大肠癌双向电泳分离条件的建立及其初步分析

采用固相pH梯度等电聚焦为第一向,SDS-PAGE垂直电泳为第二向建立了大肠癌双向电泳分离技术实验条件,对样品的处理、水化、等电聚焦、凝胶平衡等步骤进行了优化,成功地获得了大肠癌分辨率高、重复性好的双向电泳图谱.癌组织样品经3次重复实验共获得蛋白质斑点数1 186±46个,蛋白质斑点位置在IEF方向平均偏差为1.67±0.29 mm,在SDS-PAGE方向为1.41±0.16 mm,蛋白质表达量的相对标准差为6.67 %±2.25 %.经ImageMaster 2D Elite软件初步分析后发现了一些差异表达的蛋白质.     

正常与重金属铅注射的兔脑蛋白质双向电泳图谱比较与鉴定

重金属污染对人类健康的威胁日益受到关注,为了了解大量重金属摄入对脑蛋白质的影响,对比研究了正常兔脑组织蛋白质与重金属铅腹腔注射2周后的兔脑组织在蛋白质双向电泳图谱中的差异,分析重金属注射对脑蛋白质表达的可能影响.通过对脑组织蛋白质的提取,分离出水溶性的蛋白质组分,经双向电泳图谱比较正常与注射重金属铅的兔子在脑蛋白质表达上的差异,其中3个蛋白质斑点经提取,反相高效液相色谱(RP-HPLC)分离,基质辅助激光解析电离质谱(MALDI-TOF MS)确定了分子质量,并利用肽质量指纹图谱检索数据库确定蛋白质的归属.实验结果表明正常兔脑与金属铅注射的兔脑在水溶性蛋白质的表达上具有显著性差异.     

失血性休克大鼠肝脏蛋白质的差异分析

 应用蛋白质双向凝胶电泳 (two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis, 2-DE) 技术,分析在急性重度失血性休克 (refractory hemorrhagic shock, RHS) 条件下,大鼠肝脏蛋白质组表达的差异.16 只雄性 Wistar 大鼠随机分成正常对照组 (sham hemorrhage shock, SHS) 和 RHS 模型组,每组 8 只.采用股动脉放血的方法制备模型,在规定时间内处死大鼠并分离肝脏,提取肝脏总蛋白质后进行 2-DE.运用 Image Master 2D Platinum v 5.0 凝胶图像分析软件对 2-DE 凝胶图像进行差异表达分析.有意义的差异蛋白质点用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱进行肽质量指纹图谱分析,借助 Swiss-prot 数据库进行蛋白质搜索和鉴定.SHS 组和 RHS 组肝脏的 2-DE 图谱,分别平均识别到 698±11 和 700±13 个蛋白质点,SHS 组和 RHS 组肝脏间平均匹配率达88%～92 %.共发现 10 个差异有意义的蛋白质点,鉴定出了肿瘤抑制性抗原gp96、葡萄糖调节蛋白58、过氧还蛋白Ⅰ、细胞色素b5、谷胱甘肽转移酶、ATP合酶β亚单位、二磷酸果糖酶 B、三磷酸甘油醛脱氢酶等8种蛋白质.结果表明,以 2-DE 技术得到重复性和分辨率都较好的 2-DE图谱,并初步鉴定急性重度失血性休克后大鼠肝脏的差异表达蛋白质,为深入研究失血性休克的生理病理机制及寻找失血性休克预防和治疗的生物标志物提供了依据.     

肾阳虚证候的人血清比较蛋白质组学分析

利用双向电泳（2-DE）优化分离了除去高丰度蛋白（白蛋白和IgG）的老年体虚肾阳虚患者（以健康组为参照）的血清样本,对比分析pH 4～7范围的2-DE谱图,肾阳虚患者和参照组的平均蛋白点分别为(393±32)和(455±19)个. 其中肾阳虚证候表达量上调2倍（P<0.05）以上的蛋白点有26个,下调2倍以上的有33个. 用质谱获得上述差异蛋白的肽质量指纹图谱,并经数据库检索共鉴定出了49种差异蛋白质,其中有10种在肾阳虚血清中特异表达,有6种在健康组血清中特异表达. 蛋白功能分析发现,其中33种蛋白质的差异表达与肾阳虚证密切相关. 蛋白质TCRβ及transthyretin的蛋白印迹实验验证了2-DE 的结果. 该研究结果为阐明中医肾阳虚证的机理提供了一条新途径.     

