运用数据挖掘和网络药理学探讨糖尿病认知功能障碍中医用药规律和作用机制

本文旨在通过探讨中医药治疗糖尿病认知功能障碍的用药特点与规律,为临床用药提供新的参考.运用中国知网(CNKI)、万方数据(WF)、维普期刊全文数据库(VIP)、生物医学文献数据库(CBM)、及中国科学引文数据库(CSCD)检索自1999年1月至2020年10月收载的中医药治疗糖尿病认知功能障碍文献,经筛选后建立数据库,...     

基于数据挖掘及网络药理研究古方治疗强直性脊柱炎的用药规律及相关药理分析

本研究基于数据挖掘及网络药理学技术,总结古代医家治疗强直性脊柱炎处方用药规律,并对出现频率最高的药对进行网络药理学分析,阐明其药理作用机制,为临床治疗用药提供一定参考.通过检索中医药科学数据库,检索关键字段"痹""脊痛""大偻""伛偻"等,然后将检索得到的古方进行筛选、统计处理、关联规则和系统聚类分析;之后运用网络药理...     

基于网络药理学和数据挖掘探讨中药干预细胞因子风暴的物质基础及用药规律

基于网络药理学和数据挖掘探索中药干预细胞因子风暴的物质基础及用药规律。借助GeneCards、DisGeNET、DrugBank、OMIM等数据库收集细胞因子风暴(cytokine storm, CS)相关靶点;通过TCMSP数据库筛选和匹配可能干预细胞因子风暴的活性成分及中药;并利用Cytoscape 3.7.2软件构建靶点-化合物、靶点-化合物-中药网络。借助CB-Dock在线分子对接平台对潜在靶点与备选化合物进行分子对接,并利用Ligplot软件展示得分值(affinity)较好的组合。利用Microsoft Office Excel 2017表相关功能统计中药的性味、归经、功效等,并构建中药性味归经功效网络。检索到CS相关靶点113个,其中35个靶点匹配的化合物符合筛选标准,共涉及49个备选化合物。通过化合物映射,匹配到268味中药,其中银杏叶、败酱草、甘草、灯盏细辛等中药涉及的靶点较多。分析表明干预细胞因子风暴的中药多为清热类、活血化瘀类、补虚类,药味以苦为主,药性以寒最常见,且多入肝经、肺经。本研究通过系统探讨干预细胞风暴因子的物质基础,总结了细胞因子风暴相关中药的一般规律...     

基于数据挖掘和网络药理学研究强直性脊柱炎的用药规律及高频药物组合的分子作用机制CSCD

基于数据挖掘及网络药理学分析方法,总结上海中医药大学附属光华医院风湿免疫科医师运用中药治疗强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)的用药规律。并对出现频率最高的药对进行网络药理学分析,进一步阐释其药理作用机制,为中药治疗AS提供一定的参考。本研究以上海中医药大学附属光华医院为主要研究中心,采用横断面调查研究方法,对就诊于光华医院风湿免疫门诊及住院部的AS患者进行信息采集,收集患者的基本信息、中药治疗处方等数据资料,并依托现代计算机信息技术,采用数据挖掘方法进行分析,并对得到的高频药对进行网络药理学分析。收集到中药处方200个,统计中药236味,使用频率≥1%的中药有狗脊、白术、独活等28味,主要是补虚药、清热药、活血化瘀药和祛风湿药;关联规则后得到频数≥40的药物组合33个,其中狗脊-续断排名最高。网络药理学分析结果显示狗脊-续断共含有12个有效成分,对应作用蛋白430个;药物作用于疾病的主要基因包括TNF、EGFR、VEGFA、STAT3、HSP90AA1、PTGS2、MMP2、MMP9、IL2等。基因本体论(GO)生物过程分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析显示主要参与炎症调控反应和配体激活的转录因子活性等多项进程,并通过癌症通路、Toll样受体信号通路、神经营养素信号通路和T细胞受体信号通路等多条通路作用于AS。上海中医药大学附属光华医院在治疗AS上采用补虚强脊为主,兼以清热、活血化瘀、祛风除湿的标本兼治方法,为进一步应用中医药治疗AS提供参考;网络药理分析表明狗脊-续断中β-谷甾醇、山奈酚等成分可能通过TNF、VEGFA、STAT3、PTGS2、MMP9、IL2等靶点作用于癌症通路、Toll样受体信号通路和T细胞受体信号通路等,从而发挥治疗AS的作用。表明中医药治疗疾病具有多成分、多靶点、多通路的特点,为后续临床应用提供了理论基础。     

