微卫星座位对KM封闭群小鼠的遗传分析

应用微卫星分子标记对昆明小鼠(KM)封闭群相隔10代的两个群体(分别命名为A9和A19)进行遗传背景分析,共设计位于小鼠7条染色体上的7对微卫星引物用于实验研究,选取具有多态性的一个微卫星位点D3Mit22进行详细分析.结果表明:所研究的位点D3Mit22在两个群体共发现2个不同的等位基因,3种不同的基因型,其中A9代有3种不同的基因型,即AB,AA,BB.A19代有两种不同的基因型,即AB,BB.进一步埘不同的微卫星位点克隆测序,分析了该位点的DNA分子特性.对封闭群小鼠检测方法的建立及保持封闭群小鼠的遗传稳定性提供了重要的分子数据.     

频谱水对SPF级KM小鼠的抗疲劳作用

目的探讨频谱水对SPF级KM小鼠的抗疲劳作用。方法将75只雄性SPF级KM小鼠随机地分成三组,分别给予三种不同的实验处理,30 d后测定受试小鼠负重游泳时间、血清尿素、肝糖原和血乳酸含量,并进行统计学分析。结果统计分析结果显示：（1）负重游泳致死时间和肝糖原含量,A、B、C三组之间差异不显著（P〉0.05）;（2）A组的血清尿素含量显著高于B组和C组（P〈0.01）,但B组和C组之间差异不显著（P〉0.05）;（3）在三个时间点分别测定各组小鼠血中乳酸含量,其中A、B两组小鼠的血乳酸含量显著高于C组（P〈0.05）,且游泳后休息30 min,A组小鼠的血乳酸含量又显著高于B组（P〈0.05）。结论频谱水对SPF级KM小鼠抗疲劳有一定的作用,但不具有统计学意义。     

应用微卫星技术对KM小鼠种子群体遗传质量进行比较分析

目的 应用微卫星技术在2013年和2020年对同一个KM小鼠种子群体进行遗传质量检测和分析。方法 2013年和2020年分别提取30只KM小鼠DNA,应用30个微卫星标记进行PCR扩增,基因测序后计算等位基因数、杂合度和多态信息含量等参数。结果 2013年该群体有95个等位基因,平均杂合度为0.4864,平均多态信息含量(PIC)为0.4418。2020年该群体有122个等位基因,平均杂合度分别为0.5150,平均多态信息含量(PIC)分别为0.4818。结论 KM小鼠种子群体具有良好的遗传稳定性和多样性,符合封闭群动物的群体遗传概貌特征。     

应用微卫星标记研究Dunkin Hartley豚鼠封闭群的遗传背景

目的检测我国现有Dunkin Hartley豚鼠封闭的遗传背景,分析评估其遗传多样性水平和遗传分离情况,为建立标准化的豚鼠封闭群监测方法提供基础资料。方法应用筛选获得的8个微卫星位点,从一个数量为1000的豚鼠封闭群中随机选择72个个体,通过PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法,进行等位基因检测。并根据检测结果分析评估了该豚鼠封闭群的遗传现状。结果共检测到28个等位基因,每个座位的等位基因数为2～5个,有效等位基因数为1.5191～3.4422,平均2.3093。平均期望杂合度为0.5294。各位点多态信息含量在0.3154～0.6545之间,平均值为0.4687。有5个位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡。结论豚鼠封闭群的遗传多态性处于中等水平,遗传平衡检测结果提示种群的繁殖过程未能实现完全随机交配,近交现象一定程度上存在。本研究的结果将为豚鼠封闭群遗传监测方法和标准的建立提供基础。     

