猪整合素β1基因CRS-PCR多态性与产仔数的关联性分析

文章采用CRS-RFLP技术对长白猪、大白猪和杜洛克猪3个品种的整合素β1基因第5外显子T32207C位点及第7外显子A35230G位点进行单核苷酸多态性分析,并将基因多态性与猪的产仔数进行关联分析。结果表明:32207多态位点的基因型效应对3个品种的总产仔数(TNB)和产活仔数(NBA)影响均不显著;35230多态位点的基因型效应对大白猪和长白猪头胎、二胎及所有胎次的TNB和NBA的影响达到显著(P<0.05)或者极显著水平(P<0.01),基因型GG、AG与AA对产仔数的影响存在差异,其效应为GG,AG>AA。可见整合素β1基因35230位点的G等位基因对大白猪和长白猪的产仔数性状有显著影响。     

可乐猪ApoA5基因多态性及其对肉质性状的遗传效应分析

根据GenBank中报道的猪apoA5基因序列设计2对引物,应用PCR技术从可乐猪肌肉组织基因组中扩增出了apoA5基因第三外显子的特异片段,采用直接测序法对apoA5基因进行单核甘酸多态性检测,并分析该基因与可乐猪12项肉质性状的关联性,结果表明:在可乐猪apoA5基因第三外显子上共检测到3个SNPs-突变位点:A~(226)G、G~(535)C、和C~(1514)T,其中A~(226)G和G~(535)C突变发生在编码区内,没有引起氨基酸的改变,为沉默突变。C~(1514)T突变发生在3'-UTR,χ~2检验表明,发现的3个多态位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(p0.05)。A~(226)G位点为低度多态,其余两个突变位点均为中度多态。最小二乘分析显示,apoA5基因第三外显子226位点AA基因型个体的肌内脂肪显著高于AG基因型个体(p0.05),535位点GG基因型个体的肉色显著高于CC和GC型个体(p0.05),1514多态位点与可乐猪肉质性状没有显著关系(p0.05)。     

白介素-18 基因多态性与黑龙江省汉族人群心房颤动相关性

目的:探讨白介素-18(IL-18)基因启动子区-137G/C(rs187238)位点和-607A/C(rs1946518)位点的等位基因、基因型、单体型与黑龙江省汉族人群心房颤动发病风险的相关性。方法:选取56例心房颤动患者和26例对照者,心房颤动患者按持续时间分为阵发房颤组和持续房颤组。采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序法(DS)对所选2个SNPs位点的基因型进行检测。结果:1黑龙江省地区汉族人群中IL-18基因启动子区-607A/C位点存在AA、AC、GG三种基因型,-137C/G位点存在CC、GC、GG三种基因型。2各心房颤动患者组与对照组间IL-18基因启动子区-137G/C(rs187238)位点和-607A/C(rs1946518)位点的基因型和等位基因频率比较均无显著性差异(P0.05)。3IL-18基因启动子区-137G/C(rs187238)位点和-607 A/C(rs1946518)位点有CA、CC、GA、GC四种单倍体型,各组单倍体型分布频率比较均无统计学差异(P0.05。4IL-18基因启动子区-137G/C(rs187238)位点和-607 A/C(rs1946518)位点的基因型和等位基因频率与AF患者的发病年龄均无统计学相关性(P0.05)。结论:IL-18基因启动子区-607A/C(rs1946518)位点和-137G/C(rs187238)位点不是黑龙江省汉族人群心房颤动的易感基因,可能与其心房颤动的发病风险无关。     

肿瘤坏死因子α基因启动子区多态性与皖南地区Graves病发生的关系

目的 探讨肿瘤坏死因子α（TNF-α）基因启动子区-238G/A和-308G/A多态与皖南地区汉族人Graves病（GD）发生的关系.方法 采用Taqman探针等位基因鉴别技术,检测和分析432例Graves病患者和629例正常对照者的TNF-α基因-238G/A和-308G/A多态位点的基因型和等位基因的频率.结果 TNF-α-238G/A和-308G/A多态基因型和等位基因频率在病例组和对照组的分布均无统计学差异（P＞0.05）,根据基因型分组进行临床病理特征比较亦未发现相关性.结论 TNF-α-238G/A和-308G/A多态与皖南地区汉族人GD发病无相关性.     

