寡聚蛋白结合配位体的研究——统计力学模型 Ⅱ.不同配位体的效应

文(Ⅰ)的模型继续推广到自旋变量σ、μ分别可取任意整数或半整数的情形,这对应于不同配位体的效应。特别处理了配位体为抑制剂与激活剂时底物与寡聚蛋白的相互作用,导出饱和曲线的公式,并把Hill 方程推广到有抑制剂或激活剂时的情况,所用的方法不受亚基构象数及配位体种类的限制。     

变构现象中的类似相变重整化群研究

一、引言所谓变构现象,是指寡聚蛋白(例如变构酶)这样的大分子与配位体(例如底物)这样的小分子结合中表现的协同现象,是分子生物物理中研究得很活跃的课题。如果令θ_s表示酶蛋白分子的亚基结合底物分子的百分数,θ_c表示酶蛋白分子亚基的某种构象呈现的百分数,则在热平衡条件下,实验观测到在不同配位体浓度s下,θ_s或θ_c与s的关系皆呈s-型曲线,如图1。S-型曲线表现了系统的宏观景像在某个配     

四面体分子模型的寡聚蛋白结合配位体的协同现象

四面体模型的寡聚蛋白结合配位体的协同现象,已用文献[2]给出的统计力学方法研究,通过包括次最近邻相互作用项的Hamiltonian,导出饱和曲线公式。在特定的诱致吻合条件下,与Koshland的结果。一致引入协同性强弱的概念,通过相关函数得到协同性强弱的计算方法。讨论了协同现象与相变的类似方法。     

四面体分子模型的寡聚蛋白结合配位体的协同现象

四面体模型的寡聚蛋白结合配位体的协同现象,已用文献[2]给出的统计力学方法研究,通过包括次最近邻相互作用项的Hamiltonian,导出饱和曲线公式。在特定的诱致吻合条件下,与Koshland 的结果。一致引入协同性强弱的概念,通过相关函数得到协同性强弱的计算方法。讨论了协同现象与相变的类似方法。     

特异配位体在亲和生物分离中的应用进展

本文讨论了近几年来特异配位体在生物分离中应用进展,主要包括蛋白质A、蛋白质G、活性染料、金属离子等配位体在超滤和色谱两方面应用。     

特异配位体在亲和生物分离中的应用进展

本文讨论了近几年来特异配位体在生物分离中应用进展,主要包括蛋白质Ａ、蛋白质Ｇ、活性染料、金属离子等配位体在超滤和色谱两方面应用。     

低自旋氰配位紫色震颤菌血红蛋白血红素及其周围质子的核磁共振研究

报道了低自旋氰配位紫色震颤菌血红蛋白 (VtHb CN)血红素及其周围质子的核磁共振谱 .通过MCOSY ,NOESY ,1DNOE和TOE ,以及SUPERWEFT实验对VtHb -CN的¹H核磁共振谱进行识别 .已识别了血红素和配位组氨酸的几乎所有共振峰 ,获得了这些共振峰的自旋 晶格弛豫时间和它们的化学位移随温度的变化关系 ,由此可分别获得这些质子到血红素Fe³⁺ 的距离和抗磁化学位移 .通过化学位移的pH滴定 ,得到了配位组氨酸 (His 85 )的咪唑环的电离平衡常数pK_a( =4.95 ) .这一较低的pK_a 值 ,归因于带正电的Fe³⁺ 以及His 85与血红素Fe³⁺   的配位 .     

超积累植物的金属配位体及其在植物修复中的应用

综述了超积累植物体内金属配位体（包括植物螯合肽、植物金属硫蛋白、有机酸和氨基酸）的生物合成,参与的植物体内金属的吸收、运输、积累的解毒过程的生理及分子机制,并对金属配位体在植物修复中的应用作了评述。     

α-α交联的Fe-Co杂化血红蛋白的轴向键Fe-Nε共振拉曼谱研究

通过将HbA和变异HbC(Glu6→Lys)交联制得的各种Co取代的Fe-Co杂化血红蛋白进行血红蛋白氧合过程的模拟研究,用共振拉曼技术研究它们在载氧、去氧和一氧化碳配位(无IHP或有IHP)时的轴向共价键Fe-Nε(F8-His)伸缩振动证明,在血红蛋白配位过程中,第一个配体配位到β(Fe)亚基上所引起的构象变化比配位到α(Fe)亚基的大;因而,配位分子应首先结合在α(Fe)亚基上,血红蛋白四聚体配位过程T/R态构象根本转变发生在第二个配位之时或之前;而且,可能存在除T、R态外的其它构象状态。     