封闭群斑马鱼的STR遗传检测技术

目的以AB、LF、ST（本地短尾,short tail）三个封闭群斑马鱼的基因组DNA为主要研究对象,采用STR（short tandem repeat）引物扩增方法分析不同种群在核酸水平的异同。方法利用5对斑马鱼STR引物和3对剑尾鱼STR引物,优化PCR条件,对不同种群斑马鱼DNA进行扩增。结果Z24、Z9384、Z10508、Z20046这4对引物可扩增出稳定条带。除Z24的3对STR引物在群内和群间均表现出多态性。对扩增不同带型进行统计分析,Z20046群间差异显著（P〈0.01）,Z9384有群间差异（P〈0.05）,Z10508扩增结果无统计学差异（P〉0.05）。结论鉴于该方法操作简便,通过进一步研究,可为封闭群斑马鱼的遗传质量评价打下基础。     

金黄地鼠封闭群SPF化后的微卫星遗传学检测

目的检测和评估金黄地鼠封闭群SPF化后的遗传学变化,为SPF金黄地鼠遗传质量的控制提供技术资料。方法应用小鼠和大鼠的微卫星标记筛选适于金黄地鼠遗传检测的微卫星标记,并结合微卫星荧光标记-半自动基因分型技术,对成都生物制品研究所的SPF级金黄地鼠及其来源的普通级金黄地鼠进行遗传检测,计算其群体遗传学参数。结果对18个小鼠和6个大鼠微卫星标记进行了筛选,分别有2个小鼠和2个大鼠微卫星标记在金黄地鼠种群中具PCR扩增多态性。4个检测的微卫星位点在普通级金黄地鼠和SPF金黄地鼠种群分别发现25和20个等位基因,两群体的期望杂合度分别为0.4979和0.5048,其群体遗传多样性无显著差异;群体间的不同微卫星位点FST范围从0.0095到0.0367,平均为0.0315,表明两群体间的遗传分化很弱,其遗传多样性主要存在于群体内;Nei(1972)遗传距离和Nei(1978)无偏遗传距离分别为0.0678和0.0570,表明了2群体之间很高的遗传相似度和非常近的亲缘关系;Hardy-Weinberg平衡检验表明普通级和SPF金黄地鼠分别有2个和3个位点偏离遗传平衡,且偏离位点均表现为杂合子缺陷。结论该SPF金黄地鼠基本保持了其来源普通级黄地鼠的遗传多样性,两群体间遗传分化程度和遗传差异很小,但应进一步加强其封闭群的繁育控制,保持其遗传稳定性。     

SPF级KM小鼠与BALB/c小鼠肠道总菌多样性的比较

目的分析SPF级封闭群KM小鼠及近交系BALB/c小鼠的肠道菌群总菌多样性,比较两个不同遗传背景肠道总菌的丰富度、Shannon-Wiener指数和均匀度。方法收集SPF级KM小鼠和BALB/c小鼠新鲜粪便,提取粪便总菌DNA,用基于细菌16S rDNA序列的变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)分析粪便总菌多样性。结果 SPF级KM小鼠及BALB/c小鼠粪便总菌多样性差异无统计学意义(P0.05),品系内不同性别之间粪便总菌多样性差异亦无统计学意义(P0.05)。结论选择SPF级小鼠进行微生态学相关研究时,封闭群KM小鼠及近交系BALB/c小鼠均可作为选择对象,同时可忽略菌群的性别差异。     

父系遗传背景对小鼠体细胞核移植效率的影响

为了评价父系遗传背景对小鼠体细胞核移植效率的影响,本试验用129/Sv小鼠、C3H小鼠和ICR的雄鼠分别与昆明雌鼠(KM)杂交的F1代为研究对象,以KM自交鼠F1代为对照,比较卵母细胞的可操作性以及重构胚的激活率、卵裂率和囊胚发育率。结果显示:129/Sv×KM、C3H×KM和KM×KM的去核效率显著高于ICR×KM(78.0%、82.9%、81.0%vs63.9%;P<0.05);129/Sv×KM的注核成功率显著高于C3H×KM、ICR×KM和KM×KM(83.0%vs59.6%、55.5%、71.4%;P<0.05);129/Sv×KM的重构胚激活率显著高于C3H×KM、ICR×KM和KM×KM(97.3%vs85.2%、81.7%、78.3%;P<0.05);C3H×KM的卵裂率和囊胚率显著高于ICR×KM和KM×KM(84.5%、28.2%vs63.2%、11.4%,64.5%、16.5%;P<0.05)。研究表明129/Sv、C3H和ICR3个品系父系遗传背景影响小鼠体细胞核移植效率,其中C3H父系遗传背景的卵母细胞可提高体细胞核移植效率。     

