人间隙连接蛋白 31 相互作用蛋白Annexin Ⅱ的筛选与证实

间隙连接蛋白 31 (connexin31 , Cx31) 是间隙连接蛋白 (connexin) 家族的一员,目前对于 Cx31 的功能及其调节方式知之甚少 . 采用固相多肽合成的方法合成 Cx31 羧基端一个多肽片段 (250~266) ,经 HPLC 纯化后偶联到匙孔血蓝蛋白,免疫新西兰雄兔后采血检测、并纯化、经蛋白质印迹、细胞免疫荧光染色、免疫沉淀证实得到的抗体为特异性抗 Cx31 的抗体 . 运用制备的抗 Cx31 多克隆抗体免疫沉淀, SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳 (SDS-PAGE) 分离,蛋白质条带回收,蛋白质胶块酶解, Q-TOF 质谱分析,数据库扫描筛选可能相互作用蛋白,运用抗体 pull-down 实验,筛选到可能相互作用蛋白 annexin Ⅱ,经过免疫共沉淀、细胞免疫共定位等实验证实 annexin Ⅱ与 Cx31 相互作用 .     

MAP法制备抗人Connexin31抗体

MAP（multiple antigenic peptide）多肽法具有快速、简便、成本低廉的特点．用MAP法,直接在多肽合成仪上合成Connexin31羧基端一个多肽片段（250—266AA）的MAP肽,经超滤器纯化后,免疫新西兰雄兔后采血检测、并纯化．经western blotting、细胞免疫荧光染色、免疫沉淀证实得到的抗体为抗间隙连接蛋白31的特异抗体．     

Connexin31 显性听力下降相关突变体研究

Cx31 突变可以导致常染色体显性听力下降、常染色体隐性听力下降、周围神经疾病伴听力丧失,以及变性红皮肤病角化病,其导致不同疾病的机理一直是研究的重点 . 利用定点突变技术 (site-directed mutagenesis, SDM) 构建 connexin31 显性听力下降相关突变体 Cx31R180X , Cx31E183K 并插入到真核表达载体 pEGFP-N1 ,转染 HeLa 细胞,转染 Cx31R180X-pEGFP-N1 和 Cx31E183K-pEGFP-N1 Cx31 突变体质粒的 HeLa 细胞质膜上没有出现斑块状染色和聚集现象,分别用内质网染料 conA 和高尔基体染料 WGA 进行免疫荧光染色,结果显示 Cx31 显性听力下降相关突变体蛋白主要分布在细胞质内,且大部分定位在内质网和高尔基体上 . 同时分别用抗 Cx31 和抗 GFP 抗体进行蛋白质印迹检测,证实 Cx31R180X , Cx31E183K 在转染的 HeLa 细胞中都有表达 . 研究发现 Connexin31 显性耳聋相关突变体 Cx31R180X , Cx31E183K 不能正常地形成间隙连接通道,这与 connexin31 EKV ( 变性红皮肤病角化病 ) 相关突变体能够运输到细胞膜上形成间隙连接通道的报道不相同,提示 connexin31 不同部位突变导致不同疾病的致病机理可能不一样 , 从而为解释“ one connexin two diseases ”提供分子水平的依据 .     

免疫共沉淀筛选细胞内与A型流感病毒M2蛋白相互作用的蛋白

摘要：【目的】筛选细胞内与A型流感病毒M2蛋白（A/M2）相互作用的蛋白质。【方法】将A/M2编码序列插入真核表达载体pCAGGS-CFlag,重组质粒pCAGGS-CFlag-A/M2转染HEK-293T细胞,裂解细胞,以Flag单抗偶联的琼脂糖球珠免疫沉淀A/M2-Flag蛋白,清洗去除非特异性结合的杂蛋白后,SDS-PAGE银染法显示与A/M2共沉淀的蛋白,从胶上切下此蛋白条带进行质谱分析。【结果】成功构建了A/M2的表达质粒,免疫印迹证实了A/M2蛋白在293T细胞中能够表达,免疫共沉淀筛选到与A/M2结合的多种蛋白,分析质谱结果,确定ataxin 10和3个真核翻译起始因子(eIF)为候选蛋白。【结论】ataxin 10与A/M2相互作用为流感病毒感染或接种流感疫苗引发小脑性共济失调提供了解释,eIF与A/M2相互作用表明A/M2可能在调控病毒蛋白合成方面起重要作用。     

