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相似文献
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1.
吴东  Just  M.Vlak 《Virologica Sinica》2001,16(4):330-337
杆状病毒ODV-E66蛋白是包涵体来源病毒(occlusion-derived virus,ODV)囊膜的结构蛋白,ODV囊膜对ODV的稳定性和感染性具有重要作用。本文报道了HaSNPV odv-e66基因及其邻近区域共4237bp的核苷酸序列及其分析结果。HaSNPV的odv-e66基因编码区全长2019bp,推测编码一个由672个氨基酸残基组成的,分子量为74.5kD的蛋白质。在起始密码子ATG上游具有杆状病毒晚期转录起始信号ATAAG。与其他杆状病毒ODV-E66的氨基酸序列比较分显示HaSNPV ODV-E66蛋白具有多个保守区域,包括N末端的强疏水功能区、序列中部的一个可能的核定位信号RKIW,两个Leu-xipper以及5个跨膜区。odv-e66基因上游的两个ORF分别与AcMNPV的orf108和orf109具有同源性,下游的ORF与LsNPV的p13基因具有同源性。  相似文献   

2.
本文报道了棉铃虫单核衣壳核多角体病毒(Helicoverpa armigera single-nucleocapsid nucleopolyhedrovirus,HaSNPV)基因组的HindⅢ-L片段的全序列.该片段全长2 635bp,包括5个有意义的开放阅读框HaSNPV ORF227,晚期表达因子10基因(lef10),vp1054基因,Ac55(AcMNPV ORF55的同源基因),Ac56(AcMNPV ORF56的同源基因).与其它6种杆状病毒的氨基酸序列比较表明,HaSNPV的lef10基因与甜菜夜蛾核型多角体病毒(SeMNPV)的同源性最高,为64%,与冷杉毒蛾核型多角体病毒(OpMNPV)的同源性最低,为43%;HaSNPV的vp1054基因与SeMNPV的同源性最高,为65%,与OpMNPV的同源性最低,为49%.序列比较表明,HaSNPV的LEF10与VP1054蛋白与其它6种杆状病毒具有相同的保守区和亮氨酸拉链(1eucine zipper)  相似文献   

3.
大白菜雄性不育系RC7育性相关基因克隆与特性分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
根据orf138的保守序列设计引物,以大白菜萝卜胞质雄性不育系RC7的mtDNA为模板进行PCR扩增,扩增出大小为588 bp的特异条带,该片段在叶片和花蕾中均有表达,没有转录后加工,可编码75个氨基酸,定名为orf75。同源性分析结果表明:orf75推导的氨基酸序列N末端与萝卜Ogu CMS所具有的ORF138一致性为100%,有28个氨基酸完全相同,C末端与钾依赖钠钙交换蛋白-1一致性为54%。初步认为,orf75可能是orf138与钾依赖钠钙交换蛋白-1的编码基因发生重排产生的新的开放阅读框。RC7的不育性与Ogu CMS具有相似性。该588 bp片段还可编码1个含有1个疏水基团和1个跨膜区的67aa的蛋白片段,定名为orf67,属可溶性蛋白。  相似文献   

4.
昆虫包涵体衍生病毒囊膜蛋白的分子生物学   总被引:1,自引:0,他引:1  
相兴伟  吴小锋 《昆虫学报》2010,53(7):809-817
了解杆状病毒的囊膜蛋白对揭示病毒入侵、 囊膜蛋白核定向转运机制以及研究控制昆虫新策略等方面具有重要意义。 目前研究表明,包涵体衍生病毒(occlusion-derived virus, ODV)的囊膜蛋白包括ODV-E25, ODV-E66, ODV-E56, ODV-E18, ODV-E28, P74, PIF1, PIF2, PIF3, GP41, ODV-EC27, ODV-E35, ODV-EC43,BV/ODV-E26,P91和ORF150。 本文结合国内外的研究成果系统的综述了囊膜蛋白的结构和功能,其在经口感染、调节细胞周期和囊膜蛋白的传送等方面起作用。 囊膜蛋白的核定向转运机制,ODV与昆虫中肠之间和包涵体基质之间相互作用以及ODV结构蛋白之间的相互作用等将是今后的研究重点。  相似文献   

