The effect of inorganic phosphate on cyanogenesis by Pseudomonas aeruginosa

The biosynthesis of hydrogen cyanide (HCN) by a strain of Pseudomonas aeruginosa is found to be significantly influenced by inorganic phosphate. Optimum HCN production occurs when the phosphate concentration is between 1 and 10 mM. Above and below this concentration the amount of HCN produced decreases sharply and at 0.1 and 100 mM phosphate low HCN production occurs. If a culture growing at 0.1 mM phosphate and producing low HCN is shifted to 10 mM phosphate, HCN biosynthesis resumes. Experiments with chloramphenicol indicate that de novo-protein synthesis is required for the process.     

2型糖尿病家系患者LEPR基因Gln223Arg多态性的研究

目的：研究黑龙江地区汉族人2型糖尿病家系的LEPR基因Gln223Arg多态性,探讨其与2型糖尿病发病的关系。方法：应用聚合酶链式反应-限制性内切酶长度多态性（PCR-RFLP）技术,对来自于黑龙江地区120个2型糖尿病家系中的210例2型糖尿病患者及319例正常对照的LEPR基因Gln223Arg（668 A→G）位点进行基因分型。结果：LEPR基因Gln223Arg三种基因型在病例组和对照组间整体分布有统计学意义（P=0.034,df=2）;除AG基因型（x2=4.550,P〈0.01）外,其余各基因型及等位基因在病例组和对照组间分布未见显著性差异（P〉0.05）。结论：LEPR基因Gln223Arg多态性与黑龙江地区汉族人2型糖尿病有关,LEPR基因可能为中国人2型糖尿病发病的相关易感基因。     

西藏小型猪H-FABP基因的PCR-RFLP研究

目的研究西藏小型猪心脏脂肪酸结合蛋白（H-FABP）基因5’-上游区和第二内含子内的遗传变异。方法应用PCR-RFLP技术测定30头西藏小型猪H-FABP的基因型。结果（1）在5’-上游区的Hinf I-RFLP位点上,西藏小型猪表现出多态性,等位基因h的频率为0．80;（2）在在第二内含子内的Hae Ⅲ-RFLP位点上,西藏小型猪均为DD纯合子;（3）在第二内含子内的Hinf I＊-RFLP位点上,除一头猪表现为bb基因型外,其余猪都表现为BB基因型,等位基因B的频率为0．97;（4）除Hae Ⅲ-RFLP位点外,在其余位点上西藏小型猪均处于Hardy-weinberg不平衡状态。（5）在Hinf I-RFLP中,西藏小型猪表现为中度多态性（0．25〈PIC〈0．5）,而在其他位点的RFLP中表现为低度多态（PIC〈0．25）。结论可以利用西藏小型猪H-FABP基因5’-上游区的多态遗传标记来分析其与肌内脂肪的关系。     

假单胞菌海因酶基因在大肠杆菌中的高效表达(英文)

为实现利用生物酶转化法进行D 对羟基苯甘氨酸的工业化生产 ,构建了 3株海因酶基因工程菌 .利用PCR技术从恶臭假单胞菌 (Pseudomonasputida)CPU 980 1染色体DNA中扩增得到长约1.8kb的含编码区和自身启动子的海因酶全基因 .通过将海因酶全基因插入pMD18 T质粒、海因酶基因的编码区与pET 17 b质粒重组、海因酶基因编码区和T7强启动子一起插入pMD18 T质粒分别得到重组质粒pMD dht、pET dht和pMD T7 dht.将上述重组质粒分别转化大肠杆菌 (Escherichiacoli) ,通过地高辛标记菌落原位杂交和海因酶活力测定两种方法 ,筛选出具有海因酶活力的阳性转化子 .结果表明 ,大肠杆菌的RNA聚合酶能够识别和结合来自恶臭假单胞菌海因酶基因的自身启动子 ,该启动子在大肠杆菌中能够工作 .基因工程菌E .coliBL2 1 pMD dht、E .coliBL2 1 pET dht和E .coliBL2 1 pMD T7 dht的海因酶活力分别为 170 0U L、190 0U L和 2 5 0 0U L ,比野生菌P .putidaCPU 980 1的海因酶活力分别提高了 8倍、9倍和 12倍 .薄层扫描结果显示 ,这些工程菌的海因酶表达量分别约占菌体总可溶性蛋白质的 2 0 %、31%和 5 7%.SDS PAGE显示 ,海因酶的单体分子量约为 5 0kD .经工程菌E .coliBL2 1 pMD T7 dht催化 ,底物对羟基苯海因的转化率在 13h内可达到 9     