基于网络药理学及实验验证探讨益气温阳活血利水中药组分配伍防治慢性心力衰竭作用机制CSCD

利用网络药理学及分子对接预测益气温阳活血利水中药组分配伍防治慢性心力衰竭(chronic heart failure)潜在靶向作用机制。通过文献检索及课题组前期经验,确定黄芪、桂枝、丹参、葶苈子四味益气温阳活血利水代表药物。采用TCMSP、BATMAN-TCM平台筛选四种药物的活性成分并预测相关作用靶点;利用GeneCards、OMIM、TTD数据库筛选CHF相关靶点;通过String数据库构建蛋白互作PPI网络;利用DAVID数据库进行GO分析和KEGG通路分析;通过Cytoscape 3.8.0软件构建网络关系图;通过Autodock vina进行分子对接。共收集得到化合物21个,CHF靶点共10759个,其中黄芪总皂苷、丹参总酚酸、葶苈子水提物及桂皮醛与疾病的交集靶点分别为75、56、163、27个,根据degree值筛选核心靶点40个;GO分析和KEGG通路分析分别将排名靠前的条目可视化;分子对接结果显示四种中药活性成分与核心靶点结合能稳定。动物实验结果显示,组分配伍能改善心功能,降低血浆中B型钠尿肽前体(NT-proBNP)、心肌肌钙蛋白I(cTnI)、升高血清中超氧化物歧化酶(SOD)、降低丙二醛(MDA),改善心肌细胞凋亡。本研究初步揭示了黄芪总皂苷、丹参总酚酸、桂皮醛与葶苈子水提物组分配伍多成分、多靶点、多途径治疗CHF的机制,作用机制可能与细胞凋亡、氧化应激、炎症反应及能量代谢有关。     

基于数据挖掘及网络药理学探讨乳香-没药治疗乳腺癌的作用机制

本文基于数据挖掘、网络药理学及分子对接方法,探讨乳香-没药药对治疗乳腺癌的分子机制.采用Apriori关联规则算法挖掘出乳香-没药药对并建立决策树模型,使用Cytoscape软件构建化合物-靶点可视化网络及蛋白互作网络,再运用David数据库进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,并对有效成分-靶点拓扑分析所得...     

基于数据挖掘和网络药理学探究海洋中药治疗乳腺增生的用药规律及作用机制

基于数据挖掘、网络药理学及动物实验,挖掘含海洋中药的授权专利组方治疗乳腺增生的用药规律、探究核心药组治疗乳腺增生的作用机制。搜集1993年至2022年间治疗乳腺增生的授权复方专利文献,其中含海洋中药的专利组方有157首。组方中高频海洋中药有牡蛎、海藻、昆布等,高频非海洋中药有柴胡、当归、夏枯草等;高频药物可聚为三类;关联规则分析获得的核心药组为柴胡-牡蛎-当归。网络药理学分析显示柴胡-牡蛎-当归药组治疗乳腺增生的核心靶点有TP53、AKT1、ALB、ESR1;核心成分有槲皮素、山柰酚、异鼠李素、β-谷甾醇;核心药组治疗乳腺增生与P13K-ATK信号通路关系密切。分子对接结果显示核心药组中的核心成分与核心靶点对接良好,动物实验表明核心药组能有效改善乳房形态,抑制乳腺增生。本研究初步揭示海洋中药治疗乳腺增生的用药规律及机制,为海洋中药治疗乳腺增生作用机制的深入研究奠定基础,同时为相关专利的申请提供参考。     

