中国葡萄座腔菌属分类研究概况

葡萄座腔菌属Botryosphaeria及其无性型包括许多植物病原菌以及有经济价值的类群,是腔子囊菌的重要类群.简要回顾了我国该属真菌的分类研究历史,概述了近年来取得的相关研究进展,提供了中国已知种类检索表,展示建立在分类学基础上的分子系统学研究结果,即葡萄座腔菌属Botryosphaeria是多谱系的类群,可分为多个分支,各分支代表其不同的无性型类群.对开展该类真菌的物种多样性和分子系统学研究进行了展望.     

桑黄孔菌属的研究进展

历来"桑黄"的种类混淆不清,直至近年来才被确定为桑树桑黄,与其亲缘性相近的物种也一同被划分入广义纤孔菌属的新分支—桑黄孔菌属。本文整理曾被当作"桑黄"的物种,阐述其正名和桑黄孔菌属确立的过程,对目前该属内物种的生物活性和栽培研究进展进行综述,旨在为桑黄孔菌属真菌资源的研究开发提供参考。     

我国丛赤壳类真菌分类研究

丛赤壳类真菌是具有经济重要性的生物类群。该文回顾了我国该类分类研究的简史,概述近年来取得的相关研究进展,揭示我国该类真菌的物种丰富程度,展示建立在分类学基础上的真菌DNA条形码探索以及分子系统学研究成果,表明资源和分类研究与真菌天然产物研究联手的新发现。     

葡萄座腔菌科真菌的系统学和多样性探讨

葡萄座腔菌科的真菌是子囊菌中重要的代表性类群,是农林生态系统中重要的组成部分。该类真菌物种资源丰富、全型特征多样,包括许多具有重要经济价值和生态功能的类群,隶属子囊菌门(Ascomycota)果囊菌亚门(Pezizomycotina)座囊菌纲(Dothideomycetes)葡萄座腔菌目(Botryosphaeriales)。本文在概述葡萄座腔科真菌生态功能的基础上,回顾了一百年来该类真菌目、科、属和种各级分类单元的建立及其系统分类研究历史,重点评述以von ArxMüller和Barr提出的两大分类系统,总结了基于全型形态特征和多基因序列分析的现代分子系统学研究现状。虽然该类群的分类系统日趋完善,但中国的相关研究存在资源挖掘不够深入、研究的系统性不足等问题。主要针对资源挖掘必要性、分类依据科学性、物种特征全息化等几个方面存在的问题进行了分析和讨论,并对未来研究方向进行展望,以期为该类真菌的深入研究与开发利用提供科学依据。     

丝膜菌属分类系统和物种多样性研究进展

丝膜菌属是具有重要生态和经济价值的外生菌根真菌,其物种多样性丰富、形态复杂,因此物种的界定和分类研究较为困难。近年来,丝膜菌属的分类系统发生了重大的变化,且每年都有大量的新物种被描述。因此,准确理解该属的分类系统和物种多样性,对该类群分类研究的深入开展具有重要的指导意义。在大量文献调查的基础上,对丝膜菌属的分类系统及物种多样性研究现状进行了综述,探讨并展望了该类群今后的分类研究方向及需要重点解决的问题。     

国家自然科学基金委员会生命科学部2003年度资助自由申请科学基金项目一览表

项目 名称l 微生物学学科(72项)甲烷古菌资源和分子系统学研究通过分子分类修正和澄清链霉菌属分类系统中国西南地区粘菌的分类和区系研究中国乳菇属的分类研究中国毛霉科犁头霉属等七属的系统分类研究北京东灵山主要阔叶树内生真菌研究中国梅衣类地衣分类研究中国蜜环菌属的系统学研究中国鳞伞属(j)holiota)真菌的系统分类研究斑痣盘菌科及相关类群分子系统学研究海南主要自然保护区烟煤菌物种多样性研究提高结晶纤维索酶解转化率的研究火菇索抗肿瘤靶位点的确定及其分子改造的研究肌醇和磷脂酰肌醇在不同酵母种的不同胞外酶分泌调控中的 …     

中国暗金钱菌属分类研究概况

文中对中国暗金钱菌属(Phaeocollybia)分类研究现状进行了综述。在国内已报道的暗金钱菌属12个名称记录中,头饰暗金钱菌(P.cidaris)的报道缺乏标本引证,污黑暗金钱菌(P.lugubris)的报道未提供形态描述,国内外文献对于长根暗金钱菌(P.christinae)和哥伦比亚暗金钱菌(P.columbiana)的形态描述也存在差异。我国报道的暗金钱菌属种类仅发现于长江以南的6个省区,其物种多样性仍有待澄清。     