中国人诱导型一氧化氮合酶基因STR多态性研究

一氧化氮（nitric oxide,NO）作为一种可在细胞间自由扩散的信使分子在神经递质传递和血管舒张调节等生理与病理过程中起着重要作用。NO通过一氧化氮合酶（nitric oxide synthase,NOS）催化L-精氨酸的氧化反应而生成。目前在哺乳动物中已发现细胞来源、表达方式和活性调节不同的3种NOS同工酶,分别为神经原型NOS(meuronal NOS,nNOS）、诱导型NOS(inducible NOS,iNOS）和内皮细胞型NOS（endothelial NOS,eNOS）。3种NOS由位于不同染色体上的基因所编码。人iNOS基因位于第17号染色体长臂(17q11.2～17q12）,全长约37kb,含有26个外显子,iNOS可在多种类型的细胞中通过IL-1、IFN-a、INF-γ等细胞因子和其他介质的刺激作用而诱导表达。iNOS基因5‘-端调控区内存在一个CCTTT串联重复的多态性位点,这一多态性基因座已居北爱尔兰的糖尿病患者中证实与微血管病变有关。另有实验表明,CCTTT串联重复序列的变化对iNOS基因的转录将产生不同影响。目前在东方种族中有关iNOS基因CCTTT串联重复多态性尚未见报道。将303名中国汉族人基因组DNA用于iNOS基因CCTTT串联重复多态性分析,鉴定出了12种等位基因和49种基因型,其中重复17次、18次和19次的等位基因是在人类中首次发现的新等位基因。统计学检验和比较表明,中国汉族人iNOS基因CCTTT串联重复序列的6个等位基因频率与来自英格兰的高加索人差异显著,说明这一多态性位点的等位基因频率分布存在种族差异。在中国正常人群中获得的有关iNOS基因STR多态性的统计资料,对于进一步研究这一多态性基因座与心脑血管疾病的相关性将有重要应用价值。     

已建株鼻咽癌细胞的PLUNC基因启动子区序列多态性分析

目的检测人类标准鼻咽癌细胞中是否存在已知的PLUNC基因启动子-437bp-＋87bp区域的单核苷酸多态性（SNP）。以便进一步探索SNP与鼻咽癌的关系。方法采用PCR产物直接测序的方法,对7株体外培养的鼻咽癌细胞基因组DNA的PLUNC基因启动子区进行序列分析。结果发现7株PLUNC基因的启动子区皆存在已知的3个SNP位点（1888、2128和N2）和未知一个突变位点（N1）,其测观杂合度分别为85．7％、100％、100％和28．6％。其中3个已知SNP位点在筛查的细胞株中均存在T-C的突变,而且SUNE-1鼻咽癌细胞株的1888位点基因型为突变纯合子CC型。结论体外培养的标准鼻咽癌细胞株中存在已知的3个SNP位点（1888、2128和N2）的突变现象,且突变率为100％;1888位点鼻咽癌易患型（CC型）已在体外稳定建株;首次发现启动子-195bp区域N1突变位点。     

Arg753Gln Polymorphism of the Human Toll-like Receptor-2 Gene in Children with Recurrent Febrile Infections

Polymorphisms in toll-like receptors (TLRs) have been reported to increase susceptibility for some diseases. TLR-2 gene polymorphisms in Turkish children with recurrent respiratory tract infections and without well-known humoral immunodeficiencies were examined. The study consisted of 52 children with recurrent infections (study group) and 91 healthy children with a maximum of two infections in a year (control group). Recurrent infection was defined as the presence of at least six febrile bacterial infection episodes in a year. Not only TLR-2 gene polymorphisms but also immunoglobulins (IgG, IgM, IgA), IgG subsets (G1, G2, G3), and specific antibody levels (anti-tetanus and anti-hemophilus influenza) were determined to exclude humoral immunodeficiencies. The Arg753Gln and Arg677Trp polymorphisms were genotyped by polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism. The Arg753Arg genotype was significantly decreased in the study group compared to the control (P < 0.05). Children with recurrent infections were also found to be more frequently Arg753Gln heterozygous (P < 0.05), and their Gln allele distribution was higher than that of the control subjects (23% vs. 4.9%; P < 0.001). In contrast to these results, we did not detect any case with Arg677Trp polymorphism in both groups. These results have indicated that there is a strong significant relationship between susceptibility to recurrent bacterial infections and Arg753Gln polymorphism of the TLR-2 gene.     