5.
方明刚  Just  M  Vlak 《Virologica Sinica》2001,16(4):355-360
本文报道了棉铃虫单核衣壳核多角体病毒(Helicoverpa armigera single-nucleocapsid nucleopolyhedrovirus,HaSNPV)基因组的HindⅢ-L片段的全序列。该片段全长2635bp,包括5个有意义的开放阅读框:HaSNPV ORF227,晚期表达因子10基因(lef10 ),vp1054基因,Ac55(AcMNPV ORF55的同源基因),Ac56(AcMNPV ORF56的同源基因)。与其它6种杆状病毒的氨基酸序列比较表明,HaSNPV的lef10基因与甜夜蛾核型多角体病毒(SeMNPV)的同源性最高。为64%,与冷杉毒蛾核型多角体病毒(OpMNPV)的同源性最低,为43%;HaSNPV的vp1054基因与SeMNPV的同源性最高。为65%,与OpMNPV的同源性最低,为49%。序列比较表明,HaSNPV的LEF10与VP1054蛋白与其它6种杆状病毒具有相同的保守区和亮氨酸拉链(leucine zipper)。  相似文献   

6.
人类新基因C17orf32的电子克隆和编码区序列RT-PCR验证   总被引:19,自引:3,他引:16  
利用生物信息学与实验验证的技术路线,成功地克隆了人类新基因C17orf32的cDNA(GenBank登记号:AY074907和TPA: BK000260),发现C17orf32的完整开放阅读框架(ORF,31~657 bp)cDNA(627 bp)与人类假定基因LOC124919 ORF(25~807 bp)的25~651位只有一个碱基不同.经RT-PCR验证并cDNA测序、人类表达序列标签(EST)数据库的BLAST检索和基因组成规律分析三方面的结果,均支持C17orf32的序列,而不支持LOC124919的编码序列.C17orf32基因组序列全长4.610 kb,含有6个外显子和5个内含子,cDNA序列全长1 679 bp, ORF横跨全部6个外显子.该基因ORF翻译起始处符合Kozak规则,ORF起始码上游同一相位有终止码,ORF后有2个加尾信号和PolyA尾.C17orf32基因的成功克隆表明,NCBI GENOME Annotation Project在2001年12月预测的人类假定蛋白XP-058865编码基因LOC124919的模式参考序列XM-058865中存在偏差,即在C17orf32基因cDNA的406与407位碱基之间错误插入一个碱基G, 从而导致在插入位点后,ORF编码125位氨基酸以后蛋白质序列的改变,出现260个氨基酸的多肽.因此,应慎重看待计算机注释的人类基因组编码序列.建立的技术路线有助于发现更多新的人类功能基因.  相似文献   

7.
以单细胞真核生物八肋游仆虫Euplotes octocarinatus为实验材料,采用PCR、RT-PCR方法克隆了核糖体蛋白L11基因(EoRPL11).将该序列与GenBank中其他物种的RPL11基因序列进行同源性比对,采用DNAStar软件进行聚类分析.结果显示,成功克隆到游仆虫RPL11基因,大核中该基因全长709 bp,开放阅读框(ORF)为531 bp,编码176个氨基酸;cDNA序列与大核中ORF序列一致,表明该基因具有转录活性;所推导的氨基酸序列与嗜热四膜虫Tetrahymena thermophila的RPL11同源性最高,为66%.  相似文献   

8.
以AcMNPV的多角体蛋白基因为探针,定位了中国棉铃虫单粒包理核型多角体病毒(HaSNPV)的多用体蛋白基因。序列测定表明,HaSNPV的多角体蛋白基因编码区为738个核苷酸,编码246个氨基酸,预计蛋白质分子量为29kDa。同源性分析表明,HaSNPV与美洲棉铃虫单粒包理核型多角体病毒(HzSNPV)具有最高的同源性,在整个阅读框架中只有4个碱基的差异,其中第179位碱基的变化导致唯一的氨基酸变化,这种变化并未导致其二级结构的改变。此外,两种病毒该基因的启动子结构也完全一样。HaSNPV与其它的SNPV和MNPV的同源性明显要低。结果预示HaSNPV与HzSNPV可能为同种病毒的不同变种。  相似文献   

9.
根据Grover报道的XanthomonasmaltophiliaCG类受体的 342bp核酸序列设计的一特异引物P2和随机引物进行PCR扩增 ,将约 75 0bpPCR产物克隆到 pUCm T载体上 ,得到重组质粒 pUCm Ter。pUCm Ter上插入片段经M 13通用引物双向测序 ,其中ORF5 5 5核酸序列的 2 83~ 36 2bp部分与PseudomonasphageD3orf2基因的 1385~ 14 6 4bp部分有 86 %相同碱基。由ORF5 5 5编码 184aa蛋白序列的 1~ 16 5aa部分与PseudomonasphageD3orf2基因编码terminase的 2 2 9~ 393aa部分具有 6 6 %相同序列。因此 ,克隆到的ORF5 5 5核酸序列可能是编码嗜麦芽黄单胞菌terminase like蛋白的基因序列。  相似文献   

