TopBP1 and DNA polymerase-α directly recruit the 9-1-1 complex to stalled DNA replication forks

TopBP1 and the Rad9–Rad1–Hus1 (9-1-1) complex activate the ataxia telangiectasia mutated and Rad3-related (ATR) protein kinase at stalled replication forks. ATR is recruited to stalled forks through its binding partner, ATR-interacting protein (ATRIP); however, it is unclear how TopBP1 and 9-1-1 are recruited so that they may join ATR–ATRIP and initiate signaling. In this study, we use Xenopus laevis egg extracts to determine the requirements for 9-1-1 loading. We show that TopBP1 is required for the recruitment of both 9-1-1 and DNA polymerase (pol)-α to sites of replication stress. Furthermore, we show that pol-α is also directly required for Rad9 loading. Our study identifies an assembly pathway, which is controlled by TopBP1 and includes pol-α, that mediates the loading of the 9-1-1 complex onto stalled replication forks. These findings clarify early events in the assembly of checkpoint signaling complexes on DNA and identify TopBP1 as a critical sensor of replication stress.     

大白菜-甘蓝单体异附加系CO-9-1的选育与鉴定

大白菜-甘蓝异附加系是利用甘蓝的优良基因改良大白菜品种的中间材料,在遗传理论研究和育种实践中有重要的应用价值。以BC1、BC2植株为基础材料,利用形态学鉴定、花粉特征与细胞学鉴定方法,进行了大白菜-甘蓝异附加系的选育研究。结果表明,由于外源染色体的影响,植株性状表现多样性;花粉量、花粉整齐度和花粉生活力低于二倍体大白菜;从18株BC2和11株BC2中鉴定出21和22条染色体的比率分别各占16．67％、16．67％和27．27％、9．09％。进一步结合核型分析比较,从BC1、BC2自交后代中鉴定出了附加甘蓝9号染色体的大白菜-甘蓝单体异附加系植株。该研究对开展比较基因组学研究,定向地向大白菜导入甘蓝优良基因,拓宽大白菜遗传背景,增加遗传多样性具有重要意义。     

miR-9-5p靶向Ambra1促进舌癌细胞增殖

miRNAs在肿瘤中异常表达,且与肿瘤的发生发展密切相关。目前发现,miR-9-5p在肿瘤中可能发挥原癌或抑癌效应,功能尚未完全阐述清楚。本文拟探讨miR-9-5p在舌癌中的作用。前期研究中收集10例舌癌组织及配对的癌旁组织,实时荧光定量PCR技术检测后发现,miR-9-5p在舌癌组织中的表达量显著高于癌旁组织,且其在舌癌细胞中的表达量也明显高于正常舌上皮细胞。此外,在舌癌细胞Tca8113中过表达miR-9-5p显著增加细胞的增殖能力。生物信息学预测及双荧光素酶报告基因实验证实,miR-9-5p可直接结合在自噬/苄氯素1调节因子1（activating molecule in beclin1-regulated autophagy, Ambra1）的 3′-UTR区域,靶向抑制Ambra1表达。Western印迹结果证实过表达miR-9-5p降低Ambra1的表达,反之亦然。Ambra1在舌癌细胞中的表达量显著低于正常舌上皮细胞。BrdU实验证实在舌癌细胞SCC-25中过表达Ambra1可显著抑制其增殖能力;相反,使用siRNA技术沉默Ambra1能够显著促进Tca8113细胞的增殖。在干预miR-9-5p的细胞中同时干预Ambra1的表达,结果发现Ambra1可显著逆转miR-9-5p对舌癌细胞增殖的促进作用。总之,miR-9-5p在舌癌中可能发挥原癌基因样作用,通过直接靶向抑制Ambra1表达进而促进舌癌细胞发生增殖。     