苏×香F_1代JHDM1A基因多态性与生长性能相关性分析

为了解苏太猪(♂)×香猪(♀) F1代JHDM1A基因与生长性状的相关性。试验采用61头苏×香F1代杂交猪为研究对象,应用PCR扩增及PCR-RFLP技术对杂交猪JHDM1A基因的3'-UTR区多态性进行生长相关性分析。结果表明,JHDM1A基因3'-UTR区的g.244CG位点与体长、臀腿围、体重、胸围和体高均存在显著(p0.05)或极显著(p0.01)相关,CG基因型生长性能优于CC基因型,C等位基因频率高于G等位基因。因此,该位点多态性可作为猪生长性能相关基因进行考察。     

MTHFR、MTRR和MTR基因多态性与唐氏综合征发生的相关性研究

应用PCR-RFLP方法分析31例唐氏综合征（Down＇s syndrome, DS）患儿母亲和68例正常生育女性叶酸代谢相关基因：MTHFR 677C〉T、MTRR 66A〉G和MTR 2756A〉G多态性,探讨其与唐氏综合征DS发生的关系。采用Pearson χ^2 检验基因和基因型频率分布,并分析各基因之间的相互作用,计算比值比评价相对危险度。MTHFR基因T等位基因频率在病例组和对照组中具有显著性差异（P〈0.05）,而MTRR和MTR基因G等位基因频率在病例组和对照组中的差异无显著性。MTHFR TT基因型母亲生育DS风险显著增加（OR=3.51,95 %CI=1.04-11.85,P〈0.05）。MTRR GG基因型生育DS的风险增加3.57倍（OR=3.57,95 %CI=1.19-10.73,P〈0.05）。MTR突变基因型AG和GG与生育DS的风险无显著关系。MTHFR （CT＋TT）/MTRR GG、MTHFR （CT＋TT）/MTR AA和MTRR GG/MTR AA联合基因型与DS发生风险显著相关。结果表明,MTHFR 677C〉T、MTRR 66A〉G位点变异是生育DS的独立风险因子,尚不能认为MTR 2756A〉G多态与DS发生相关。基因与基因多态位点之间存在交互和修饰效应。     

3个猪品种黑素皮质素受体1(MC1R)基因变异研究

利用测序、PCR-RFLP和PCR-SSCP等技术对杜洛克、长白、大白猪MC1R基因进行研究发现了5个多态位点。其中,668位点G→C突变发生在5′UTR,其余4个多态位点nt894insCC(894位点CC插入),1318C→T,1554G→A和1197G→A发生在编码区。nt894insCC导致编码蛋白过早终止。1318C→T,1554G→A和1197G→A突变分别导致a164Val,Ala243Thr和Asp124Asn氨基酸的改变。所有长白、大白猪个体在894位点均存在CC插入,其余多态位点基因型分别为668GG,1197AA,1318CC,1554GG。所有杜洛克个体在894位点均不存在CC插入,其余多态位点基因型分别为668CC,1197GG,1318TT,1554AA。所有突变位点无杂合子出现。由此可以推测,668G→C,1318C→T和1554G→A可能与杜洛克的红毛色存在相关,导致1197G→A突变无意义的894位点CC插入可能与长白、大白猪白毛色存在相关。     

