塔里木河流域发现河川沙塘鳢

2006年10月28日,作者在新疆阿拉尔市塔里木大学集贸市场采购到1尾活的属于塘鳢科小鱼;2007年6月15日,塔里木大学文理学院学生在新疆生产建设兵团农一师十二团八连(属阿拉尔市管辖)塔里木河灌溉沟渠中抓获一批小杂鱼,从中获得6尾与上述小鱼同样的鱼;     

河川沙塘鳢视觉器官的发育及其与摄食的关系

利用光学显微镜观察了河川沙塘鳢(Odontobutis potamophila)视觉器官的发育,并对其发育与摄食的关系进行了研究。河川沙塘鳢的眼囊起源于神经外胚层。当胚胎发育至心跳期时,眼囊内陷形成视杯;之后,视杯内表面的外胚层形成晶状体而与视杯分离,视杯进一步发育形成视网膜。随着胚胎的进一步发育,晶状体的直径增加,结构逐步发育完善。胚胎发育至眼黑色素出现期时,视网膜分化为6层,其中,外核层、内核层和神经节细胞层3个核层明显;胚胎发育至孵化前期时,视网膜已分化为10层。孵出后1d的仔鱼,其视网膜已能行使功能,仔鱼逐渐开口摄食。随着稚、幼鱼的发育,视网膜厚度进一步增加,结构发育完善。视网膜的结构和视觉特性显示河川沙塘鳢是要求光照条件好、白昼活动并具有较好视觉功能的鱼类。     

云斑尖塘鳢胚胎和早期仔鱼的发育

对云斑尖塘鳢(Oxyeleotris marmoratus)胚胎和早期仔鱼的发育进行了观察,详细描述了各发育阶段的形态特征。在28℃定水温条件下,云斑尖塘鳢的胚胎发育历时80h 30min,可分为24个发育分期。在整个发育过程中,眼、耳囊、心脏、消化道、肾脏、鳔、胸鳍和尾鳍等得到了优先发育。     

河川沙塘鳢孵化腺的发生及孵化酶的分泌

利用光学显微镜和扫描电镜观察了河川沙塘鳢Odontobutis potamophila(Gnther)孵化腺的发生及孵化酶的分泌过程。河川沙塘鳢的孵化腺为单层细胞腺体,发生于外胚层。孵化腺(Hatching gland,HG)最早发生自眼晶体形成期的胚胎,初发生时孵化腺细胞(Hatching gland cells,HGCs)分布于头部腹面及其与卵黄囊连接处。随着胚胎的发育,HG仍以单层细胞分布于胚体和卵黄囊的外表面,HGCs数量急剧增多,细胞体积增大,分布范围更加广泛。至眼黑色素出现期的胚胎,HGCs的数量达到大约900-1200个,广泛分布于胚胎头部两侧、头部腹面及其与卵黄囊连接处、卵黄囊的前腹面。HGCs大多呈椭圆形,短径为5-8μm,长径为7-12μm,在HE染色中呈粉红色。至孵化前期时,孵化酶颗粒自HGCs顶部的开口分泌出来,分泌颗粒呈圆球形,直径为0.5-1.0μm,有的以单体的形式存在,有的粘结成团。孵化酶进入卵周液,对卵膜内层进行消化和降解,使胚胎破膜而出。孵化后2d,HGCs便从表皮中消失。     

苯并(a)芘与壬基酚对河川沙塘鳢的联合毒性研究

为探究环境内分泌干扰物联合毒性对鱼类的影响,选取苯并芘(benzo[a]pyrene,BaP)及千幕酚(4-nonlyphenol,NP)对河川沙塘鳢Odontobutis potamophila进行单独和联合毒性研究.研究了NP和BaP对河川沙塘鳢血清雌二醇(E2)、卵黄蛋白原(Vtg)、血清谷草转氨酶(GOT)以及肝脏7-乙氧基-3-异吩咏唑酮-脱乙基酶(7-ethoxyresoufin-O-deethylase,EROD)和超氧化物岐化酶(SOD)的影响.结果 表明,BaP单一暴露时,随着BaP剂量浓度的升高雌鱼血清E2含量下降,肝脏EROD活性升高;25 mg/kg BaP试验组雌鱼肝脏EROD活性显著高十对照组;肝脏SOD和血清GOT活性与对照无筹异;NP和BaP联合暴露中,200 mg/kg NP+10 mg/kg BaP、200 mg/kg NP+2 mg/kg BaP试验组雄性个体血清Vtg平均含量比200 mg/kg NP组低50%左右,而血清E2含最显著高于对照组,肝脏EROD酶活性、血清GOT活性变化与BaP剂量浓度呈正相关,而肝脏SOD酶活性则与BaP剂量浓度呈负相关;200 mg/kg NP+25 mg/kg BaP试验组肝脏SOD活性显著低于对照组,而血清GOT活性则显著高于对照组.显示NP和BaP联合作用时BaP可拮抗NP对雄鱼Vtg的诱导效应;200 mg/kg NP+2 mg/kg BaP可导致河川沙塘鳢肝脏肝细胞损伤.     

