药用植物功能基因

药用植物功能基因研究是药用植物基因研究中最活跃的领域。以药用植物功能基因在GenBank中注册的统计数据为基础 ,介绍了药用植物功能基因研究的最新进展。注册的功能基因涉及 32属 42种药用植物。统计数据包括 :自 1 992年至 2 0 0 3年 (前 9个月 )每年注册基因总数、基因注册数最多的 1 6种主要的药用植物以及在药用植物功能基因研究方面比较活跃的 1 4个国家。还重点报道了植物功能基因专利注册情况、黄酮类化合物与紫杉醇生物合成基因研究进展以及植物P45 0基因研究现状 ,对药用植物生物合成功能基因研究的发展趋势进行了探讨。     

成人视网膜假定蛋白基因ARHP的克隆及生物信息学分析

从UniGene库中选取编号为BG2 2 2 62 4来自人鼻咽组织的表达序列标签 (EST )序列 ,联网到NCBI调用Blast服务器分析 ,发现该EST序列是一个代表新基因的未知序列 .利用Blast检索GenBank的nr数据库和EST数据库 ,构建EST重叠群 ,联网到NCBI的ORFfinder服务器 ,分析发现该EST重叠群具有完整的阅读框架 .分别在cDNA序列阅读框架的起始密码子和终止密码子的两侧设计引物 ,以人胎脑cDNA文库为模板 ,进行PCR扩增 ,测序确定该基因的cDNA全长序列 .该基因cDNA序列全长为 1672bp ,阅读框架位于第 3 0 4～ 1557位之间 ,编码由 417个氨基酸组成 ,分子质量为 46 58ku的蛋白质 ,其理论 pI为 4 2 1.将蛋白质序列通过NCBI的Blast服务器进行序列相似性分析 ,发现该基因编码的蛋白质和成年小鼠视网膜未知蛋白 (BAB3 2 2 14 )同源 .经与国际人类基因组命名委员会协商定名为成人视网膜假定蛋白 (adultretinahypotheticalprotein ,ARHP) ,GenBank登录号为AY174896.生物信息学分析表明 ,该蛋白质可能为一参与转录调控的核蛋白 .ARHP基因定位在染色体 5q3 5,跨越 3 5163bp ,含 4个外显子和 3个内含子 .在基因的 5′非翻译区有 2个CpG岛     

《西北植物学报》投稿须知

《西北植物学报》创刊于1980年,2003年变更为月刊.本刊为A4开本,214页,每月15日出版,国内外公开发行.据2004年版《中国科技期刊引证报告》数据,《西北植物学报》影响因子为0.607,在全国科技期刊影响因子总排序中居第198名,列生物类期刊第13名,植物学科期刊第5名.《西北植物学报》居《中文核心期刊要目总览》第四版(2004年版)植物学科第5名.1.内容范围:《西北植物学报》立足西北,面向全国,主要刊载有关植物遗传育种学、分子生物学、植物基因工程、植物解剖学、植物分类学、植物生理生化、药用植物成分分析,以及植物群落生态学、生物多样性、…     

《西北植物学报》投稿须知

《西北植物学报》创刊于1980年,2003年变更为月刊.本刊为A4开本,214页,每月15日出版,国内外公开发行.据2004年版《中国科技期刊引证报告》数据,《西北植物学报》影响因子为0.607,在全国科技期刊影响因子总排序中居第198名,列生物类期刊第13名,植物学科期刊第5名.《西北植物学报》居《中文核心期刊要目总览》第四版(2004年版)植物学科第5名.1.内容范围:《西北植物学报》立足西北,面向全国,主要刊载有关植物遗传育种学、分子生物学、植物基因工程、植物解剖学、植物分类学、植物生理生化、药用植物成分分析,以及植物群落生态学、生物多样性、…     

