典范趋势面分析及其在山西省沙棘灌丛水平格局分析中的应用

介绍一种综合趋势面的分析方法——典范趋势面分析。典范趋势面分析是典范相关分析与趋势面分析的结合,它克服了趋势面分析的缺陷,能同时对单母体空间上的多变量进行分析,拟合一个综合趋势面。通过对山西沙棘灌丛水平格局的分析介绍了典范趋势面分析的应用,并比较了趋势面分析与典范趋势面分析。     

MATLAB 7.X 生物信息工具箱的应用-- 专用分析工具（ 六）*

序列分析可以获取蕴藏在简单序列中的生物信息,是生物信息分析的基础。通过生物大分子序列差异分析构建的系统树则可为我们提供可视化的物种间的进化关系。MATLAB7.X生物信息工具箱包含了几个图形用户界面设计的专用分析工具,这些专用分析工具交互性好,易于使用。借助于这些分析工具,用户不仅可以对基因序列进行分析查看并能进行相对应的氨基酸序列分析,还可以方便快捷地构建系统发育树。即使用户不会编程也可以进行序列分析和系统发育分析的研究,大大地提高了分析的效率。本文详细介绍了序列分析工具Seqtool和系统发育分析工具Phytreetool在序列分析及系统发育树构建方面的应用,所有操作方便快捷,分析结果可视化程度高。     

RNA-Seq本地分析平台的构建

目的:构建一个本地化的RNA-Seq数据处理分析平台,为RNA-Seq研究人员提供数据分析平台。方法:在调研现有的RNA-Seq数据分析研究成果的基础上,构建一套本地化的RNA-Seq分析平台,平台首先将测序数据中的低质量数据进行过滤,然后使用Top Hat将过滤后的数据与参考基因组数据进行比对,利用比对结果进行可变剪切分析、基因差异表达分析等,最后通过R语言工具包对分析结果进行可视化绘图。结果:通过对2组小鼠的RNA-Seq测序数据进行分析,构建的分析平台能够较好地过滤低质量测序数据,并且分析出2组数据间的差异表达基因,同时还可以图形化表示这些差异表达基因。结论:分析平台能够实现对RNA-Seq测序数据的质量控制、差异表达分析及分析结果的可视化。     

环境投入产出分析在产业生态学中的应用

综述了环境投入产出分析的基本知识及其在产业生态学领域的应用。环境投入产出分析的核心是投入产出模型,包括价值型投入产出模型、实物型投入产出模型和混合型投入产出模型。环境投入产出分析在产业生态学领域主要用于环境压力核算、生命周期评估、社会经济因素相对贡献分析、产业链路径分析、风险影响分析和环境网络分析。同时,相关学者进行环境投入产出数据库开发,给环境投入产出分析提供便捷、标准化的数据渠道。讨论了环境投入产出分析的若干发展趋势。     

牛磺酸、羟脯氨酸、γ－氨基丁酸、鸟氨酸和色氨酸的测定

在日立８３５－５０型氨基酸分析仪上,用７２ｍｉｎ程序进行分析,通常一次只能分析１７种氨基酸。采用本文所述方法则一次能分析２２种氨基酸。在不延长分析时间,不增加成本的情况下,一次多分析了五种氨基酸,提高了仪器工作效率。经过精密度、准确度试验和样品分析证明：该方法测定的数据准确、可靠,是一个又快又省的好方法。     

药物分析技术应用研究新进展

通过对2012 年我国学者在国内外发表的有关药物分析技术应用研究论文进行检索和整理,分类综述针对化学药物、基因工程药物以及中药等各类药物或生物样本的过程分析技术、高通量筛选分析技术、固态性质表征分析技术、杂质谱检测分析技术、体内样本分析技术、中药分析技术、生化药物分析技术等的应用研究新进展。     

文本分析技术在蛋白质生物信息学中应用的案例综述

海量数据时代考察文本分析技术在生物信息学领域的应用具有重要的理论和现实价值。本文讨论了文本分析在蛋白质计算分析中的几个应用实例以及核心技术内容。文本分析技术应用于生物信息学领域可发挥引领和导向作用,在生物信息学中的应用又进一步促进了文本分析技术的发展。文本分析技术虽然广泛在生物信息学中应用,但是其发展仍然有需要尚待解决的几个问题,本文对此也进行了讨论。     

微弱发光分析技术原理及应用实例(一)

微弱发光分析技术近年得到迅速发展,在自由基、活性氧分析、化学发光分析、生物的超微弱发光分析、发光免疫分析、生物发光分析等领域得到广泛应用.简要介绍了微弱发光分析技术的测量原理,并以一些研究成果为实例讲解如何应用微弱发光分析技术进行研究和实践.     

