四面体分子模型的寡聚蛋白结合配位体的协同现象

四面体模型的寡聚蛋白结合配位体的协同现象,已用文献[2]给出的统计力学方法研究,通过包括次最近邻相互作用项的Hamiltonian,导出饱和曲线公式。在特定的诱致吻合条件下,与Koshland 的结果。一致引入协同性强弱的概念,通过相关函数得到协同性强弱的计算方法。讨论了协同现象与相变的类似方法。     

中国城市生态与经济社会协同性评估

为认识城市经济社会和生态的协同特征,本研究基于城市人均绿地面积、人均GDP和人均期望寿命等构建城市生态与经济社会功能协同性指标评价体系,建立城市生态与经济社会协同性指数评价方法。通过比较中国35个典型城市的协同性指数与功能综合得分,分析了中国城市协同性特征,并按照城市规模、行政区类型分析城市协同性差异和城市功能综合得分差异,对协同水平进行分类。结果表明: 2016年,中国35个城市生态与经济社会平均协同性指数为28.79,协同性最强城市的协同性指数为3.83,最弱的城市为63.04,表明中国城市协同性不高且城市间差异较大。协同性指数、城市经济功能、社会功能与城市人口规模、经济规模呈显著正相关。不同人口规模、经济规模、不同行政职能城市之间协同性指数差异具有显著性。中国城市化总体仍处于功能失衡的发展阶段,城市发展有利于各城市功能性提高但并未有效提升协同性,生态功能的高低显著影响城市协同性,城市生态功能不高是当前中国城市协同性高低的主要制约因素。     

真核基因转录激活的多位点协同调控

真核基因的转录激活具有协同性的特征,表现为多个转录调控位点的共同作用效果大于每个位点单独作用之和,受多个位点调控的基因转录呈S型曲线.多个激活蛋白之间的相互作用、激活蛋白与各DNA位点的协同结合以及激活蛋白与转录机器的协同作用,三种途径都对协同性转录激活行为产生影响.协同性转录激活的本质是多个结合在调控位点上的激活蛋白之间直接或间接的相互作用.多位点的协同转录调控机制有助于理解生物的多种调控过程和建立基因调控网络.     

寡聚蛋白结合配位体的研究——统计力学模型 Ⅰ.等同配位体的效应

这篇论文推广了一维Ising 模型,用来研究寡聚蛋白结合配位体的现象,不象单一自旋变量的Ising 模型,这里用一对自旋变量(σ、μ)来描述粒子(蛋白质亚基)的状态,构造出4×4矩阵。对于等同配位体的相互作用,以纯矩阵代数方法,得到饱和曲线,分子构象-配位体曲线以及某些关连函数等等。熟知的协同模型与序列理论模型皆作为特例包括于此统计力学模型内,模型不受亚基的全同性与非全同性及其数目所限制。最后,讨论了正负协同性的问题。     

半胱氨酸氧化还原状态的协同性

以2002年4月份的Culled Protein Data Bank数据库中的639条蛋白质多肽链为研究对象,统计分析了其含有的584条二硫键的形成特征,发现半胱氨酸氧化还原状态表现出明显的协同性现象：含有二硫键的蛋白质中几乎所有的半胱氨酸都以氧化态形式存在。这一协同性可以通过蛋白质全局水平上的20种氨基酸组分的百分含量很好地加以说明,由此来预测半胱氨酸的氧化还原状态准确率最高可达84．5％。结果表明半胱氨酸是否形成二硫键主要取决于蛋白质全局的而非局部的结构信息。     

MicroRNA基因簇的多样性与进化

microRNA（miRNA）基因簇是一类miRNA基因在染色体上成簇排列形成的基因群.在动植物基因组中,已发现存在大量簇生排列的miRNA基因.然而这种簇生排列方式所具有的功能意义尚不完全清楚.miRNA基因簇常位于一个多顺反子内,通过共表达在胚胎发育、细胞周期和细胞分化等诸多方面发挥协同调控的功能.基于近些年来的研究进展,本文综述了miRNA基因簇在动物染色体上分布的多样性,表达与功能的协同性,以及重复和转座介导下miRNA基因簇产生与消亡的适应性进化过程.     

