柳州和南宁HIV-1亚型分布及耐药情况调查

为了解柳州和南宁两市HIV-1亚型分布和耐药情况,在柳州和南宁招募HIV感染者和AIDS患者共304名,采集外周静脉血,从血浆中提取HIVRNA,扩增HIVpol基因并测序。将获得的序列进行系统进化树分析,结果表明柳州的HIV-1毒株中存在CRF01_AE和CRF07_BC两种亚型,其中CRF01_AE毒株占75.2%,CRF07_BC毒株占24.8%;南宁的HIV-1毒株中存在CRF01_AE、CRF08_BC、B亚型和C亚型共4种亚型,其中CRF01_AE和CRF08_BC仍是南宁最主要的亚型,CRF01_AE占85.8%,CRF08_BC占11.5%。根据所得的序列资料进行HIV-1耐药性分析,计算耐药率。计算结果表明,柳州未治疗和治疗研究对象的耐药率分别为3.3%和8.7%,南宁未治疗和治疗研究对象的耐药率分别为1.4%和27.5%。     

HIV-1衣壳蛋白的结构研究进展及应用策略分析

人类免疫缺陷病毒(HIV)已在全球蔓延并且出现了耐药性,急需开发新的高效、低毒的抗艾滋病药物和新的治疗策略。衣壳蛋白(CA)在HIV病毒颗粒的组装、成熟过程中的作用举足轻重,其单体主要由N端区域(NTD)和C端区域(CTD)组成。近年来HIV衣壳蛋白的空间精细结构得到了解析。本文总结了HIV衣壳蛋白在X射线晶体衍射技术下的空间结构特征,分别介绍了CA的NTD-NTD、NTD-CTD和CTD-CTD界面处的结构特征。本文也分析了基于HIV CA结构的AIDS治疗方法,并结合Crispr/Cas9基因编辑技术阐述了以CA为靶点的AIDS治疗新策略。     

人类免疫缺陷病毒1型Tat蛋白N末端缺失突变体融合蛋白的表达及其免疫原性分析

本研究采用PCR方法从人类免疫缺陷病毒1型（Human immunodeficiency virus 1,HIV-1）HXB2株tat基因中扩增编码Tat蛋白N末端1-21位氨基酸缺失的突变体Tat22-101基因片段,构建其原核表达质粒pET32a-Tat22-101,经双酶切及测序验证后,转化大肠埃希菌BL21（DE3）,进行IPTG诱导表达及Ni²⁺-NTA柱亲和层析纯化。纯化后的突变体融合蛋白PET32a-Tat22-101经SDS-PAGE及Western blotting鉴定,其相对分子质量约为26.9kD。该融合蛋白免疫BALB/c小鼠,经ELISA检测结果表明,pET32a-Tat22-101融合蛋白不仅较好地保留其免疫原性,而且能诱导产生高滴度的针对Tat N末端区之外的Tat其他功能区表位的抗体,为进一步研究Tat生物学功能和研制新型HIV Tat疫苗奠定试验基础。     

我国河南、陕西两省献血感染者HIV-1 B亚型毒株gag基因变异研究

从河南和陕西既往献血感染的109份HIV-1阳性血浆样本中提取病毒RNA,扩增并测定其gag全长基因序列。按照采样时间对序列进行分组并利用Entropy软件分析不同组别的氨基酸序列差异。结果表明,2004年、2005年的序列与2002年的序列比较,分别存在8个和13个氨基酸组成有统计学意义的位点,其中有5个位点在两组比较中同时出现。存在差异的16个氨基酸位点中,10个位点的氨基酸分布呈现多态性增加的趋势,其中8个位点被我国人群主要HLA递呈的CTL表位覆盖;6个位点的氨基酸分布呈现多态性减少的趋势,这些位点均位于Gag蛋白重要的功能区内。     

HIV-1 p24蛋白在大肠肝菌中的高效可溶性表达、一步纯化及抗原性分析

合成引物扩增HIV-1 p24基因,并将其克隆到pQE-30质粒中,使其在大肠杆菌E.coli M15中以IPTG诱导高效表达,经SDS-PAGE分析,该表达产物约占菌体总蛋白20%,并且以可溶蛋白的形式存在于细菌裂解液上清之中.经镍离子柱亲和层析一步纯化,洗脱产物中p24蛋白纯度达95%.ELISA分析表明,该蛋白可与HIV感染者血清发生特异性免疫反应.以此蛋白交联Sepharose 4B,亲和层析纯化HIV感染者血清中的抗体,用所得抗体与HIV确认试剂反应,发现该纯化抗体仅与确认试剂中的p24蛋白反应.上述结果表明在大肠杆菌中已经高效表达了可溶性HIV-1 p24蛋白,该蛋白具有良好的抗原性.     