河鲈胚胎及卵黄囊期仔鱼发育

为探究河鲈(Perca fluviatilis)早期生活史和发育生物学,采用体视解剖镜、显微镜仔细观察、测量、描述、绘图的方法,连续观察了6个批次河鲈胚胎及卵黄囊期仔鱼发育状况,进行比较分析。结果显示:(1)在水温8~13℃时,胚胎期约需265h,有效积温2540~2880℃.h;水温11~13℃时,卵黄囊期约需6d,有效积温1750~2120℃.h;(2)辐射状次级卵膜将受精卵连成长带形单层网片状,每个胚胎周围有6个胚胎,排列很有规则。胚胎卵黄囊表面有一个大圆形油球。出膜前期可见眼球色素、胸鳍突起;(3)胚胎出膜的不同步主要是由于出膜前期长短不一和孵化水温较低所致。     

线纹尖塘鳢仔、稚鱼的形态发育

对池养条件下线纹尖塘鳢(Oxyeleotris lineolatus)的胚后发育进行定期观察,胚后发育大致可分为前期仔鱼、后期仔鱼、稚鱼和幼成鱼期。观察发现,线纹尖塘鳢的初孵仔鱼个体较小,仅2.875mm,前期仔鱼,包括混合营养仔鱼期,时间短,仅为5d,属较早建立起外源性营养摄食机制的鱼类;器官发育主要在后期仔鱼阶段完成;鳞的出现和鳞被形成在稚鱼发育阶段完成;在池塘自然水温26~30℃条件下,从初孵仔鱼到稚鱼发育期完成历时43~44d。     

云斑尖塘鳢仔鱼摄食节律的研究

对自然光照条件下云斑尖塘鳢仔鱼的昼夜摄食节律和在夜间增加不同强度外光源条件下仔鱼的摄食发生率进行了研究。结果表明,云斑尖塘鳢仔鱼具有明显的昼夜摄食节律,晚上摄食发生率是著高于白天,其摄食主要集中在光线较弱的16:00～00:00;5日龄仔鱼在100～500Lx,8日龄和12日龄仔鱼在10～100Lx光照条件下的摄食发生率要明显高于黑暗或更高光照条件下的摄食发生率。     

白斑狗鱼胚胎和仔鱼发育的研究

白斑狗鱼 (EscoxluciusLinnaeus) ,卵圆球形 ,呈金黄色 ,直径为 1.9— 2 .2mm ,具黏性。在 5— 11℃的温度下 ,受精卵历时 185h 18min发育后孵出 ,所需总积温为 2 6 4 1 37℃ ,胚胎发育可划分为 6个阶段 ,33个发育时期。初孵仔鱼全长 7 0— 7 7mm ,从孵出到各鳍形成需 2 1d。胚胎发育各期及仔鱼的主要形态特征均被描述     

河川沙塘鳢繁殖期与非繁殖期种群形态差异、雌雄个体差异及遗传多样性分析

本研究利用传统形态性状测量及框架性状分析方法研究了江苏省河川沙塘鳢繁殖期与非繁殖期种群形态特征及雌雄个体差异。结果显示，河川沙塘鳢存在形态特征的季节差异，繁殖期个体拥有相对较大的眼径、眼间距，推测与食物资源的季节性变化有关；另外，背鳍前距和胸鳍基长较长，可能因性腺发育饱满导致该时期个体腹腔容积变大。在两性特征中，两性异形指数为-0.013，表明雄鱼个体较大。雄性在尾柄高、尾鳍长等方面显著大于雌性，以此来增加竞争能力以及对后代的保护能力。雌性个体具有较大的腹腔容量，增加了繁殖输出，提高繁殖适合度。另外，本研究基于线粒体cyt b基因，84个个体共识别出17个单倍型，整体表现出具有较高的遗传多样性（h=0.892，π=0.508%），表明江苏省河川沙塘鳢群体存在丰富的线粒体DNA多态性。     

家蚕胚胎发育时期的蛋白质变化及构造分析

采用蛋白质双向电泳技术及蛋白质氨基酸序分析技术,从蛋白质水平研究了家蚕胚胎发育时期的基因表达情况。结果表明,从家蚕临界期胚胎直到点青期胚胎的较长一段时间内,蛋白质的双向电泳图变化不大,匹配蛋白质斑点率达６３．０％,卵特异性蛋白质,３０Ｋ蛋白质的含量很大。     

白点鲑胚胎与仔鱼发育

通过Bouin's液、5%的福尔马林、透明液固定和活体解剖观察等4种不同方法,对白点鲑(Salvelinus leucomaenis)胚胎和仔鱼发育进行了系统观察,描述了早期发育过程。白点鲑受精卵为端黄卵,沉性,橙黄色,呈圆球形。在水温3.40～8.89℃,受精卵历时1 944 h,经历6个阶段的胚胎发育破膜孵出仔鱼;初孵仔鱼全长(17.89±0.32)mm,破膜后73 d各鳍条发育完全,并出现"幼鲑斑",破膜后350d鱼体外部形态与成鱼基本相同。将白点鲑与几种鱼类进行了对比,并且探讨了其胚胎发育特点。经比较4种不同观察方法,Bouin's液固定后剥离卵膜观察是研究白点鲑等卵膜较厚鱼类的理想方法。     