α-α交联的Fe-Co杂化血红蛋白的轴向键Fe-Nε共振拉曼谱研究

通过将HbA和变异HbC(Glu6→Lys)交联制得的各种Co取代的Fe-Co杂化血红蛋白进行血红蛋白氧合过程的模拟研究,用共振拉曼技术研究它们在载氧、去氧和一氧化碳配位(无IHP或有IHP)时的轴向共价键Fe-Nε(F8-His)伸缩振动证明,在血红蛋白配位过程中,第一个配体配位到β(Fe)亚基上所引起的构象变化比配位到α(Fe)亚基的大;因而,配位分子应首先结合在α(Fe)亚基上,血红蛋白四聚体配位过程T/R态构象根本转变发生在第二个配位之时或之前;而且,可能存在除T、R态外的其它构象状态。     

丝状真菌胞吐体的研究进展

胞吐体(Exocyst)是真核生物细胞内由8个亚基组成的复合体,在后高尔基体产生的分泌囊泡与细胞膜特定位置的定向与拴系过程中发挥重要作用。一些小G蛋白通过直接与胞吐体的亚基相互作用,对极性胞外分泌进行精确的时空调节。丝状真菌的生长是通过菌丝顶端的极性生长来完成的,并且具有极强的分泌蛋白质能力,是研究胞吐体的理想系统。胞吐体对丝状真菌的形态发生和致病性都有极大的影响。本文综述了当前在丝状真菌中胞吐体的研究进展,包括它的组成、亚基定位、相关功能和调控。     

甘草酸二铵脂质配位体对非酒精性脂肪肝大鼠白细胞浸润的影响

目的研究甘草酸二铵脂质配位体(DGLL)对非酒精性脂肪肝(NAFLD)大鼠白细胞浸润的影响及机制。方法用高脂乳剂灌胃诱导大鼠NAFLD模型并给予DGLL干预,6周后观察肝脏组织中髓过氧化物酶(MPO)的表达,酶标仪法测定肝脏组织MPO活性的变化,流式细胞技术测定外周血白细胞粘附分子表达的变化,Western blot技术检测肝脏组织内皮细胞间粘附分子-1(ICAM-1)的表达水平。结果与高脂模型组相比,DGLL能明显降低NAFLD大鼠肝脏组织中白细胞MPO的表达和活化,下调大鼠外周血中单核细胞和粒细胞粘附分子的表达,同时显著地抑制肝脏组织中内皮细胞ICAM-1的表达。结论 DGLL能显著降低高脂饮食诱导的NAFLD大鼠肝脏组织中白细胞的活化和浸润,这种作用可能与抑制白细胞与内皮细胞粘附分子的表达相关。     

混合配位体络合物的结构稳定性及其生物学意义(上)

在大自然中,生物体系内发生的各种生物化学反应的特异选择性和高效性常使人惊叹不已。现代分子生物学的发展已充分揭示了这与生物体内存在的各种生命金属元素紧紧相关。越来越多的证据支持下述论点,即金属离子是通过金属络合物,特别是它的复杂络合物—混合络合物(mixed complex)在生命体内发挥作用的。混合络合物可分为混合金属络合物(mixed metal complex)和混合配体络合物(mixed ligand complex)。由于生物体内存在着大量的各种各样的配位体,它们的浓度大大超过体内的金属元素,因此生物体内大量、     

几种诊断肿瘤的定位显影剂—99~m锝铬合物配位体的合成

合成了六个肿瘤定位显影剂,单氨三乙酰氨基酸配位体,其中三个未见报道。     

拟南芥核酸外切体亚基RRP41L与RRP42及RRP45B的互作关系

在真核生物中,核酸外切体(exosome)是一个由9个核心蛋白亚基组成的在进化上十分保守的大分子复合物,具有加工和降解RNA的重要功能。为了了解影响拟南芥生长发育的核酸外切体亚基RRP41-LIKE (RRP41L)与其他外切体亚基之间的互作关系,本文利用酵母双杂交和荧光素酶互补技术从体外和体内两个方面验证了RRP41L与另外两个核酸外切体亚基RRP42及RRP45B的互作关系。结果显示RRP41L不能与RRP42互作,而能与RRP45B互作。     