TNFR2基因的CA重复多态性在两个独立的白人群体中与肥胖表型的连锁和关联

我们先前通过全基因组扫描发现lp36与体重指数显提示性连锁（LOD=2．09）。肿瘤坏死因子受体2（1NFR2）定位于lp36,是肥胖的一个极好的图位和功能侯选基因。本研究采用数量传递连锁不平衡检验在两个大的独立的白人样本中进行了TNFR2基因与肥胖表型的连锁与关联检验。第一组受试者由来自79个多代家系的1836个个体组成;第二组受试者由来自157个核心家庭的636个个体组成。所检测的肥胖表型包括体重指数、脂肪量和脂肪量百分数。在多代家系中我们发现TNFR2基因变异与BMI显著连锁（P=0．0056）。结果表明,TNFR2基因是影响白人BMI变异的一个数量性状位点。     

山茶属CHS基因家族的组成和分子进化初探

用PCR方法从4种山茶属(Camellia)(山茶科)(Theaceae)植物的总DNA中分别扩增到CHS基因外显子2的部分序列,经克隆、测序得到16个该基因的序列,这些序列与来自GenBank的该属另一种植物的3个序列及作为外类群的大豆(Glycine max (L.) Merr.)的2个序列一起进行分析.研究表明,山茶属CHS基因家族在进化过程中已分化为A、B、C三个亚家族,包括A1、A2、A3、B1、B2、C 等6类不同的基因成员;其中只有A2类成员为全部被研究的5种植物所共有,而其他5类成员只在部分被研究的植物中发现;所有这些CHS成员具有很高的同源性:在核苷酸水平上同一亚家族内基本上高于90%,不同亚家族间也在78%以上.从推测的氨基酸组成看,山茶属内CHS基因的功能已发生了分化,各类成员的碱基替代率有较大差异; 从分子系统发育树和可能的氨基酸组成分析,山茶属具有新功能的基因成员是在经过基因重复后,或是由少数几个位点的突变而成,或是由逐渐积累的突变而形成的.进一步分析认为,该属CHS基因的分化直到近期还在活跃地进行,并且不同种的进化式样有一定的差别,这种不同的进化式样可能是物种形成后受不同环境因素影响而形成的.     

山茶属CHS基因家族的组成和分子进化初探

用PCR方法从4种山茶属(Camellia)(山茶科)(Tlaeaceae)植物的总DNA中分别扩增到CHS基因外显子2的部分序列,经克隆、测序得到16个该基因的序列,这些序列与来自GenBank的该属另一种植物的3个序列及作为外类群的大豆(Glycine max (L)Merr)的2个序列一起进行分析。研究表明,山茶属CHS基因家族在进化过程中已分化为A、B、c三个亚家族,包括A1、A2、A3、B1、B2、C等6类不同的基因成员;其中只有A2类成员为全部被研究的5种植物所共有,而其他5类成员只在部分被研究的植物中发现;所有这些CHS成员具有很高的同源性：在核苷酸水平上同一亚家族内基本上高于90％,不同亚家族间也在78％以上。从推测的氨基酸组成看,山茶属内CHS基因的功能已发生了分化,各类成员的碱基替代率有较大差异;从分子系统发育树和可能的氨基酸组成分析,山茶属具有新功能的基因成员是在经过基因重复后,或是由少数几个位点的突变而成,或是由逐渐积累的突变而形成的。进一步分析认为,该属CHS基因的分化直到近期还在活跃地进行,并且不同种的进化式样有一定的差别,这种不同的进化式样可能是物种形成后受不同环境因素影响而形成的。     