急性早幼粒细胞白血病维甲酸耐药性的双向电泳分析

目的:研究急性早幼粒细胞白血病(APL)对全反式维甲酸(ATRA)治疗敏感和耐药患者的外周血淋巴细胞在蛋白质组水平上的差异。方法:采用双向凝胶电泳(2-DE)对敏感和耐药患者的外周血淋巴细胞进行蛋白质组差异分析。结果:ATRA敏感和耐药患者外周血淋巴细胞的2-DE平均蛋白质点分别为(746±57)和(617±41),敏感与耐药患者的2-DE相比,有16个蛋白点表达明显上调,22个明显下调。另有4个蛋白点(Mr/pI:24.6kD/8.05,32.3kD/5.17,22.3kD/6.51,25.1kD/7.09)在敏感患者中特异表达,5个蛋白点(Mr/pI:21.9kD/5.45,23.4kD/6.27,22.9kD/6.65,23.9kD/7.39,24.7kD/7.65)在耐药患者中特异表达。结论:结果提示这些差异表达的蛋白质可能与APL对ATRA耐药的机制有关,该研究有助于揭示APL对ATRA耐药机理和发现新的临床分子标志物。     

人支气管上皮不典型增生与浸润癌组织的比较蛋白质组学研究

为筛选支气管上皮鳞状不典型增生进展的分子标志物,采用改良的脱氧胆酸-三氯醋酸(deoxycholate-trichloroaetic acid, DOC-TCA)法提纯支气管上皮总蛋白质进行双向电泳（two-dimensional electrophoresis,2-DE）,应用ImageMaster 2D分析软件、Student’s t-检验识别差异蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS）得到相应的肽质指纹图（peptide mass fingerprint,PMF）,搜索数据库鉴定差异蛋白质.由此获得人支气管上皮不典型增生和浸润癌组织的2-DE图谱及其凝胶的平均蛋白质点数（1 273.00±43.31,1 326.00±66.63）,且两阶段间平均差异蛋白质点数为 56.00±8.96.取38个差异蛋白质点进行PMF分析,鉴定出一些与细胞生长、分化或肿瘤发生等有关的蛋白质,随即应用免疫组化检测差异蛋白质EGFR、c-Jun、Mdm2在两类组织中的表达,其结果也显示了类似的表达差异.支气管上皮不典型增生恶性转化过程中存在蛋白质的差异表达,这些差异蛋白质可能以不同的方式参与了癌变过程,且EGFR、c-Jun、Mdm2的免疫组化验证结果与质谱结果的一致性表明,比较蛋白质组学是一种筛选癌变相关分子标志物的可靠方法之一.     

新生、成年和老年小鼠大脑皮层突触小体神经递质氨基酸含量的比较研究

用DANS反应-薄膜层析-萤光方法测定了蔗糖密度梯度超离心制备的不同年龄小鼠大脑皮层突触小体中递质氨基酸的含量。实验结果表明:(1)不同年龄小鼠每克皮层组织中突触小体蛋白质含量不同。新生——5.68、成年——21.37、老年——19.14毫克/克脑组织湿重。(2)递质氨基酸含量以毫微克分子/克脑组织湿重表示时,GABA含量在发育期升高,到老年期又降低;牛磺酸含量由新生到老年期持续下降;谷氨酸、天冬氨酸含量在发育期升高,到老年期无明显变化。(3)突触小体中“抑制性”递质氨基酸总量与“兴奋性”递质氨基酸总量的比值(GABA Tau Gly/Glu Asp)随年龄增长而明显降低,成年的比值趋近于1。新——3.39、成年——1.06、老年——0.79。(4)老年小鼠皮层突触小体的蔗糖梯度区带明显分成两层。即除P_2B层外,出现明显的P_2B′层,其GABA、谷氨酸、天冬氨酸含量与P_2B层相比,分别降低24.2%(P<0.05)、50.4%(P<0.001)和44%(P<0.001)。     