HIV-1p24蛋白在大肠肝菌中的高效可溶性表达、一步纯化及抗原性分析

合成引物扩增HIV 1p2 4基因 ,并将其克隆到 pQE 30质粒中 ,使其在大肠杆菌E .coliM 15中以IPTG诱导高效表达 ,经SDS PAGE分析 ,该表达产物约占菌体总蛋白 2 0 % ,并且以可溶蛋白的形式存在于细菌裂解液上清之中。经镍离子柱亲和层析一步纯化 ,洗脱产物中 p2 4蛋白纯度达95 %。ELISA分析表明 ,该蛋白可与HIV感染者血清发生特异性免疫反应。以此蛋白交联Sepharose 4B ,亲和层析纯化HIV感染者血清中的抗体 ,用所得抗体与HIV确认试剂反应 ,发现该纯化抗体仅与确认试剂中的 p2 4蛋白反应。上述结果表明在大肠杆菌中已经高效表达了可溶性HIV 1p2 4蛋白 ,该蛋白具有良好的抗原性     

Rev蛋白: 抗HIV-1感染的新靶点

病毒颗粒蛋白表达调节因子(regulatorofvirionproteinexpression,Rev)是HIV-1转录过程中不可缺少的调控蛋白。Rev与病毒mRNA的Rev应答元件(revresponseelement,RRE)相互作用,加速mRNA向核外转运。Rev缺乏或者不能进入细胞核,未剪接和部分剪接的mRNA将在核内完全降解,导致HIV-1的复制被阻断。Rev在HIV-1复制周期中起着重要的反式调节作用,是寻找新作用机制和不易产生耐药性的抗艾滋病药物的新靶点。该文介绍Rev介导的核质转运过程和Rev蛋白的相关抑制剂。     

上海地区人类免疫缺陷病毒1型感染/艾滋病患者病毒耐药基因突变及亚型分布

目的 研究上海地区人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)感染／艾滋病(AIDS)患者中HIV-1耐药株出现的情况及亚型分布。方法 对33例HIV-1感染／AIDS患者的血浆HIV-1分离株,进行抗HIV-1药物(核苷类反转录酶抑制剂、非核苷类反转录酶抑制剂和蛋白酶抑制剂)的基因型耐药检测和亚型分析。结果 33例的HIV-1均未检出对PI的耐药突变;10例高效抗反转录病毒疗法(HAART)治疗失败或抑制病毒复制不完全者中,检出的耐药突变为70％,过渡型耐药突变为20％;23例未经抗HIV-1治疗者中,耐药突变为4．3％,过渡型耐药突变为13％。所有过渡型耐药突变均为T215S。15例经血制品传播的HIV- 1均为B亚型;18例经吸毒和性传播的HIV-1中,B和CRF01-AE亚型分别为39％,和33％,此外,还有C、D、G、K和CRF02-AG亚型。结论 上海地区HIV-1感染／AIDS患者中,HAART治疗失败或复制抑制不完全者HIV-1的NRTI和NNRTI耐药突变率高;吸毒和性传播者的HIV-1中,除主要为B和CRF01-AE亚型外,尚有其他少见的亚型。     

HIV-1辅助调节蛋白Vpu的结构与功能

Vpu蛋白是HIV病毒的辅助调节蛋白之一,仅存在HIV一1型病毒中。在病毒的复制过程中Vpu蛋白下调CD4受体的表达,调节Pr55^gag蛋白的核定位影响病毒的装配,细胞膜上类似离子通道作用促进子代病毒颗粒的释放。该文介绍Vpu蛋白的结构与功能。     

Study of HIV-1 Drug Resistance in Patients Receiving Free Antiretroviral Therapy in China

