DNA分子标记技术在植物种质资源鉴定中的应用

DNA分子标记技术从基因水平进行标记,不受环境因素、个体发育阶段及组织部位影响,多态性强,已成为生物学主要遗传标记手段之一。综述了几种主要DNA分子标记技术的原理和优缺点,着重阐述了其在植物种质资源鉴定方面的应用。     

23株海洋真菌的分子鉴定及其抗植物病原真菌和细胞毒活性研究

从南海沉积物中分离得到23株海洋真菌,通过ITS测序进行鉴定。以新月弯孢霉(Curvularia lunata)、柱枝双胞霉(Cylindrocladium scoparium)、链格孢(Alternaria alternata)、胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)为受试植物病原真菌,以神经胶质瘤细胞(SF-268)、乳腺癌细胞(MCF-7)、大细胞肺癌细胞(NCI-H460)和肝癌细胞(HepG-2)为受试肿瘤细胞,分别采用生长速率法和SRB法对这些菌株的发酵液粗提物进行抗植物病原真菌和细胞毒活性测试,发现11个菌株的粗提物在浓度为50 mg/mL时,对至少1种受试植物病原真菌的抑制率在50%以上,有9个菌株的粗提物在浓度为100μg/mL时,对至少1种肿瘤细胞株的抑制率在80%以上,其中菌株Eupenicillium sp.FS100、Penicillium sp.FS105、Dichotomomyces cejpii FS110、Acaromyces ingoldii FS121对植物病原真菌和(或)肿瘤细胞具有明显的抑制活性。     

镰孢属几种植物病原真菌分子核型的研究

利用脉冲电场凝胶电泳（ｐｕｌｓｅｄ－ｆｉｅｌｄ ｇｅｌ ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ,ＰＦＧＥ）,研究了４株串珠镰孢（Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｍｏｎｉｌｉｆｏｒｍｅ）、１株尖镰孢（Ｆ．ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）．１株茄镰孢（Ｆ．ｓｏｌａｎｉ）和１株Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｐ的分子核型以及不同地域和寄主来源的串珠镰孢种内菌株间的分子核型差异。以凝胶包埋法（不破除分生孢子细胞壁）制备供试菌株电泳样本,采用３组条件组     

黄精属植物DNA分子鉴定技术应用研究进展

黄精属植物分布广泛、资源丰富、类群复杂、栽培历史悠久,具有重要的药用、经济、观赏与文化价值.在大健康的时代背景下,黄精作为中国传统中药材,其潜在市场和广泛用途不断受到人们的重视与发掘.随着分子生物学科研究的完善与深入,先后出现了多种基于DNA水平的分子鉴定技术,加速黄精属相关领域的研究并取得了较为丰硕的成果.本文对近年...     

寄主选择性植物病原真菌的毒素化学

Wheeler和Luke把那些在病害中起重要病因作用的毒素称为致病毒素（path。toxin）‘”,那么由真菌产生的致病毒素则称为真菌毒素（MyC0t0Xin）。长期以来,人们一直对那些重要的植物病原真菌毒素进行分离、提纯和化学结构鉴定,发现它们大多数为低分子量的次生代谢产物m．自从＊all欢。从梨上的菊池键格抱（Alternariakikl,chiana）中发现第一个寄生选择性真菌毒素阳StSCICChVCt0Xill）以来l’］,现已报道有9个属的对种植物病原真菌可以产生寄主选择性毒素14－’］其中已有15种明确了其化学结构,（见表1）。实践证明来源于某一病原…     

植物病原真菌分泌蛋白质组学研究进展

分泌蛋白质组是指在特定时间和特定条件下,由组织或细胞等分泌的全部蛋白质。在病原真菌与植物的相互作用过程中,病原真菌会分泌大量的蛋白质和代谢产物,在病原真菌对植物的侵入、定殖和扩展等致病过程中起着重要作用。本文主要介绍了分泌蛋白质在植物病原真菌致病性中的作用、重要植物病原真菌分泌蛋白质组的研究进展、及植物病原真菌分泌蛋白质组的生物信息学预测分析等,对于全面了解植物病原真菌的致病机理具有重要意义。     

植物病原真菌对二甲酰亚胺类杀菌剂的抗性分子机制

综述了近年来国内外植物病原真菌对二甲酰亚胺类杀菌剂抗性机制研究的主要成果,包括：二甲酰亚胺类杀菌剂（DCFs）的杀菌机制、植物病原菌对DCFs抗药性的产生现状、促分裂原活化蛋白激酶（MAPK）途径和依赖环化腺苷酸（cAMP）的蛋白激酶途径在抗药性产生中的可能作用及相关的分子生物学研究进展。     

DNA分子标记在雌雄异株植物性别鉴定中的应用

雌雄异株植物中不同性别的植株所产生的经济效应和生态效应存在一定的差异,在生产实践中,选取适宜性别的植株进行栽培有助于提高效率,避免不必要的浪费。然而,性别鉴定的常用方法大多是根据表型、代谢产物含量及活性等方面的差异,在成株阶段进行的,鉴定结果的可靠性和准确性都有一定的局限。近几年,DNA分子标记技术应用于雌雄异株植物的性别鉴定研究中,获得了快速准确的鉴定结果。在比较常用性别鉴定方法的基础上,主要就常用DNA分子标记在雌雄异株植物性别鉴定中的研究进展做一概述并对该领域的研究提出展望。     