《西北植物学报》投稿须知

《西北植物学报》创刊于1980年,2003年变更为月刊.本刊为A4开本,214页,每月15日出版,国内外公开发行.据2004年版《中国科技期刊引证报告》数据,《西北植物学报》影响因子为0.607,在全国科技期刊影响因子总排序中居第198名,列生物类期刊第13名,植物学科期刊第5名.《西北植物学报》居《中文核心期刊要目总览》第四版(2004年版)植物学科第5名.;1.内容范围:《西北植物学报》立足西北,面向全国,主要刊载有关植物遗传育种学、分子生物学、植物基因工程、植物解剖学、植物分类学、植物生理生化、药用植物成分分析,以及植物群落生态学、生物多样性…     

科学出版社新书

DNA和蛋白质序列数据分析工具(第三版)作者:薛庆中等在众多生物基因组测序项目完成之际,我们面临的最大挑战是如何对DNA和蛋白质数掘进行科学的分析和注释。《DNA和蛋白质序列数据分析工具(第三版)》分三个层次解读基因数据库和网络工具:基因组学层面重点介绍序列比对工     

贵州省仁怀市药用植物资源调查分析

目的：通过对仁怀市中药资源普查,全面掌握该地药用植物资源现状,并摸底中药材市场和流通情况。方法：以全国第四次中药资源普查技术规范为指导,采用野外样地实地调查、市场走访调查的方法,对仁怀市药用植物资源进行普查与统计分析。结果：本研究共调查了41个样地1 230个样方,采集药用植物566种,隶属130科365属,其中127种植物被2020版《中国药典》收载。植物生活型主要以草本为主,占总种数的48.94%。植物药材入药部位以全草类,根及根茎类为主,占总种数的72.09%。药材性味以寒性、苦味药物最多,分别占总种数的27.09%和41.34%。结论：仁怀市中药资源较为丰富,但存在“多的不特,特的不多”情况,中药材产业发展滞后。建议当地政府合理规划中药材产业发展,促进中药材资源的可持续开发利用。     

4种小檗科植物叶片的蛋白质及氨基酸组成分析

蛋白质和氨基酸是植物体内重要的营养物质,研究药用植物的蛋白质和氨基酸组成对药用植物资源的合理开发和综合利用具有重要意义,但目前对药用植物次生代谢物的研究较为广泛（如黄酮类化合物[1-2],而对其初生代谢物的研究相对较少[3-4]。     

植物基因组表达序列标签(EST)计划研究进展

植物表达序列标签(EST)计划是随机挑选cDNA克隆,并对其3′或5′端进行大规模一次性测序,将得到的150～500 bp长度的DNA片段与数据库中的序列进行比较,获得对基因组结构、组织、表达等认识的基因组研究策略.就近年来国际植物EST计划的实施情况、植物EST计划的研究范围、生物信息学在EST研究中的应用、EST数据库及查询、植物EST研究中遇到的问题等方面内容进行了综述.     

盐芥(Arabidopsis salsuginea)cDNA文库的随机测序

实验以盐生植物盐芥为材料 ,提取经盐处理的盐芥总RNA ,分离mRNA后 ,构建cDNA文库。从cDNA文库中随机挑取克隆进行测序。结果共测得 5 3个表达序列标记 (EST) ,有 37个EST( 6 9 8% )与拟南芥的基因在多肽水平上有较高同源性 ;2 1个EST( 39.6 % )的功能未知     