间隙连接分子Cx43相关蛋白及其功能研究进展

间隙连接是细胞间直接进行信息交流的唯一膜通道结构。Cx43是构成间隙连接中分布最广、研究最多的间隙连接分子,目前运用免疫共沉淀、免疫荧光共定位、pull-down以及酵母双杂交等多种方法研究发现了众多的Cx43相关蛋白。这些蛋白通过与Cx43相互作用在间隙连接蛋白的组装、运输、膜定位,间隙连接通道的形成以及对间隙连接通讯的调控等一系列过程中均发挥十分重要的作用。本文就目前已经研究发现的Cx43相关蛋白及其最新的功能研究进展进行综述。     

一种特异性多用途抗人Connexin31抗体的获得与应用

间隙连接蛋白31(Connexin31,Cx31)是间隙连接蛋白(Connexin)家族的一员,目前对于Cx31的功能及其调节方式知之甚少。本实验利用Fmoe固相多肽合成的方法合成Cx31羧基端一个多肽片段(250-266从),经HPLC纯化后偶联到匙孔槭血蓝蛋白,免疫新西兰雄兔后采血检测、并纯化,采用Cx31myc表达蛋白进行Western blotting、细胞免疫荧光染色、免疫沉淀实验,证实得到的抗体为抗间隙连接蛋白31的特异抗体。     

血管生成素相互作用蛋白的发现及其在哺乳动物细胞中的验证

通过RT-PCR从人外周血白细胞中钓取血管生成素(angiogenin,Ang)cDNA,构建诱饵蛋白载体pAS-2-1-Ang,对其自身转录激活活性进行鉴定后,通过酵母双杂交系统筛选人肝细胞cDNA文库,获得两个双阳性克隆.序列分析和同源检索表明所获候选蛋白分别为人上皮细胞素和λ晶体蛋白.构建Ang及候选蛋白标签融合表达载体并共转染COS-7细胞,利用免疫共沉淀和蛋白质印迹方法在哺乳动物细胞中验证了Ang与候选蛋白间的相互作用.为阐明Ａng促血管新生的分子机制创造了条件.     

凋亡蛋白和Nmi的相互作用及作用位点的筛选鉴定

为研究来源于鸡贫血病毒的小分子蛋白质———凋亡蛋白 (apoptin)诱导肿瘤细胞凋亡的分子机制 ,利用酵母双杂交系统从人白细胞cDNA文库筛选凋亡蛋白相互作用蛋白质 ,核苷酸序列分析及同源性检索表明 ,其中一个约为 1.2kb的克隆与Nmi(N Mycinteractionprotein)高度同源。细胞免疫共沉淀实验结果显示 ,在哺乳动物细胞水平仍能够检测到凋亡蛋白与全长Nmi的特异相互作用。利用构建好的分别缺失C端 11个氨基酸、中间 33～46位氨基酸和二者均缺失的 3个凋亡蛋白突变体进行相互作用位点研究 ,结果表明凋亡蛋白的 33～ 46位氨基酸(核外运信号 )对于凋亡蛋白与Nmi的相互作用是必需的 ,而C端核定位信号 /DNA结合序列对于凋亡蛋白与Nmi的相互作用不是充分必要的     

与TaFRA蛋白相互作用候选蛋白的筛选

F-box蛋白是E3泛素连接酶SCF复合体的重要亚基, 通过底物蛋白的特异识别发挥功能。TaFRA是在盐胁迫差异表达片段基础上通过RACE方法获得的一个基因, 编码F-box蛋白。文章利用TaFRA基因构建诱饵表达载体, 直接用cDNA+pGAD+pBD共转化酵母双杂交的方法筛选相互作用的候选蛋白。通过对阳性克隆的鉴定和测序分析, 共获得44个与TaFRA相互作用的候选蛋白, 其中32个为已知蛋白, 包括硫氧还蛋白、金属硫蛋白、ATP合成酶及丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶等多种逆境胁迫反应蛋白及转录因子蛋白, 说明TaFRA与胁迫反应相关, 可能通过对上述蛋白编码基因的调控参与了植物的胁迫反应过程, 为进一步阐明TaFRA的功能及作用机制奠定了理论基础。     