小儿病毒性脑炎中医证型分布规律及其影响因素

目的 探究小儿病毒性脑炎中医证型分布规律及其影响因素。 方法 回顾性分析2016年1月至2018年10月我院收治的141例病毒性脑炎(VE)患儿临床资料,根据临床表现,参照中医及西医诊断标准,归纳小儿病毒性脑炎常见症候,并根据患者预后情况分为预后良好组(n=97)与预后不良组(n=44),采用Logistic回归模型分析影响预后的相关因素。 结果 中医四诊证候出现频率较高的为发热、头晕头痛、肢体困重、偏瘫或麻、纳呆、便溏、便干尿赤等。舌脉表现中,舌红、痰白、脉弦、脉滑数出现频率较高。卫气营血分布中气分证患者占比最高,其次为营分证、卫分证。证型分布中痰湿证出现频率最高,其次为热证,而后是风证及其他证型。本研究中最常见的为痰蒙心窍证。预后不良组患者中精神行为异常、意识状态异常、惊厥、肌力异常、脑MRI异常及病灶≥2个者的比例均显著高于预后良好组(均P结论 小儿病毒性脑炎基本属于温病范畴,以气分证最多,多为合并证型。意识状态异常、脑MRI异常、病灶数目多、惊厥时间长、发热时间长及Glasgow评分低均会对患儿预后产生严重影响,需重视具有上述症状的患儿以改善其预后。     

基于网络药理学的柿果药理功能定位及作用机制

基于网络药理学,通过国内外文献检索获取柿果中的化合物,采用Swiss target prediction数据库对化合物进行潜在靶点垂钓以探讨柿果的药理功能定位及作用机制。以Cytoscape软件构建化合物-靶点网络,靶点-疾病名称-疾病分类网络,同时对靶点进行蛋白相互作用(PPI)网络构建,采用DAVID数据库对靶点进行通路富集分析。本研究共收集到柿果中16个化合物,可作用于68个靶点,这些靶点主要作用于心血管疾病、神经精神性疾病等。PPI网络图包含84个节点,226条边,其中degree值排前10的关键蛋白分别为ERS1、PGS2、MMP2、TIMP1、MMP9、MMP1、AR、SLC6A3、PRKCB、CYP19A1。上述靶点可调节氮素代谢、血清素能突触以及TRP通道炎症介质的调节等信号通路。本研究为阐明柿果的药理功能定位及其作用机制研究提供了可靠的依据。     

基于数据挖掘和网络药理学分析《中国药典》治疗心悸药物配伍规律及其作用机制

通过挖掘《中国药典》中用于治疗心悸中成药的组方规律,并通过网络药理学分析,探究中成药中心悸的应用规律及其可能存在的关键作用机制,为临床选方用药科研试验提供参照.在2015版《中国药典》(一部)收集用于治疗心悸的中成药的方剂名称、中药成分、中药用量、功能与主治,并录入中医传承辅助平台V2.5中,进行药频统计、关联分析、因...     

数据挖掘中药治疗癫痫药对“陈皮-半夏”及其网络药理学作用机制分析

探讨中药治疗癫痫的方药使用规律,挖掘出常用药对陈皮-半夏,借助网络药理学技术预测陈皮-半夏中的化学成分所潜在的作用靶点,探讨其治疗癫痫多成分,多靶点,多通路的作用机制。以中国全文期刊数据库(CNKI)、维普、万方收集治疗癫痫的中药复方,运用Apriori算法建立起关联模型,挖掘出数据库中隐藏的药物配伍规律,利用TCMSP、OMIM、STRING及DAVID数据库分析药物疾病靶点间相互作用关系及相关通路。在所筛选出符合标准的131篇文献中,有226个方剂中共使用221种中药,得到置信度最高的药对陈皮-半夏,陈皮-半夏得到的18个目标化合物共检索出268个靶点基因,癫痫检索出的相关靶基因为886个,两者相关靶基因进行匹配得到共同靶基因41个,通过Cytoscape获取PPI网络中得到AKT1、MAPK3、FOS等具有重要地位的基因在陈皮-半夏治疗癫痫中具有重要意义。关键靶基因的GO和KEGG富集分析可得到陈皮-半夏配伍治疗癫痫的作用机制主要涉及对药物的反应、脂肪细胞分化的正调节、Ras蛋白信号转导、运动行为等生物功能,通过调节Serotonergic synapse、Kaposi sarc...     