地花菌属的研究概况和进展*

地花菌属(AlbatrellusGray)是多孔菌类中具有突出特征和特殊地位的一个属,有极高的系统学和分类学研究价值,但专门的针对性研究很少。综述了地花菌属在分类学、系统学、生态习性、经济价值、保护生物学等方面的研究概况和进展,并对该属的深入研究提出了针对性的建议。     

关于中国角蟾属物种属称订正的建议(无尾目,角蟾科)

简要介绍了角蟾属和异角蟾属的研究历史;通过比较两属的形态学特征,并结合骨骼细胞核型资料和分子系统学的研究结果,证实异角蟾属为有效属;建议将我国的原角蟾属物种归入异角蟾属.     

干旱胁迫下丛枝菌根真菌对疏叶骆驼刺和多枝柽柳生长及生理的影响

水柏枝属是一类具有重要生态、经济意义的资源植物,该文対国内外关于水柏枝属分类学、系统学、内生菌、繁育和保护以及药用成分等方面的研究进展进行综述。并针对该属存在的有关物种界定与谱系地理、植物内生菌与适应性机理、药用成分与药理研究等关键科学问题,提出可能采用的研究方法,为高效利用野生资源植物提供基本思路。     

中国纳入一级保护的极小种群野生植物濒危机制

为科学有效地保护极小种群野生植物, 明确其濒危机制具有重要意义。本文通过分析中国28种极小种群一级保护野生植物的种群特征及其濒危的内在原因和受威胁因素等, 总结了极小种群野生植物的濒危机制。极小种群野生植物的种群特征表现为遗传多样性低(13种)、衰退型种群结构(11种)、聚集型分布(11种)且分布区域狭窄(20种)。极小种群野生植物濒危的内在原因主要是繁殖力低(21种)和竞争能力弱(16种)。受威胁因素主要包括过度采挖等人类活动导致的种群数量减少(15种)和生境破坏(25种)以及气候变化等。因此, 除了保护极小种群野生植物免遭人类活动破坏, 保护策略应加强关注种群规模的维持和遗传多样性的保护。     

针叶树病原菌异担子菌属的物种多样性及相关检疫建议

异担子菌属Heterobasidion种类是北半球针叶树最严重的森林病原菌,在世界范围内能侵染27种针叶树,对欧洲和北美洲的经营林己造成重大损失.基于传统形态学研究,认为异担子菌属有2个种,即多年异担子菌H.annosum和岛生异担子菌H.insulare,然而单孢交配实验研究证明2个种为复合种.分子系统发育分析研究表...     

红菇属研究进展

红菇属Russula是一类具有较高经济和研究价值的食药用真菌,部分种类有毒。从红菇属的资源和分类、分子系统学、遗传多样性与应用研究等方面,本文对近年的研究进展进行了综述。红菇属研究存在的主要问题是形态特征记述误差较大导致的鉴定不准确,现有分子系统学研究和遗传多样性研究只涉及了少数种类的单基因片段,我国已报道的大量原初描述于欧洲和北美洲的种名是否在我国有分布尚存在争议,解决上述问题是今后红菇属研究的主要方向。     

Population genetics and evolutionary history of Miscanthus species in China

Miscanthus species have received considerable attention as a potential biomass source for renewable energy production because of their ability to produce high yields of biomass and adapt to a wide range of climates and soils. To explore the genetic diversity and phylogenetic relationship of Miscanthus species in China, we used 24 simple sequence repeat markers to genotype 100 natural populations representing all four Chinese Miscanthus species (M. sinensis Andersson, M. floridulus (Lab.) Warb. ex K. Schum. & Lauterb., M. sacchariflorus (Maxim.) Hack., and M. lutarioriparius L. Liu ex Renvoize & S. L. Chen). Based on phylogenetic, principal coordinate, and Structure analyses, we found that the 100 populations formed two major groups corresponding to sect. Triarrhena and sect. Miscanthus. Group 1 (i.e., sect. Triarrhena) was further subdivided into two subgroups corresponding to M. sacchariflorus and M. lutarioriparius; Group 2 (i.e., sect. Miscanthus) was subdivided into three subgroups, group 2a (M. sinensis populations in southern China), group 2b (M. sinensis populations in northern China), and group 2c (all the M. floridulus populations). Population genetics analyses indicated high levels of the genetic diversity at both population (H_E = 0.468–0.599) and species (H_E = 0.559–0.708) levels, indicative of the potential of these wild resources in future breeding programs. The species distribution modeling showed that M. sacchariflorus and M. lutarioriparius have experienced population reductions during the last glacial maximum and population expansion afterward; in contrast, M. sinensis and M. floridulus both underwent gradual population expansions from the last interglaciation to the present. We also suggest that M. floridulus originated from M. sinensis in southeast China through ecological speciation. The understanding of the evolutionary history and population dynamics of these species not only provides valuable information for further genetic improvement and breeding of this energy crop but also gives important insights into the origin and speciation processes of the Miscanthus species.     

