人胎儿脑的一个cDNA编码序列及其蛋白质预测

用 m RNA差异显示 PCR技术 ,从人 1 8周、2 2周胎儿脑和肝肾组织的 m RNA逆转录产物得到一些特异性显示的片段 .其中一个随机片段 GC1 0 2作为探针 ,从本实验室构建的 1 8周胎儿脑c DNA基因文库进行杂交筛选 ,得到一个阳性克隆λ gt1 0 /GC1 0 2 .该克隆内插入的 c DNA片段长2 .9kb,经过 DNA测序 ,显示具有一个开放阅读框架 ,编码 1 37个氨基酸的肽链 .用蛋白质结构的建模软件预测了该肽链的立体结构初步模型 .     

用表达性差异显示分析技术分离人胎肝组织选择性表达基因

目的：建立4月龄人胎肝组织选择性表达基因EST库,为研究胚胎肝组织特异表达基因提供有力的工具。方法：采用表达性差异显示分析（representational difference analysis,RDA) 技术建立4月龄人胎肝组织选择性表达基因EST库,并测定部分克隆核苷酸序列,以竞争PCR检测代表性基因的差异表达。结果与结论：以珠蛋白家族基因为标志,所建差减cDNA文库中α－珠蛋白家族基因的表达频率较未差减cDNA文库增高7倍,同时该文库也含有多种与肝生长密切相关的基因,表明RDA技术确是研究差异表达基因的有效手段,所建EST库富集胎肝特异表达基因。部分克隆序列分析获得2种未报道序列,其中一株含有丝／苏氨酸激酶结构域,表明可望从此库中分离具有重要未知功能的新基因。     

有序差异显示法研究大鼠脑特异基因

有序差异显示法(ordered differential display, ODD)是一种简便的系统研究基因表达谱差异的有效方法. 采用链霉亲和素和生物素的特异亲和性质分离目标cDNA片段, 从而排除非特异DNA片段的影响后, ODD法的重复性和可靠性得到了进一步的改进和完善; 随后利用ODD法对胚胎大鼠脑与身体的基因表达差异进行了初步研究, 得到几十条脑特异表达的EST(expressed sequence tag)片段; 再通过反向杂交、RT-PCR实验和EST结果分析, 验证了改进后的ODD方法的结果可靠, 假阳性率低, 重复性好, 同时, 还对克隆到的脑特异全长新基因rZIC的生理功能进行了初步研究. 将rZIC的反义核酸注射到小鼠侧脑室, 测定小鼠的行为变化. 通过分析实验结果发现, rZIC对维持成年小鼠的运动功能有一定的作用.     

通过荧光差异显示PCR法分离水稻中由ABA调节的基因

脱落酸（ABA）在植物种子发育以及植物地外源环境因子（如逆境,胁迫等）反应过程中起着重要的作用,对其调节基因的分离将有助于了解其相关信号传导途径及作用机制。通过荧光差异显示PCR法我们由水稻中分离了部分ABA调节的cDNA片段,在所分离克隆的17个片段中,有14个片段被ABA诱导（2,4,8,12h),有2个片段被ABA抑制（8h),测序及序列分析表明这些片段可能分别编码与植物光合作用（7）,信号传导（1）,转录调控（2）,代谢（6）相关的蛋白或未知蛋白（1）而且其表达可能受到ABA的调节或ABA参与了其作用,对其中可能编码α/β水解酶折叠蛋白,酪氨酸磷酸酶,液泡H^ -ATPase的mRNA进行的RT－PCR和Northern blot分析,确证了ABA对它们表达的调节作用。在此基础上对FDD－PCR技术及ABA作用的可能机制进行了讨论。     