SARS康复患者血浆蛋白谱的双向凝胶电泳分析

以蛋白质双向凝胶电泳（2-DE）比较了不同中和抗体效价的SARS康复患者血浆样本（试验组）与正常人单采血浆样本（对照组）蛋白谱的异同。结果显示：对照组9份样本的2-DE 图谱出现蛋白斑点338±24个,试验组9份样本出现蛋白斑点348±45个,二者主要斑点的位置与数量基本一致;对照组中少量蛋白斑点的出现频度不同,且有4个蛋白点群的灰度值存在明显的差异;试验组有6个蛋白点群与对照组出现差异,并在相同区域Ⅲ内有4个蛋白斑点的灰度值出现变化,且灰度值与样本的中和抗体效价呈正相关性。结果表明,试验组与对照组的蛋白谱存在差异,且与SARS病毒中和抗体效价呈现相关性。     

应用超高分辨双向凝胶电泳技术进行正常人类肝脏蛋白质组研究

肝脏是人体最大的实质器官, 承担着人体许多关键的生理功能, 在生命活动中占有重要地位. 根据人类肝脏蛋白质组计划, 本实验旨在构建人肝脏蛋白质双向凝胶电泳表达谱, 尽可能分离和鉴定更多的蛋白. 在双向凝胶电泳第一向等电聚焦水平上, 从上样方式、水化液配方、聚焦时间等方面优化了碱性蛋白的分离条件, 利用超放大胶分离技术搭建了高分辨的双向凝胶电泳分离平台, 构建了人类肝脏蛋白质2-DE参考谱, 检测到5481个蛋白质点. 这是目前国际上最为全面的人体器官蛋白质组2-DE参考谱, 为其他肝病的研究提供了较好的参照系. 成功鉴定了429个非冗余蛋白, 对pH 4.0~7.0, 5.0~6.0, 5.5~6.7, 6.0~9.0部分蛋白质点在胶上进行了注释, 由此构建了人肝2-DE蛋白质表达谱数据库. 对蛋白质的理化性质、功能及亚细胞定位进行了全面分析. 研究中构建的人类肝脏蛋白质2-DE图谱将为肝脏比较蛋白质组学研究提供参考.     

吗啡成瘾及戒断大鼠前额叶皮质蛋白质组变化的初步研究

目的：探讨与大鼠吗啡成瘾和戒断相关的前额叶皮质（PFC）蛋白。方法：以固相pH梯度等电聚焦为第一向和垂直SDS-PAGE为第二向,分别对吗啡成瘾和自然戒断大鼠及正常大鼠的PFC蛋白质样品进行二维分离,2-DE图谱经ImageMaster 2D Plat-inum v5.0软件分析,选取4个差异蛋白点用基质辅助激光解吸附离子化飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）进行鉴定。结果：通过对2-DE图谱蛋白斑点的匹配及对比分析,与吗啡成瘾和自然戒断相关的差异表达蛋白斑点为79个;经质谱鉴定出2个有意义的差异表达的蛋白斑点：Snap25亚型-βSnap25突触相关蛋白25,β-肌动蛋白。结论：PFC的某些蛋白可能与吗啡成瘾和戒断相关,其中尤其是神经毒性相关的蛋白可能与吗啡成瘾机制相关。     

产热凝胶土壤杆菌ATCC31749蛋白质组双向电泳图谱的构建

建立了热凝胶生产茵土壤杆茵茵体总蛋白的蛋白质提取方法和双向电泳方案,确定了使用蛋白质裂解液(7 mol/L尿素,2 mol/L硫脲,1%ASB-14去垢剂,40 mmol/L Tris,0.001%溴酚蓝,1 mmol/L EDTA,1%TBP和1%两性电解质)结合超声破碎法来提取茵体总蛋白的方案为最佳,选择17 cm...     