海马多巴胺D1受体激活抑制谷氨酸介导的大鼠慢性应激性抑郁

本文旨在探讨在慢性应激性抑郁发生过程中多巴胺D1受体对谷氨酸及其离子型受体的影响。实验通过建立慢性不可预见性温和应激(chronic unpredictable mild stress,CUMS)抑郁模型,结合海马微量注射多巴胺D1受体激动剂SKF38393、非竞争性N-甲基-D-天冬氨酸(N-methyl-D-aspartic acid,NMDA)受体拮抗剂MK-801和α-氨基羟甲基异恶唑丙酸(α-amino-3-hydroxy-5-methylisoxazole-4-propionic acid,AMPA)受体的拮抗剂NBQX,运用糖水偏爱测试、旷场实验和悬尾实验等方法检测动物的行为表现,采用高效液相色谱法(high-performance liquid chromatography,HPLC)和Western blot实验来检测海马内谷氨酸含量及其离子型受体关键亚基的表达。结果显示,与对照组相比,CUMS组大鼠表现出明显的抑郁样行为变化,且海马谷氨酸含量升高,其NMDA受体的NR1亚基与AMPA受体的GluR2/3亚基也明显下调;注射SKF38393后可明显改善应激引起的抑郁样行为,且海马谷氨酸含量显...     

配位体交换色谱法测定槐米废渣水解液单糖成分

利用生物质转化成糖研究近年来备受关注,为给工业化高效利用槐米废渣提供检测技术,本文建立了槐米废渣水解转化糖液中4种主要单糖的铅(Pb~(2+))配位体交换高效液相色谱分析方法并采用离子色谱法验证了方法的可行性;实验比较了Pb~(2+)和Ca~(2+)两种不同柱内抗衡离子对组分分离的影响,最终利用铅配体方法对实际样品进行了测试。方法分离柱采用Sepax Carbomix Pb-NP 5(300×7.8 mm ID,5μm,8%交联度)色谱柱,柱温75℃;流动相采用超纯水,流速0.50 m L/min;检测器采用示差折光检测器,检测器温度为30℃;样品采用活性炭固相萃取小柱脱除色素。结果表明,组分葡萄糖、木糖、半乳糖和阿拉伯糖在25 min内完成分离,在0.2~20.0 mg/m L浓度范围内呈现良好的线性关系,方法检测限在1.94~1.98μg/m L之间;槐米废渣水解液中阿拉伯糖平均含量大于67%,具有较高回收价值。方法样品前处理简便,重现性好,结果准确,测试成本低。     

不同失水状态发菜类囊体膜蛋白的分离及鉴定

采用液氮研磨与超声波破碎相结合的方法,破碎不同失水状态的发菜藻体和细胞,用差速离心法制备发菜类囊体膜粗制品,蔗糖密度梯度高速离心纯化类囊体膜,SDS-PAGE电泳分离类囊体膜蛋白,并对膜蛋白进行了MALDI-TOF-TOF/MS质谱分析和鉴定。结果表明:(1)充分吸胀4h后失水6h的发菜(含水量51.2%)和失水24h的发菜(含水量14.9%),经过多步差速离心后再进行蔗糖密度梯度高速离心,可得到纯化的类囊体膜。(2)发菜类囊体膜蛋白SDS-PAGE电泳分离到14个条带,共鉴定出8种蛋白,根据其功能可分为4类——光合作用相关蛋白(光系统Ⅱ锰稳定蛋白PsbO,F1F0 ATP合成酶α亚基和β亚基)、结构域蛋白、选择性通道蛋白OprB、未知蛋白(hypothetical protein Npun_R1321、Npun_R3785、N9414_02186),它们在发菜的光合作用中具有重要作用。     

外切体研究进展

外切体是酿酒酵母中鉴定的一个保守复合体,具有3′外切核酸酶的活性.10个核心亚基,除Csl4p/Ski4p外,在体外都具有3′外切核酸酶的活性.外切体在多种RNA的代谢中起重要作用.外切体普遍存在于真核生物中,并与真核基因的表达调控密切相关.     

腾冲嗜酸热两面菌S5分子伴侣β亚基的表达、纯化和活性的初步分析

用NdeI和BamHI酶切回收腾冲嗜酸热两面菌S5的分子伴侣β亚基基因片段插入pET-23b的相应位置,并分别在BL21(DE3)和Rosetta-gami~(TM)B(DE3)pLysS中表达。表达的β亚基以可溶的形式存在。β亚基在Rosetta-gami~(TM)B(DE3)pLysS中表达较高,其占菌体总蛋白的16．2%,且以单体和聚体形式同时存在。表达的菌体经超声破碎、70℃热处理后,上清中β亚基蛋白含量达到30%,再经(NH_4)_2SO_4沉淀、Bio-Gel A-1．5m和DEAE-Sepharose CL-6B柱层析,得到在SDS-PAGE呈电泳均一的β亚基,Native-PAGE表明其为聚体,有弱的ATPase活性。