优秀长跑运动员NADPH氧化酶p22phox亚基基因多态性分子标记的探讨*

目的:解析NADPH 氧化酶p22^phox(NADPH Oxidase p22phox, CYBA)基因的C242T、A930G和A675T多态位点,探讨用于我国北方汉族优秀长跑运动员分子选材标记的可行性。方法:选取优秀长跑运动员123人作为运动员组,127名中国北方汉族普通大学生为对照组,采用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱检测技术,对CYBA基因的C242T、A930G和A675T位点进行解析并分析比较。结果:与对照组相比,运动员组A930G和A675T位点的基因型和等位基因频率均无显著性差异(P＞0.05),而C242T位点的TC基因型在5 km/10 km运动员组的分布频率存在显著性差异(P＜0.05)。结论:C242T位点的TC基因型可作为5 km/10 km优秀运动员选材的分子标记。     

北方汉族人群白细胞介素-6基因-572C/G单核苷酸多态性与冠心病的相关性研究

目的:探讨中国北方汉族人群中白细胞介素-6(IL-6)基因启动子区-572C/G单核苷酸多态性与冠心病的关系。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,检测434例冠心病(冠心病组)患者和417名非冠心病人(对照组)的IL-6基因型,探讨-572C/G单核苷酸多态与冠心病的关系。结果:IL-6基因-572C/G多态位点的CC、CG和GG基因型在冠心病组中分别为59.68%、37.09%、3.23%,等位基因频率C和G分别为78.23%、21.77%;在健康成年者中基因型分别为67.87%、30.22%、1.92%,等位基因频率C和G分别为82.97%、17.03%。IL-6基因-572C/G位点多态性在两组人群中的分布差异存在显著性(P<0.05);经Logsitic回归校正性别、年龄、体重指数、高血压病、糖尿病、高胆固醇血症及吸烟等冠心病易患因素后,IL-6基因-572C/G单核苷酸多态是冠心病发病的独立的危险因素(P<0.05);等位基因频率的相对风险分析发现,G等位基因携带者患冠心病的风险是C等位基因的1.356倍〔OR=1.356,95%CI=1.0648～1.7279〕。...     

CDA基因多态性与晚期非小细胞肺癌患者含吉西他滨化疗疗效的研究

为了探讨胞苷脱氨酶(CDA)基因多态性与晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者含吉西他滨化疗疗效的关系。在试验中120例患者均接受含吉西他滨化疗,采用直接测学法检测化疗前CDA A79C和G208A的基因多态性,比较不同基因型与疗效的关系。结果表明CDA G208A位点中,基因型及等位基因与化疗有效率的差异无统计学意义,携带突变等位基因的基因型相对于野生型纯合子化疗无效的风险未升高(p=0.768);CDA A79C AA、AC、CC基因型的有效率依次为41.3%、20.0%和6.7%,A、C等位基因的有效率分别为37.8%和13.3%,差异均有统计学意义(p0.05);以野生型AA型为参照,突变基因型AC和CC化疗无效的风险均升高,且C等位基因相对于A等位基因化疗无效的风险也升高,差异均有统计学意义(p0.05)。CDA A79C多态性与化疗疗效有关,且携带突变等位基因患者化疗无效的风险较高,可以为临床个体化用药提供参考。     

白介素10和白介素17基因启动子区多态性位点与儿童哮喘 的相关性研究

目的:探讨IL-10基因启动子区-627A/C和IL-17基因启动子-152A/G位点多态性与儿童哮喘发生的相关性。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-PFLP)方法检测186名哮喘儿童、198名健康儿童各个多态性位点的基因型,采用SPSS13.0进行统计学分析。结果:IL-17基因-152A/G位点的基因型及等位基因频率分布在哮喘组与正常对照组均存在显著性差异(p<0.05),哮喘组-152A/G位点等位基因A频率显著高于正常对照组(x2=6.077,p=0.014,OR=1.430,95%CI=1.076-1.902)。结论:IL-17基因-152A/G位点可能与儿童哮喘的发病存在关系,其中A等位基因可能是易感基因,携带A的个体可能更易患有哮喘。     