AngⅡ和PKC对心肌细胞AngⅡ 1型受体的转录调节

利用体外培养的心肌细胞,观察血管紧张素Ⅱ（ＡｎｇⅡ）和蛋白激酶Ｃ（ＰＫＣ）在诱导ＡｎｇⅡ１型受体（ＡＴ１）基因表达及蛋白质代谢中的作用．研究结果表明：ＡｎｇⅡ可诱导ＡＴ１ｍＲＮＡ水平一过性下调,呈时间及剂量依赖性,１０ｎｍｏｌ／ＬＡｎｇⅡ刺激细胞６ｈ,引起ＡＴ１ｍＲＮＡ水平降低幅度最大,降至对照的５１．６％±９．５％,然后逐渐回升,２４ｈ恢复至对照水平．３０μｍｏｌ／ＬＨ－７（ＰＫＣ抑制剂）能阻断ＡｎｇⅡ诱导的ＡＴ１ｍＲＮＡ水平的下调．０．３μｍｏｌ／Ｌ的ＰＭＡ（ＰＫＣ激活剂）单独应用可诱导ＡＴ１ｍＲＮＡ水平下调达对照的４３％±８％,加入ＡＴ１拮抗剂ＤＭＰ８１１及Ｄｕｐ７５３均可阻断ＡｎｇⅡ诱导的ＡＴ１ｍＲＮＡ水平的下调．１０ｎｍｏｌ／Ｌ的ＡｎｇⅡ刺激心肌细胞９６ｈ可使蛋白含量降低至对照的７３．４％±５．６％,而加药持续刺激１４４ｈ可使蛋白含量较对照增加３３．８％±６．３％,Ｈ－７不能阻断ＡｎｇⅡ诱导的蛋白含量降低,但可有效地抑制蛋白含量的增加．以上结果提示：ＡｎｇⅡ对心肌细胞ＡＴ１基因的转录和细胞的蛋白代谢有调节作用,而ＰＫＣ则参与了ＡｎｇⅡ的这种调节作用     

瘦素诱导体外培养大鼠脂肪间充质干细胞凋亡

为观察瘦素诱导体外培养大鼠脂肪间充质干细胞凋亡的作用, 采用胶原酶消化法分离培养大鼠附睾脂肪垫间充质干细胞, 第3代细胞用于实验。细胞免疫荧光化学方法鉴定CD105、Vimentin表达阳性率约80%以上, 10-6 mol/L的瘦素作用细胞48 h、72 h后激光共聚焦显微镜观察分别可见早期及中晚期特征表现; 0 mol/L、10-8 mol/L、10-7 mol/L、10-6 mol/L瘦素分别作用于细胞48 h后, 应用AnnexinⅤ/PI双染色法流式细胞仪检测早期凋亡率分别为2.50%±0.72%、6.78%±1.99%、11.99%±1.58%、17.93%±4.82% (P<0.05); 随着瘦素浓度的增加和作用时间的延长, Caspase-3的活性逐渐增高, 至48 h时达到高峰。说明瘦素可以直接诱导脂肪间充质干细胞凋亡, 从数量上减少脂肪组织的含量。     

应激心肌细胞蛋白质组双向凝胶电泳分析

采用双向凝胶电泳技术和计算机辅助的图像分析方法 ,对去甲肾上腺素诱导的应激心肌细胞与正常心肌细胞蛋白质进行分离和比较分析 .正常心肌细胞可分离 12 32± 5 6个蛋白点 ,蛋白点匹配率为 83 3%± 1 0 %.有 11种蛋白质在NE应激后发生了明显和稳定的质和量的改变 (P <0 0 5 ) ,其中 6种 (Mr pI :4 9 7kD 7 8,38 3kD 5 9,37 1kD 6 6 ,2 9 3kD 7 4 ,18 7kD 6 1,18 5kD 7 7)在应激后表达降低 ,4种 (Mr pI:4 7 6kD 5 5 ,31 9kD 4 4 ,2 6 6kD 4 6 ,33 2kD 8 1)在应激后表达增高 ,1种 (Mr pI:19 4kD 6 9)只在应激后发生表达 .这些差异表达的蛋白质可能参与了心血管应激反应乃至应激损伤发生的过程 .     