eNOS基因第四内含子a／b多态与湖北汉族人原发性高血压而不是2型糖尿病相关联

目的：探讨内皮型一氧化氮合酶基因（eNOS）与湖北汉族人原发性高血压（EH）和2型糖尿病（T2DM）的关系。方法：采用病例-对照设计,分析了657例样本eNOS第四内含子重复序列多态性a／b,测量了身高、体重、腰围、臀围、收缩压、舒张压、空腹血糖,餐后2小时血糖等临床指标。结果：EH病例组eNOSab＋aa基因型和a等位基因频率显著高于EH对照组（基因型：25．3％vs18．9％,P=0．049;等位基因：13．3％vs9．8％,P=0．045）;而T2DM病例组与T2DM对照组的eNOSab＋aa基因型频率没有显著差异（20．2％vs24．1％,P=0．247）。单因素Logistic回归分析显示eNOSab＋aa基因型是EH的危险因子（OR=1．623,95％CI 1．053—2．506,P=0．029）。多因素回归分析显示,EH的独立风险因素是年龄、体重指数和eNOS基因a／b多态性,而体重指数和腰臀比是T2DM的独立风险因素。结论：eNOS基因a／b多态性是湖北汉族人群EH的一个易感标记,而与T2DM没有相关性。     

中国特有种四合木种群遗传多样性的RAPD分析

采用随机扩增多态性 DNA(RAPD)技术检测了西鄂尔多斯高原特有种四合木种群 5个斑块的遗传多样性。2 2个扩增引物产生 1 1 6条带 ,Shannon信息指数和 Nei指数对 RAPD数据的分析表明 :四合木种群存在较高的遗传多样性 ,其中千里山斑块的遗传多样性和多态位点比例较高 ,石嘴山斑块的最低。遗传多样性的 86.5 %存在于斑块内 ,斑块间的遗传变异为 1 3 .5 %。遗传距离与地理距离无直接相关关系。这些结果说明 ,遗传多样性反映了四合木种群基因组 DNA存在较高的变异性 ;同时各斑块间存在一定的基因流 ,四合木各斑块可看成是处于同一种群的半隔离状态 (meta-种群 ) ,对四合木应注意保护遗传多样性丰富的 meta-种群。     

牛FSHR基因第10外显子单核苷酸多态性及其与双胎性状的关系

以秦川牛和荷斯坦奶牛的双胎母牛和单胎母牛为实验材料 ,以牛的FSHR基因的第 10个外显子作为标记牛双胎性状的候选基因 ,用SNP法进行了多态检测 .结果发现 ,在秦川牛的双胎母牛中突变率 6 0 % (6 10 ) ,而在单胎母牛中突变率为 2 0 % (2 10 ) ;在荷斯坦奶牛中 ,双胎母牛突变率为31 2 5 % (5 16 ) ,单胎母牛突变率为 6 6 7% (1 15 ) ;由此可见双胎牛和单胎牛二者之间FSHR基因的第 10个外显子的突变率差异明显 .这表明 ,选择FSHR基因的第 10个外显子有可能作为双胎性状的候选基因 .序列分析发现 ,在FSHR基因的第 15 0 6位碱基发生了突变 (T→C) ,但氨基酸没有发生变化 .     

海岛棉NBS类型抗病基因类似物的起源、多样性及进化

利用已克隆植物的R基因NBS序列中保守模体合成简并引物,以海岛棉品系Pima 90(Gossypium barba—dense)基因组DNA为模板进行PCR扩增,通过T／A克隆、测序和序列比较分析共得到31条RGAs,其中19条具有连续的ORF。利用海岛棉的31条RGAs与GenBank中陆地棉种质系M—249(Gossypium hirsutum)的RGAs进行了比较分析,RGAs可分为两大类：其中第Ⅰ类全部为陆地棉的RGAs;第Ⅱ类分别包括了陆地棉和海岛棉的RGAs。同时对海岛棉RGAs的核苷酸和氨基酸序列进行系统发育树分析,表明海岛棉RGAs可分为TIR(Drosophila Toll or human inter—leukin receptor—1ike)和non—FIR两类,与前人所报道的R基因进化一致。对19条具有连续ORF的RGAs进行了结构分析,结果表明它们包括P—loop、Kin—2、“PLAL”及Meyers等所定义的RNBS—A、B、C3个模体。结果表明,可能海岛棉NBS类型抗病基因类似物和其他物种具有同样的起源和进化机制。     

Linkage and Association Between CA Repeat Polymorphism of the TNFR2 Gene and Obesity Phenotypes in Two Independent Caucasian Populations

