类志贺邻单胞菌属于肠杆菌科的邻单胞菌属,是革兰阴性杆菌,为人类条件致病菌,该菌首先发现于胃肠道,但无明确证据证实其具有肠致病性,仅个别例证报道其可引起败血症和肠胃炎。霍乱弧菌属于弧菌属,革兰阴性杆菌,血清型O1群和O139群是甲类传染病霍乱的病原菌,通过侵袭力和霍乱肠毒素致病,可引起严重的呕吐和腹泻;而血清型非O1/O139群血流感染在国内偶见报道。本文报告1例在湘潭市中心医院就诊的慢性肝病患者无明显诱因出现腹痛、腹泻伴呕吐,且畏寒、寒战,血培养检出1株革兰阴性杆菌,初期经VITEK 2 Compact 全自动细菌鉴定及药敏分析系统鉴定为霍乱弧菌;但后经基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)和16S rDNA基因测序,均确认为类志贺邻单胞菌。根据药敏试验结果,予哌拉西林/他唑巴坦抗感染,输血、护肝等对症治疗后好转出院,随访无复发。本报告结果提示,当Vitek-2 Compact将待检样本鉴定为霍乱弧菌等临床少见菌时,仍须结合细菌菌落形态、辅助生化试验以及患者的临床情况进行综合判断,必要时可采用质谱、基因测序等其他检测手段进行复核。     

应用基质辅助激光电离飞行时间质谱快速鉴定临床酵母菌

目的研究基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight MassSpectrometry,MALDI-TOF-MS)用于快速检测鉴定临床分离的酵母菌的可行性。方法应用Bruker MALDI-TOF-MS和VITEK 2-compact系统分别鉴定150株临床分离的酵母菌,结果不一致的菌株通过基因序列测定来鉴定。结果 MALDI-TOF-MS快速准确鉴定出了150株临床酵母菌,鉴定符合率在属水平上为100%,种水平上为94%。结论基于MALDI-TOF-MS鉴定方法具有很好的可重复性和准确性,并且其检测成本较低,实验准备时间很短,MALDI-TOF-MS可以用于临床分离的酵母菌的快速鉴定。     

新生儿血培养阳性病原菌分布及耐药状况分析

目的了解本院新生儿血培养阳性标本病原菌分布情况及主要病原菌的耐药特点,为临床合理治疗提供依据。方法对我院新生儿科4 750例患儿入院时行血培养,并以VITEK32全自动微生物分析仪进行菌株鉴定,K-B法进行药敏试验。结果共分离出病原菌617株,其中革兰阳性菌382株(61.91%),前三位为凝固酶阴性葡萄球菌(41.49%)、金黄色葡萄球菌(7.94%)和肠球菌属(6.00%),革兰阴性菌216株(35.01%),前四位为大肠埃希菌(12.97%)、肺炎克雷伯菌(9.08%)、粘质沙雷菌(5.51%)和阴沟肠杆菌(4.86%),真菌19株(3.08%)。药敏结果显示主要革兰阳性菌对青霉素G耐药率90%,对利福平和呋喃妥因的耐药率较低,未检出耐利奈唑烷和万古霉素菌株。主要革兰阴性菌对阿米卡星、左氧氟沙星、哌拉西林/他唑巴坦和头孢哌酮/舒巴坦耐药率较低,未检出耐亚胺培南、美罗培南和替加环素菌株。结论本院新生儿血培养病原菌以革兰阳性菌为主,凝固酶阴性葡萄球菌是主要病原菌,并且耐药率较高。     

Microscan AS-4和VITEK32微生物分析仪在室间质控中的应用

目的通过Microscan AS-4和VITEK32微生物鉴定／药敏分析仪对室问质控菌株的鉴定，了解2种仪器的差异性及与质控结果的符合程度。方法将质控菌株按操作规程进行操作，用Microscan AS-4和VITEK 32同时进行结果鉴定。结果Microscan AS-4和VITEK 32与36株质控菌株结果一次性的完全符合程度为72．2％(26／36)和80．6％(29／36)。结论VITEK 32对链球菌科的检出率与质控菌株结果的符合程度较高。Microscan AS-4对链球菌科的检出率相对较低。鉴定／药敏板中的苯唑西林最小稀释浓度为0．5μg／ml，按1999年版NCCLS药敏标准，苯唑西林对凝固酶阴性葡萄球菌MIC≤0．25μg／ml为敏感，MIC≥0．5μg／ml为耐药的标准不符合。     

4 689例血培养病原菌的临床分布与种类分析

目的：了解本院血培养病原菌的检出种类及在临床各科的分布。方法：应用Bact/Alert-120全自动血培养仅对4689例血标本进行培养,标本检出病原菌按常规鉴定并分类统计。结果：检出有临床意义病原菌355株,其中肠杆菌科和葡萄球菌属的细菌为主要病原菌（35.5%和27.3%)。以2000年全年标本统计,阳性率12.5%,假阳性率0.4%。以内科,外科,儿科,传染科,血液科,新生儿科等为病区统计,病原菌种类分布有明显不同,此外,病原菌种类不同,其阳性报告时间不同。结论：应用全自动血培养仪可以缩短阳性检出时间,了解病原菌在临床各科的分布特点,有利于医师对败血症诊治,及时准确地选择药物。     

1940例慢性阻塞性肺病患者感染的病原菌特点及其耐药性分析

目的 分析COPD病人感染的病原菌组成情况及其耐药性与院内的耐药性比较。方法 采用VITEK全自动微生物鉴定系统鉴定病原菌,按NCCLS（美国临床实验室标准化委员会）的纸片扩散法进行耐药性、ESBLs（超广谱β-内酰胺酶）及MRS（耐甲氧西林葡萄球菌）检测,统计分析采用WHONET5.4软件进行。结果 培养出的革兰阴性菌中肺炎克雷伯、绿脓假单胞菌及大肠埃希菌占前3位,革兰阳性菌中以葡萄球菌和肠球菌为主,ESBLs、MRS检出率分别为78.5%与76.1%,Fisher确切概率计算法革兰阴性菌的耐药率明显高于全院患者所感染革兰阴性菌的平均水平。结论 COPD患者感染以革兰阴性菌较为多见,且耐药率明显高于全院水平,ESBLs、MRS检出率高,提示感染患者细菌的高耐药性。     

儿童社区获得性肺炎的致病菌分布及耐药性分析

目的探讨我院儿童社区获得性肺炎(CAP)细菌感染情况及药敏情况,为抗生素的合理使用提供依据。方法以本院2010年1月至2013年12月儿科收治的CAP患儿为研究对象,回顾性分析CAP的病原菌分布和耐药情况。菌株鉴定使用法国梅里埃VITEK32分析仪,用纸片扩散法做药敏试验。结果病原菌以革兰阴性菌为主,前四位分别为肺炎克雷伯杆菌、大肠埃希菌、流感嗜血杆菌和阴沟肠杆菌;革兰阳性菌次之,主要为肺炎链球菌和金黄色葡萄球菌。药敏结果显示,主要革兰阴性菌对头孢吡肟、哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦和亚胺培南耐药率较低;主要革兰阳性菌对左氧氟沙星、莫昔沙星和万古霉素耐药率较低。结论了解CAP患儿病原菌分布,有利于在儿童CAP经验性治疗时制定正确的治疗方案。