广西龙胜红瑶传统药用植物的民族植物学知识

瑶族是一个拥有悠久历史和灿烂文化的民族,红瑶是其中一个分支,因妇女服饰上的花纹图案以大红色为主而得名,其生活习俗饱含民族特色,对植物尤其是药用植物的利用方式,与其他民族不同。该研究采用经典的民族植物学理论和方法,访问调查了广西龙胜红瑶传统药用植物种类,根据植物拉丁名、中文名、当地名、用途、用法及药用部位,对其进行民族植物学编目,并与《中国药典》作了比较。结果表明:共记录到药用植物95种,隶属于57科83属,其中蔷薇科、百合科种类最多,分别含有7种,显示龙胜红瑶传统药用植物资源的多样性;全株入药的植物种类41种,占总数的43.16%;根入药的种类为23种,占总数的24.21%;叶入药的种类为13种,占总数的13.68%。药用植物的药用部位以全株、根及叶为主;治疗风湿类疾病的药物比重最大,为23.47%,推测与其生活的环境有关;与《中国药典》比较,发现71种植物未被其收录,另有17种虽被收录但主治功效不同,有7种被收录且主治功效大致相同,为新型中药的研发提供了借鉴。同时,还探讨了龙胜红瑶传统药用植物的药用价值、资源现状及文化传承的问题。     

药用植物资源利用的一种分析模型

在系统分析药用植物资源利用的各方面因素基础上,以资源利用模式为研究切入点,提出了一个基于资源利用模式和模式形成路径的分析模型（Pattem—Path Model）,用于整体分析某一药用体系中植物资源的开发利用水平和发展过程。应用该分析模型对2005版中国药典使用的药用植物资源（549种高等植物）进行了分析,结果表明：中国药典中应用的药用植物,其资源利用发展较成熟（供应持续性良好的植物资源占79％,暂不能持续供应的占21％）;但是资源利用的发展过程不尽合理（部分植物资源的栽培开展滞后于野生资源的枯竭,占40％）。该结论与已有定性评价观点相一致,并量化地体现出资源利用的发展水平和发展过程,能够推广应用到其他药用体系的资源利用分析,为药用植物资源的利用管理提供决策依据。     

江苏宝华山区药用维管植物资源组成分析

为全面了解江苏宝华山区药用维管植物资源现状,依据“第四次全国中药资源普查”项目的要求,采用线路调查和样方调查相结合的方法,对该区域药用维管植物的种类组成、科属构成、生活型、濒危现状和中药学特征以及重点药用维管植物的资源状况进行了调查和分析。结果显示：宝华山区共有药用维管植物164科620属1089种(含种下等级),分别占江苏省药用维管植物科、属、种数的88.2%、87.3%、81.0%,其中,蕨类植物25科33属50种、裸子植物7科13属16种、被子植物132科574属1023种;在科属构成上均以包含单种和寡种的小科、小属为主。从该区域药用维管植物的生活型看,以草本最为丰富,有734种;乔木和灌木(含木质藤本)较少,分别有125和230种。从所在的植被类型看,阔叶林数量最多,其后依次为针阔混交林、灌草丛、人工植被,针叶林数量最少。从地理分布看,与同区域种子植物的地理分布特征基本吻合,具有亚热带向温带过渡的特点。从珍稀濒危状况看,该区域现存中国特有属14属、国家级珍稀濒危药用维管植物18种、江苏省省级保护药用维管植物32种。从中药材上看,有道地药材17种和重点药用维管植物130种,但各种类的数量总体上较少。从该区域药用维管植物的中药学特征看,在药用部位上以全草(株)类、根和根茎类较多,分别占总种数的44.2%和24.0%;在药性上以平性最多,占30.9%;在药味上以苦味最多,占40.0%;有毒的药用植物占12.9%,其中小毒种类最多。综合分析结果显示：宝华山区药用维管植物种类丰富,其中,道地药材占有一定比例,但重点药用维管植物数量有限且分布频度总体较低。根据上述调查结果,对宝华山区药用维管植物资源的保护和利用提出了一些建议。     

Investigation of the biosynthetic potential of endophytes in traditional Chinese anticancer herbs