中国跳鼠总科物种的系统分类学研究进展

近年来,随着分子系统学的发展以及荒漠地区物种多样性和分类学研究的深入,新的隐存种不断被发现,一些类群的分类地位也发生了变动。中国是世界上跳鼠总科(Dipodoidea)物种多样性最高的国家,通过对中国跳鼠总科物种的分类系统进行重新梳理和研究,确认跳鼠总科在中国有3科6亚科12属22种。证实中国分布有第五种蹶鼠——灰蹶鼠(Sicista pseudonapaea)。五趾跳鼠亚科原属Allactaga是一个并系群,应拆分为Allactaga、Orientallactaga、Scarturus三个属;原五趾跳鼠、巨泡五趾跳鼠、巴里坤跳鼠归于Orientallactaga属,小五趾跳鼠移入Scarturus属,且是一个包含隐存种的种团。大五趾跳鼠在我国仅有文献记载,其分布存疑。跳鼠亚科原三趾跳鼠努日亚种提升为种——塔里木跳鼠(Dipus deasyi);而准噶尔羽尾跳鼠(Stylodipus sungorus)在我国有分布。奇美跳鼠(Chimaerodipus auritus)是近年来在我国发现并命名的新属新种。     

栓皮栎人工林灌木层植物多样性的空间分布及其与光环境的关系

采用地统计学方法,对栓皮栎纯林和栓皮栎-侧柏混交林2种林分类型灌木层植物物种多样性空间异质性及其与光环境的关系进行研究。结果表明:栓皮栎纯林灌木层植物Shannon(H)、Simpson(D_s)、Margalef(M_a)物种多样性指数均显著小于栓皮栎-侧柏混交林。栓皮栎纯林灌木层植物物种多样性指数的变程和空间自相关距离均大于栓皮栎-侧柏混交林,其空间均一性较差,空间依赖性较强。栓皮栎纯林灌木层植物H、D_s、M_a结构比为44.2%～49.7%,具有中等强度的空间自相关性;栓皮栎-侧柏混交林中H、D_s、M_a结构比为1.5%～3.3%,具有强烈的空间自相关性。栓皮栎纯林灌木层植物物种多样性指数的空间分布主要呈明显的条带状梯度变化,而栓皮栎-侧柏混交林则呈明显的斑块状梯度变化,说明栓皮栎混交林灌木层植物较栓皮栎纯林空间连续性差,空间变异更为显著。相关与逐步回归分析表明,对栓皮栎纯林和栓皮栎-侧柏混交林灌木层植物多样性影响最为显著的光环境指标分别是林下总光照和冠层开...     

中国百合科的系统梗概及对今后研究的一些意见

自A.L.De Jussieu在1789年建立百合科以来,到1930年K.Krause在Engler-Prantl主编的Naturliche Pflanzen-Familien 2auflage Band 15a一书中发表他的系统为止,该科已成为一个十分庞杂的类群(heterogeneous group)。正如我们业师汪发缵教授曾说过:"凡不能确定隶属于何科的单子叶植物,就可放于百合科中"。     

