马铃薯class I patatin基因家族的一个新亚型

马铃薯ｃｌａｓｓⅠ与ｃｌａｓｓⅡｐａｔａｔｉｎ基因是具有不同组织表达专一性的一个多基因家族。用马铃薯ｃｌａｓｓⅡｐａｔａｔｉｎ启动子为探针,从中国马铃薯栽培品种“东农３０３”基因文库中筛选到一个ｃｌａｓｓⅠｐａｔａｔｉｎ基因。测定其ＤＮＡ顺序１．８ｋｂ;它包括ｐａｔａｔｉｎ基因５＇侧翼区１４０７ｂｐ、结构基因３６３ｂｐ。根据５＇端非翻译区顺序,它属ｃｌａｓｓⅠｐａｔａｔｉｎ基因。该基因的５＇侧翼区     

Class I patatin基因5‘侧翼区驱动的GUS基因在马铃薯块茎中专一性表达

Binary vectors pPATIs (with partial signal sequence) and pPATI (without signal sequence) were constructed by fusing 1.4 kb 5' flanking regions of Class I patatin gene with GUS. Transient GUS expression was observed in in vitro tuber slices bombarded with pPATI. These constructs were then introduced into potato (cv. Desiree) via Agrobacterium tumefaciens transformation. Transgenic potato plants were confirmed by X-Gluc staining and PCR. Using in vitro tuberization system, GUS activities were assayed by fluorescence. It was shown that, in plants transformed with PATI-GUS, GUS specific activities were about 10-20 fold higher in tubers than in stems. Increased sucrose concentration could not induce PATI-GUS expression, but light enhanced PATI-GUS expression in cultured shoots.     

Class I patatin基因5＇侧翼区驱动的GUS基因在马铃薯块茎中专一性表达

将1.4kbClassIpatatin基因的5＇侧翼区与GUS基因融合,构建了双元表达载体pPATIs(含patatin部分信号顺序)和pPATI(不含patatin部分信号顺序).pPATI通过基因枪介导在块茎切片中获得了瞬间表达.以上建构物通过农杆菌介导转入了马铃薯品种Desiree.X-Gluc染色(PATIs不能染色)及PCR结果证实已获得转基因植株.利用离体块茎诱导系统,GUS的表达进一步用荧光进行定量检测,结果显示,PATI-GUS的转基因植株中GUS比活性均以块茎明显高于茎段,达10-20倍.蔗糖浓度的升高,PATI-GUS植株中的GUS比活性无明显变化,与前人报道有不同.此外,光照促进PATI-GUS的表达.     

Class I patatin基因5′侧翼区驱动的GUS基因在马铃薯块茎中专一性表达

将1.4kb Class I patatin基因的5′侧翼区与GUS基因融合,构建了双元表达载体pPATIs(含patatin部分信号顺序)和pPATI(不含patatin部分信号顺序)。pPATI通过基因枪介导在块茎切片中获得了瞬间表达。以上建构物通过农杆菌介导转入了马铃薯品种Desiree。X-Gluc染色(PATIs不能染色)及PCR结果证实已获得转基因植株。利用离体块茎诱导系统,GUS的表达进一步用荧光进行定量检测,结果显示,PATI-GUS的转基因植株中GUS比活性均以块茎明显高于茎段,达10-20倍。蔗糖浓度的升高,PATI-GUS植株中的GUS比活性无明显变化,与前人报道有不同。此外,光照促进PATI-GUS的表达。     

具有高外切葡聚糖纤维二糖水解酶Ⅰ活力的新型黄单胞工程菌的构建

由广宿主质粒pRK404和微紫青霉外切葡聚糖纤维二糖水解酶Ⅰ(CBHI)c DNA基因cbhⅠ构建了重组质粒pRK404-181,在携带有诱动质粒的菌株ED86 54(pRK2013)的存在下, 采用三亲滤膜结合的方法,将该质粒转移到野油菜黄单胞菌S-152中,并成功地得到表达。结合子S-152(pRK404-181)外切葡聚糖纤维二糖水解酶的pNPC活力比原始菌株S-152提高了2-4倍,滤纸酶活提高了1倍。 Abstract:Recombinant plasmid pRK404-181 was constructed with the wide-host-range plasmid pRK404 and the cellubiohydrolase I(cbh I)gene of Penicillium janthinellum.The plasmid was transferred into Xanthomonas campestris S-152 with the aid of helper plasmid pRK2013.As a result,the intracellular collubiohydrolase activity of S-152(pPK404-181)increased 2~4 time,and the filter paper degrading activity increased 1 time in comparison with the initial bacterial Xanthomonas campestris S-152.     