温敏核不育水稻花药蛋白质组初步分析

采用固相pH梯度 SDS聚丙烯酰胺双向凝胶电泳对温敏核不育水稻 96 4 2S可育与不育条件下减数分裂期花药总蛋白进行了分离 ,通过银染显色 ,获得了分辨率和重复性较好的双向电泳图谱 .PDQuest 2DE图像分析软件可识别约 10 0 0个蛋白质点 .蛋白质点在 2D胶上的重复性为 :沿等电聚焦方向偏差为 1 4 5± 0 2 3mm(n =8) ,沿SDS PAGE方向偏差为 :1 15± 0 17mm(n =8) .对两种育性不同样品的 2D胶上部分共有的蛋白质点 ,采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 (matrixassistedlaserdesorption ionizationtimeofflightmassspctrometry ,MALDI TOF MS)进行了肽质谱指纹图分析 .通过采用PeptIdent软件对SWISS PROT数据库的查询 ,有 5 0个蛋白质点在数据库得到归属鉴定 .对育性不同的2种样品 2D较上明显差异的蛋白质点进行了分析鉴定 .在不育变化为可育的过程中 ,明显表达上调的蛋白质点包括几丁质酶 ,酸性磷酸酶 ,胞浆激酶 ,谷蛋白前体 ,以及ESTSC72 61蛋白 ,明显下调的蛋白质包括β expansin前体 ,谷氨酸氨甲酰转移酶和 1种未知功能的蛋白质     

Comparative Proteome Analysis of Human Temporal Cortex Lobes by Two-Dimensional Electrophoresis and Identification of Selected Common Proteins

Human brain proteins were isolated from left and right temporal cortex lobes at the age of 73, 23, 84 years and separated by two-dimensional gel electrophoresis (2-DE). 2-DE was carried out with an immobilized pH gradient strip in the first dimension and by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis in the second dimension. Over 800 polypeptide spots were resolved with a silver-staining protocol by computerized 2-D gel analsis. Seven of the polypeptide spots were evidently distinguishable between human left and right temporal lobes. Four of the polypeptide spots were larger and three were smaller in human right temporal lobe. One of these three protein spots that have descendent expression in human right temporal lobe was identified as carbonyl reductase (NADPH) 1 by MALDI-TOF MS. Thirty-three common spots were identified by ESI-MS/MALDI-TOF MS/Edman sequencing and a protein database search. These identified proteins include some important enzymes and regulating proteins.     

Proteomic analysis of methyl parathion-responsive proteins in zebrafish (Danio rerio) brain

Methyl parathion (MP), an organophosphorus pesticide used worldwide, has been associated with a wide spectrum of toxic effects on organisms in the environment. This study set out to analyze the alteration of protein profiles in MP-exposed zebrafish (Danio rerio) brain and find the proteins responsive to MP toxicity. Zebrafish were subjected to 1, 3 and 5 mg/L MP and the proteomic changes in their brains were revealed using two-dimensional gel electrophoresis. Six protein spots were observed to be significantly changed by MP exposure. Among these, 4 spots were down-regulated, while 2 spots were up-regulated. These altered spots were excised from the gels and identified by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight tandem mass spectrometry and database searching. The results indicate that these proteins were involved in binding, catalysis, regulation of energy metabolism and cell structure. These data may provide novel biomarkers for the evaluation of MP contamination and useful insights for understanding the mechanisms of MP toxicity.     