缺氧对大鼠大脑皮质细胞色素氧化酶亚基Ⅰ、Ⅳ表达协同性的影响

本文探讨缺氧对细胞色素氧化酶（cytochrome oxidase,COX,即complexⅣ）的mtDNA和nDNA编码亚基Ⅰ,Ⅳ表达及其协同性的影响。实验用成年雄性Wistar大鼠随机分为对照组,缺氧2,5,15和30d组,缺氧大鼠于低压舱内模拟海拔5000m连续减压,对照组大鼠于舱外同时喂养（舱外海拔高度为300m)。用半定量逆转录-PCR法测定大脑皮质COXⅠ,ⅣmRNA量,用Western blot分析大脑皮质线粒体COXⅠ,Ⅳ蛋白量,以两个亚基的蛋白量,mRNA量的比值反映亚基表达的协同性,结果显示,缺氧2,5d,COXⅠmRNA增加,缺氧15,30d时下降至对照水平,缺氧2,5和15d时,COXⅣmRNA显著增加,缺氧30d时降低,与对照组差异非常显著。COXⅣ,ⅠmRNA比值在缺氧15d时最高,其它各缺氧组与对照组的差异无显著意义。各组COXⅠ,Ⅳ蛋白量及其比值均无显著差异。上述结果表明,缺氧可影响COXⅠ,ⅣmRNA的表达及其协同性,但对蛋白的表达及其协同性没有显著影响,提示转录后调节是缺氧过程中线粒体内COXⅠ,Ⅳ蛋白表达协同的主要机制。     

新城疫病毒3种检测方法的研究比较

目的:利用3种方法对新城疫(Newcastle disease virus, NDV)病毒进行检测并对这3种检测方法的优缺点做出比较。方法:分别将NDV强毒F48E9和弱毒Lasota接种SPF鸡胚后,获取尿囊液。利用双抗夹心ELISA法、悬液芯片系统以及RT-PCR进行检测。通过对制备的针对新城疫病毒的抗体4D9和6C4蛋白浓度测定后,选择6C4进行生物素标记,将4D9作为固相捕获抗体,利用生物素-链霉亲和素放大系统构建双抗夹心检测体系。通过对Genebank上已发表的新城疫强弱毒F基因进行电脑分析后,设计一组针对NDV强弱毒的通用型引物,分别对强弱毒进行RT-PCR并检测其检出限。结果:ELISA法对NDV强弱毒尿囊液的检出灵敏度为1:160,但操作繁琐,耗时长;液相芯片对强弱毒尿囊液的检出限为1:160和1:320,然而和ELISA相比,操作较为方便,但仪器设备昂贵。RT-PCR对强弱毒RNA检出限分别为259pg和14pg,与前两种方法相比,PR-PCR在核酸水平上对病毒进行检测,理论上灵敏度较高,但是所需试剂、设备昂贵,且实验人员还需一定的技能培训。     

放牧对草地生态系统服务和功能权衡关系的影响

内蒙古草原是我国北方的重要生态屏障和绿色畜牧业基地, 放牧是草原生态系统的主要利用和管理方式, 在放牧管理中充分发挥生态系统某一项或几项服务和功能最大利用价值时, 往往会与其他服务(功能)发生冲突, 需要权衡多项生态系统服务和功能, 制定合理的放牧管理制度。该研究以内蒙古锡林郭勒典型草原为例, 通过设置不放牧、轻度放牧、中度放牧以及重度放牧的放牧梯度, 从多项生态系统服务和功能权衡的角度比较了最适放牧管理强度。结果显示, 在放牧管理的草地生态系统服务和功能的权衡中, 权衡、协同、不相关关系同时存在, 如土壤呼吸速率与植物群落净生长量、生物多样性与植物群落净光合速率表现为权衡关系, 植物群落净生长量分别与土壤含水量、植物群落净光合速率及草地蒸散速率存在协同关系, 土壤有机碳含量与其他服务或功能间呈不相关关系; 放牧能不同程度地削弱多项生态系统服务及功能间的权衡关系(冲突对立关系); 中度放牧条件下的多项生态系统服务及功能的协同性最佳。     

放牧对草地生态系统服务和功能权衡关系的影响

内蒙古草原是我国北方的重要生态屏障和绿色畜牧业基地,放牧是草原生态系统的主要利用和管理方式,在放牧管理中充分发挥生态系统某一项或几项服务和功能最大利用价值时,往往会与其他服务(功能)发生冲突,需要权衡多项生态系统服务和功能,制定合理的放牧管理制度。该研究以内蒙古锡林郭勒典型草原为例,通过设置不放牧、轻度放牧、中度放牧以及重度放牧的放牧梯度,从多项生态系统服务和功能权衡的角度比较了最适放牧管理强度。结果显示,在放牧管理的草地生态系统服务和功能的权衡中,权衡、协同、不相关关系同时存在,如土壤呼吸速率与植物群落净生长量、生物多样性与植物群落净光合速率表现为权衡关系,植物群落净生长量分别与土壤含水量、植物群落净光合速率及草地蒸散速率存在协同关系,土壤有机碳含量与其他服务或功能间呈不相关关系;放牧能不同程度地削弱多项生态系统服务及功能间的权衡关系(冲突对立关系);中度放牧条件下的多项生态系统服务及功能的协同性最佳。     