不同胃癌前病变中医证型PG、G-17、CEA和叶酸水平变化及相关性研究

目的:对不同胃癌前病变中医证型和血清胃蛋白酶原(pepsinogen,PG)、胃泌素-17(gastrin-17,G-17)、癌胚抗原(carcinoembry-onic antigen,CEA)和叶酸水平变化的关系进行探讨,为胃癌前病变的诊断提供一定的依据.方法:以80例胃癌前病变(precancer-ous les...     

基于网络药理学的玫瑰花潜在药理及保健作用机制

基于网络药理学探讨药食同源玫瑰花的有效化合物及其潜在药理及保健作用机制。利用中药系统药理学技术平台(TCMSP)和蛋白质相应作用平台(STRING),过滤玫瑰花的有效化合物及对应作用靶点;运用Cytoscape 3.7.0软件建立并分析玫瑰花有效化合物-作用靶点网络;利用STRING数据库平台和Cytoscape 3.7.0软件建立并分析玫瑰花有效化合物作用靶点PPI网络;利用Bioconductor对作用靶点进行生物功能注释(GO)和KEGG通路富集分析。结果显示:玫瑰花中的番茄红素、Rubixanthin、Rugosin A、β-谷甾醇、豆甾醇、Cyanine、维生素E、去甲氧基茵陈色原酮、β-胡萝卜素和槲皮素10个有效化合物可能通过AGE-RAGE、TNF、IL-17和HIF-1等161条信号通路作用于PTGS2、NCOA2、PTGS1、BCL2、CASP9、JUN、CASP3和CASP8等154个作用靶点,发挥抗氧化、抗肿瘤、抗炎、抗病毒、免疫调节和保肝等药理作用以及降糖、降脂、抗衰老及改善皮肤等保健功能。玫瑰花发挥药理及保健作用具有多成分、多靶点和多途径的特点,研究结果可为玫...     

基于数据挖掘及网络药理学研究新安固本培元高频药对及其治疗慢性阻塞性肺疾病的作用机制CSCD

本文基于数据挖掘、网络药理学及分子对接方法,探讨新安固本培元高频药对人参-黄芪治疗慢性阻塞性肺疾病的分子机制。采用Apriori算法建立关联模型挖掘出人参-黄芪为新安固本培元高频药对。使用Cytoscape 3.7.2软件构建“化合物-靶点”网络、蛋白互作网络及进行拓扑分析。采用Metascape数据库,进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,筛选度值较高的“有效成分-靶点”进行分子对接。结果表明人参-黄芪有效成分33种,相关靶点206个,慢性阻塞性肺疾病靶点946个,获取目标靶点64个。GO分析共包含1629条生物过程、48条细胞组分、91条分子功能,247条KEGG富集结果。分子对接结果显示山奈酚、人参皂苷Rh及常春藤皂苷元能够与AKT1、IL6、CXCL8、MAPK1及TNF-α结合。本研究总结出人参-黄芪为新安固本培元医家治疗慢性阻塞肺疾病的高频药对,初步揭示了人参-黄芪治疗慢性阻塞性肺疾病的作用机制。     

静息心率与慢性心力衰竭患者血清NT-proBNP的相关性分析

目的:探讨入院时静息心率与慢性心力衰竭患者血清N末端B型钠尿肽原(NT-pro BNP)相关性。方法:选取我院收治的242例慢性心力衰竭患者为研究对象,按静息心率将患者分为Ⅰ组(心率70次/min),Ⅱ组(心率:70%~90次/min),Ⅲ组(心率90次/min);测量患者入院时血清NT-pro BNP水平,按照其中位数分为两组:NT-pro BNP2087.63 pg/m L组和NT-pro BNP≥2087.63 pg/m L,比较各组相关指标的差异。用多元线性回归分析静息心率与血清NT-pro BNP的关系。结果:三组在收缩压、心功能分级、左室射血分数(LVEF)、左室舒张末内径(LVEDD)、空腹血糖(FPG)比较具有统计学差异(P0.05),与Ⅰ组及Ⅱ组比较,Ⅲ组患者收缩压、LVEDD、FPG,NYHA心功能分级Ⅲ~Ⅳ比例较高、LVEF偏低;三组在血清NT-pro BNP比较亦存在显著的统计学差异(P0.05),Ⅲ组高于Ⅰ组及Ⅱ组、Ⅱ组高于Ⅰ组;与NT-pro BNP2087.63 pg/m L组比较,NT-pro BNP≥2087.63 pg/m L组静息心率偏快,且患者中90(次/min)的比例较高(P0.05)。静息心率与与NT-pro BNP呈正相关(r=0.281,P=0.035);静息心率是影响NT-pro BNP水平的独立危险因素。结论:静息心率水平与慢性心力衰竭患者血清NT-pro BNP水平密切相关。     

