多个核酸序列的计算机比较分析

本文介绍了一组应用于多个DNA序列比较分析的BASIC程序。程序K1246^p利用1-P、2-P、4-P和6-P替代模型估计同源DNA序列分化后的核昔酸替代数K;程序DOT利用点阵方法比较两个DNA或蛋白质序列,寻找序列间的相似性以及寡聚核昔酸、回文序列等初级结构特征。     

基于Windows的核酸序列分析软件的开发

随着基因组计划的发展和基因分离技术的不断提高,大量的DNA序列需要进行分析以获得有用的生物学信息。然而当前开发的大多数序列分析软件或者使用功能比较单一,或者价格比较昂贵,不能很好的满足日常工作的需要。利用流行的Visual Basic语言进行核酸序列分析软件的开发,编制的BioXM软件能够满足包括翻译、ORF查找、序列联配、酶切位点分析、引物辅助设计、序列排列格式化、序列格式转换、载体序列去除等需要,达到了满意的应用效果。     

通过电子邮件开展核酸和蛋白质序列分析

近年来,许多核酸和蛋白质序列数据库如ＧｅｎＢａｎｋ、ＥＭＢＬ、ＤＤＢＪ、ＳＷＩＳＳＰＲＯＴ、ＰＤＢ等均建立了与Ｉｎｔｅｒｎｅｔ的连接,并开通了电子邮件服务器,向用户免费提供序列分析服务。只要用户按规定的格式向电子邮件服务器发送序列分析请求,电子邮件服...     

核酸和蛋白质一级结构序列的计算机分析

本文介绍了计算机在核酸和蛋白质一级结构序列分析上的一些应用,包括序列的收集和贮存,两个或多个序列之间同源性的比较,用限制性内切酶找出酶切位点,找出DNA序列的开放式密码解读链和蛋白质序列倒翻成DMA序列的可能结果以及DNA和蛋白质序列的建立和应用等。     

核酸和蛋白质序列分析的软件系统——GOLDKEY

近年来基因工程和蛋白质工程取得巨大进展,但核酸和蛋白质实验费用昂贵,分析工作繁杂,难于考虑周全。提供一套快速、严格而又尽可能全面地分析实验可行性并对实验结果作初步预测的软件,将大大提高实验在最有利条件下取得成功的可能性。因此,从基因工程技术诞生起,相应的计算机软件和数学方法也随之产生。随着基因工程技术的深入发展,又提出许多用     

在英特网上分析核酸与蛋白质的序列

在英特网上分析核酸与蛋白质的序列李健张卿伟（山东大学生命科学学院,济南２５０１００）关键词英特网序列分析核酸蛋白质近年来,数目众多的分子生物学数据库和软件相继与英特网连接［１］,使得在英特网上分析核酸与蛋白质序列成为可能,可分析的种类也越来越多。例如...     

微型蛋白质序列分析仪

Porton International 集团的分公司 Porton Instruments 介绍了一种新型氨基酸序列分析仪。他们相信,这种氨基酸序列分析仪能使用户节省投资、减少运行成本。Porton 序列分析仪利用氮气而不是氩来充气;反应罐空罐时会自动关闭,所有的开关设备是由聚四氟乙烯构成的,通过一整套液体传送系统和不需要真空辅助装置的新型开关来防止药物的氧污染。整个系统设计较为简单,利于用户自我服务(尽管对部件和劳务有一年     

核酸序列重复片段的统计分析

对核酸序列编码区的重复片段进行了统计分析。发现不同物种的序列具有近似相等的约化重复长度和次数,研究了重复区内碱基分布的特点,并讨论了此结果可能的生物学涵义。     

核酸起始序列、终止序列和插入序列的统计分析

对八百个核酸序列进行了统计分析,讨论了起始序列、终止序列、插入序列、间隙序列以及序列的氨基酸编码区的各项信息指标,进行了相互比较,并讨论了这些指标和分子进化的统计相关性.     

基于Z曲线的核酸序列可视化分析平台研究

随着Z曲线的提出,用几何学的方法研究DNA序列得到了发展。利用z曲线的思想对核酸序列的可视化分析平台的构建进行了研究,提出了基于包围盒的多精度抽稀算法,实现了从DNA序列到三维空间点和曲线的直接转换。     

Clustal W—蛋白质与核酸序列分析软件

蛋白质与核酸的序列分析在现代生物学和生物信息学中发挥着重要作用,新的算法和软件层出不穷,本文介绍一个可运行在ＰＣ机上的完全免费的多序列比较软件－ＣｌｕｓｔａｌＷ,它不但可以进行蛋白质与核酸的多序列比较,分析不同序列之间的相似性关系,还可以绘制进化树。由于其灵活的输入输出格式、方便的参数设定和选择、详尽的在线帮助以及良好的可移植性,使得ＣｌｕｓｔａｌＷ在蛋白质与核酸的序列分析中得到了广泛应用。     

奶粉用于核酸分子杂交

以低脂奶粉和SSC组成简单的核酸分子杂交体系进行核酸斑点杂交、Southern及Northern印迹杂交以及Benton菌斑原位杂交,并与传统的杂交体系进行了比较。说明该体系简单、可靠和价廉,很适于一般实验室采用。     

核酸序列特征区域的计算机判定

本文叙述了一个称作“SPECIAL REGION”的计算机核酸序列分析程序,该程序具有判定核酸序列中的诸如“回交”、“对称”、“重复”、“丰富”等特征区域的功能。程序用Apple Pascal语言编写,在Apple Ⅱ_e计算机上运行。