红树林植物叶片形态和解剖特征对叶肉导度、叶片导水率的影响

叶肉导度和叶片导水率是影响光合作用的两个重要过程,叶肉导度通过影响从气孔下腔到Rubisco酶位点的二氧化碳浓度梯度直接影响光合作用,而叶片导水率则通过影响水分供应或气孔行为来影响光合作用,然而对这两个生理过程之间的协同性研究较少。本研究选择9种红树林植物为研究对象,探讨盐生环境下植物叶肉导度和叶片导水率的协同性及其与叶片解剖结构特征之间的相关性。结果表明,9种红树林植物叶片导水率(0.78~5.83 mmol·m~(-2)·s~(-1)·MPa-1)、叶肉导度(0.06~0.36 mol·m~(-2)·s~(-1))、最大光合速率(7.23~23.71μmol·m~(-2)·s~(-1))等特征的差别较大;叶肉导度与最大光合速率呈显著正相关,而与比叶重无显著相关性,其原因是由于比叶重与叶片厚度、叶片密度不存在相关性;叶脉密度与气孔密度呈较强的相关性,说明红树林植物叶片水分运输与散失相关的叶片结构之间存在协同关系;叶片导水率不受叶脉密度影响,并且与叶肉导度、最大光合速率也不存在相关性,这很可能与红树林植物叶片的肉质化、有发达的储水组织有关,体现了红树林植物叶片结构和功能的特殊性。     

植物磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的研究——Ⅱ.高粱叶片PEP羧化酶的代谢物调节特性和油酸抑制效应

本文报导高粱叶片的PEP羧化酶与一些代谢物相互作用的动力学特性。MgCl_2对不同PEP羧化酶同工酶表现程度不同的负协同性,Hill系数分别为0`86(PC Ⅰ)和0.47(PCⅡ)。PEP的饱和曲线呈S型。Hill系数为2.4,表现为正协同性。在不同浓度的G6P存在下,曲线的S型特性消失,Hill系数下降至1。而在不同浓度甘氨酸存在下负协同程度逐步增强,Hill系数为0.72。测定不同浓度G6P对酶活化程度的影响结果表明高浓度G6P(10 mM以上)活化程度反而下降,同时加入低浓度的甘氨酸(0.1～5 mM)能减缓高浓度G6P活化作用下降的程度。上述结果表明Mg~( )和PEP不仅作为底物或辅因子参与反应而且以同位协同的方式调节酶构象的变化,G6P和gly活化酶的作用类型是不同的。低浓度油酸(5～50 μM)对酶有强烈的抑制效应。高浓度Mg~( )不能解除其对酶的抑制。不同材料的酶对油酸反应不同。使高梁叶片PC Ⅰ活性完全抑制的油酸浓度(100 μM),对PCⅡ和小麦的PEP羧化酶活性几乎没有多大影响,表明油酸对高梁光合型PEP羧化酶的选择性抑制与Mg~( )的螯合作用无关。酶先后与Mg~( )或油酸预保温试验结果表明油酸可能作用于Mg~( )在酶蛋白上的调节位置。     

His-tag的人胞浆磷脂酶A_2的C2结构域的表达、纯化及性质

带有His tag的人胞浆磷脂酶A2 的C2结构域高效表达 ,用内源荧光的变化测定了其稳定性和其与钙离子结合的结合常数 .结果表明 ,带有His tag的C2结构域仍可有效用于研究其折叠及其与钙离子的协同性结合 ,温度从 2 2℃升高到 35℃时 ,C2结构域和钙离子结合的协同性程度显著增强 .     