高效毛细管电泳法直接测定红豆杉悬浮培养细胞中游离芳香族氨基酸

建立了红豆杉悬浮培养细胞中游离芳香族氨基酸的高效毛细管电泳的分离直接紫外吸收测定方法。在优化的实验条件下 ,以间苯二酚为内标 ,未涂层融硅毛细管 (75 μmi.d .,总长 37cm ,有效分离长度 30cm)为分离通道 ,40mmol/L磷酸缓冲液 (pH10 .46 )为电泳介质 ,3sec(0 .5 psi)压力进样 ,15kV恒压电泳 ,2 0 0nm检测 ,在 9min内三种氨基酸得到分离测定。色氨酸、苯丙氨酸和酪氨酸的线性范围分别为 2 .5 0～ 2 5 0 μmol/L(r =0 .996 2 ,RSD =2 .5 2 % )、1.2 5～ 2 5 0 μmol/L(r =0 .996 6 ,RSD =2 .12 % )和 2 .5 0～ 2 5 0 μmol/L(r=0 .9940 ,RSD =2 .93% ) ,苯丙氨酸回收率为 96 .8%± 1.37% ,酪氨酸回收率为 99.2 %± 3.0 4%。     

Liposomal amikacin dry powder inhaler: Effect of fines on in vitro performance

The aim of the present investigation was to prepare and evaluate the influence of adding fines on the in vitro performance of liposomal amikacin dry powder inhaler (AMK LDPI) formulations. Liposomes composed of hydrogenated soyaphosphatidylcholine, cholesterol and saturated soyaphosphatidylglycerol (AMK 1), or stearylamine (AMK 2) were prepared by a reverse phase evaporation technique, extruded to reduce size and separated from unentrapped drug. Purified liposomal dispersion was subjected to lyophilization using optimized cryoprotectant to achieve maximum percentage drug retentio (PDR). Lactose carrier in varying mass ratios with or without addition of fines in different mixing sequences was used to formulate AMK LDPI formulations. AMK LDPI formulations were characterized for angle of repose, compressibility index, dispersibility index, scanning electron microscopy, and fine perticle fraction (FPF). PDR was found to be 97.6%±2.2% for AMK1 and 98.5%±1.9% for AMK2 using sucrose as optimized cryoprotectant in lipid:sucrose ratio of 1∶4. Lactose carrier containing 10% fines (wt/wt) was found to be the optimum blend at 1∶5 mass ratio of liposome:lactose. The addition of fines and the order of mixing of fines were found to influence the FPF with significantly different device fractions. FPF of AMK LDPI formulations using Rotahaler as the delivery device at 30, 60, and 90 L/min were found to be 21.85%±2.2% and 24.6%±2.4%, 25.9% ±1.8% and 29.2%±2.1%, and 29.5%±2.6% and 34.2%±2.0% for AMK1 and AMK2, respectively. From the studies performed in this investigation, it was observed that liposomal charge, addition of fines and order of mixing fines, has a significant effect (P<.05) on in vitro deposition of drug from LDPI formulation.     

Proximate,vitamins A and E,and mineral composition of free‐ranging cotton mice (Peromyscus gossypinus) from St. Catherines Island,Georgia

Although rodents are an integral part of numerous carnivore diets, there is little published information regarding nutrient composition in free‐ranging mice for comparison with laboratory‐reared prey. Cotton mice (Peromyscus gossypinus, n=6) were captured on St. Catherines Island, Georgia, and analyzed for water, ash, protein, and fat content (proximate constituents), as well as minerals and the fat‐soluble vitamins A and E. The overall body composition (mean±SD: 65.8%±1.9% water, 10.9%±2.2% ash, 56.4%±4.1% protein, and 27.2%±3.9% fat) was similar to published values for adult laboratory mice (Mus domesticus). The macro‐ (Ca, K, Mg, Na, and P) and trace (Cu, Fe, Mn, and Zn) mineral levels were also similar to previously reported values for laboratory mice, and in general met or exceeded the established nutrient requirements for domestic carnivores. Vitamin E ranged from 77 to 170 IU/kg dry matter (DM) in these mice–again, similar to values previously quantified in laboratory mice. However, the vitamin A concentrations (21,947±6,893 IU/kg DM) in the free‐ranging mice were consistently and substantially lower than values reported for whole laboratory mice. To our knowledge, this is the first quantification of vitamin A in free‐ranging mice used as prey by carnivores. While other nutrients measured were similar between captive‐reared and free‐ranging mice, the current data suggest the need for further investigation of vitamin A nutrition in the development of optimal diets for carnivores in captivity. Zoo Biol 23:253–261, 2004. © 2004 Wiley‐Liss, Inc.