基于网络药理学的九香虫水煎液抗肝癌成分及可能机制分析

【目的】运用网络药理学探究九香虫Aspongopus chinensis水煎液治疗肝癌的成分及可能作用机制。【方法】在前期测定的九香虫水煎液成分基础上,运用Pubchem、SwissTargetPrediction等数据库收集排名前50的化合物及其可能靶点,GeneCards、Drugbank、DisGeNET等数据库获取肝癌治疗的可能靶点,Cytoscape 3.9.0构建药物-成分-靶点-疾病网络与成分-靶点-通路网络,STRING、cytoHubba等构建PPI网络,Metascap进行KEGG与GO富集分析,得到治疗的关键通路,进而得到关键成分和靶点。【结果】九香虫水煎液可能通过腺苷等15种成分,作用于EGFR、MAPK1、CCND1等13个靶点,调控20条癌症相关通路发挥其对肝癌的重要治疗作用。【结论】九香虫水煎液可能通过多成分、多靶点、多通路发挥治疗肝癌的作用。     

腰椎间盘突出症中医证型、影像学类型与外周血TNF-α表达水平的相关性研究

目的观察腰椎间盘突出症(LIDP)患者中医证型、影像学类型与外周血肿瘤坏死因子(TNF-α)表达水平的关系,探讨中西医结合对LIDP的中医证型辨证诊断。方法将52例腰椎间盘突出症患者(观察组)按中医证型分为气滞血瘀型(20例)、风寒湿滞型(11例)、湿热痰滞型(7例)及肝肾亏虚型(14例),并按MRI或/和CT影像学诊断的突出程度,选择膨出型(28例)和突出型(17例)患者;同时选择健康体检者32例为正常对照组。采用放免法(RIA)检测所有研究对象的外周血TNF-α水平。结果外周血TNF-α水平在腰椎间盘突出症各型(肝肾亏虚型、风寒湿滞型、湿热痰滞型、气滞血瘀型)患者中均较正常对照组显著升高,呈逐步升高趋势;LIDP的膨出型、突出型均较正常对照组显著升高,尤其突出型升高更明显,各组间差异均有统计学意义。结论不同中医证型、影像学类型的LIDP患者存在外周血TNF-α水平差异,可辅助用于腰椎间盘突出症患者中医证型的辨证诊断。     

2型糖尿病患者中医证型与糖脂代谢和甲状腺功能的关系

目的:探讨2型糖尿病患者中医证型与糖脂代谢和甲状腺功能的关系。方法:选择2016年1月-2017年12月期间武警宁夏总队医院收治的2型糖尿病患者104例,根据中医证型将其分为湿热困脾组23例、阴虚热盛组21例、气阴两虚组20例、阴阳两虚组22例与血瘀脉络组18例。检测并对比不同中医证型2型糖尿病患者糖脂代谢与甲状腺功能指标水平。结果:阴虚热盛组、气阴两虚组、阴阳两虚组与血瘀脉络组甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)水平低于湿热困脾组,高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平高于湿热困脾组(P0.05);阴阳两虚组TG、TC、LDL-C水平低于阴虚热盛组、气阴两虚组、血瘀脉络组(P0.05)。湿热困脾组、气阴两虚组、阴阳两虚组与血瘀脉络组空腹血糖(FPG)、餐后2h血糖(2hPPG)、糖化血红蛋白(GHb)水平低于阴虚热盛组(P0.05)。湿热困脾组、阴虚热盛组、气阴两虚组、血瘀脉络组游离甲状腺素(FT4)、游离三碘甲状腺原氨酸(FT3)水平高于阴阳两虚组,促甲状腺激素(TSH)水平低于阴阳两虚组(P0.05),各组总甲状腺素(TT4)、总三碘甲状腺原氨酸(TT3)水平总体比较差异无统计学意义(P0.05)。结论:糖脂代谢和甲状腺功能能够在一定程度上反映出2型糖尿病患者的中医证型变化,可作为2型糖尿病患者中医证型与病情变化的有效参考指标。     