miR-9-5p靶向抑制Ambra1促进舌癌细胞增殖

miRNAs在肿瘤中异常表达,且与肿瘤的发生发展密切相关。目前发现,miR-9-5p在肿瘤中可能发挥原癌或抑癌效应,功能尚未完全阐述清楚。本文拟探讨miR-9-5p在舌癌中的作用。前期研究中收集10例舌癌组织及配对的癌旁组织,实时荧光定量PCR技术检测后发现,miR-9-5p在舌癌组织中的表达量显著高于癌旁组织,且其在舌癌细胞中的表达量也明显高于正常舌上皮细胞。此外,在舌癌细胞Tca8113中过表达miR-9-5p显著增加细胞的增殖能力。生物信息学预测及双荧光素酶报告基因实验证实,miR-9-5p可直接结合在自噬/苄氯素1调节因子1(activating molecule in beclin1-regulated autophagy,Ambra1)的3'-UTR区域,靶向抑制Ambra1表达。Western印迹结果证实过表达miR-9-5p降低Ambra1的表达,反之亦然。Ambra1在舌癌细胞中的表达量显著低于正常舌上皮细胞。Brd U实验证实在舌癌细胞SCC-25中过表达Ambra1可显著抑制其增殖能力;相反,使用siRNA技术沉默Ambra1能够显著促进Tca8113细胞的增殖。在干预miR-9-5p的细胞中同时干预Ambra1的表达,结果发现Ambra1可显著逆转miR-9-5p对舌癌细胞增殖的促进作用。总之,miR-9-5p在舌癌中可能发挥原癌基因样作用,通过直接靶向抑制Ambra1表达进而促进舌癌细胞发生增殖。     

胱天蛋白酶-9

在哺乳动物细胞凋亡的过程中 ,需要一系列的半胱氨酰天冬氨酸特异性蛋白酶 (ｃｙｓ ｔｅｉｎｙｌａｓｐａｒｔａｔｅｓｐｅｃｉｆｉｃｐｒｏｔｅａｓｅ) ,简称胱天蛋白酶 (ｃａｓｐａｓｅ)。目前胱天蛋白酶家族中已有1 3个成员 ,根据其氨基端前域的不同 ,分为启动酶和执行酶。启动酶能通过其前域与信号分子结合 ,引起执行酶的活化 ,导致凋亡。胱天蛋白酶的激活途径 ,目前认为有两条 :其一是由细胞表面Ｆａｓ和ＴＮＦ等介导胱天蛋白酶 8活化 ,并依次活化下游分子胱天蛋白酶 3、6、7等 ;其二是由Ｃｙｔ ｃ/Ａｐａｆ 1 /胱天蛋白酶 9/胱天蛋白…     

Integrin α9β1

Integrins are transmembrane heterodimeric receptors responsible for transducing and modulating signals between the extracellular matrix and cytoskeleton, ultimately influencing cell functions such as adhesion and migration. Integrin α9β1 is classified within a two member sub-family of integrins highlighted in part by its specialized role in cell migration. The importance of this role is demonstrated by its regulation of numerous biological functions including lymphatic valve morphogenesis, lymphangiogenesis, angiogenesis and hematopoietic homeostasis. Compared to other integrins the signaling mechanisms that transduce α9β1-induced cell migration are not well described. We have recently shown that Src tyrosine kinase plays a key proximal role to control α9β1 signaling. Specifically it activates inducible nitric oxide synthase (iNOS) and in turn nitric oxide (NO) production as a means to transduce cell migration. Furthermore, we have also described a role for FAK, Erk and Rac1 in α9β1 signal transduction. Here we provide an over view of known integrin α9β1 signaling pathways and highlight its roles in diverse biological conditions.     

热带亚热带植物学报 第9卷 第1-4期 总目录

第1期木本植物阳生和阴生叶片叶绿体O2和NO2-………………………………光还原作用林植芳,彭长连,林桂珠（1）运用灰关联模型分析大鹏湾叶绿素-b………………与海水理化因子的关系黄伟建,黄贯虹,江天久,齐雨藻（7）菠菜乙醇酸氧化酶同工酶GOI…………………………………………………的纯化和特性徐杰,吴燕燕（14）梧桐科……………………………………………………………………………植物的地理分布徐颂军,徐祥浩（19）……………………………………………………………………………广东山区的兰科植物及其分布王英强（31）……………     

F9-1胚胎癌细胞与大鼠胸腺细胞杂交产生分化细胞

利用抗8氮鸟嘌呤的F9-1 aza突变株细胞与大鼠胸腺细胞融合,在HAT培养基中成功地筛选到FRT杂交细胞。该种细胞与亲本细胞F9-1 aza的细胞形态完全不同,呈成纤维样、上皮样、圆形或多突起样的分化细胞形态。在扩大繁殖后主要为成纤维样或上皮样细胞。对其中一个集落FRT-1核型检查表明杂种细胞染色体众数为80(范围62—88),C分带显示??包含F9和大鼠胸腺细胞二个亲本的染色体。FRT-1细胞的乳酸脱氢酶图谱中出现由大鼠LDH-A亚基与小鼠LDH-A亚基组成的杂种酶带。该细胞接种到经x光照射的129/Sv-ter小鼠皮下不能长瘤,亦不能在软琼脂上生长,表明F9-1 aza细胞的恶性表型已受到大鼠胸腺细胞基因组的抑制。     