物质流分析研究述评

物质流分析方法近年来在循环经济和可持续发展研究领域发展迅速。阐述了物质流分析的定义及其与自然生态系统物质流的区别,着重回顾了该研究方法的发展历程,阐明了物质流分析的主要观点、理论基础、研究思路及研究框架,详细阐译和对比分析了物质流分析的六大类指标及分析方法,并在物质流分析框架的基础上,建立循环经济及可持续发展的评价指标体系,并对物质流分析指标体系和方法学的研究意义及其在环境经济学中的地位进行了客观的评价,进而指出了物质流分析方法的不足之处。对物质流分析在不同层次的应用研究也进行了充分的阐述和分析。对物质流分析今后相关领域的进一步研究予以了讨论和展望。     

旧石器时代残留物分析:回顾与展望

残留物分析是1970年代在西方发展起来的一项功能学分析技术, 即借助自然科学的多种手段, 对工具表面加工对象残存物的提取和鉴定分析。本文对西方石制品残留物分析研究史做了回顾和综述, 简要介绍此种方法的概念、原理及相关技术问题, 同时对中国旧石器时代石制品残留物分析的前景进行了展望, 希望对相关理论和方法的引进和应用起到铺垫和促进作用。我国旧石器时代考古资源非常丰富, 残留物分析在石器功能解读、遗址环境重建、古人类行为复原和食谱分析等方面都会起到重要的作用, 成为破解很多学术疑点和难题的钥匙。     

蛋白质序列复杂性简化与非比对序列分析

非比对序列分析是最新发展的一种序列分析方法,具有计算效率高并适用于分析低相似性的序列,已成功用于DNA的序列分析中.但是由于蛋白质序列的复杂性,非比对序列分析对于蛋白质序列分析的准确度却不高.用将20种天然氨基酸残基归类的方法,简化了蛋白质序列的复杂性,并运用到对蛋白质的非比对序列分析中,有效地提高了序列分析的准确性.     

小波分析在生态环境研究中的应用初探

小波分析(Wavelet Analysis)是时间-频率分析领域近年来迅速发展的一种新技术,具有多时间尺度,多层次和多分辨的特性,已被广泛地应用在信号分析、信息分析和地球科学研究上.本文以大亚湾大鹏澳水域2002年春秋两季浮游植物30d连续观测资料为例,首次运用小波技术分析浮游植物对生境变化的响应特征.结果表明,通过小波变换的浮游植物数量(细胞密度)的时间序列,存在各自的优势周期和多时间尺度结构特征,而春秋两季浮游植物细胞密度的优势周期和多时间尺度结构,在大尺度上大致相同,但在小尺度结构上稍有差别;使用不同小波变换(如Mexh小波变换和Morlet小波变换)可以取得各自不同特点的结果.本文对小波分析技术在生态环境研究的初步应用说明,小波分析技术可以对生态系统中浮游植物的动态变化进行多时间尺度,多层次和多分辨的分析,为深入研究和预测浮游植物的动态变化提供一种新的分析手段.     

现代荧光免疫分析技术应用及其新发展

免疫分析作为一类特殊的试剂分析技术,已经被广泛应用于多个不同领域。作为免疫分析方法家族中的一员,现代荧光免疫分析技术在相关领域里也扮演了重要角色。现代荧光免疫分析技术主要包括荧光偏振免疫分析(FPIA)和时间分辩荧光免疫分析(TRFIA)两种技术。本文从原理角度出发,综述了FPIA和TRFIA近年来在分析领域中的应用,并且阐述了二者的一些最新发展动态。     