10.
对棉铃虫单核衣壳核多角体病毒(HaSNPV)的组织蛋白酶(ν-cath)基因进行了序列分析,此基因编码区长1098bp,预计编码一个366个氨基酸的蛋白产物.序列分析表明,HaSNPV的V-CATH蛋白与其它杆状病毒的同源蛋白具有相似的保守结构并保留有相同的酶活性位点,根据已知的杆状病毒组织蛋白酶序列构建了ν-cath基因的进化树,发现HaSNPV的ν-cath位于NPV组中一个单独的分枝,结合ν-cath基因在棉铃虫病毒基因组中的位置与其它NPV有较大不同,推测HaSNPV的ν-cath基因可能拥有特殊的进化历程.  相似文献   

11.
肿瘤抑制基因p53和原癌基因c-myc已被证明在动物中高度保守并参与许多PCD过程。这两个基因编码的同源蛋白及其RNA在玉米中的存在已有报道,并且其DNA同源序列已利用荧光原位杂交定位在玉米相应的染色体上。利用免疫组织化学方法探测了与人类p53和c-myc基因同源的玉米基因在玉米颖果发育过程中的时空表达模式。结果发现,在授粉后的一定阶段,在反足细胞、珠被、未成熟的胚乳、予房壁、导管组织和糊粉层中,p53同源基因表达强烈,c-myc同源基因的表达相反,在授粉后的这些组织中基本不表达,而在授粉前的中央细胞的极核中表达水平较高。TUNEL检测显示,在p53同源基因呈现高水平表达的地方,DNA断裂信号强烈。在动物细胞中,p53和c-myc起相反的调节作用,这与其同源基因在玉米中的作用模式相似。由此说明p53和c-myc同源基因可能在玉米颖果发育PCD过程中起重要作用,并进一步推论高等植物PCD和动物细胞凋亡存在一定的保守性机制。  相似文献   

12.
The major heat shock proteins from Thiobacillus ferrooxidans were identified as DnaK and GroEL equivalents by Western blotting and analysis of the N-terminal amino acid sequence of spots isolated from dried 2-D polyacrylamide electrophoresis gels. The T. ferrooxidans chaperonins showed 70% and 80% identity with the Escherichia coli GroEL and DnaK, respectively. By using electrophoresis with a transverse pore gradient of cross-linked polyacrylamide and nondenaturing conditions followed by Western blotting, we found that the GroEL proteins from both bacteria formed a 14-mer, whereas E. coli DnaK protein existed partially as a dimer and the T. ferrooxidans DnaK-equivalent showed only a monomeric nature under our experimental conditions.  相似文献   

13.
棉铃虫田间种群Bt毒素Cry1Ac抗性基因频率的估算   总被引:7,自引:0,他引:7  
采用改进的F1筛查法检测了2005年采自华北地区的棉铃虫Helicoverpa armigera (Hübner)田间种群对Bt毒素Cry1Ac的抗性基因频率。2005年从河南安阳和河北沧县转Bt基因抗虫棉上采集二代棉铃虫卵,在室内用人工饲料饲养至2龄幼虫,用1 μg/cm2 的Cry1Ac活化毒素进行初筛,将初筛存活成虫与室内筛选的GYBT抗性品系成虫进行单对杂交,并用区分剂量(2.5 μg/cm2)对F1代进行检测。经检测,2005年河南安阳棉铃虫种群和河北沧县棉 铃虫种群对Cry1Ac抗性基因频率基本一致,分别为1.4×10-3和1.5×10-3。用毒素涂表法测定了2004、2005年采自河南安阳、河北高阳、河北沧县、新疆阿克苏和新疆沙湾棉铃虫田间种群对Cry1Ac活化毒素的敏感性水平,结果表明华北棉区与新疆内陆棉区棉铃虫种群对Cry1Ac的敏感性存在一定的地区性差异(<8倍)。总体上,我国华北棉区棉铃虫种群对Cry1Ac还未产生明显抗性,抗性基因频率处于正常水平。棉铃虫对转Bt基因抗虫棉的抗性风险依然存在,需要尽快启动全国性的早期抗性检测和预警工作。  相似文献   