中华绒螯蟹胚胎发育过程中主要生化成分的变化

中华绒螯蟹胚胎发育过程中三种主要生化成分中以蛋白质含量最高（44．56％－67．76％）,脂类次之（21．32％－34．07％）,碳水化合物含量最低（0．47％－3．03％）。从胚胎发育开始至结束,蛋白质降低了23．20％,脂类和碳水化合物均没有明显变化。结果表明,蛋白质是中华绒螯蟹胚胎发育过程中的主要能源物质。     

皮屑蛋白粉中氨基酸组成与评价

测定了用皮革工业下脚一皮屑蛋白粉中氨基酸含量,与常用动物蛋白源比较发现,皮屑蛋白是一种不完全蛋白质,其氨基酸组成很不平衡,但其限制性氨基酸,赖氨酸和蛋氨酸的含量与其他几种动物蛋白源具有互补性,使用时宜同其他动、植物蛋白源或单体氨基酸相配合,以提高其生物价。     

两种沼虾胚胎发育中可溶蛋白的组成及含量变化

采用生物化学方法测定了罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)、日本沼虾(M.japonicus)成熟卵细胞和胚胎发育时期可溶蛋白的组成及含量。结果显示,2种沼虾的可溶蛋白在组成和含量上体现了较高的相似特性。可溶蛋白的含量在胚胎发育过程中逐渐降低;在成熟卵细胞和胚胎期,可溶蛋白在组成上以89 ku和100 ku的卵黄磷蛋白(Vitellin,Vn)为主,同时还存在243 ku1、81 ku6、7 ku5、4 ku和31 ku等其他一些蛋白亚基。40 ku蛋白亚基仅出现在成熟卵细胞中,推测可能参与执行了特定的生殖功能。可溶蛋白随着胚胎的发育呈现出蛋白亚基经水解逐渐由大分子变成小分子的趋势。前状幼体期和状幼体期出现的74 ku蛋白亚基可能与其在胚胎后期发育的功能有关。可溶蛋白在不同物种胚胎发育时期不同的变化,显示了每个物种在卵黄蛋白的组成、利用以及组织结构蛋白的形成中各自的特点。     

基于氨基酸分类的基本氨基酸秩序的研究

在分析了基本氛基酸分类的基础上,提出基本氛基酸存在着一种参考排列秩序,以此固定的氛基酸排列秩序为参考标准,分析蛋白质一级结构相对此参考秩序的变化规律,能够找到构成蛋白质的二级结构的某些信息．     

SuccSite: Incorporating Amino Acid Composition and Informative k-spaced Amino Acid Pairs to Identify Protein Succinylation Sites

Protein succinylation is a biochemical reaction in which a succinyl group (-CO-CH2-CH2-CO-) is attached to the lysine residue of a protein molecule. Lysine succinylation plays important regulatory roles in living cells. However, studies in this field are limited by the difficulty in experimentally identifying the substrate site specificity of lysine succinylation. To facilitate this process, several tools have been proposed for the computational identification of succinylated lysine sites. In this study, we developed an approach to investigate the substrate specificity of lysine succinylated sites based on amino acid composition. Using experimentally verified lysine succinylated sites collected from public resources, the significant differences in position-specific amino acid composition between succinylated and non-succinylated sites were represented using the Two Sample Logo program. These findings enabled the adoption of an effective machine learning method, support vector machine, to train a predictive model with not only the amino acid composition, but also the composition of k-spaced amino acid pairs. After the selection of the best model using a ten-fold cross-validation approach, the selected model significantly outperformed existing tools based on an independent dataset manually extracted from published research articles. Finally, the selected model was used to develop a web-based tool, SuccSite, to aid the study of protein succinylation. Two proteins were used as case studies on the website to demonstrate the effective prediction of succinylation sites. We will regularly update SuccSite by integrating more experimental datasets. SuccSite is freely accessible at http://csb.cse.yzu.edu.tw/SuccSite/.     

根据蛋白质的氨基酸组成实现其快速鉴定

常规进行蛋白质鉴定的方法是测定其氨基酸顺序,它需要蛋白质顺序分析仪,对蛋白质的纯度要求高,费时和花费大,与之相比,蛋白质的氨基酸组成和分子量是容易实验测定的。本文描述了一个基于蛋白质的组成和分子量进行其快速鉴定的方法。其基本出发点是,通过统计蛋白质序列数据库中每个序列的氨基酸组成和分子量,得到一个含蛋白质长度、组成和分子量的数据库,将靶蛋白质的组成等数据与该数据库进行对比,可以检出组成和分子量与之接近的蛋白质。从而对该蛋白质进行初步鉴定。在有些情况下,甚至能相当准确地确定靶蛋白质与数据库中的某个（些）蛋白质相关。根据这一原理本文设计了根据氨基酸组成检索蛋白质组成数据库的程序,通过对胰岛素原、细胞肿瘤抗原Ｐ５３和泛肽等多种蛋白质的组成分析,证实根据氨基酸组成能较好地进行蛋白质鉴定。