IL-6基因多态性与小儿全身炎症反应综合征的相关性研究

目的探讨白细胞介素-6（Interleuk in-6,IL-6）基因多态性与小儿全身炎症反应综合征（system ic inflamm atory response syndrom e,SIRS）的关系。方法 30例SIRS患儿为SIRS组,随机挑选30例健康体检的小儿为对照组,采用限制片段长度多态分析聚合酶链反应方法（PCR/RFLP）对2组儿童的IL-6基因的-174位点和-572位点基因进行分析;并应用酶联免疫吸附试验法（ELISA）检测2组儿童的血清IL-6水平,观察基因型对血清IL-6水平的影响。结果 IL-6基因-572位点基因型和等位基因频率在2组间分布差异有统计学意义,SIRS组GG基因型和G等位基因频率均显著高于对照组（P〈0.05）;携带G等位基因个体患SIRS的风险约是C等位基因型个体的6.84倍（OR95%CI：2.62～17.89,P〈0.05）;G等位基因携带者IL-6血清含量显著高于CC基因携带者（P〈0.05）。IL-6基因启动子-174位点在SIRS组与对照组中只发现GG基因型,CG和CC基因型在2组中均未发现;SIRS组IL-6血清水平显著高于对照组（P〈0.05）。结论 IL-6基因-572C/G多态性可能是中国汉族儿童SIRS发病的遗传危险因素之一,血清IL-6水平可能受其基因多态性的影响。而IL-6基因-174G/C多态性与中国汉族儿童SIRS发病可能不具有相关性。     

从江香猪RARG基因多态性与繁殖性状关联分析

本实验目的是研究RARG基因SNP位点与从江香猪繁殖性状的相关性,寻找影响从江香猪繁殖性状的QTL,为分子标记辅助选择提供依据。本研究以从江香猪母猪为研究对象,利用DNA直接测序技术,筛选RARG基因SNP位点,并进行基因多样性、关联性和数量性状遗传分析研究。受试群体中,在RARG基因中发现3个SNP位点,其中A~(55)G、C~(1464)T位于intron7,C~(128)T位于exon8;关联分析发现,A~(55)G位点与初、经产母猪总产仔数、产活仔数及乳头数差异性均不显著(p0.05);C~(1464)T位点与经产母猪总产仔数、产活仔数及乳头数均呈显著性差异(p0.05),且CC基因型比CT、TT基因型多;对于C128T位点,AA基因型初产母猪的总产仔数、产活仔数及母猪乳头数均比AB、BB基因型多,且差异性均显著(p0.05);数量性状遗传分析发现,等位基因C对经产母猪总产仔数、产活仔数、乳头数的平均效应分别为0.56、0.59、0.29,CC基因型估计育种值分别为1.12、1.18、0.58;等位基因A对初产母猪总产仔数、产活仔数、乳头数的平均效应分别为0.61、0.60、0.33,AA基因型估计育种值分别为1.22、1.20、0.65。推测等位基因C和等位基因A可能为从江香猪总产仔数、产活仔数、乳头数的有利等位基因,且CC基因型和AA基因型为有利基因型。     

健康人群肿瘤坏死因子-α基因多态性的分析

了解汉族健康人群中TNF-A基因多态性的分布,研究TNF-α表达与相关疾病之间的联系。采用PCR-限制性长度片段多态分析法检测140名重庆地区汉族健康人群的TNF—A-308,TNF—A-857位点基因多态性,计算其基因型和等位基因频率,结果显示TNF-A-308G／G、G／A、4朋基因型的频率分别为89％、11％、1％,其等位基因的发生频率以G等位基因最常见（93％）,其次为A等位基因（7％）。TNF—A-857C／C、C／T、形,基因型的频率分别为68％、36％、8％,其等位基因发生频率以C等位基因最常见（81％）,其次为T等位基因（19％）。由结果可以得出重庆地区汉族健康人群TNF—A-308位点存在G／A多态性,TNF-A-857位点存在C／T多态性。     