转录因子AP-2β与SLP-2的蛋白相互作用

AP-2β是转录因子AP-2家族中的重要一员.AP-2是一个与哺乳动物的发育、细胞生长、分化、凋亡和肿瘤发生都有密切联系的重要的转录因子家族.最近的研究表明,AP-2能通过与其他蛋白的相互作用来调控AP-2下游基因的转录活性.采用免疫共沉淀结合质谱鉴定的方法筛选与AP-2β相互作用的蛋白.结果筛选到Stomatin like protein2(SLP-2)蛋白可能与AP-2β相互作用.免疫共沉淀实验证实外源过表达和内源的SLP-2蛋白都能与AP-2β蛋白相互作用.而且,细胞免疫荧光实验发现外源表达的Myc-AP-2β蛋白与内源的SLP-2蛋白在MCF-7细胞的胞质中有共定位.此外,免疫印记实验结果表明过表达SLP-2能上调AP-2β的蛋白水平,这就表明SLP-2与AP-2β相互作用后,SLP-2可能使AP-2β蛋白更稳定.这些研究结果为进一步研究这两个基因的功能提供了新的切入点.     

酵母双杂交技术筛选并回转验证在胞内与PML-C结构域相互作用的蛋白

目的 利用酵母双杂交技术在活细胞内筛选并回转验证与PML-C结构域相互作用的蛋白质.方法 通过诱饵质粒pGBKT7-PML-C,利用酵母双杂交系统从白血病细胞cDNA文库中筛选与PML-C结构域相互作用的蛋白质.结果 利用酵母双杂交技术筛选到43个能与PML-C结构域相互作用的克隆;经进一步的归类与酵母回转试验得到9个阳性克隆.结论 在细胞内PML-C结构域能与多种蛋白质有相互作用.中性粒细胞弹性蛋白酶（neutrophil elastase,NE）介导的急性早幼粒细胞白血病的发生可能与这些相互作用所致的生物学功能改变有关.     

肝细胞生成素在睾丸组织中的相互作用蛋白

肝细胞生成素（HPO）具有复杂的生理功能,在睾丸中的高表达提示其在生殖活动中的重要性,而不仅局限于肝再生.构建了酵母表达载体pGBKT7-HPO,采用酵母双杂交系统,以HPO为诱饵蛋白,从人睾丸cDNA文库中寻找能够与HPO相互作用的蛋白质.经过筛选、验证阳性克隆,并进行PCR、测序和序列比对,得到4种相互作用蛋白质：NADH脱氢酶1、钠/钾ATP酶β3亚基、磷脂酶C δ1以及附睾分泌蛋白.提示HPO可能参与了细胞的蛋白质合成,能量代谢等.通过对候选蛋白的研究,为探讨HPO对睾丸组织细胞功能的调节机制提供了重要的线索.     

血管生成素相互作用蛋白质的筛选与鉴定

血管生成素（angiogenin, ANG）在肿瘤、神经退行性疾病和先天免疫过程中均发挥作用,但对其具体生理病理功能和作用机制的了解并不深入全面.蛋白质 蛋白质相互作用调控着细胞内的各个生物学过程,可以为目标蛋白质功能和机制的探索提供信息.本文利用酵母双杂交技术,分别从人心肌和肝cDNA文库中筛选了ANG的可能相互作用蛋白质.对筛选获得的20个候选蛋白质进行生物信息学分析,显示10个蛋白质含有EGF结构域;有5个蛋白质在KEGG 数据库已有记录,主要参与细胞黏附、通讯和迁移等过程.在以往的研究中,我们已经验证α 辅肌动蛋白2（α-actinin 2）、卵泡抑素（follistatin）、磷脂混杂酶1（phospholipid scramblase 1）和腓骨蛋白1（fibulin1）与ANG作用的真实性.本文的蛋白质沉降实验显示,ANG与腓骨蛋白2、3、4之间也存在相互作用.     

Short-Range Functional Interaction Between Connexin35 and Neighboring Chemical Synapses

Auditory afferents terminating as mixed, electrical, and chemical, synapses on the goldfish Mauthner cells constitute an ideal experimental model to study the properties of gap junctions in the nervous system as well as to explore possible functional interactions with the other major form of interneuronal communication—chemically mediated synapses. By combining confocal microscopy and freeze-fracture replica immunogold labeling (FRIL), we found that gap junctions at these synapses contain connexin35 (Cx35), the fish ortholog of the neuron-specific human and mouse connexin36 (Cx36). Conductance of gap junction channels at these endings is known to be dynamically modulated by the activity of their co-localized chemically mediated glutamatergic synapses. By using simultaneous pre- and postsynaptic recordings at these single terminals, we demonstrate that such functional interaction takes place in the same ending, within a few micrometers. Accordingly, we also found evidence by confocal and FRIL double-immunogold labeling that the NR1 subunit of the NMDA glutamate receptor, proposed to be a key regulatory element, is present at postsynaptic densities closely associated with gap junction plaques containing Cx35. Given the widespread distribution of Cx35- and Cx36-mediated electrical synapses and glutamatergic synapses, our data suggest that the local functional interactions observed at these identifiable junctions may also apply to other electrical synapses, including those in mammalian brain.     