14.
目的利用5溴-4氯-3吲哚乙酰基神经氨酸盐(X-Neu5Ac)为底物测定阴道唾液酸酶活性诊断细菌性阴道病(bacterial vaginosis,BV)的价值.方法健康妇女30例,临床Amsel法诊断为BV的患者45例,共计75例进行了阴道分泌物分析和检测,并与唾液酸酶活性法诊断作了对比研究.取阴道分泌物作为标本分别进行唾液酸酶活性和阴道菌群定量分析,检测细菌包括乳酸杆菌、类杆菌、肠杆菌、葡萄球菌、肠球菌和阴道加德纳菌.唾液酸酶活性测定利用的底物为X-Neu5Ac,特异活性用其产物 ——甲氧基苯酚的纳摩尔数来表示.结果阴道液唾液酸酶活性测定诊断细菌性阴道病的敏感性、特异性、阳性预期值和阴性预期值分别为88.9%、90%、93%和84.3%.唾液酸酶法在检测细菌性阴道病上和传统的Amsel法比较,差异无显著性(P>0.05).唾液酸酶阳性组Gv活菌数(6.96 log CFU/g)明显高于唾液酸酶阴性组(2.05 log CFU/g)(P<0.01).唾液酸酶阳性组产H2O2阴道乳杆菌(LB+)活菌数(4.26 Log CFU/g)明显低于唾液酸酶阴性组(8.66 Log CFU/g)(P<0.01).唾液酸酶阳性组与唾液酸酶阴性组两组的阴道液中需氧菌活菌数差异无显著性(P>0.05),主要包括金黄色葡萄球菌、肠球菌和肠杆菌.结论利用X-Neu5Ac作为唾液酸酶的底物测定唾液酸酶活性的方法是诊断细菌性阴道病的有效检测方法.阴道内唾液酸酶活性增强,厌氧菌数量增加,LB+数量减少,提示BV发生恶化.  相似文献   

15.
对利用苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis,Bt)强启动子——cry1Ac基因启动子p1Ac指导cry基因在大肠杆菌中的表达进行了研究。结果显示,大肠杆菌中由启动子p1Ac指导表达的Cry1Ac蛋白与苏云金芽胞杆菌来源的Cry1Ac蛋白在碱溶性、胰蛋白酶活化、杀虫活性等方面有较好的一致性,从而解决了目前商业化载体大肠杆菌表达cry基因时形成不易溶解的包涵体问题。同时,还对p1Ac指导的cry1Ac基因在大肠杆菌中表达的发酵条件进行了初步探索。  相似文献   

16.
17.
减数分裂是有性生殖过程中的关键步骤,近年来,借助于先进的分子生物学技术,通过对一些模式生物的研究,在减数分裂染色体相互作用、周期调控等方面取得了重要的研究成果,进一步形成了对其分子机制的某些认识⒚为此,对减数分裂的机制及其研究进展进行了综述⒚  相似文献   

18.
The trematode parasite Fasciola hepatica causes chronic infection in hosts, enabled by an immunosuppressed environment. Both host and parasite factors are known to contribute to this suggesting that avoidance of immunopathology is beneficial to both parties. We have previously characterised a parasite transforming growth factor (TGF)-like molecule, FhTLM, that interacts with host macrophages to prevent antibody-dependent cell cytotoxicity (ADCC). FhTLM is one of many described helminth TGF homologues and multiple helminths are now known to utilise host immune responses as developmental cues. To test whether, or how, F. hepatica uses FhTLM to manipulate host immunity, we initially examined its effects on the CD4 T-cell phenotype. Despite inducing IL-10, there was no induction of FoxP3 within the CD4 T-cell compartment. In addition to inducing IL-10, a wide range of chemokines were elicited from both CD4 T-cells and macrophages. However, no growth or survival advantage was conferred on F. hepatica in our co-culture system when CD4 T-cells, macrophages, or eosinophils were tested. Finally, using RNA interference we were able to verify a host-independent role for FhTLM in parasite growth. Despite the similarities of FhTLM with other described helminth TGF homologues, here we demonstrate species-specific divergence.  相似文献   

19.
The sulfated glycosaminoglycan content of primary cultures of fibroblasts from guinea-pig embryo kidney is reported. A hybrid chondroitin sulfate comprises approx. 90% of these glycosaminoglycans from the cell coat. Changes in the proportion of labelled heparitin sulfate were also observed after successive subcultures. We postulate a possible correlation between the pattern of glycosaminoglycans and processes of cell selection and cell dedifferentiation in these cultures.  相似文献   

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