基质金属蛋白酶-2、-9及其组织抑制剂-1在大鼠肺组织中的增龄变化

目的研究基质金属蛋白酶（MMPs）-2、-9及组织型基质金属蛋白酶抑制剂（TIMPs）-1在大鼠肺组织中的增龄性变化规律。方法不同月龄（1月龄、3月龄、12月龄、18月龄、24月龄）雄性清洁级（SD）大鼠47只分为5组,按月龄取实验大鼠的右下叶肺组织,用流式细胞术检测MMP-2、MMP-9及TIMP-1的表达水平,进行定量分析。结果 MMP-2、MMP-9和TIMP-1均随着月龄的增长呈先降后升波谷型曲线变化;3月龄、12月龄和18月龄MMP-2、MMP-9和TIMP-1均较1月龄明显下降,且以12月龄为最低值;24月龄MMP-2、MMP-9和TIMP-1均较1月龄上升。MMP-2/TIMP-1比值和MMP-9/TIMP-1比值均随着月龄的增长呈先升后降波峰型曲线变化;12月龄和18月龄均较1月龄明显升高,且以18月龄为最高点;3月龄的MMP-2/TIMP-1较1月龄有所上升,3月龄的MMP-9/TIMP-1与1月龄持平;24月龄的MMP-2/TIMP-1和MMP-9/TIMP-1较1月龄也有不同程度上升。结论大鼠肺组织中MMPs及其抑制剂TIMPs随月龄的增长,呈特征性变化规律。     

Sensing of replication stress and Mec1 activation act through two independent pathways involving the 9-1-1 complex and DNA polymerase ε

Following DNA damage or replication stress, budding yeast cells activate the Rad53 checkpoint kinase, promoting genome stability in these challenging conditions. The DNA damage and replication checkpoint pathways are partially overlapping, sharing several factors, but are also differentiated at various levels. The upstream kinase Mec1 is required to activate both signaling cascades together with the 9-1-1 PCNA-like complex and the Dpb11 (hTopBP1) protein. After DNA damage, Dpb11 is also needed to recruit the adaptor protein Rad9 (h53BP1). Here we analyzed the mechanisms leading to Mec1 activation in vivo after DNA damage and replication stress. We found that a ddc1Δdpb11-1 double mutant strain displays a synthetic defect in Rad53 and H2A phosphorylation and is extremely sensitive to hydroxyurea (HU), indicating that Dpb11 and the 9-1-1 complex independently promote Mec1 activation. A similar phenotype is observed when both the 9-1-1 complex and the Dpb4 non-essential subunit of DNA polymerase ε (Polε) are contemporarily absent, indicating that checkpoint activation in response to replication stress is achieved through two independent pathways, requiring the 9-1-1 complex and Polε.     

MicroRNA-9-1促进大鼠表皮干细胞分化为神经细胞

目的:探讨MicroRNA-9-1在体外诱导大鼠表皮干细胞向神经细胞分化过程中的作用。方法:构建大鼠MicroRNA-9-1慢病毒载体,并感染SD大鼠的表皮干细胞;实验分为感染组、未感染组和阴性对照组;采用β-巯基乙醇诱导感染后的SD大鼠表皮干细胞分化为神经细胞。倒置荧光显微镜下观察表皮干细胞感染后GFP荧光表达的情况;免疫细胞化学染色检测神经微管结合蛋白2(MAP-2)的表达水平;RT-PCR检测MAP-2mRNA的表达水平。结果:阳性克隆PCR检测证明大鼠MicroRNA-9-1慢病毒载体构建成功;感染后48 h,在倒置显微镜下观察到,感染组GFP荧光表达达到峰值,感染效率达到了(85.6±1.9)%;β-巯基乙醇诱导7 h时,感染组大部分表皮干细胞向神经细胞分化,且诱导效果显著好于未感染组和阴性对照组;MAP-2在蛋白((87.3±0.6)%)和mRNA水平(约2倍)的表达率显著高于其他各组(P0.05)。结论:MicroRNA-9-1慢病毒载体可以高效感染大鼠表皮干细胞,且可以促进表皮干细胞在β-巯基乙醇的诱导下向神经细胞分化。     