白介素10和白介素17基因启动子区多态性位点与儿童哮喘的相关性研究

目的：探讨IL-10基因启动子区-627A/C和IL-17基因启动子-152A/G位点多态性与儿童哮喘发生的相关性。方法：采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析（PCR-PFLP）方法检测186名哮喘儿童、198名健康儿童各个多态性位点的基因型,采用SPSS13.0进行统计学分析。结果：IL-17基因-152A/G位点的基因型及等位基因频率分布在哮喘组与正常对照组均存在显著性差异（p〈0.05）,哮喘组-152A/G位点等位基因A频率显著高于正常对照组（x2=6.077,p=0.014,OR=1.430,95%CI=1.076-1.902）。结论：IL-17基因-152A/G位点可能与儿童哮喘的发病存在关系,其中A等位基因可能是易感基因,携带A的个体可能更易患有哮喘。     

NEDD4L基因变异体与内蒙古地区蒙古族人群中高血压 的相关分析

目的：探讨内蒙古地区蒙古族人群中NEDD4L基因多态性位点rs4149601(G/A)突变与高血压的相关性。方法：应用病例对 照方法研究包头地区蒙古族高血压病个体308 例及蒙古族血压正常个体454 例。检测所有个体舒张压,收缩压。使用TaqMan PCR技术进行rs4149601 多态基因分型。结果：rs4149601 多态基因型及等位基因分布在GG 基因型、GA 基因型、AA 等位基因的 频率在高血压组及对照组分别为54.7%,92.8%;11.4%及56.2%;71.4%,7.9%。rs4149601 多态基因型及等位基因分布与对照组差 异有显著性。应用多元logistic 回归分析对性别、年龄进行校正后发现rs4149601 多态基因与高血压病患病风险相关。结论：上皮 细胞钠通道亚单位基因多态性(rs4149601)同内蒙古地区蒙古族人群高血压病发病有关。     

rs25754G/A多态性与颈动脉斑块稳定性的关系

为了探讨一种具有玉型血小板反应蛋白的去整合素和金属蛋白酶12 (ADAMTS-12)基因rs25754G/A单核苷酸多态性(SNPs)与颈动脉斑块稳定性的关系,本研究选择78例颈动脉易损斑块患者和101例颈动脉稳定斑块患者作为本次实验的受试对象,应用荧光标记-限制性内切酶酶切法对ADAMTS-12基因rs25754G/A位点进行SNPs基因型检测,运用SPSS16.0统计学软件进行等位基因和基因型频数分布的分析。研究结果显示,颈动脉易损斑块组ADAMTS-12基因rs25754G/A多态位点G+AA基因型和A等位基因频率(98.72%和87.82%)明显高于颈动脉稳定斑块组(90.10%和62.38%)(p0.05)。本研究初步结论表明,ADAMTS-12基因rs25754G/A多态位点与颈动脉易损斑块的发生有相关性。     

蛋鸭IP3R2基因多态性与蛋品质关联性分析

为了了解IP3R2基因对蛋鸭蛋品质的遗传效应,本研究以樱桃谷鸭、三穗鸭和兴义鸭为实验材料,采用PCR产物直接测序法对IP3R2基因g.70681～g.71200和g.71864～g.72386区域进行单核苷酸多态性筛查,应用一般线性模型分析多态座位对三穗鸭蛋品质的影响。结果显示,在IP3R2基因中g.70681～g.71200共检测到2个SNPs位点,分别为g.70868 CT和g.70871 CT,2个SNPs位点完全连锁,均位于内含子2,共检测到2种基因型:CC和CT,等位基因C的频率在3个鸭品种中均为优势等位基因,三穗鸭群体中该多态座位为低度多态座位,樱桃谷鸭和兴义鸭群体中均为中度多态座位,樱桃谷鸭群体的杂合度最高、有效等位基因数最大,分别为0.475 8和1.907 7,三穗鸭群体则最低,分别为0.284 8和1.398 2;卡方(χ2)检验发现,该多态座位在樱桃谷鸭群体中基因型分布极显著偏离了Hardy-Weinberg平衡(p0.01),三穗鸭和兴义鸭群体基因型分布均未偏离Hardy-Weinberg平衡(p0.05)。关联性分析表明,IP3R2基因多态座位对蛋黄色泽的影响达到显著性水平(p0.05),CC基因型个体显著高于CT基因型个体(p0.05),其他蛋品质指标在2个基因型间差异未能达到显著水平(p0.05)。IP3R2基因g.70681～g.71200多态座位对鸭的蛋壳品质的影响未达显著水平,但却对蛋黄色泽有显著影响,为进一步研究其功能提供参考。     