通过荧光差异显示PCR法分离水稻中由ABA调节的基因

脱落酸(ABA)在植物种子发育以及植物细胞对外源环境因子(如逆境、胁迫等)反应过程中起着重要的作用,对其调节基因的分离将有助于了解其相关信号传导途径及作用机制.通过荧光差异显示PCR法我们由水稻中分离了部分ABA调节的cDNA片段,在所分离克隆的17个片段中,有14个片段被ABA诱导(2、4、8、12h),有3个片段被ABA抑制(8h).测序及序列分析表明这些片段可能分别编码与植物光合作用(7)、信号传导(1)、转录调控(2)、代谢(6)相关的蛋白或未知蛋白(1)而且其表达可能受到ABA的调节或ABA参与了其作用,对其中可能编码α/β水解酶折叠蛋白、酪氨酸磷酸酶、液泡H+-ATPase的mRNA进行的RT-PCR和Northern blot分析,确证了ABA对它们表达的调节作用.在此基础上对FDD-PCR技术及ABA作用的可能机制进行了讨论.     

一种快速mRNA差异显示技术及用于分离辐射诱导转录子

介绍一种从不同类型细胞或不同生长状态细胞中分离差异表达基因的快速ｍＲＮＡ差异显示技术．其特点是不用同位素标记,操作简便,在普通琼脂糖凝胶电泳中就能分辨差异显示的ｃＤＮＡ带,便于ＤＮＡ回收和进一步重组克隆．用此方法成功地分离到电离辐射诱导转录子．     

用改进的DDRT-PCR技术进行人胚差异基因筛选

介绍一种从不同类型细胞或不同生长状态细胞中分离差异表达基因的快速高效mRNA差异显示技术,其特点是利用Ready-To-Go RT-PCR反应珠和Ready-To-Go RAPD分析珠进行mRNA差异显示分析,使取样步骤降至最低程度,减少了潜在的取样误差和外源DNA污染,并确保每次反应的高度重复性.通过银染测序胶分析差异显示的cDNA带,便于DNA回收和进一步克隆.用此方法分析人胚发育早期不同阶段基因的差异表达,选用6条随机引物对3、4和5周龄人胚进行mRNA差异显示分析,从2 000多条带中共分离出14个差异产物,经二次扩增及反向RNA印迹确证其中6个片段为发育不同阶段差异表达基因.     

用差异显示PCR技术克隆冬小麦春化设定cDNA克隆实验系统的建立

差异显示PCR技术是一种新近发展起来的在真核细胞中检测与克隆特异表达基因的手段。本文建立了用此技术克隆春化相关基因的研究系统,并提供了诸如总RNA的提取、污染DNA的去除、sscDNA的逆转录、PCR参数、扩增cDNA的电泳、特异cDNA的收集与重扩增等在方法上的细节。用这种技术分离了一个仅在春化20天这一特异时期表达的春化设定cDNA克隆VPC28。这些结果也适用于更加广泛的类似研究。     

人乳铁蛋白cDNA的克隆及序列分析

从北京正常人乳腺组织中提取总RNA,用RT-PCR的方法扩增人乳铁蛋白(hLF)的cDNA,将其克隆到pGEM-T载体上并进行DNA序列测定。结果表明,所克隆的hLF cDNA序列全长为2136bp,其DNA序列与GenBank中另外5个hLF cDNA序列相比,有2个碱基与这5个序列不同：1740位这5个序列是G,本文序列是C;1756位这5个序列是T,本文序列是C。其中1740位碱基的变化导致了第580位氨基酸由Glu变为Asp。     

Regulation of Actin and Its mRNA by Thyroid Hormones in Cultures of Fetal Human Brain During Second Trimester of Gestation