Traditional Chinese medicine encompasses a rich empirical knowledge of the use of plants for the treatment of disease. In addition, the microorganisms associated with medicinal plants are also of interest as the producers of the compounds responsible for the observed plant bioactivity. The present study has pioneered the use of genetic screening to assess the potential of endophytes to synthesize bioactive compounds, as indicated by the presence of non-ribosomal peptide synthetase (NRPS) and polyketide synthase (PKS) genes. The total DNA extracts of 30 traditional Chinese herbs, were screened for functional genes involved in the biosynthesis of bioactive compounds. The four PCR screens were successful in targeting four bacterial PKS, six bacterial NRPS, ten fungal PKS and three fungal NRPS gene fragments. Analysis of the detected endophyte gene fragments afforded consideration of the possible bioactivity of the natural products produced by endophytes in medicinal herbs. This investigation describes a rapid method for the initial screening of medicinal herbs and has highlighted a subset of those plants that host endophytes with biosynthetic potential. These selected plants can be the focus of more comprehensive endophyte isolation and natural product studies.     

广西靖西端午节药市民族药用植物数据库系统的设计与构建

药用植物数据库的建立与相关数据挖掘,对民族药物学的研究具有重要意义。该研究在顶层设计的基础上,对广西靖西端午节药市及周边地区实地调查时获得的药用植物标本和照片进行形态学特征、药用价值、民族传统利用方式等信息的整理,由此设计和建立开放的民族药用植物数据库系统。主要应用Microsoft Office Access和Java编程对数据进行管理、查询和统计,通过提取药用植物特征的不同权值来计算不同科属和类别之间的相似度。结果表明:该数据库系统能以柱状图或饼状图的形式将数据之间的关系直观地展示出来,从而反映出各种植物特征和各种功能属性之间的联系。同时该数据库系统还可以用于数据的管理、检索和查询相关民族药用植物的背景资料、药用价值等信息,并能进行相应的统计分析,有利于挖掘数据和发现新线索。     

西藏色季拉山药用种子植物区系研究

该研究根据国家中医药管理局全国第四次中药资源普查的标准,在色季拉山设置样方63套,每套样方中设1个10 m×10 m的乔木样方,1个5 m×5 m的灌木藤本样方和4个2 m×2 m的草本样方,调查记录海拔、经纬度、坡度、坡向等地理信息以及样地内每个物种的高度、盖度、株数等生物学信息,分析该区药用种子植物区系的基本组成、地理成分以及相对应的药用植物功效。结果表明:色季拉山有药用种子植物91科335属625种(含变种),分别占西藏种子植物科、属、种的55.49%,29.26%和11.80%。分布区类型多样,科的分布区分为7个分布区及5个亚型,热带科25个(占非世界分布科数的49.02%),温带科26个(占非世界分布科数的50.98%)。属的分布区分为13个分布区及13个亚型,热带属52个(占总属数的15.52%),温带属236个(占总属数的70.45%)。种的分布区类型,以温带成分为主,在625种药用种子植物中,温带种429个,占总种数的68.64%,在该区占优势。此外,该区药用植物的古老成分缺乏。特有成分很低,无中国特有科分布,中国特有属1个,中国特有种176个(其中西藏特有种21个)。色季拉山药用种子植物资源丰富,区系分布类型多样,起源于热带—亚热带成分,现以温带性质为主,说明该区处于热带向温带的过渡地带。从各药用植物的区系分布类型来看,所含药用植物具有较多样的药用功效。     

基于专利分析的转基因药用植物技术发展趋势研究

据世界卫生组织不完全统计,药用植物在发展中国家和发达国家的使用量均逐年上升。随着对药用植物需求和消耗的不断增加,许多药用植物资源急剧减少。面对日趋严峻的药用植物资源,利用转基因技术进行品种改良,提高其有效成分含量成为研究的重要方向之一。基于德温特数据库的专利信息,对收录的有关转基因药用植物领域的专利文献进行统计分析,分别从全球和中国本土两个层面对转基因药用植物的研究现状、核心技术、研究热点、技术分布与格局等方面进行研究。结果表明,在转基因药用植物领域美国技术实力最强,而中国专利数量名列前茅,但其国际影响力尚且不足。研究结果为相关企业和科研机构掌握转基因药用植物的发展趋势提供必要的情报支持。     

