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相似文献

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1.

In silico representation and discovery of transcription factor binding sites 总被引：3，自引：0，他引：3

Pavesi G Mauri G Pesole G 《Briefings in bioinformatics》2004,5(3):217-236

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2.

Pinpointing transcription factor binding sites from ChIP-seq data with SeqSite

X Wang X Zhang 《BMC systems biology》2011,5(Z2):S3

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3.

A blind deconvolution approach to high-resolution mapping of transcription factor binding sites from ChIP-seq data

Desmond S Lun Ashley Sherrid Brian Weiner David R Sherman James E Galagan 《Genome biology》2009,10(12):R142-12

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4.

Mining ChIP-chip data for transcription factor and cofactor binding sites

Smith AD Sumazin P Das D Zhang MQ 《Bioinformatics (Oxford, England)》2005,21(Z1):i403-i412

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5.

Pseudocounts for transcription factor binding sites

Keishin Nishida Martin C. Frith Kenta Nakai 《Nucleic acids research》2009,37(3):939-944

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6.

Position dependencies in transcription factor binding sites

Tomovic A Oakeley EJ 《Bioinformatics (Oxford, England)》2007,23(8):933-941

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7.

Prediction of transcription factor binding sites using ChIP-chip and phylogenetic footprinting data

Friberg MT 《Journal of bioinformatics and computational biology》2007,5(1):105-116

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8.

Gibbs Recursive Sampler: finding transcription factor binding sites

Thompson W Rouchka EC Lawrence CE 《Nucleic acids research》2003,31(13):3580-3585

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9.

Measuring similarities between transcription factor binding sites

Szymon M Kielbasa Didier Gonze Hanspeter Herzel 《BMC bioinformatics》2005,6(1):1-11

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10.

Adaptive evolution of transcription factor binding sites

Johannes?Berg Stana?Willmann Michael?L?ssig Email author 《BMC evolutionary biology》2004,4(1):42

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11.

Evolution of transcription factor DNA binding sites 总被引：2，自引：0，他引：2

Kotelnikova EA Makeev VJ Gelfand MS 《Gene》2005,347(2):255-263

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12.

Preferred distances between transcription factor binding sites

I. V. Kulakovskiy A. S. Kasianov A. A. Belostotsky I. A. Eliseeva V. J. Makeev 《Biophysics》2011,56(1):114-116

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13.

Integrating genome sequence and structural data for statistical learning to predict transcription factor binding sites

Pengpeng Long Lu Zhang Bin Huang Quan Chen Haiyan Liu 《Nucleic acids research》2020,48(22):12604

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14.

Combined analysis of expression data and transcription factor binding sites in the yeast genome

Nagaraj VH O'Flanagan RA Bruning AR Mathias JR Vershon AK Sengupta AM 《BMC genomics》2004,5(1):59-15

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15.

Positional distribution of human transcription factor binding sites

Koudritsky M Domany E 《Nucleic acids research》2008,36(21):6795-6805

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16.

Cell-type specificity of ChIP-predicted transcription factor binding sites

T Håndstad M Rye R Mocnik F Drabløs P Sætrom 《BMC genomics》2012,13(1):372

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17.

xFITOM: a generic GUI tool to search for transcription factor binding sites

Bhargava N Erill I 《Bioinformation》2010,5(2):49-51

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18.

Method for identifying transcription factor binding sites in yeast 总被引：2，自引：0，他引：2

Tsai HK Huang GT Chou MY Lu HH Li WH 《Bioinformatics (Oxford, England)》2006,22(14):1675-1681

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19.

A non-parametric model for transcription factor binding sites

King OD Roth FP 《Nucleic acids research》2003,31(19):e116

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20.

Probabilistic inference of transcription factor binding from multiple data sources

Lähdesmäki H Rust AG Shmulevich I 《PloS one》2008,3(3):e1820

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