遗传背景对小鼠四倍体胚胎发育的影响

不同遗传背景的小鼠2-细胞期胚胎经过电融合后,胚胎的融合效率和四倍体胚胎的发育能力存在着一定的差异。本试验采用C57(C57×C57)、ICR(ICR×ICR)、BALB/c(BALB/c×BALB/c)、B6D2F2(B6D2F1×B6D2F1)、B6C3D2F2(B6C3F1×B6D2F1)品系的二倍体2-细胞期胚胎在相同的条件下经过电融合处理,结果表明:小鼠四倍体胚胎的获得效率受小鼠遗传背景的影响,远交系小鼠胚胎B6D2F2和B6C3D2F2的融合率显著高于近交系C57,ICR和BALB/c(P<0.05);四倍体胚胎在体外的发育情况也受其遗传背景的影响,在桑椹胚发育率和囊胚发育率上B6D2F2和B6C3D2F2品系的四倍体胚胎都显著高于C57和BALB/c品系的四倍体胚胎(P<0.05);杂合和纯系遗传背景的小鼠四倍体胚胎囊胚细胞数目相比具有显著差异(P<0.05或P<0.01);不同遗传背景的小鼠四倍体胚胎着床率间不存在显著差异(P>0.05);杂合背景的小鼠四倍体胚胎得到5只发育至13.5dpc(dayspostcoitum,dpc)的胎儿,纯合背景的小鼠四倍体胚胎得到0只发育至11dpc的胎儿。     

频谱水对SPF级KM小鼠抗疲劳作用的实验研究

目的探讨频谱水对SPF级KM小鼠的抗疲劳作用。方法将75只雄性SPF级KM小鼠随机地分成3组,分别给予3种不同的实验处理,30 d后测定受试小鼠负重游泳时间、血清尿素、肝糖原和血乳酸含量,并进行统计学分析。结果统计分析结果显示：（1）负重游泳致死时间和肝糖原含量,A、B、C 3组之间差异不显著（p〉0.05）;（2）A组的血清尿素含量显著高于B组和C组（P〈0.01）,但B组和C组之间差异不显著（P〉0.05）;（3）在3个时间点分别测定各组小鼠血中乳酸含量,     

多个SPF鸡品系的RAPD分析

目的用RAPD方法分析三个品系SPF鸡的遗传变异,以指导SPF鸡群的育种工作.方法对三个SPF鸡品系F、M及B系和对照H纯系分别采血样30个,等量混匀为三个混合样,提取DNA,筛选随机引物,优化反应体系后进行PCR扩增,计算品系内平均相似系数,根据品系间遗传距离进行聚类分析并绘制树状聚类图.结果60个随机引物中有13个产生清晰稳定的多态条带,B系品系内平均相似系数为0.903,F系和M系分别为0.673和0.755,H系为0.968;聚类分析的结果是每个品系的三个样品先聚为一类,然后F系与M系、B系与对照H系分别聚为一类.结论F系和M系的纯合程度均较低,而B系较高;F系与M系的遗传距离较近,而与B系之间距离较远,三者亲缘关系以F系与M系较近,这与各个品系的引种背景相一致.     