四川沙湾区重点药用植物资源调查研究

目的:调查研究四川沙湾区的药用植物资源,全面掌握沙湾区重点中药资源的分布以及利用现状。方法:通过野外调查和内业整理以及文献查阅工作,重新明确该地区现有的重点药用植物。结果:沙湾区内药用植物有135科527种,重点药用植物100种,其中沙湾区国家Ⅰ级野生保护植物有1种,Ⅱ级野生保护植物10种,Ⅲ级野生保护植物6种;2015年版中国药典收载的基原植物有85种,人工栽培药用植物有23种。结论:沙湾区中药资源较为丰富但利用率低,其中药材产业发展具有较大潜力,此次调查结果为沙湾区中药资源的中药材产业化发展提供新的基础数据与方向。     

MPDB 1.0: a medicinal plant database of Bangladesh

The term of medicinal plants include a various types of plants used in herbalism with medicinal activities. These plants are considered as rich resources of ingredients which can be used as complementary and alternative medicines and, also in drug developments and synthesis. In addition, some plants regarded as valuable origin of nutrition. Thus, all these plants are recommended as therapeutic agents. Information related to medicinal plants and herbal drugs accumulated over the ages are scattered and unstructured which make it prudent to develop a curated database for medicinal plants. MPDB 1.0 database is dedicated to provide the first window to find the plants around Bangladesh claimed to have medicinal and/or nutritive values by accumulating data from the published literatures. This database contains 406 medicinal plants with their corresponding scientific, family and local names as well as utilized parts for treatment from different districts of Bangladesh. Information regarding ailments is available for 353 plants. In addition, we have found active compounds for 78 plants with their corresponding PubMed ID.

Availability

www.medicinalplantbd.net     

Distribution patterns and industry planning of commonly used traditional Chinese medicinal plants in China

Medicinal plants are the primary material basis for disease prevention and treatment in traditional Chinese medicine (TCM). The conservation and sustainable utilization of these medicinal plants is critical for the development of the TCM industry. However, wild medicinal plant resources have sharply declined in recent decades. To ameliorate the shortage of medicinal plant resources, it is essential to explore the development potential of the TCM industry in different geographical regions. For this purpose, we examined the spatial distribution of commonly used medicinal plants in China, the number of Chinese medicinal material markets, and the number of TCM decoction piece enterprises. Specifically, multispecies superimposition analysis and Thiessen polygons were used to reveal the optimal range for planting bulk medicinal plants and the ideal regions for building Chinese medicinal material markets, respectively. Furthermore, we quantitatively analyzed mismatches between the spatial distribution of commonly used medicinal plant richness, Chinese medicinal material markets, and TCM decoction piece enterprises. We found that the areas suitable for growing commonly used medicinal plants in China were mainly distributed in Hengduan Mountain, Nanling Mountain, Wuling Mountain, and Daba Mountain areas. The Thiessen polygon network based on Chinese medicinal material market localities showed there are currently fewer markets in southwestern, northwestern, and northeastern China than in central and southern China. TCM decoction piece enterprises are concentrated in a few provinces, such as Hebei and Jiangxi. We found that the distribution of commonly used medicinal plants, Chinese medicinal material markets and TCM decoction piece enterprises are mismatched in Henan, Shaanxi, Hunan, Hubei, Zhejiang, Fujian, Chongqing, and Xizang. We recommend strengthening development of the TCM industry in Henan, Hunan, Zhejiang, Shaanxi, Hubei, Chongqing, Fujian, and Xizang; building more Chinese medicinal material markets in southwestern, northwestern, and northeastern China; and establishing medicinal plant nurseries in resource-rich provinces to better protect and domesticate local medicinal plants.