To investigate the prevalence of drug-resistance mutations,resistance to antiretroviral drugs,and the subsequent virological response to therapy in treatment-naive and antiretroviral-treated patients infected with HIV/AIDS in Henan,China,a total of 431 plasma samples were collected in Queshan county between 2003 and 2004,from patients undergoing the antiretroviral regimen Zidovudine Didanosine Nevirapine(Azt Ddi Nvp).Personal information was collected by face to face interview.Viral load and genotypic drug resistance were tested.Drug resistance mutation data were obtained by analyzing patient-derived sequences through the HIVdb Program(http://hivdb.stanford.edu).Overall,38.5% of treatment-naive patients had undetectable plasma viral load(VL),the rate significantly increased to 61.9% in 0 to 6 months treatment patients(mean 3 months)(P<0.005)but again significantly decrease to 38.6% in 6 to 12 months treatment patients(mean 9 months)(P<0.001)and 40.0% in patients receiving more than 12 months treatment(mean 16 months)(P<0.005).The prevalence of drug resistance in patients who had a detectable VL and available sequences were 7.0%,48.6%,70.8%,72.3% in treatment-na?ve,0 to 6 months treatment,6 to 12 months treatment,and treatment for greater than 12 months patients,respectively.No mutation associated with resistance to Protease inhibitor(PI)was detected in this study.Nucleoside RT inhibitor(NRTI)mutations always emerged after non-nucleoside RT inhibitor(NNRTI)mutations,and were only found in patients treated for more than 6 months,with a frequency less than 5%,with the exception of mutation T215Y(12.8%,6/47)which occurred in patients treated for more than 12 months.NNRTI mutations emerged quickly after therapy begun,and increased significantly in patients treated for more than 6 months(P<0.005),and the most frequent mutations were K103N,V106A,Y181C,G190A.There had been optimal viral suppression in patients undergoing treatment for less than 6 months in Queshan,Henan.The drug resistance strains were highly prevalent in antiretroviral-treated patients,and increased with the continuation of therapy,with many patients encountering virological failure after 6 months therapy.     

HIV-1整合酶蛋白的可溶性表达及功能研究

HIV 1整合酶是HIV病毒复制中一个重要的酶,也是治疗艾滋病药物的一个重要靶点。为了开展以整合酶蛋白为靶点的抑制剂筛选,构建HIV 1整合酶重组质粒,在原核细胞中进行可溶性表达和功能研究。通过重叠PCR技术引入F185K和C280S突变于HIV 1 B亚型标准株的整合酶cDNA片段中,PCR扩增片段克隆到pET 28a(+)表达载体中,构建重组质粒,在E. coli中进行整合酶基因表达,SDS PAGE鉴定表达产物,亲和层析纯化蛋白,酶联免疫吸附实验方法测定整合酶的生物学活性。结果构建的重组质粒获得高效稳定的可溶性表达,ELISA实验证实该蛋白具有整合酶的3′切割DNA和5′链转移的活性。HIV 1整合酶蛋白的可溶性表达和活性研究为建立以整合酶为靶点的抗HIV药物筛选平台打下了基础。     

Updates on CRISPR-based gene editing in HIV-1/AIDS therapy

Although tremendous efforts have been made to prevent and treat HIV-1 infection, HIV-1/AIDS remains a major threat to global human health. The combination antiretroviral therapy (cART), although able to suppress HIV-1 replication, cannot eliminate the proviral DNA integrated into the human genome and thus requires lifelong treatment that may lead to various side effects. In recent years, clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)-associated nuclease 9 (Cas9) related gene-editing systems have been developed and designed as effective ways to treat HIV-1 infection. However, new gene-targeting tools derived from or functioning like CRISPR/Cas9, including base editor, prime editing, SHERLOCK, DETECTR, PAC-MAN, ABACAS, pfAGO, have been developed and optimized for pathogens detection and diseases correction. Here, we summarize recent studies on HIV-1/AIDS gene therapy and provide more gene-editing targets based on studies relating to the molecular mechanism of HIV-1 infection. We also identify the strategies and potential applications of these new gene-editing technologies for HIV-1/AIDS treatment in the future. Moreover, we discuss the caveats and problems that should be addressed before the clinical use of these versatile CRISPR-based gene targeting tools. Finally, we offer alternative solutions to improve the practice of gene targeting in HIV-1/AIDS gene therapy.     