样品预处理对有机碳同位素分析结果的影响

文中主要阐述样品预处理方法不同对于有机碳同位素分析结果将产生重要影响,并直接关系到由此而得出研究结论的可靠性。分析样品采自扬子地台震旦纪蓝田组剖面,并对相同岩石样品采取两种不同的预处理方法。分析结果显示,得到的两套数据之间存在明显的差值。这种分析差主要是来源于分析样品中残存的碳酸盐。因此,在对全岩分析样品实施有机碳同位素测定之前,务必将分析样品中无机碳除尽。此外,针对目前应用于有机碳同位素分析的样品预处理方法可能存在的问题提出看法。     

近红外光谱技术在烟草行业中的应用进展

介绍了近红外光谱分析技术在烟草常规化学成分分析、烟气分析、卷烟配方设计、不同产地模式识别和真假烟鉴别等方面的应用,认为近红外光谱分析技术在烟草行业中正扮演着越来越重要的角色,而且具有十分广阔的应用前景.     

群体遗传学研究中的数据处理方法Ⅰ.RAPD数据的AMOVA分析

近年来,RAPD数据和AMOVA分析广泛地应用于群体遗传学和保护遗传学研究。然而,由于RAPD标记具显性特点,加上目前进行AMOVA分析所依赖的RAPDistance软件不完善,使得对RAPD数据进行AMOVA分析时存在许多不足。本文介绍了AMOVA分析的基本过程,同时引入一个新的程序DCFA用以替代RAPDistance,并详述了将DCFA与WINAMOVA联用,对RAPD数据进行AMOVA分析的具体步骤与注意事项。最后,以产自中国和巴西8个普通野生稻（Oryza rufipogon）天然群体为例,演示了对RAPD表型数据进行AMOVA分析的过程,讨论了AMOVA分析结果在群体遗传结构上的意义。通过对AMOVA算法的分析,同时比较4种距离系数所得AMOVA结果,我们认为在进行AMOVA分析时选择NEILI距离和欧氏距离平方较为合适,而目前国内使用较多的JACCARD系数不适合AMOVA分析。     

植被生态信息的典范相关分析技术理论

植被生态信息分析中对两（多）组取样集间的相关分析的需求导致了典范相关分析技术的应用和发展。本文对典范相关分析技术的原理、典范参数的生态学意义进行了提示,比较了典范相关分析与ＰＣＡ之间的差异,产在典范相关分析技术的应用过程中,原始数据的预处理提出了建议。     

PCR-DGGE研究微生物种群中多条带产生原因分析

鸡肠道微生物菌群经PCR-DGGE分析,回收PCR-DGGE分析胶上的一条DNA片段,回收的DNA片段再重复进行2次PCR-DGGE分析,以及分别用PCR反复循环扩增和PCR高保真酶扩增后再进行DGGE分析等方法研究PCR-DGGE分析中多条带产生原因。结果显示PCR-DGGE分析中多条带产生原因可能是作PCR扩增模板的DNA混杂有少量其他DNA片段,多条带现象不易被消除。DGGE分析胶上的DNA片段测序时,将该DNA片段回收、PCR扩增后克隆,提取多个阳性克隆菌的质粒DNA片段,分别与其原目的DNA片段进行DGGE分析,在DGGE分析胶上选取与原目的DNA片段处于同一电泳位置的质粒DNA测序,提高测序的准确性。     

基因表达谱芯片的数据挖掘

随着基因芯片技术的迅速发展,表达谱芯片分析及aCGH等方法已被广泛应用于生命科学各个研究领域,由此产生的数据也呈指数级增长。如何从海量数据中获取有生物学意义的结果成为摆在生物学工作者面前的难题。对表达谱芯片数据挖掘方法进行了综述。介绍了基本分析思路,当前重点分析方向,如GO分析、pathway与调控网络分析、聚类分析等计算法则和相关几款易用的分析软件。并介绍了几种科学自由计算软件在表达谱生物信息学分析中的应用。藉此为从事芯片分析的研究人员提供参考。     

生物信息学在新基因全长cDNA序列分析及功能预测中的应用

差异表达基因的检测与分析已成为研究具有差异的生物学表型的常规策略.对通过实验所获得的差异基因片段进行生物信息学分析,主要包括基于国际互联网的序列相似性分析、片段重叠群分析和全长cDNA序列分析,以及如何构建局域网并采用本地服务器进行规模化的数据分析,从而为研究人员提供可参考的生物信息学数据分析方案.