秦岭中段野生动物多样性的红外相机监测数据库平台介绍

秦岭地处我国中西部, 生物地理位置重要, 拥有丰富的生物多样性, 有大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)、秦岭羚牛(Budorcas bedfordi)、金丝猴(Rhinopithecus roxellana)和朱鹮(Nipponia nippon)等4个秦岭森林旗舰物种, 被称为“秦岭四宝”。利用红外相机技术开展秦岭野生动物的非损伤性监测不仅可以为秦岭山系提供物种名录信息, 还可以为了解秦岭野生动物的行为和活动格局提供科学数据。清华大学环境学院生态团队自2009-2020年在秦岭中段南坡先后实施了7个项目, 对秦岭南坡的4个保护区进行了野生动物监测, 面积达1,113 km ²(26.5 km × 42 km), 红外相机位点数267个, 相机日数152,160天, 共获取红外相机照片855,260张。共鉴定出27种野生兽类和63种野生鸟类, 并应用这些照片数据开展了信息挖掘工作, 对野生动物行为、稀有物种、与生境的关系, 以及人为活动对野生动物的影响等领域进行了研究, 已取得部分成果。在此基础上建立了“秦岭中段野生动物多样性的红外相机监测数据库平台”, 供团队内部及合作者使用。通过10年的监测, 我们提出未来研究建议: (1)对于非常偶见的物种, 还需要更长的时间并在更多样化的生境布设相机, 以获取更多影像数据评估其现状; (2)数据库需要在更大程度和深度上进行信息挖掘, 尤其在种间关系、物种-生境关系、种群动态等方面; (3)对典型大种群数量的物种(如秦岭羚牛和野猪Sus scrofa)及食物链顶端大型捕食动物(如金钱豹Panthera pardus)进行种群动态研究, 为整个秦岭生态系统的健康持续提供科学支撑; (4)利用数据库的数据及今后红外相机监测数据进行野生动物疾病的发生发展监测研究。     

Revisiting of Carex sect. Confertiflorae s.l. (Cyperaceae): New data from molecular and morphological evidence and first insights on Carex biogeography in East Asia

Carex sect. Confertiflorae s.l. is a medium-sized species group (ca. 40 species) with its center of diversity in E Asia (China and Japan). According to morphological traits, the section has been proposed to split into two sections (sects. Confertiflorae sensu Ohwi and Molliculae Ohwi) up to five different ones (sects. Confertiflorae s.s., Molliculae, Dispalatae Ohwi, Ischnostachyae Ohwi, and Alliiformes Akiyama). Recent phylogenetic reconstructions showed Confertiflorae s.l. not to be monophyletic, as species traditionally considered part of it were found to belong to other clades, whereas species traditionally ascribed to other sections were nested within it. In this study, we investigated the phylogenetic structure, morphological affinities, and biogeographic history of sect. Confertiflorae s.l. We employed a taxon-based approach to explore the morphological affinities of the species considered in sect. Confertiflorae and compared the micromorphology of the nutlets of almost all the taxa using SEM. We included 40 samples representing 31 species/subspecies of sect. Confertiflorae s.l. and used two nuclear (ETS and ITS) and three plastid (trnL-F, matK, and rpl32-trnL ^UAG) molecular markers to reconstruct the phylogeny of the group. The phylogenetic analyses confirmed the polyphyly of sect. Confertiflorae s.l., whose representatives were found within five distinct clades. From these, two clades, sect. Confertiflorae and sect. Molliculae, were found to be closely related and contained the majority of the species. The composition of the two clades agreed with the morphological structure of the group, and we confirmed an exclusive combination of features (namely color of basal sheaths, presence of bract sheath, peduncle of lowest spike, inflorescence sex distribution, shape of pistillate glume apex, and color and veins of utricle, among others) characterizing each of the two clades. The origin of the two clades was found to be in the early Pliocene; however, the majority of the diversification events within each clade took place during the Pleistocene. This illustrates that although Asia has been regarded as having little potential ecological space for Carex to diversify due to its climate stability, groups of sedges sub-endemic from that area may have a fairly recent origin related to glaciations. We proposed the rearrangement of sect. Confertiflorae as previously conceived as three independent sections: the monotypic Alliiformes, sect. Molliculae, and sect. Paludosae.     

中国甘肃省狭义丝盖伞属二新种

依据形态学和分子系统学研究结果,描述了产自中国甘肃省的狭义丝盖伞属2个新种,即拟黄囊丝盖伞Inocybe muricellatoides和甘肃丝盖伞I. gansuensis。对新种的ITS、LSU和rpb2片段进行了测序和分析,并提供了详细描述、线条图、生态照片及与相似种的区别。拟黄囊丝盖伞以菌盖翘起的鳞片、菌柄纤维状、孢子光滑和厚壁的侧生囊状体为主要识别特征。甘肃丝盖伞具有粗壮的子实体、较大的孢子和厚壁侧生囊状体。基于LSU和rpb2联合数据的分子系统发育分析显示这两个新种隶属于狭义丝盖伞属且分别占据独特的分支。