AFLP─一种DNA分子标记新技术

AFLP──ANovelTechniqueforDNAMolecularMarkerWengYuejin(InstituteofCropGermplasmResourees,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Beijing100081)公司科学家ZabeauMarc和VosPieter发明创建的一种DNA分子标记新技术,它不仅具备了其它DNA分子标记技术所具有的特点,多态性丰富,共显性表达,不受环境影响,无复等位效应,而且还具有带组丰富,用样量少,灵敏度高,快速高效等特殊优点．一个0．5mgDNA样品,可做4000个反应,获得8万个标记,650万条带纹。美国加利福尼亚大学MackillDavid[7]利用14份水稻为材料,比较AF…     

DNA分子标记在药用植物中的应用

对DNA分子标记技术在药用植物鉴定、中药质量标准化、遗传图谱构建和近缘物种进化关系等方面的研究进展进行了综述,并展望了分子标记技术在药用植物研究中的发展前景。     

DNA分子标记在番茄遗传育种研究中的应用

本文综述了DNA分子标记在番茄遗传图谱构建、番茄种质资源研究与品种纯度的鉴定、番茄基因分子标记研究及番茄基因图位克隆方面的应用研究进展。 Abstract:This paper reviewed the recent advance of the application of DNA molecular marker in various aspects of tomato breeding including genetic map construction,germplasm research and purity control of cultivars,identification markers linked to important genes and map-based gene cloning.     

应用贝叶斯理论推断DNA分子标记基因型

引入贝叶斯理论用以从DNA分子标记的表现型（电泳谱带）推断其基因型（DNA来源）。结果表明,根据标记座位独立贫富而确定的遗传信息不完全标记的基因型概率,与根据邻近的遗传信息完全标记的基因型和有关重组率算得的相应贝叶斯概率,通常都有很大的差异,所以在进行数量性状基因定位和标记辅助选择等工作前前,应当计算每一个体基因组上所有遗传信息不完全座位的有关基因型的贝叶斯概率,文中列出计算未知基因型的贝叶斯概率的详细过程,也讨论了贝叶斯概率的若干推广应用。     

应用贝叶斯理论推断DNA分子标记基因型

引入贝叶斯理论用以从DNA分子标记的表现型（电泳谱带）推断其基因型（DNA来源）。结果表明,根据标记座位独立贫富而确定的遗传信息不完全标记的基因型概率,与根据令近的遗传信息完全标记的基因型和有关重组率算得的相应贝叶斯概率,通常都有很大的差异,所以在进行数量性状基因定位和标记辅助选择等工作之前,应当计算每一个体基因组上所有遗传信息不完全座位的有关基因型的贝叶斯概率。文中列出计算未知基因型的贝叶期概率的详细过程,也讨论了贝叶斯概率的若干推广应用。     

Animal Toxicity of Phytopathogenic Fungi

Twelve genera of phytopathogenic fungi comprising 27 species previously reported to produce phytotoxins were tested concurrently for animal and plant toxicity. There appeared to be no direct relationship between plant and animal toxicity.     

分子标记技术在玉米品种分析中的初步应用

以玉米沈丹16、沈丹2100的可见叶片为材料,采用CTAB-Ⅱ方法提取玉米基因组DNA,然后应用RAPD分子标记技术对基因组DNA进行多态性扩增。结果是：从RAPD反应所用的40个随机引物中筛选出11个适宜引物,共扩增出63条谱带,其中14条为差异性谱带,其余引物没有扩增出谱带,被淘汰;此次实验的RAPD反应系统虽然较成功,但不是最佳的,今后要进一步优化。     

Molecular Taxonomy of Phytopathogenic Fungi: A Case Study in Peronospora

Background

Inappropriate taxon definitions may have severe consequences in many areas. For instance, biologically sensible species delimitation of plant pathogens is crucial for measures such as plant protection or biological control and for comparative studies involving model organisms. However, delimiting species is challenging in the case of organisms for which often only molecular data are available, such as prokaryotes, fungi, and many unicellular eukaryotes. Even in the case of organisms with well-established morphological characteristics, molecular taxonomy is often necessary to emend current taxonomic concepts and to analyze DNA sequences directly sampled from the environment. Typically, for this purpose clustering approaches to delineate molecular operational taxonomic units have been applied using arbitrary choices regarding the distance threshold values, and the clustering algorithms.

Methodology

Here, we report on a clustering optimization method to establish a molecular taxonomy of Peronospora based on ITS nrDNA sequences. Peronospora is the largest genus within the downy mildews, which are obligate parasites of higher plants, and includes various economically important pathogens. The method determines the distance function and clustering setting that result in an optimal agreement with selected reference data. Optimization was based on both taxonomy-based and host-based reference information, yielding the same outcome. Resampling and permutation methods indicate that the method is robust regarding taxon sampling and errors in the reference data. Tests with newly obtained ITS sequences demonstrate the use of the re-classified dataset in molecular identification of downy mildews.

Conclusions

A corrected taxonomy is provided for all Peronospora ITS sequences contained in public databases. Clustering optimization appears to be broadly applicable in automated, sequence-based taxonomy. The method connects traditional and modern taxonomic disciplines by specifically addressing the issue of how to optimally account for both traditional species concepts and genetic divergence.     

RAPD分子标记在食用菌研究中的应用

RAPD分子标记以其简单、快速、经济等优点正在被广泛应用于食用菌的研究中。RAPD分子标记克服了传统的标记手段和形态分类学的缺点,在食用菌种质的鉴定和遗传多样性研究,在亲本和杂交种的鉴别以及在基因克隆与分离和遗传图谱的建立等研究中都起着重要的作用。RAPD分子标记为食用菌的深入研究提供了强有力的工具和手段,其应用和发展前景广阔。