Genetic background modifies amyloidosis in a mouse model of ATTR neuropathy

Penetrance and age of onset of ATTRV30M amyloidotic neuropathy varies significantly among different populations. This variability has been attributed to both genetic and environmental modifiers. We studied the effect of genetic background on phenotype in two lines of transgenic mice bearing the same ATTRV30M transgene. Amyloid deposition, transthyretin (TTR), megalin, clusterin and disease markers of endoplasmic reticulum stress, the ubiquitin-proteasome system, apoptosis, and complement activation were assessed with WB and immunohistochemistry in donor and recipient tissue. Our results indicate that genetic background modulates amyloid deposition by influencing TTR handling in recipient tissue and may partly account for the marked variability in penetrance observed in various world populations.     

应用微卫星标DNA记对三个封闭群兔遗传分析

目的检测国内Et本大耳白兔、青紫蓝兔、新西兰白兔的遗传背景及遗传结构,为封闭群兔遗传检测方法建立和标准化提供基础资料。方法应用18个微卫星标记及荧光标记一半自动基因分型技术对三个群体95个个体进行Hardy．Weinberg检测,统计每个位点等位基因频率、杂合度、F值、遗传距离等信息。结果三个种群平均等位基因观测数为3．167、4．556、3．444,平均观测杂合度为0．444、0．5230、0．4976。18个位点平均多态信息含量（PIC）为0．410、0．549、0．470,日本大耳白兔6个位点HWE检验（P〈0．05）,显著偏离Hardy—Weinberg平衡,并在Satl3,INRCCDDV0088位点基因型完全纯和,新西兰白兔和青紫蓝兔分别有2个位点显著偏离Hardy—Weinberg平衡。三个种群遗传距离：青紫蓝兔与新西兰白兔遗传距离最近,为0．124,与日本大耳白兔遗传关系最远,为0．320;新西兰白兔与日本大耳白兔较远,为0：10。结论三个种群有各自不同遗传特征,遗传多样性较高,种群间分化明显。个别位点偏离遗传平衡,推测人工繁育过程中存在一定问题。     

丁酸梭菌影响肠炎沙门氏菌对SPF小鼠致病性的作用

【目的】旨在探究丁酸梭菌影响肠炎沙门氏菌(CVCC3377)对SPF小鼠的致病性及对小鼠的保护作用。【方法】选用72只6周龄SPF级雌性C57BL/6小鼠,按照完全随机区组设计分为阴性对照(CON)、饲喂丁酸梭菌组(CB)、沙门氏菌感染组(SE)和丁酸梭菌保护组(CB+SE)4组,每组18只。CON组和SE组饲喂基础日粮和饮水,CB组和CB+SE组饲喂基础日粮和每天更换添加丁酸梭菌(1×10⁷CFU/mL)的饮水,连续饲喂一周;第8天进行肠炎沙门氏菌感染实验,分别对SE组和CB+SE组灌服0.2mL 1.1×10⁴CFU/只的肠炎沙门氏菌,同时对阴性对照组和丁酸梭菌组灌服0.2mL生理盐水。在感染后第6天处死小鼠并采集肝脏、脾脏和盲肠及内容物样品。采用H.E染色检测肝脏和脾脏组织的病理学变化,免疫组化检测脾脏组织中TLR4、MyD88蛋白的表达水平,荧光定量PCR检测盲肠组织中TNF-α和IL-6的表达水平,并通过高通量测序方法分析其对肠道菌群的影响。【结果】结果显示,丁酸梭菌能够缓解肠炎沙门氏菌感染引起的小鼠体重下降;H.E染色结果显示,丁...     