TNF-α基因多态性及其与奶牛乳房炎的相关性分析

以417头中国荷斯坦奶牛为研究对象,根据体细胞评分(Somatic cell score,SCS)的大小将该奶牛群体划分为感染牛群(100头)和健康牛群(317头)。通过PCR-RFLP和CRS-RFLP方法检测了肿瘤坏死因子α(Tumor necrosis factor-alpha,TNF-α)基因在荷斯坦奶牛群体中的多态性,并分析这些多态位点和奶牛乳房炎的相关性。研究发现了3个单核苷酸多态位点(Single-nucleotide polymorphism,SNP):第2外显子39bp处G→A的突变;第4外显子293bp处C→T的突变;5′侧翼区(5′-flanking region,5′UTR)C→G的突变。这3个突变位点分别是DraⅠ、AfaⅠ和DdeⅠ限制性内切酶的酶切多态位点,其中DraⅠ为创造酶切位点。经过基因型分析与χ2检验表明:3个酶切多态位点在荷斯坦奶牛群中均未达到Hardy-Weinberg平衡状态。运用SPSS13.0软件,采用最小二乘拟合线性模型分析3个酶切多态位点与SCS的关系,结果表明:AA基因型个体在DraⅠ酶切位点中的SCS显著大于BB及AB基因型个体(P0.05),BB基因型表现出乳房炎抗性。AfaⅠ酶切位点中BB基因型个体的SCS显著大于AA及AB基因型个体(P0.05),AA基因型表现出乳房炎抗性。DdeⅠ酶切位点中,AB基因型个体的SCS显著低于AA基因型个体(P0.05),AB基因型为优良基因型。因此BB、AA、AB基因型分别为DraⅠ、AfaⅠ、DdeⅠ酶切位点中的优良基因型,可作为分子标记应用于奶牛乳房炎抗性筛选。     

FTH1基因多态性与湖羊和小尾寒羊产羔数的关联分析

为了解FTH1基因在2个绵羊品种中的遗传变异及其与产羔数的关系,本研究以具有详细产羔记录的湖羊(n=424)和小尾寒羊(n=432)为研究对象,采用DNA-pooling结合PCR-RFLP的方法进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)扫描,同时分析SNP位点与绵羊产羔数的相关性。结果表明,在FTH1基因第一内含子上发现一个g.1635GA的SNP位点,并在小尾寒羊和湖羊群体中均有AA、AG和GG三种基因型,其基因型频率分别为0.08、0.45、0.47和0.10、0.43、0.47,A和G等位基因频率分别为0.305、0.695和0.315、0.685,表明GG为优势基因型,G为优势等位基因;湖羊群体的基因He、Ho、Ne和PIC分别为0.431、0.569、1.759和0.338;在小尾寒羊中则分别为0.424、0.576、1.737和0.334。χ~2适合性检验表明,在此位点湖羊和小尾寒羊群体均不处于Hardy-Weinberg平衡状态(p0.05)。与产羔数的关联分析发现,在湖羊群体中,GG基因型个体的产羔数显著高于AA基因型(p=0.029),而在小尾寒羊群体中各基因型个体的产羔数差异不显著。综上所述,FTH1基因可以作为提高湖羊产羔数的分子辅助标记。