疮痂链霉菌拮抗菌HD9-1的筛选及功能评价

【背景】近年来,由土传致病链霉菌引起的疮痂病在我国马铃薯产区大面积暴发,严重影响块茎的商品价值,由于缺乏有效防控措施,其危害程度呈逐年加重趋势。然而拮抗菌可有效抑制病原菌的繁殖,其防控效果优异,对环境友好,逐渐引起了人们的关注。【目的】分离筛选对致病链霉菌具有拮抗功能的细菌,鉴定其分类学名,评价其主要生物学特性,为研发高效防病菌剂提供菌种资源。【方法】以疮痂链霉菌为靶向微生物,从马铃薯疮痂病高发土样中筛选拮抗菌株,通过形态学、生理生化和分子生物学试验确定其分类地位;用盆栽试验初步判定其对马铃薯疮痂病的防控效果,研究其广谱抗病性和耐盐碱特性,结合生产中常用化学农药的敏感性测定,综合评价其应用前景。【结果】筛选出一株对致病疮痂链霉菌(Streptomyces scabies)有显著拮抗效果的菌株HD9-1,抑菌圈直径约31mm,菌落呈圆形、淡黄色,边缘较为整齐,革兰氏染色阳性,菌体杆状,宽度约为0.75μm,长度为1.0-2.5μm。以蔗糖作为唯一碳源,能产生β-半乳糖苷酶、精氨酸双水解酶、赖氨酸脱羧酶和鸟氨酸脱羧酶;培养24 h后代谢产物中含有3.44 mg/L的吲哚乙酸;16S rRN...     

3-甾酮-9α-羟基化酶基因的表达及其催化合成9α-羟基雄甾-4-烯-3,17-二酮

研究应用于甾体9α-羟基化的高效催化剂和催化体系是实现甾体药物9α位羟基高效合成的关键。本文中,笔者对来源于分支杆菌(Mycobacterium tuberculosis) H37Rv和红平红球菌(Rhodococcus erythropolis) SQ1的3-甾酮-9α-羟基化酶基因(reksh A,mtksh A)进行优化,并对2个基因的催化活性进行检测。通过构建工程表达菌株,以雄甾-4-烯-3,17-二酮(AD)为底物,对制备9α-羟基雄甾-4-烯-3,17-二酮(9α-OH-AD)的催化反应进行了探索。结果表明:基因序列优化显著提升了Re Ksh A和MtKshA蛋白的可溶性表达,其中Re Ksh A具有较好的雄甾-4-烯-3,17-二酮9α位羟基化活性。用TB培养基培养Re Ksh A的工程表达菌株BL21(DE3)-p ET28a-reksh A-yh,在30℃、500μmol/L底物浓度、0. 8%(体积分数)乙醇为助溶剂、0. 1 mmol/L IPTG诱导浓度、底物与诱导剂同时加入到工程菌液中的条件下,9α-OH-AD得率达到97. 09%。     

基质金属蛋白酶- 9, 组织抑制因子- 1 在进展期 胃癌中的表达与意义

目的：研究基质金属蛋白酶-9（matrix metalloproteinase-9,MMP-9）及其组织抑制因子-1（tissue inhibitor of metallopmteinase—1,TMP-1）在进展期胃癌中的表达情况,探讨二者的表达与胃癌侵袭转移闻的关系及二者间的联系。方法：应用免疫组化方法检测70例进展期胃癌标本中MMP-9,TIMP-1的表达,并进行回顾性随访。结果：馒反肌层以上者MMP-9的阳性表达（66．67％）明显高于肿瘤局限于粘膜、粘膜下者（20％P〈0.01）。MMP-9阳性表达与胃癌的淋巴转移与肝转移有相关性（P〈0．01）。TIMP-1的表达随胃癌浸润深度增加而减少,当肿瘤突破浆膜时TIMP-1的表达呈现陡降趋势（P〈0．01）。结论：MMP-9的过阳性表达和TIMP-1的表达失衡可能与胃癌转移行为有关。TIMP-1可能抑制胃癌的浸润转移。     