马铃薯Patatin class—I启动子及信号肽基因的克隆和序列分析

为利用ｐａｔａｔｉｎ ｃｌａｓｓ－Ｉ启动子的块茎表达专一性以达到马苓薯的目的,利用ＰＣＲ技术从马铃薯总ＤＮＡ中扩增出Ｐａｔａｉｔｎ ｃｌａｓｓ－Ｉ启动子及信号肽基因,并将其克隆;序列分析发现该基因片段与已发表ｃＤＮＡ相应片段约９４％同源。     

马铃薯GBSS基因5‘侧翼区调控作用的研究

将０．４、０．８、１．６、２．９ｋｂＧＢＳＳ基因的５＇侧翼区与ＧＵＳ基因融合,构建了双元表达载体。０．８ｋｂＧＢＳＳ－ＧＵＳ通过基因枪介导在块茎切片中获得了瞬间表达。以上建构物通过农杆菌介导转入了马铃薯。Ｘ－Ｇｌｕｃ染色及ＰＣＲ结果证实已获得转基因植株。利用离体块茎诱导系统,ＧＵＳ表达用荧光进行定量检测,结果显示,２．９、１．６、０．４ｋｂＧＢＳＳ－ＧＵＳ的表达均以块茎明显高于茎段,达２￣１０倍。     

马铃薯GBSS基因的克隆与DNA顺序分析

构建了中国马铃薯 (Solanum tuberosum)栽培品种“东农 30 3”基因文库 ,用 PCR扩增得到淀粉粒结合淀粉合成酶基因 (GBSS,granule- bound starch synthase)的部分顺序 (GB3) ,以此为探针从基因文库中筛选到 2 0个阳性克隆。测定其中 1个克隆 (GBSS1 7- 1 )的 DNA顺序共 542 8bp;它包括 GBSS基因 5′侧翼区 1 82 3 bp、结构基因 2 964 bp和 3′侧翼区 641 bp。该顺序与已报道的 GBSS顺序同源性很高 ,但 5′侧翼区最上游 730 bp尚未见文献报道 ;并存在较多的茎环结构。     

口蹄疫病毒VP1基因转化马铃薯及其块茎专一性表达

报道了FMDV VP1基因与马铃薯块茎专一性表达class Ipatatin基因5′区融合,经农杆菌介导导入马铃薯植株,PCR、RT-PCR证实了其整合及转录表达。ELISA结果进一步表明,VP1在转基因马铃薯块茎中具有免疫活性。为探讨在马铃薯块茎中高表达VP1蛋白及进一步开发其作为FMDV口服疫苗生物反应器奠定基础。     

马铃薯StXYLP基因家族的生物信息学分析

[目的]在马铃薯基因组水平上鉴定木质形成素类蛋白(Xylogen-like protein, XYLP)基因家族,分析其理化性质及基因的表达模式。[方法]用生信学方法鉴定马铃薯XYLPs,分析其理化性质、亚细胞定位、进化关系、蛋白质结构、基因结构和染色体定位。利用芯片数据分析马铃薯StXYLPs的时空表达模式及对非生物胁迫的响应。[结果]马铃薯中共有20个StXYLPs;蛋白全长在139～221氨基酸之间,理论等电点在4.36～9.42之间,均锚定在质膜上;蛋白质结构基本相似,均具有保守的nsLTP结构域;StXYLPs在染色体上的定位具有偏好性;StXYLPs具有明显差异的组织表达模式,响应不同的非生物胁迫。[结论]StXYLPs与生长素、细胞分裂素和赤霉素共同调控马铃薯器官发育,19个StXYLPs表达受调控。12个StXYLPs受ABA诱导表达上调,在盐、高温及干旱胁迫下,14个StXYLPs受诱导表达上调,参与对抗非生物胁迫。     

一个由HSVⅠ诱导的类SR蛋白新基因的克隆

 根据mRNA差异显示分析 ,由单纯疱疹病毒 (HSV)Ⅰ型结合人成纤维细胞膜受体后 2h诱导产生的早期基因cDNA库中 ,分离到一个编码具有SR蛋白结构特征的新基因 ,该基因长 90 4bp .编码产生的蛋白含 12 1个氨基酸残基 ,分子量 14 9kD ,具有RS重复区和PPLP结构域 ,但不具备SR蛋白家族所特有的RNA识别区域 (RRM) .主要分布于细胞质内 ,仅在细胞膜相应受体与HSVⅠ结合后特异产生     

马铃薯Patatinclass－Ⅰ启动子及信号肽基因的克隆和序列分析

为利用Ｐａｔａｔｉｎｃｌａｓｓ－Ⅰ启动子的块茎表达专一性以达到改良马铃薯的目的,利用ＰＣＲ技术从马铃薯总ＤＮＡ中扩增出Ｐａｔａｔｉｎｃｌａｓｓ－Ⅰ启动子及信号肽基因,并将其克隆：序列分析发现该基因片段与已发表的ＣＮＤＡ相应片段约９４％同源。     

一个Ⅰ型遗传性淋巴水肿中国家系的VEGFR3基因的新突变方式

通过对国人Ⅰ型遗传性淋巴水肿一家系分子遗传学检测,报告VEGFR-3基因新突变.首先在Ⅰ型遗传性淋巴水肿对该家系进行致病基因的连锁分析,然后用DNA直接测序方法进行基因突变分析.连锁分析和单倍体分析确定该家系致病基因位于5q35.3,与Ⅰ型遗传性淋巴水肿连锁.VEGFR-3基因突变分析发现了一个新的错义突变D1055V.该错义突变在家系中共分离,且在100个正常对照组中未发现该序列改变.本研究首次报告了国内Ⅰ型遗传性淋巴水肿VEGFR-3基因新的错义突变D1055V,丰富了VEGFR-3基因基因突变谱,为今后开展遗传性淋巴水肿的基因诊断和遗传咨询奠定基础.     