上海地区人类免疫缺陷病毒/艾滋病合并乙型、丙型肝炎病毒感染的临床流行病学研究

目的 研究人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)感染者中乙型肝炎病毒(HBV)和(或)丙型肝炎病毒(HCV)感染的流行现状及其特点。方法 对上海市(复旦大学附属)公共卫生中心就诊的170例HIV-1感染者采集血标本,使用微粒子酶联免疫法(MEIA)检测HIV-1感染者血清的乙型肝炎二对半(HBsAg、抗-HBs、HBeAg、抗-HBe、抗-HBc),应用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测HCV抗体。结果 170名HIV-1感染者中,男性146人,女性24人,最小年龄16岁,最大年龄74岁,平均年龄41±13岁;HBsAg阳性患者19人(11．2％),抗-HBs阳性者87人(51．2％),HBeAg阳性者7人(4．1％)．抗-HBe阳性者49人(28．8％),抗-HBc阳性者111人(65．2％);抗-HCV阳性者77人(45．3％)。HIV-1、HBV和HCV三重感染者9人,约占5．3％。结论 HIV-1感染者HBsAg阳性率与普通人群相近,但HIV-1与HCV混合感染的比例显著高于普通人群。     

Comprehensive mutagenesis of HIV-1 protease: a computational geometry approach

A computational geometry technique based on Delaunay tessellation of protein structure, represented by C(alpha) atoms, is used to study effects of single residue mutations on sequence-structure compatibility in HIV-1 protease. Profiles of residue scores derived from the four-body statistical potential are constructed for all 1881 mutants of the HIV-1 protease monomer and compared with the profile of the wild-type protein. The profiles for an isolated monomer of HIV-1 protease and the identical monomer in a dimeric state with an inhibitor are analyzed to elucidate changes to structural stability. Protease residues shown to undergo the greatest impact are those forming the dimer interface and flap region, as well as those known to be involved in inhibitor binding.     

HIV-1包膜基因变异的体外研究

采用亚型测定、核苷酸和氨基酸序列测定和同源性分析等方法,观察了HIV-1 ⅢB毒株在实验室长期传代过程中包膜基因变异的情况.研究的毒株包括:经过实验室8年多连续使用而获得的毒株、在MT4细胞长期连续传代而获得的每间隔10代的毒株样品及多次更换宿主细胞传代而获得的毒株.主要结果有:(1)各种毒株包膜基因变异均不显著,核苷酸序列同源性均大于92%,变异距离均小于7.5%,且随着传代数增加核苷酸趋于稳定,代间同源性由92%上升至99%,而变异距离由7.5%下降为0.6%.(2)在传代过程中HIV-1亚型保持稳定,各种毒株均为HIV-1 B3亚型.结果显示HIV在体外长期传代培养的过程中变异不大,遗传性状稳定,可能是体外生长的环境十分稳定,缺乏机体免疫学压力.结果也提示体外长期传代HIV毒株仍然适用于各种HIV的应用研究,用长期传代的方法发展HIV-减毒活疫苗的可能性不大.     

细胞内抗体在HIV-1感染及爱滋病治疗中的应用

ＨＩＶ1是慢病毒亚家族的成员,是ＡＩＤＳ的病因。像其它逆转录病毒一样,ＨＩＶ1基因组包含ｐｏｌ(聚合酶)、ｅｎｖ(包膜)结构基因,也编码Ｒｅｖ(毒粒蛋白调节子)、Ｔａｔ(反式激活蛋白)等调节蛋白。抗ＨＩＶ1细胞内抗体由细胞合成并导向其结合靶ＨＩＶ1蛋白和发挥抑制功能的细胞隔室。这些内抗体主要瞄准病毒生命周期中必需的蛋白质。1.包膜糖蛋白(ｅｎｖｅｌｏｐｅｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ)ＨＩＶ1包膜糖蛋白是作为ｇｐ160前体合成的,并在高尔基复合体上分裂为成熟的ｇｐ120/41蛋白。ｇｐ120与ＣＤ4在细胞表面和细胞内的相互作用不仅对病…