血清CEA、CA19-9、CYFRA21-1与结直肠腺癌的相关性分析

目的:探究血清癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)、糖类抗原19-9、细胞角蛋白19片段(cytokeratin19 fragements,CYFRA21-1)与结直肠腺癌的病理相关性。方法:选择于我院接受治疗的80例结直肠腺癌患者为病例组,选择同期于我院接受治疗的50例良性结直肠病变患者为良性对照组,选择我院体格检查的50例健康个体为对照组,分别采集三组个体的血样并进行CEA、CA19-9以及CYFRA21-1水平的检测,并比对三组个体上述因子阳性表达率、因子水平,同时分析三种因子同结直肠腺癌患者TNM分期相关性,最后探究三种因子对结直肠腺癌的诊断价值。结果:(1)以CEA≥2.805μg/L、CA19-9≥39 U/m L、CYFR21-1≥3.3 ng/mL为临界值,结果显示病例组CEA阳性率51.25%,CA19-9阳性率31.25%,CYFR21-1阳性率40.00%,明显高于良性组的10.00%、20.00%和10.00%,高于对照组的8.00%、12.00%和2.00%(P<0.05);(2)比较显示病例组患者的CEA、CA19-9以及CYFR21-1水平明显高于良性对照组以及对照组(P<0.05),良性对照组CEA、CA19-9以及CYFR21-1水平明显高于对照组(P<0.05);(3)比较显示IV期结直肠腺癌患者CEA、CA19-9以及CYFRA21-1水平明显高于III期以及I+II期(P<0.05),III期三种因子水平明显高于I+II期(P<0.05);(4)CEA对结直肠腺癌诊断一致性71.25%,灵敏度65.00%,特异度90.00%;CA19-9诊断一致性46.25%,灵敏度35.00%,特异度80.00%;CYFRA21-1诊断一致性55.00%,灵敏度46.67%,特异度80.00%;联合诊断一致性95.00%,灵敏度95.00%,特异度95.00%。结论:血清CEA、CA19-9以及CYFRA21-1对结直肠腺癌具有较明确的诊断价值,不同病理分期患者中表达差异明显,可以考虑将联合诊断作为结直肠腺癌鉴别方式之一,推广于临床中。     

基质金属蛋白酶-9与动脉粥样硬化

基质金属蛋白酶-9（matrix metalloproteinase 9,MMP-9）是基质金属蛋白酶家族中的一种,通过降解胞外基质．在动脉粥样硬化的血管重构、斑块不稳定所导致的心血管病的发展过程中发挥着重要的作用。     

3-甾酮-9α-羟基化酶基因在分枝杆菌中的异源表达与9α-羟基雄烯二酮的制备

9α-羟基雄烯二酮(9-OH-AD)是制备甾体类药物的重要中间产物。3-甾酮-9α-羟基化酶(KSH)能够转化雄烯二酮(AD)产生9α-羟基雄烯二酮(9-OH-AD),该酶由Ksh A和Ksh B两个亚基构成。为获得高效积累9-OH-AD的重组菌株,本研究选择耻垢分枝杆菌Mycobacterium smegmatis mc2155和戈登氏菌Gordonia neofelifaecis NRRL B-59395,对其在胆固醇为唯一碳源条件下表达明显上调的ksh A和ksh B候选基因进行克隆,插入到分枝杆菌表达载体p NIT中,构建共表达质粒,并将它们导入分枝杆菌Mycobacterium sp.NRRL B-3805中,获得重组菌株。利用重组菌株分别对植物甾醇、胆固醇和谷甾醇进行生物转化,分离纯化转化产物,采用光谱学方法鉴定其化学结构,确定该转化产物为9α-羟基雄烯二酮,说明分枝杆菌Mycobacterium sp.NRRL B-3805由积累雄烯二酮变为积累9α-羟基雄烯二酮(9-OH-AD),进而证明导入的候选基因ksh A和ksh B确实为有功能的基因。生物转化实验表明,与胆固醇、谷甾醇相比,植物甾醇作为底物更易于转化;而用来源于耻垢分枝杆菌的ksh A、ksh B构建的重组菌转化率更高,可达90%,具有较高的应用价值。本研究通过对KSH编码基因的异源表达,成功地进行了分枝杆菌生物转化特性的改造,为探索各种甾体药物中间体的工业生产奠定了基础。     

Miscellaneous mistletoe notes, 1–9

Three new species,Cladocolea biflora Kuijt,Struthanthus condensatus Kuijt, andS. lojae Kuijt are described and six new combinations,Cladocolea diversifolia (Benth.) Kuijt,C. lenticellata (Diels) Kuijt,Dendrophthora virgata (Trel.) Kuijt,Korthalsella chilensis (Hook. & Arn.) Kuijt,Phthirusa retroflexa (Ruiz & Pavon) Kuijt, andStruthanthus flexilis (Rusby) Kuijt are proposed. Nomenclature of two more neotropical Loranthaceae,Psittacanthus ramiflorus (DC.) G. Don andStruthanthus interruptus (H.B.K.) Blume is revised.