微量全血快速检测乙肝病毒基因亚型

选用特殊血液标本裂解液,可有效除去血液中对Taq酶有抑制作用的物质血叶啉,微量指尖全血标本即可满足检测需要,可取代血清检测HBV基因亚型．     

系统发生分析发现牛病毒性腹泻病病毒新基因亚型

本研究对我国首次分离获得的牛源牛病毒性腹泻病毒(BVDV)毒株Changchun 184(CC-184)和猪源牛病毒 性腹泻病毒ZM-95进行了遗传衍化关系研究。选择主要抗原E2基因为研究对象,首先应用RT-PCR及套式PCR 克隆得到CC-184和ZM-95的E2片段,通过序列测定发现CC-184和ZM-95 E2基因长度分别为1,122bp和1, 125bp,各自编码374和375个氨基酸残基。核酸序列同源性比较和系统发生分析表明2株病毒均属于BVDV-1, CC-184与Osloss亲缘关系最近,都属于已有的b基因亚型,其E2基因同源性达91．8％。而ZM-95的E2基因有 一个特征性的变异区,包含一个密码子序列插入,这一变异区编码了一段有别于其他瘟病毒的五肽氨基酸序列 HYKKK。结果还表明ZM-95与BVDV-1现有的5个基因亚型的亲缘关系均较远,E2基因同源性最高(与Oregon c24v)只有72．4％。而BVDV-1亚型内毒株间的同源性大于85％,亚型间的同源性在69％～75％之间,充分说明 ZM-95是BVDV-1中一个新发现的基因亚型。通常认为猪源BVDV来源于牛,应该与牛源BVDV有十分近的遗 传关系,但是本研究发现ZM-95与其他已知牛源BVDV较低的基因同源性说明猪源BVDV还具有独立的遗传衍 化与传播来源的可能性。     

系统发生分析发现牛病毒性腹泻病病毒新基因亚型

本研究对我国首次分离获得的牛源牛病毒性腹泻病毒(BVDV)毒株Changchun 184(CC-184)和猪源牛病毒性腹泻病毒ZM-95进行了遗传衍化关系研究.选择主要抗原E2基因为研究对象,首先应用RT-PCR及套式PCR克隆得到CC-184和ZM-95的E2片段,通过序列测定发现CC-184和ZM-95 E2基因长度分别为1,122bp和1,125bp,各自编码374和375个氨基酸残基.核酸序列同源性比较和系统发生分析表明2株病毒均属于BVDV-1,CC-184与Osloss亲缘关系最近,都属于已有的b基因亚型,其E2基因同源性达91.8%.而ZM-95的E2基因有一个特征性的变异区,包含一个密码子序列插入,这一变异区编码了一段有别于其他瘟病毒的五肽氨基酸序列HYKKK.结果还表明ZM-95与BVDV-1现有的5个基因亚型的亲缘关系均较远,E2基因同源性最高(与Oregonc24v)只有72.4%.而BVDV 1亚型内毒株间的同源性大于85%,亚型间的同源性在69%～75%之间,充分说明ZM-95是BVDV-1中一个新发现的基因亚型.通常认为猪源BVDV来源于牛,应该与牛源BVDV有十分近的遗传关系,但是本研究发现ZM-95与其他已知牛源BVDV较低的基因同源性说明猪源BVDV还具有独立的遗传衍化与传播来源的可能性.     

HBV新亚型中C基因片段的B/C型结构分析

乙型肝炎是严重威胁人类健康的疾病之一。分析乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)的进化过程,可以获得HBV序列间的亲疏进化关系,进而为乙型肝炎的预测、治疗等方面研究提供依据。为了研究乙肝病毒样本的基因亚型,本文使用序列分析方法对采集到的临床HBV序列和公共核酸数据库的HBV数据集进行系统进化树构建和序列结构分析。结果显示,样本中有一条克隆序列的C基因区域是一种新的HBV B/C混合亚型。并且,实验结果还验证了云南省西双版纳州HBV新亚型HBV/B6的存在。本文的实验结论对云南省少数民族聚居地区乙型肝炎病毒的系统进化研究具有一定的价值。     

用马铃薯人工饲养马铃薯块茎蛾的方法

介绍一种马铃薯块茎蛾Phthorimaeaoperculella的室内人工饲养方法。在人工养虫室内用 1 0 %的蜂蜜水喂养成虫 ,用滤纸收集卵块 ,幼虫在薯块上饲养 ,化蛹于牛皮纸卷成的纸筒中 ,饲养结果发现马铃薯块茎蛾完成 1代大约需要 35～ 4 6d ,室内连续饲养块茎蛾 3代 ,卵的孵化率、幼虫化蛹率、成虫羽化率均在 90 %以上。