Interaction between Intrinsically Disordered Proteins Frequently Occurs in a Human Protein-Protein Interaction Network

Intrinsic protein disorder is a widespread phenomenon characterised by a lack of stable three-dimensional structures and is considered to play an important role in protein-protein interactions (PPIs). This study examined the genome-wide preference of disorder in PPIs by using exhaustive disorder prediction in human PPIs. We categorised the PPIs into three types (interaction between disordered proteins, interaction between structured proteins, and interaction between a disordered protein and a structured protein) with regard to the flexibility of molecular recognition and compared these three interaction types in an existing human PPI network with those in a randomised network. Although the structured regions were expected to become the identifiers for binding recognition, this comparative analysis revealed unexpected results. The occurrence of interactions between disordered proteins was significantly frequent, and that between a disordered protein and a structured protein was significantly infrequent. We found that this propensity was much stronger in interactions between nonhub proteins. We also analysed the interaction types from a functional standpoint by using GO, which revealed that the interaction between disordered proteins frequently occurred in cellular processes, regulation, and metabolic processes. The number of interactions, especially in metabolic processes between disordered proteins, was 1.8 times as large as that in the randomised network. Another analysis conducted by using KEGG pathways provided results where several signaling pathways and disease-related pathways included many interactions between disordered proteins. All of these analyses suggest that human PPIs preferably occur between disordered proteins and that the flexibility of the interacting protein pairs may play an important role in human PPI networks.     

Identification and Functional Expression of HCx31.9, a Novel Gap Junction Gene

By combining in silico and bench molecular biology methods we have identified a novel human gap junction gene that encodes a protein designated HCx31.9. We have determined its human chromosomal location and gene structure, and we have identified a putative mouse ortholog, mCx30.2. We have observed the presence of HCx31.9 in human cerebral cortex, liver, heart, spleen, lung, and kidney and the presence of mCx30.2 in mouse cerebral cortex, liver and lung. Moreover, preliminary data on the electrophysiological properties of HCx31.9 have been obtained by functional expression in paired Xenopus oocytes and in transfected N2A cells.     

酵母双杂交系统筛选GATA-1相互作用蛋白质及功能验证

目的 利用酵母双杂交技术从人脑cDNA文库中筛选与人GATA-1相互作用的蛋白质.方法 从人K562细胞中扩增出全长GATA1基因,设计引物将其3段截断体亚克隆入酵母表达载体pDBLeu中,转化至AH109感受态酵母中,利用酵母双杂交技术筛选人脑cDNA文库中与其相互作用的蛋白质,阳性克隆通过回转及免疫共沉淀试验进行验证,利用3xGATA荧光素酶报告基因对相互作用蛋白质进行功能验证.结果 成功构建出酵母诱饵蛋白表达质粒pDBLeu-GATA1（1）,pDBLeu-GATA1（2）,pDBLeu-GATA1（3）,筛到34个阳性克隆,用生物信息学分析及回转验证得到5个与GATA-1相互作用的候选蛋白,通过免疫共沉淀试验进一步验证,获得3个蛋白质能与GATA-1相互作用,分别是ECSIT,EFEMP1和GPS2.荧光素酶试验表明这3个蛋白质均能对GATA1的转录活性产生影响,证实它们之间的相互作用具有影响GATA1转录的功能.结论 应用酵母双杂交技术及免疫共沉淀试验,从人脑cDNA文库中成功获得3个与GATA-1相互作用并对其转录活性具有调节作用的蛋白质,为研究GATA1蛋白质的功能提供了新的线索.     

Segment-specific expression of the gap junction gene connexin31 during hindbrain development

 During segmentation of the mouse hindbrain (d8.0–8.5 pc), expression of the gap junction gene connexin31 (cx31) is precisely restricted to rhombomeres (r) 3 and 5. Shortly afterwards, during the turning process, cx31 expression in rhombomere 3 decreases and is no longer detectable at d9.5 pc, whereas expression in rhombomere 5 is maintained until about d10.0 pc. So far, cx31 is the first gap junction gene found to be expressed in rhombomeres. Its precise segmental and temporal expression pattern may reflect a critical requirement of cx31 channels for these odd numbered rhombomeres to acquire distinct cell identities. Received: 9 June 1997 / Accepted: 30 July 1997