基于网络药理学、分子对接及大鼠实验的黄芪-冬虫夏草药对治疗IgA肾病作用机制研究CSCD

通过网络药理学筛选黄芪-冬虫夏草治疗IgA肾病(IgA nephropathy,IgAN)的作用靶点和相关信号通路,明确其作用机制,并进行实验验证。应用TCMSP、BATMAN-TCM数据库结合文献挖掘获取黄芪-冬虫夏草的活性成分和作用靶点;通过GeneCards、OMIM数据库获取慢性IgAN的疾病靶点;筛选出与黄芪-冬虫夏草共同的靶点,进而利用Venny 2.1绘制共同靶点韦恩图;利用STRING构建共同靶点互作网络(PPI);应用Cytoscape 3.7.1软件构建成黄芪-冬虫夏草丸活性成分-靶点交集的网络;通过R语言软件对共同靶点进行GO分析和慢性IgA肾病作用靶点的KEGG分析,筛选出潜在通路并分析其作用机制。运用分子对接技术验证黄芪-冬虫夏草活性成分与关键靶点的结合效能。取IgA肾病造模大鼠(分空白组、模型组和黄芪-冬虫夏草中剂量组)分别治疗21天。取肾脏组织,采用酶联免疫法检测各组大鼠肾组织中VEGFA含量。筛选出黄芪-冬虫夏草中生物活性成分5个,作用于37个IgAN的共同靶点,核心靶点为VEGFA、HIF1A、NOS3、CASP3,主要涉及类固醇结合、细胞凋亡过程的半胱氨酸型内肽酶活性、雌激素受体结合、胆固醇结合等生物过程,主要富集在Lipid and atherosclerosis信号通路、AGE-RAGE信号通路、Fluid shear stress and atherosclerosis通路、PI3K-Akt信号通路等信号通路。分子显示主要成分和关键靶点之间具有较好的结合效能。相对于模型组,黄芪-冬虫夏草中剂量组VEGFA含量显著降低(P<0.05)。黄芪-冬虫夏草药对可能作用于VEGFA、HIF1A、NOS3、CASP3等关键靶点,通过抑制纤维化等与IgA肾病疾病相关的信号通路实现对IgA肾病的治疗作用。     

心元胶囊对慢性心力衰竭心血瘀阻证患者心脏超声参数、脂质代谢及血液流变学的影响

摘要 目的：探讨心元胶囊对慢性心力衰竭（CHF）心血瘀阻证患者心脏超声参数、脂质代谢及血液流变学的影响。方法：根据随机数字表法,将我院2020年3月~2022年3月期间收治的的CHF心血瘀阻证患者120例分为对照组（常规西药治疗,n=60）和观察组（心元胶囊联合常规西药治疗,n=60）。对比两组中医疗效、心功能指标、血脂指标、肌酸激酶（CK）、肌酸激酶同工酶（CK-MB）、N-末端脑钠肽前体（NT-proBNP）、血液流变学指标,并观察两组不良反应情况。结果：观察组的中医总有效率明显高于对照组（P<0.05）。两组治疗后左室射血分数升高,左室舒张末期容量、左室收缩末期容量缩小,且观察组的改善效果优于对照组（P<0.05）。两组治疗后三酰甘油（TG）、总胆固醇（TC）、低密度脂蛋白胆固醇（LDL-C）下降,高密度脂蛋白胆固醇（HDL-C）升高,且观察组的改善效果优于对照组（P<0.05）。两组治疗后CK、CK-MB、NT-proBNP下降,且观察组的改善效果优于对照组（P<0.05）。两组治疗后全血高切黏度、全血低切黏度、血浆黏度、纤维蛋白原下降,且观察组的改善效果优于对照组（P<0.05）。两组不良反应发生率对比,差异无统计学意义（P>0.05）。结论：心元胶囊治疗CHF心血瘀阻证可提高临床疗效,改善心功能,调节脂质代谢、血液流变学水平,安全有效。