Previously, our group has reported a suggestive linkage evidence of 1p36 with body mass index (BMI) (LOD = 2.09). The tumor necrosis factor receptor 2 (TNFR2) at 1p36 is an excellent positional and functional candidate gene for obesity. In this study, we have investigated the linkage and association between the TNFR2 gene and obesity phenotypes in two large independent samples, using the quantitative transmission disequilibrium tests (QTDT). The first group was made up of 1 836 individuals from 79 multi-generation pedigrees. The second group was a randomly ascertained set of 636 individuals from 157 US Caucasian nuclear families. Obesity phenotypes tested include BMI, fat mass, and percentage fat mass (PFM). A significant result (P = 0.0056) was observed for linkage with BMI in the sample of the multigenerational pedigrees. Our data support the TNFR2 gene as a quantitative trait locus (QTL) underlying BMI variation in the Caucasian populations.     

A single residue mutation of 5-enoylpyruvylshikimate-3-phosphate synthase in Pseudomonas stutzeri enhances resistance to the herbicide glyphosate

A novel class II 5-enoylpyruvylshikimate-3-phosphate synthase (EPSPS) was identified from Pseudomonas stutzeri A1501 by complementation of an Escherichia coli auxotrophic aroA mutant. The single amino acid substitution of serine (Ser) for asparagine (Asn)-130 of the A1501 EPSPS enhanced resistance to 200 mM glyphosate. The mutated EPSPS had a 2.5-fold increase for IC(50) [glyphosate] value, a 2-fold increase for K (i) [glyphosate] value, but a K (m) [PEP] value similar to that of wild type. The effect of the single residue mutation on glyphosate resistance was also analyzed using a computer-based three-dimensional model.     

中国美利奴羊H-FABP基因多态性及其与部分肉质性状的相关性

利用聚合酶链式反应-单链构象多态（PCR-SSCP）技术检测中国美利奴羊（Ovis aries var. Merino）心型脂肪酸结合蛋白基因（H-FABP）外显子2的单核苷酸多态性（SNPs）和遗传多态性,分析其与肌内脂肪（IMF）含量、肌纤维直径和肌纤维密度的相互关系,为该品种绵羊的分子标记辅助选择提供理论依据。结果显示,H-FABP基因外显子2有AA、AB和BB 3种基因型,AA型和BB型在778位均发生了C缺失,939位均发生了A→G转换,BB型还在789位发生了T→C转换,该突变导致所编码氨基酸发生了缬氨酸→丙氨酸的替换;BB型为IMF的优势基因型,与AB型相比差异显著（P<0.05）,与AA型相比差异极显著（P<0.01）;BB型对肌纤维直径存在负相关。结果提示,中国美利奴羊H-FABP基因外显子2具有多态性,该基因可能是中国美利奴羊肉质性状的主效基因,或者与控制肉质性状的主效基因相连锁。     

不同性别类型黄瓜ACC合酶基因的单核苷酸多态性标记和酶切扩增长度多态性标记

黄瓜的性别分化与乙烯密切相关,1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC)合酶是乙烯生物合成过程中的关键酶.根据ACC合酶基因家族的保守序列设计PCR引物,从8个不同性别类型(雌雄同株、强雌性和全雌性)黄瓜品种中克隆了长度为1188bp的ACC合酶基因(CS-ACS2)片段(GenBank登记号为:DQ115884～DQ115886和DQ115875～DQ115879).经测序分析,3个雌雄同株性别类型品种的序列完全相同.与之相比,5个强雌性和全雌性品种中存在8个单核苷酸多态性(SNPs)标记,SNPs标记为4个A←→G和4个T←→C之间的转换.在8个SNPs中,有1个SNP位于内含子区域,其余7个SNPs都位于外显子区域.在7个位于外显子区域的SNPs中,有3个为非编码区的SNPs,4个为cSNPs.而在4个cSNPs中,有3个导致了编码的氨基酸序列改变.研究结果表明,与雌雄同株性别类型相比,雌性系中均存在单核苷酸的变异,这提示ACC合酶基因CS-ACS2的单核苷酸变异可能与黄瓜雌性系的发生形成有关.另一方面,根据SNP多态性还发展了一个酶切扩增长度多态性(CAPS)标记C-MT700.利用CAPS标记C-MT700能将强雌性优良品种MT-705与其他黄瓜品种相区别,该标记在黄瓜育种生产上具有一定的应用价值.此外,研究获得的SNPs标记和CAPS标记丰富了黄瓜的分子标记种类.