The impact of genetic background and Bid on the phenotype of Bcl-2-deficiency in mice

How a central apoptosis mechanism could be modulated during a specific developmental or homeostatic process to comply with the specific needs of a particular tissue is poorly understood. Bcl-2 is a key anti-apoptosis regulator and its deletion resulted in multiple defects in mice, indicating its broad involvement in development and homeostasis of various tissues. We found that the severity and extensiveness of the defects could be greatly influenced by the genetic background of the mice. Hence, Bcl-2-deficient mice predominantly on C57BL/6 background had the most severe presentation with increased embryonic lethality, whereas Bcl-2-deficient mice predominantly on 129/SvJ background had a significantly minor phenotype. In particular, the 129/SvJ background could almost completely rescue the polycystic kidney disease phenotype of the Bcl-2 deficiency, resulting in normal renal functions. These observations would be consistent with the assumption that the C57BL/6 background is more pro-death while the 129/SvJ background is more pro-survival. Concurrent deletion of Bid, a BH3-only molecule, in either genetic background, could significantly increase the birth rate of the Bcl-2 deficient progenies and lessen lymphocytopenia, although the double knockout mice still developed the polycystic kidney diseases. Overall, our work indicates that the phenotype of Bcl-2 deficiency can be affected by multiple genetic elements, resulting in tissue-specific modulations of the cell death program during development and cellular homeostasis.     

Genetic diversity of two endemic and endangered Plantago species

Plantago algarbiensis and Plantago almogravensis are two endangered and endemic species from Portugal. Due to the rarity and endangered nature of these species as well as the lack of molecular data, their genetic variation was evaluated using ISSR and RAPD markers. P. algarbiensis species showed higher genetic variability (73.9% of polymorphism) than P. almogravensis (61.2%). The two species revealed a high level of genetic diversity, with a Nei's genetic diversity of 0.1965 and 0.2309 and a Shannon's diversity index of 0.2975 and 0.3520, for P. almogravensis and P. algarbiensis, respectively. A low level of genetic differentiation was observed (Gst = 0.1873) among the species. However, the cluster and PCA analyses, based on genetic similarity, revealed two main, clearly separate clusters, which directly corresponded to the plants isolated from each species. In situ and ex situ measures should be applied in order to preserve both species but, based on these results, P. almogravensis population should be a priority for conservation.     

Effects of flanking genes on the phenotypes of mice deficient in basigin/CD147

The induction of null mutations by means of homologous recombination is a powerful technique for clarifying the biological activities of target genes. However, the problems of the genetic background and flanking genes should be borne in mind. Here we employed a breeding strategy to compare three lines of mice deficient in the basigin (Bsg)/CD147 gene. The first line was F2 from F1 hybrid offspring of the 129/SV chimera and C57BL/6J. The second one was from a C57BL/6J congenic line. Both lines showed high embryonic lethality, sterility, and blindness. The third one was 'reverse F2' from 'reverse F1' hybrid offspring of the C57BL/6J congenic line and 129/SV. Surprisingly, this line showed a normal birth rate, while sterility and blindness persisted. Our results clearly separate the effects of the induced null mutation from those of flanking genes and the genetic background, and provide a useful means of investigating the biological functions of Bsg.     

常见SPF级小鼠和大鼠肠道菌群多样性研究

目的研究常见SPF级小鼠和大鼠的肠道菌群多样性。方法分别采集广东地区三家实验动物生产单位的C57BL/6、ICR、BALB/c小鼠和Wistar、SD大鼠的盲肠内容物样品,用细菌16S rDNA通用引物扩增V4-V5区域,采用Illumina Miseq 2×300 bp测序平台进行测序,使用生物信息学方法进行微生物群落分析、Alpha多样性分析与Beta多样性分析。结果对序列去杂优化后OTU聚类分析,稀释性曲线说明本次测序的数据量合理;实验小鼠和大鼠肠道菌群共分成八个门,其中拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)占据主要地位,属水平上主要是拟杆菌属(Bacteroides)、Hungatella、副杆状菌属(Parabacteroides)、乳酸杆菌属(Lactobacillus)等;样品间差异性分析显示相同设施来源动物的菌群组成相似性较高;Alpha分析结果显示来源于同种设施的动物物种丰富度相近;Beta分析显示相同设施动物的肠道菌群差异较小,但品系对肠道菌群差异性有所影响。结论不同来源设施的饲养环境是动物肠道菌群多样性的主要影响因素,不同品系对肠道菌群多样性有一定影响。