渭北旱原农业生态区划及农业生产合理结构的初步研究

本文通过分析渭北旱原的农业生态条件和农业生态系统的特点,用生态学的观点和方法,根据区域分异原则,自然地理环境结构一致性原则、农业生态系统功能协同性原则,农业生产结构一致性原则和保持发展与环境统一性原则,对渭北早原进行了农业生态区划。提出了各生态区综合治理的途径与措施,以及农业生产合理结构的模式,以便建立良好而稳定的农业生态系统。     

硝酸还原酶的研究——Ⅳ.NADH对小麦硝酸还原酶的钝化作用

不同浓度的NADH(0.5～4mM)与硝酸还原酶(NR)在不同温度下(0～20℃)一起预保温,均可看到NADH对NR的钝化作用。KCN也抑制NR活性。NADH和KCN同时存在能强烈地协同钝化NR。连二亚硫酸钠也能与KCN协同钝化NR。这种协同钝化作用可被铁氰化钾逆转。在亲合层析纯化的NR上可看到同样的可逆钝化现象,表明NR的氧化还原状态调节NR的活性。     

昆虫变态的激素与基因调控

昆虫变态是一个有趣而复杂的生物学现象,有不完全变态和完全变态。昆虫通过变态获得飞翔与生殖能力,扩大了生活范围,增强了适应能力。昆虫变态主要由咽侧体分泌的保幼激素和前胸腺分泌的蜕皮激素协同调控,众多基因参与。本文综合近几年的研究进展,重点介绍昆虫变态过程中保幼激素与蜕皮激素通过级联反应基因和microRNA调控的机制,以及保幼激素和蜕皮激素的合成调节机制。     

小杜鹃对小鳞胸鹪鹛的巢寄生

鸟类的巢寄生现象一直被作为生物协同演化的典型模式系统之一。对杜鹃选择宿主及其巢寄生情况进行调查和观测,能够为协同演化研究提供重要基础资料。2015年7月,我们在四川省雷波县发现一个被杜鹃寄生的鸟巢。通过野外观测和分子生物学检测,确定宿主为小鳞胸鹪鹛(Pnoepyga pusilla),而寄生者为小杜鹃(Cuculus poliocephalus)。     

产超广谱β-内酰胺酶菌株检测方法的探讨

目的提高产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)细菌的检出率,以利于对产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)监控和治疗。方法采用NCCLS推荐的确认法和非NCCLS推荐的双纸片协同法进行试验。结果头孢他啶(CAZ)-克拉维酸(clav)对产ESBLs大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌确认率分别为64．7％(11／17)、42．8％(3／7);头孢噻肟(CTX)-克拉维酸对其确认率分别为76．4％(13／7),克拉维酸对其确认率为71．4％(5／7)。CAZ、CTX与阿莫西林-克拉维酸(Amc／clav)纸片边缘间距为15mm、20mm和25mm,出现协同现象率分别为100％、100％;70％、80％;30％、40％。结论确认试验中CT优于CAZ;双纸片协同试验中纸片边缘之间距离为15mm,协同现象检出率最高。     

以生活垃圾堆肥为基质的废弃物铺网草皮建植研究

以生活垃圾堆肥为基质,5种生活废弃物为铺网,对高羊茅、草地早熟禾及本特3种草坪植物的草皮培植与铺坪应用进行了研究.结果表明:(1)在草皮培植中,同种草坪植物在不同铺网草皮中的生长效应差异较大,其中早熟禾在草席与塑料纱网草皮中的综合性能表现较好;本特和高羊茅在竹席和草席中的表现较好.(2)草皮的刈割再生生长能力总体上与草皮培植时的生长状况密切相关,草种与基质、铺网间的协同性存在差异,生长协同性较好的草皮组合为早熟禾的草席草皮、本特的草席与塑料纱网草皮以及高羊茅的草席、纤维网袋与塑料纱网草皮.(3)5种生活废弃物铺网中,塑料薄膜在草皮培植中与各草种间的协同性均最差,其铺网草皮在铺坪应用中的再生生长能力也较差,可见塑料薄膜不适宜作为草皮铺网.     

秸秆降解菌的筛选及其纤维素降解性能的研究

通过秸秆粉平板、刚果红染色法以及小麦秸秆降解率来筛选高效秸秆降解菌,并测定菌株的胞外纤维素酶活来研究其秸秆纤维素的降解能力。结果表明,在所筛选的4株真菌中,菌株z-5的秸秆降解率最高,为47%;其次是菌株4-1、3-1和2-2,分别为45%、32%和31%,滤纸腐解实验结果与秸秆降解试验结果相似。4株秸秆降解菌均具有外切葡聚糖酶、内切葡聚糖酶和β-葡萄糖苷酶等3种纤维素酶,但变化趋势不同。菌株z-5和菌株4-1的三种酶活呈现出较好的协同性,菌株2-2和菌株3-1协同性较弱。通过秸秆粉平板,秸秆降解率测定以及滤纸孔洞法可以更准确快速地得到目的菌株;纤维素酶在秸秆降解中起着主导作用。