Abstract: The effect of thyroid hormones (THs) on the expression of actin gene during fetal human brain development and the period of sensitivity to the hormones have been investigated. Developmental profile of actin in the cytoskeletal (CSK) and noncytoskeletal (non-CSK) fractions in the fetal cerebra showed a pronounced rise in the level of CSK actin at weeks 17–19. Northern blot analysis also revealed a sharp rise in the level of actin mRNA at weeks 16–18, temporally coinciding with the period of rise of THs and peak expression of TH receptors in the fetal brain. In organ cultures of weeks 13–23 fetal cerebra, THs elicited a general stimulation of CSK proteins at all ages studied with a preferential effect on actin at weeks 17–19. During this period, THs also stimulated the rate of synthesis of actin. Kinetics of induction of actin by TH in the non-CSK and CSK fractions in organ cultures of week 17 fetal cerebra showed an increased level of actin in both fractions within 1 h. Subsequently (at 5 and 18 h), induction was evident only in the insoluble CSK fraction, suggesting an effect of the hormone on the intracellular distribution of actin between the soluble non-CSK fraction and the insoluble CSK fraction. Correspondingly, in cultures of week 17 fetal cerebra, THs elicited an increase in actin mRNA level within 30 min of hormonal exposure. The overall results suggest that THs regulate the expression of actin gene by stimulating the rate of synthesis as well as intracellular distribution of actin during the mid phase of the second trimester of gestation.     

Lactose- and Heparin-Inhibitable Agglutinin from Human Fetal Brain

An agglutinin activity which was sensitive to lactose and heparin was estimated during prenatal brain development. The agglutinin showed higher specific activities in cerebral cortex and midbrain. There was an increase in lectin specific activity in all the brain regions with development. In addition to brain, other fetal organs also showed the presence of developmentally regulated agglutinin. Cerebral cortical agglutinin was purified by Sepharose CL-6B gel filtration and asialofetuin- and heparin-Sepharose affinity chromatography. Purified agglutinin was strongly inhibited by lactose, asialofetuin, and heparin. It showed no requirement for divalent cations and was maximally active at pH 8.0. Electrophoretic characterization showed the aggregate nature of the agglutinin, and sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis gave subunit molecular weights of 58,000, 45,000, and 24,000.     

用DD—PCR法克隆AVP4—8诱导的鼠脑差异表达基因

精氨酸加压素（ＡＶＰ）Ｃ端片段ＡＶＰ４－８,具有增强记忆的功能,它在大鼠脑内引发一系列的生理和生化变化。采用差示ＰＣＲ（ＤＤ－ＰＣＲ）技术,寻找注射ＡＶＰ４－８前后在大鼠海马中差异表达的基因。抽提总ＲＮＡ,以反转录产生的ｃＤＮＡ为模板进行ＰＣＲ,经过９组引物组合,获得了十几个差异片段,挑选其中差异最大的片段ｄｄｌ进行克隆,测序,并与Ｇｅｎｅｄａｎｋ等数据进行同源比较 有找到同源基因,可能是个新基因     

mRNA差别显示研究肝再生调控基因

以正常肝和再生肝为对比材料,利用mRNA差别显示技术,研究肝再生过程中基因的差别表达,旨在从基因选择性表达水平上探讨肝再生调控机理. 得到4种未知肝再生相关cDNA,完成其克隆与序列分析,一例在再生肝中的表达低于正常肝,余者则高于正常肝. 这些序列均已在EMBL(Europe Molecular Biology Laboratory)数据库中登录,登录号分别为X95721、X95722、X95723、X97973.     

大鼠脑cDNA文库的构建

采用简单高效的cDNA合成技术制备Wistar大鼠脑cDNA基因文库,以纯化的poly( A)⁺－RNA为模板,含Not I切点的oligo－（dT）15为引物,在反转录酶的作用下,合成第一股单链cDNA;用E.coli RNase H除去模板RNA,并以E.coli DNA聚合酶Ｉ,E.coli DNA连接酶和T4 DNA聚合酶催化合成cDNA第二条链,即成为双链cDNA;此双股cDNA除0．5μg用于插入pSPORT I载体,转入E.coli DH5a,建成cDNA文库外,其余保存在－20℃,以此cDNA为模板,应用PCR方法,先后克隆了谷氨酸脱羧酶（GAD,1800bp）、神经元特异性烯醇化酶（NSE,1340bp）,甲状腺激素受体（T3－receptor,1230bp）、胆囊收缩素（CCK,345bp）的全编码基因．